1

SOAL UTS BIOKIMIA

DOSEN: SARMOKO, S.FARM., APT
UJIAN TERTUTUP
Petunjuk.
1. Soal boleh di bawa pulang
2. Dikerjakan secara urut
3. Mulailah dengan berdoa semoga diberi kelancaran dan kelapangan berfikir
4. Bekerjalah dengan usaha sendiri, tidak boleh bekerjasama selama ujian.

Soal 1
Rumus umum dari asam amino adalah sebagai berikut
. Lys (L) adalah asam amino dengan R adalah (CH
2
)
4
-NH
2
.
Pertanyaan:
a. Gambarkan struktur zwiter ion dari asam amino Lys (L).
b. Apakah pengertian zwiter ion?
c. Gambarkan reaksi ionisasi Lys pada berbagai pH.
d. Jika pK1 adalah 2,18; pK2 adalah 8,95; dan pKR adalah 10,53, tentukan nilai titik
isoelektriknya (pI).
e. Kondisi apa yang terjadi ketika asam amino berada pada pI-nya?
e. Gambarkan reaksinya dengan asam amino Glisin dan tunjukkan ikatan peptidanya.

Soal 2
Struktur protein bisa dibgai menjadi empat yaitu struktur primer, sekunder, tersier, dan
kuarterner.

a. Lengkapi keterangan A, B, C, D masing
b. Pada gambar B (-sheet), ter
c. Pada struktur B, ikatan apakah yang dominan mempengaruhi?
d. Jika struktur C atau D mengalami denaturasi, maka akan membentuk strukur ..................
Mengapa?
e. Struktur kuartener merupakan struktur protein yang terdiri dari lebih satu polipeptida
(lebih dari satu sub unit). Gambar D merupakan struktur
metalprotein pengangkut oksigen yang mengandung besi dalam sel merah dalam darah
mamalia dan hewan lainnya. Molekul hemoglobin terdiri dari globin, apoprotein dan empat
gugus heme. Heme merupakan
Heme di sini berfungsi sebagai
tambahan terhadap kerja enzim. Gugus prostetik terdiri dari molekul
terikat rapat/kuat dengan enzim.
kompleks yang fungsinya memindahkan gugus kimia, atom, atau elektron dari suatu enzim ke

a. Lengkapi keterangan A, B, C, D masing-masing merupakan struktur apa?
sheet), termasuk orientasi paralel atau antiparalel?
c. Pada struktur B, ikatan apakah yang dominan mempengaruhi?
d. Jika struktur C atau D mengalami denaturasi, maka akan membentuk strukur ..................
merupakan struktur protein yang terdiri dari lebih satu polipeptida
Gambar D merupakan struktur Hemoglobin, merupakan
metalprotein pengangkut oksigen yang mengandung besi dalam sel merah dalam darah
Molekul hemoglobin terdiri dari globin, apoprotein dan empat
merupakan suatu molekul berbentuk cincin pipih yang mengandung besi
Heme di sini berfungsi sebagai gugus prostetik, yang berperan untuk memberikan kekuatan
ja enzim. Gugus prostetik terdiri dari molekul-molekul organik
dengan enzim. Ada juga Koenzim yaitu molekul organik non protein
kompleks yang fungsinya memindahkan gugus kimia, atom, atau elektron dari suatu enzim ke
2
masing merupakan struktur apa?
d. Jika struktur C atau D mengalami denaturasi, maka akan membentuk strukur ..................
merupakan struktur protein yang terdiri dari lebih satu polipeptida
merupakan
metalprotein pengangkut oksigen yang mengandung besi dalam sel merah dalam darah
Molekul hemoglobin terdiri dari globin, apoprotein dan empat
suatu molekul berbentuk cincin pipih yang mengandung besi.
berperan untuk memberikan kekuatan
molekul organik yang
yaitu molekul organik non protein
kompleks yang fungsinya memindahkan gugus kimia, atom, atau elektron dari suatu enzim ke
3

enzim lain. Contoh NAD+ . Koenzim dilepaskan dari enzim selama berlangsungnya reaksi.
Berdasarkan informasi ini, simpulkan perbedaan gugus prostetik dan konzim, berdasarkan
kekuatan ikatannya dengan enzim!
Soal 3
Bayi yang mendapatkan suplemen makanan dengan tingkat DHA (Docosahexaenoic acid)
dan ARA (asam arakidonat) dalam dosis tepat terbukti lebih dapat berkonsentrasi daripada
mereka yang kekurangan kedua zat itu. DHA mempunyai struktur ditulis dengan 22:6 cis
4, 7,
10, 13, 16, 19
. Asam arakidonat mempunyai strukur ditulis dengan: 20:4 cis
5,8,11,14

