BIOINFORMATIKA

Sejarah dan Masa Depan

Egi Nuryadin, M.Si.

Dita Agustian, M.Pd.
Samuel A. Triyanto, M.Pd.
PENDAHULUAN
Apa itu Bioinformatika?
 Perkembangan Aktivitas Bioinformatika
 Dipicu oleh tiga faktor:

Protein Sequencing Kemajuan Teknologi Komputer Adanya Makromolekul

Biologis
Penemuan teknik pengurutan
protein oleh Frederick Sanger Gagasan adanya
pada makromolekul biologis
1950an membawa informasi oleh
Emile Zuckerkandl & Linus
Pauling pada 1965
Kelahiran Bioinformatika sebagai
ilmu ditandai dengan adanya penyusunan Atlas of Protein
Sequence and Structure.

Margaret Oakley Dayhooff dan

Koleganya (1965)
Margaret Oakley Dayhooff (1965)
 The first protein database
 The first program for sequence assembly

“Kita dapat menentukan struktur tiga dimensi dari sebuah

protein, hanya dengan melihat urutan asam aminonya.”
 Penelitian Pemacu Bioinformatika
Protein Data Bank
Teknologi Pengurutan DNA
(PDB) 1970
Di Alamos Sequence
Di Brookhaven
Database
National Library
(GenBank)

Algoritma Penjajaran Urutan Data Base Biologis

Protein Blast
Oleh Saul Needleman & (Altschul et al., 1990)
Christian Wunsh (1970) FASTA
(Lipman & Pearson, 1985)
 Database
storage

We are
here
 Istilah
Bioinformatika
dipublikasikan
Tahun 1970
“Bioinfomatika adalah ilmu yang mempelajari
proses-proses informatika dalam sistem biotik
dari tingkat sel hingga ekosistem.”

Pauline Hogeweg Ben Hesper

Definisi BIOINFORMATIKA
 Ilmu yang mengkaji biologi pada tatanan makromolekul dan kemudian menerapkan
teknologi informasi untuk memahami dan menata informasi yang terkait dengannya
dalam skala besar (Luscombe et al., 2001).

Bioinformatika

Analisis dalam Skala

Analisis informasi pada Penerapan Teknologi
Besar
makromolekul biologis Informasi / Komputer
BIOINFORMATIKA
 Melahirkan sekelompok disiplin ilmu baru yang secara kolektif disebut ilmu –omika (-
omics)

 Ilmu –omika teridiri atas sekumpulan ilmu yang mempelajari konteks secara totalitas
atau keseluruhan.

 Contoh: Genomika ; Transkriptomika; Proteomika ;Metabolomika

Ruang Lingkup
BIOINFORMATIK
A
Meliputi kajian: Analisis urutan, struktur, dan fungsi
makromolekul biologis pembawa informasi (DNA,
RNA, & Protein).

Ruang Lingkup
1. Pengembangan teknis analisis komputasi dan
database.
2. Penerapan teknis analisis dan database untuk
menghasilkan pengetahuan baru di dalam biologi.
 - Pengembangan Teknologi Komputer dan Algoritma
- Pengembangan Database Biologis

Analisis Struktur Analisis Urutan Analisis Fungsi

● Perbandingan genom ● Pemodelan Jalur Metabolisme

● Prediksi Struktur Asam
Nukleat
● Prediksi Struktur Protein
● Klasifikasi Struktur Protein
● Perbandingan Struktur Protein
● Filogeni ● Pembuatan Profil Ekspresi Gen
● ● Prediksi Interaksi antar Protein
Prediksi Gen dan Promoter
● Pencarian Motif ● Prediksi Penempatan Protein
● Pencarian Database Urutan Subseluler
● Penjajaran Urutan
Penerapan BIOINFORMATIKA
 Perkembangan Bioinformatika sangat bergantung pada perkembangan teknologi komputer yang
penerapannya menjawab berbagai permasalahan biologi.
 Penerapan Bioinformatika dibagi menjadi:

1. Analisis Struktur

2. Analisis Urutan

3. Analisis Fungsi
Penerapan BIOINFORMATIKA
Perkembangan Bioinformatika pada berbagai bidang, seperti:

1. Biomedis 2. Ilmu Forensik 3. Bioteknologi

 Keterbatasan
Bioinformatika
Keterbatasan BIOINFORMATIKA
 Analoginya adalah “Peranan Intelijen dalam Perang”
1. Bioinformatika sebagai intelijen yang bertugas menganalisis informasi.
2. Biologi eksperimental sebagai serdadu perang.

 Akurasi dan prediksi Bioinformatika adalah relatif berdasarkan kualitas data dan
pemodelan yang diberikan.
 Masa Depan
Bioinformatika
Masa Depan BIOINFORMATIKA
 Bioinformatika berpotensi merevolusi
berbagai penelitian biologi di masa depan.
 Tantangan yang harus dihadapi:
“Pengembangan teknik komputasi untuk
analisis struktur, urutan, dan fungsi
makromolekul biologis secara tepat
namun juga akurat.”
 “A PICTURE IS
WORTH THAN
THOUSAND WORDS”

-Thank You-
Bioinformatics