PENGELOLAAN SPESIMEN

UNTUK PEMERIKSAAN
MIKROBIOLOGI

Dr. Cahyarini, SpMK.

Mikrobiologis RSUP Persahabatan

 Alur Prosedur Lab MK

Pra-Analitik Pasca-Analitik
Intra-Analitik

Mikrobiologi Klinik

Klinisi Klinisi Terkait

Terkait
Soebandrio A, Konsensus Mikrobiologi Klinik. Jakarta 2005
Pengelolaan Spesimen

Pemilihan spesimen

Pengambilan spesimen
Pengelolaan Spesimen

Pengiriman spesimen

Penyimpanan/pengawetan spesimen
Prinsip Mikroorganisme
Media Transport
 SALURAN NAPAS BAWAH
¡ SPUTUM
– Bukan saliva !!!
– Mukolitik dan inhalasi sebelumnya
– Bangun tidur – berkumur – batuk dalam
– Wadah steril
Saliva vs sputum

Sputum + Pewarnaan Gram

 … saluran napas bawah

¡ Lain :
› Bronchial washing
› Bronchial brushing
¡ Dilakukan oleh dokter dengan bronkoskopi
¡ Bronchial brushing lebih baik daripada bronchial washing

› Bronchoalveolar lavage
› Transtracheal aspiration
› Tracheal aspiration
 … saluran napas bawah

¡ Untuk beberapa bakteri seperti:

› Corynebacterium diphteriae,
› Bordetella pertussis,
› N. gonorrhoeae,
› Legionella spp.,
› Chlamydia,
› Mycoplasma

Dokter pengirim hendaknya menghubungi

laboratorium mikrobiologi terlebih dahulu sebelum
mengambil spesimen.
 DARAH

• Waktu Pengambilan
• saat suhu badan meningkat
• Bakteremia intermiten èdiambil 2-3 kali, dari 2
tempat berbeda,interval 5 menit
• aerob dan anaerob
• Untuk typhoid diambil pada demam minggu
pertama.
• Sebaiknya sebelum pemberian antibiotik atau
setelah 3 hari antibiotik dihentikan.
 Kapan ?
Ambil spesimen darah sedekat mungkin
dengan waktu demam. Jumlah bakteri
menurun ketika suhu tubuh menurun.

Demam Biakan Darah

Bacteremia
Temp Level
30

0 Waktu (min) 60
 Sampling darah
Volume Jumlah sampling

Bayi 1 – 3 ml 2 x/ set pemeriksaan

Anak-anak 3 – 5 ml 2 x/ set pemeriksaan

Dewasa 10 – 20 ml 2 x/ set pemeriksaan

Darah

 2-3 set spesimen akan dapat

meningkatkan angka deteksi~99%
episode sepsis.

 JANGAN hanya menggunakan 1 set

spesimen untuk diagnosis sepsis pertama
kali
 Konsentrasi bakteri dalam darah pada anak-anak lebih tinggi daripada dewasa.
 Konsentrasi bakteri dalam darah menurun sesuai pertambahan usia -> volume darah harus
ditingkatkan
 Sepsis – Kultur Darah

Konsentrasi bakteri dalam darah pada anak-anak lebih tinggi

daripada dewasa.
Konsentrasi bakteri dalam darah menurun sesuai pertambahan
usia -> volume darah harus ditingkatkan

Berat Rekomendasi Vokume Darah (mL) % volume Darah

Pasien Kultur 1 ideal

kg Pediatric bottle %
≤1 0,5 to 2 4
1.1 – 2 1.5 to 4.5 4.5
2.1 – 12.7 3 to 6 3

Berat Rekomendasi Vokume Darah (mL) % volume

Pasien Kultur 1 Kultur 2 Kultur 3 Darah ideal

Aerobic Anaerobic Aerobic Anaerobic Aerobic Anaerobic %

12.8 – 36.3 5 5 to 7 5 to 7 5 2.9
>36.3 10 10 10 10 10 10 2.8
Anaerobic bottles allow the growth of both aerobic and anaerobic organisms.

(5) ‘’European Manual of Clinical Microbiology’’ ESCMID 1st edition. 2012.