a. DHA dan ARA termasuk asam lemak tidak jenuh (PUFA= poly-unsaturated fatty acid).
Manakah yang merupakan omega 3 dan omega 6? Jelaskan singkat.
c. Contoh fosfogliserida (suatu penyusun lipid membran yang umum) adalah fosfatidilkolin.
(a)
(b)
Gambarkan fosfatidilkolin dalam strukur (b) dengan penyusun asam lemak di C1 adalah
DHA dan C2 adalah ARA.
O P O
O

O
H
2
C
CH
H
2
C
O C R
1
O O C
O
R
2
CH
2
CH
2
N CH
3
CH
3
CH
3
+



phosphatidylcholine

d. Fosfatidilkolin menyumbang 27% dari total membran pospolipid. Berdasarkan data
distribusi di membran
kecenderungan posisi fosfatidilkolin (di posisi A atau B)?
e. Apa guna kolestrol sebagai penyusun membran sel?
Soal 4. Mengapa protein bisa ditentukan kadarnya secara spektrofotometri
Soal 5. Gambarkan garis besar
terbentuk AMP dan GMP.
Soal 6. Obat pirai adalah alopurinol. Enzim apakah yang dihambat?
Soal 7
d. Fosfatidilkolin menyumbang 27% dari total membran pospolipid. Berdasarkan data
distribusi di membran tabel di atas (inner dan outer monolayer), dimanakah
posisi fosfatidilkolin (di posisi A atau B)?
Apa guna kolestrol sebagai penyusun membran sel?
bisa ditentukan kadarnya secara spektrofotometri?
Gambarkan garis besar biosintesis nukleotida purin dari ribosa-5-pospat sampai
Soal 6. Obat pirai adalah alopurinol. Enzim apakah yang dihambat?
4

d. Fosfatidilkolin menyumbang 27% dari total membran pospolipid. Berdasarkan data
nner dan outer monolayer), dimanakah

?
pospat sampai
5

Metotreksat (MTX) adalah suatu antimetabolit dan antifolat yang digunakan pada tritmen
kanker dan penyakit autoimun. MTX bekerja dengan menghambat metabolisme asam folat.
Strukturnya adalah mirip dengan asam folat sbb:

Pada biosintesis pirimidin reaksi berikut memerlukan derivat tetrahidrofolat. Selama proses
pemindahan, gugus metilen pada senyawa N5, N10-metilen-tetrahidrofolat (H4 folat)
direduksi menjadi gugus metil, sedangkan pembawa tetrahidrofolat dioksidasi menjadi
dihidrofolat (H2 folat). Agar terjadi sintesis lebih lanjut, dihidrofolat harus direduksi menjadi
tetrahidrofolat dalam reaksi yang dikatalisis oleh dihidrofolat reduktase (DHFR). Sebagai
akibatnya, sel-sel yang sedang membelah yang harus menghasilkan dTMP serta dihidrofolat
peka terhadap inhibitor MTX.

Pertanyaan:
MTX
6

a. Gambarkan strukur dari dTMP. Bantuan, strukut timin adalah

b. DHFR menurut penamaan NC-IUBMB adalah EC. 1.5.1.3. Termasuk kelas apakah
enzim DHFR?
c. MTX berikatan secara spesifik pada sisi aktif enzim, berkompetisi langsung dengan
dihidrofolat mengakibatkan perubahan pada kemampuan katalitik enzim. Tipe inhibisi
apakah kerja dari metotreksat?
d. Grafik kompetisi di atas bisa digambarkan sebagai berikut:

Apakah terjadi perubahan Km dan Vmax? Jelaskan.
Nilai Km DHFR pada suhu 37oC adalah sebagai berikut:
7

(Tahar et al., Molecular & Biochemical
Parasitology 113 (2001) 241249)
d. Km DHFR terhadap dihidrofolat adalah 107 M, apakah artinya?
e. Jika dibandingkan terhadap dihidrofolat dengan MTX, manakah yang lebih kuat ikatannya
terhadap enzim?