BAHAN BACAAN

Fessenden, R . J dan Fessenden, J.

S , 1986. Kimia Organik. Edisi Ketiga.
Jilid 2. Erlangga.
 Protein Sifat fisika Sifat Kimia
(Introduction) asam amino asam amino

Sintesis asam Reaksi asam Struktur

amino amino Protein
 Protein : Senyawa organik yang mengandung karbon (C ),
Hidrogen (H), Oksigen (O), Nitrogen (N) dan Sulfur (S)
 polimer dari monomer-monomer asam amino yang
dihubungkan satu sama lain dengan ikatan peptida
 kumpulan 20 asam amino yang sama 
POLIPEPTIDA
• Hidrolisis
protein  panas
 asam amino
• Ada 20 jenis
asam amino
 berbeda
bentuk dan
fungsi
 • Asam amino paling
sederhana  tidak memiliki
Klp Sifat rantai samping (R-group)
dan ciri
Glutamat Valina

Non-Polar
Polar
Hemoglobin kurang
larut dalam darah
A. Keamfoteran Asam Amino

B. Asilasi

C. Reaksi dengan ninhidrin

A. Keamfoteran Asam Amino
Cont...
Cont...
• Acylation  the process of adding an acyl group to a
compound
• The compound providing the acyl group is called the
acylating agent.
Reaction
• Sel  polipeptida  rantai melipat secara
spontan untuk mengambil konformasi
fungsional protein tersebut
• Konformasi adalah suatu penataan ruang
tertentu dari atom – atom dalam molekul.
• Pelipatan  digerakkan dan diperkuat
oleh
berbagai ikatan yang terbantuk
• Urutan asam amino yang terikat
secara kovalen dalam suatu
polipeptida
• Struktur primer ditentukan oleh
informasi genetik yang diwarisi
• Perubahan sedikit struktur
primer
 berpengaruh terhadap
konformasi dan kemampuan yang
digunakan (Ex : perubahan
struktur primer hemoglobin
 anemia sel sabit)
• Definisi  Rantai polipeptida
yang terlilit dan terlipat secara
berulang dalam pola yang
membentuk protein secara
keseluruhan  heliks α dan
lembaran berlipat2 (β)
• Terbentuk karena ikatan
hidrogen pada interval
beraturan disepanjang tulang
belakang polipeptida
• Ikatan hidrogen antara gugus
CO dan gugus NH disepanjang
tulang belakang polipeptida
• Definisi : Keseluruhan
konformasi polipeptida
setelah diperkuat dengan
interaksi antara rantai-rantai
samping (gugus R) asam
amino
• Ikatan yang berperan :
Interaksi hidrofobik, Ikatan
hidrogen, Ikatan ionik dan
jembatan disulfida
• Definisi : Hubungan 2 atau
lebih polipeptida yang
menyusun suatu protein
• Ex : Hemoglobin  protein
pengikat O2 pada sel
darah merah  protein
globuler dengan struktur
kuartener  2 jenis rantai
polipeptida
• Unit asam amino dalam rantai polipeptida= residu
• Konsensus :
– ujung amino asam amino N-ujung = residu asam amino
awal
– ujung karboksil  asam amino C-ujung = residu asam amino akhir
 Poliamida dengan residu asam amino <50  peptida
 Poliamida dengan residu asam amino >50  protein
Nama Polipeptida Diambil
Dari Singkatan Nama
Asam Amino
Pembentuknya (Kiri Ke
Kanan).
• CONTOH: ALA-TYR-GLY
 Question
• Bagaimana Struktur leu-lys-met??
• Bagaimana struktur ala-gly-phe??
 SOAL TUGAS
1. Tandailah masing-masing senyawa berikut ini sebagai asam, basa
atau netral : a. Isoleusin; b. Asam aspartat; c. Asparagina; d.
Serina; e. Histidina; f. Glutamina
2. Asam amino apa yang mempunya lebih dari satu karbon kiral?
3. Ikhtisarkan suatu sintesis strecker untuk : (a) fenilalanin, (b)
isoleusina
4. Tuliskan persamaan untuk menyatakan (a) pembentukan ion-
dipolar dari histidina, (b) kesetimbangan antara histidina dan air,
(c) reaksi histidina dengan HCl dalam air,encer, (d) reaksi histidina
dengan NaOH dalam air,encer
5. Dalam struktur dibawah ini, tandai : (a) ikatan (ikatan-ikatan)
peptida ; (b) asam amino N-ujung : (c) asam amino C-ujung; (d)
apakah struktur ini dipeptida, tripeptida atau tetrapeptida? (e)
asam, basa atau netralkah peptida ini?
Cont...
6. Tuliskan struktur untuk ; (a) glisilglisina; (b)
alanileusilmetionina
7. Tuliskan nama lengkap dan nama
singkatan
untuk masing-masing peptida berikut :