 … darah

Lokasi pengambilan :
 Pada vena perifer, bukan pada ujung
kateter

Cara pengambilan :
 Proses aseptik dan antiseptik ->
langsung ke botol Bactec/ BacTalert

Penyimpanan : < 24-48 jam , suhu ruang

 SALURAN KEMIH: URIN

 Pemeriksaan semikuantitatif
 Transport :
› minimal 2 jam setelah pengumpulan
spesimen
› > 2 jam : lemari es (bukan freezer)
 Cara pengumpulan spesimen urin

1. Mid stream urine ( Clean catch

urine )
JELASKAN PADA PASIEN:
urine pertama pagi hari
spesimen dikumpulkan di
pertengahan urine dikeluarkan
Penis / vulva dibersihkan
dengan air sabun atau tissue
basah steril
Hindari kemih mengenai kulit
 Cara pengumpulan spesimen urin

2. Urin Kateter
 bukan dari catheter bag

 kumpulkan dari selang indwelling catheter

melalui sampling port setelah dibersihkan
dengan swab alkohol terlebih dahulu
Cara pengumpulan spesimen urin
 Cara pengumpulan spesimen urine

3. Urine Aspirasi S uprapubik

Spesimen urine paling

baik
Invasif
Tindakan secara
aseptik
Dikerjakan bila urin
porsi tengah sulit
didapatkan
 SPESIMEN SALURAN CERNA

• FESES
• Feses segar sebanyak + 10 gram/ 1
sendok teh, taruh dalam wadah
bersih, jangan tercampur dengan
urine atau air kloset.
• Jika ada, ambil bagian berdarah/
berlendir
 … spesimen saluran cerna
• USAP DUBUR (rectal swab)
• Bayi, konstipasi
• memasukkan lidi kapas
steril sepanjang 1 inchi/ 2,5
cm ke dalam sfingter anus.
Secara hati-hati, putar lidi
kapas pada kripte anus
searah jarum jam dan putar
balik lidi kapas.
• Bila tidak langsung ditanam,
masukkan ke dalam media
transport Carey-Blair.
 … spesimen saluran cerna
Tujuan Pemeriksaan Feses

• untuk mengisolasi :
• Shigellae,
• Salmonella,
• E. Coli patogen,
• permintaan khusus: Clostridium
difficile, Vibrio, dan Yersinia.
 LUKA / ABSES
Cara :
› biopsi (terbaik): aerob & anaerob
› Aspirasi: aerob & anaerob
› Swab: aerob

Tidak dianjurkan untuk mengambil pus

yang berasal dari drain
 … luka / abses
BIOPSI DAN ASPIRASI
Aspirasi untuk :
• Abses tertutup
• Luka bergaung dengan cairan di dalamnya yang tertutup
debris superfisial
 … luka / abses

SWAB
 PEMERIKSAAN ANAEROB

Kriteria spesimen:
– aspirasi atau biopsi jaringan swab
– Tidak tercemar oleh mikroba yang tidak
diinginkan
– Terhindar dari kontak dengan udara.
– Menggunakan media transport anaerob
masukkan dalam anaerobic bag
 … pemeriksaan anaerob

PENYIMPANAN & PENGIRIMAN ANAEROB

• Sampel penderita dalam

spuit -> tidak dianjurkan
• Jangan dimasukkan
dalam lemari es
 … pemeriksaan anaerob

Spesimen yang bukan untuk kultur anaerob

Eksudat atau material lain yang diambil dari luka di

permukaan, abses, luka bakar, kista, ulkus
Swab vagina, serviks dan uretra

Spesimen saluran nafas yang diambil dengan swab, suction

nasotrakeal atau orotrakeal, sputum, bronkoskopi
Feses, usap dubur
(kecuali sampel feses dengan permintaan spesifik :
C.difficile, C. botulinum)

Urin porsi tengah atau urin dari kateter

Spesimen ditolak atau
diterima dengan catatan bila :
 Penderita memakai antibiotik
 Ada kemungkinan bahan terkontaminasi
 Jumlah kurang
 Penyimpanan dan pengiriman tidak
memenuhi syarat
 Bahan untuk pemeriksaan anaerob tidak
dikirim dalam suasana anaerob.
GOOD QUALITY SPECIMENS
ARE NEEDED FOR RELIABLE
MICROBIOLOGIC
DIAGNOSES