Prosedur pertama yang dilakukan pada praktikum isolasi protein adalah 10 cacing dicuci dengan M9 dan dikumpulkan dalam

15 atau 50 ml tabung sentifuga. Cacing disentrifugasi selama 2 menit pada 1000 rpm (200 G). M9 diganti dengan M9 segar. Sentrifugasi diulangi dan diganti kembali sebanyak 2 kali, lalu sentrifugasi dihentikan. Kemudian cacing diletakkan dalam es selama 2 menit. Setelah itu M9 dibuang dan larutan sukrosa ditambahkan sebanyak 7-8 ml. Kemudian sentrifugasi segera dilakukan pada 4oC pada 1000 rpm (200 G) selama 5 menit. Lalu cacing segera dikeluarkan dari permukaan cairan ke tabung sentrifugasi baru dan air segera ditambahkan pula untuk melarutkan sisa sukrosa. Kemudian sentrifugasi dilakukan pada 1000 rpm (200 G) selama 2 menit. Setelah itu pelet cacing direndam dalam sedikit cairan. Dengan menggunakan M9, cacing dipindahkan ke tabung 1,5 ml bertutup putar. Cacing dicuci 3x dengan M9 (setelah dicuci, sentrifugasi dilakukan pada 2000 rpm selama 2 menit, lalu ganti M9 kembali). Cairan dibuang dan pelet cacing dibiarkan dalam tabung.