• Sisi yang kurang dari penggunaan promoter ini adalah hama yang
menyerang bagian tsb tidak mengalami efek racun dari protein Bt.
Selain itu, ekspresi gen tsb menjadi berkurang bahkan terhenti pada
saat tanaman telah menyelesaikan daur hidupnya dimana terjadi
pengurangan proses fotosintesis secara drastis.
Bt yang berasal dari alam memiliki keterbatasan dalam
penggunaannya.
Bt alami tersebut umumnya berspektrum sangat sempit,
terbatas pada satu ordo saja, misalnya hanya Lepidoptera.
Pada waktu diaplikasikan seringkali terdapat perbedaan
kepekaan antarspesies hama, misalnya strain HD-1 ternyata
lebih toksik terhadap Spodoptera sp. dibanding pada Heliothis
sp.
Insektisida dengan bahan aktif protein Bt dikenal dengan
nama dagang Dipel, Thuricide, Raven, CRYMAX dan Lapinox.
Karena spesifikasinya, pestisida tsb termasuk dalam kategori
aman bagi lingkungan dengan sedikit atau hampir tidak ada
efek buruk bagi manusia, hewan liar, polinator dan jenis
serangga lainnya yang berguna bagi manusia.