PENGANTAR BIOLOGI MOLEKULER

Dr. E. Bimo Aksono H, M.Kes.,Drh

PENGERTIAN BIOLOGI MOLEKUL

CABANG

ILMU YANG MEMPELAJARI :

STRUKTUR

SIFAT

PERAN/FUNGSI
BIOMOLEKUL DALAM PELAKSANAAN
SEGALA ASPEK FUNGSI KEHIDUPAN

PERKEMBANGAN BIOLOGI MOLEKUL

BIOLOGI

ILMU

KIMIA

FAAL

ILMU BIOKIMIA

BI0LOGI MOLEKUL

LINGKUP ILMU YANG DIPELAJARI

BIOLOGI : MEMPELAJARI ORGANISMA

(MAKHLUK HIDUP) SECARA
KESELURUHAN
ILMU BIOKIMIA : MEMPELAJARI SUSUNAN
KIMIA & PROSES-PROSES KIMIA
DALAM TUBUH MAKHLUK HIDUP
BIOLOGI SEL : MEMPELAJARI UNIT TERKECIL
ORGANISME

ORGANISMA DARI SUDUT PANDANG

BIOLOGI MOLEKUL

ORGANISMA
MERUPAKAN
KUMPULAN
BIOMOLEKUL YANG TERTATA RAPI DAN RUMIT.
KOMPOSISI
BIOMOLEKUL
MENENTUKAN
SIFAT-SIFAT KHAS YANG DIMILIKI SETIAP
ORGANISME
FUNGSI-FUNGSI
KEHIDUPAN
MERUPAKAN
MANIFESTASI
DARI
INTERAKSI
ANTAR
MOLEKUL DALAM ORGANISMA.

KEDUDUKAN BIOLOGI MOLEKUL

ILMU

(SAINS, SCIENCE) :

* ILMU DASAR (BASIC SCIENCES)

* ILMU TERAPAN (APPLIED SCIENCES)

ILMU KEDOKTERAN Veteriner :

ILMU TERAPAN/ILMU KLINIS YANG

MEMPELAJARI : PENYEBAB ,

PATOGENESIS

TERAPI

PERAN BIOLOGI MOLEKUL DALAM

ILMU KEDOKTERAN Veteriner
BERUSAHA MENGETAHUI

DASAR
MOLEKULER PATOGENESIS, SEHINGGA
PADA AKHIRNYA DAPAT DIGUNAKAN
UNTUK MEMBERIKAN TERAPI YANG
LEBIH RASIONAL & TERARAH

ORGANISMA
LIFE

FUNCTIONS :
1. REPRODUKSI/REPLIKASI
2. PEWARISAN SIFAT-SIFAT
3. TUMBUH KEMBANG
4. METABOLISME PENGADAAN ENERGI
5. MEMPERTAHANKAN HOMEOSTASIS
6. TRANSPORT ANTAR & INTRASEL
7. KOMUNIKASI ANTAR SEL.

DIPANDANG DARI KEMAMPUAN

MENGUBAH SENYAWA KIMIA, ORGANISMA
DIBAGI :
ORGANISMA AUTOTROFIK

:
Hanya memerlukan SENYAWA INORGANIK
(CO2, H2O, NH3) untuk membentuk senyawa
yang dibutuhkan.
ORGANISMA HETEROTROFIK :
memerlukan SENYAWA ORGANIK
(CARBON) untuk kehidupannya. Hanya Dapat
mensintesis Sebagian biomolekul, sebagian
yang lain harus dari luar.

SEL
1.

SEL MERUPAKAN UNIT TERKECIL

ORGANISMA YANG APABILA
DIPISAHKAN MASIH MAMPU HIDUP
SECARA MANDIRI.
2. SEL MASIH MENUNJUKKAN SEMUA
FUNGSI-FUNGSI KEHIDUPAN
3. SEL TERDIRI DARI MOLEKUL MOLEKUL (BIOMOLEKUL)

JENIS SEL BERDASARKAN STRUKTUR :

SEL PROKARIOTA
SEL EUKARIOTA
BERDASAR STRUKTUR SELNYA,

ORGANISMA DIBAGI MENJADI :

ORGANISMA PROKARIOTA
ORGANISMA EUKARIOTA

PERBEDAAN SEL EUKARIOTA & SEL

PROKARIOTA

EUKARIOTA :
INTI SEL : +
ORGANEL SEL +
DNA : TERIKAT PADA PROTEIN :
HISTON, MEMBENTUK
NUKLEOSOM
mRNA :PERLU PENGOLAHAN PASCA
TRANSKRIPSI
MONOKISTRONIK
MEMILIKI CAP & POLY-A TAIL

PROKARIOTA :
INTI

SEL : ORGANEL SEL : DNA : TELANJANG

mRNA : TIDAK PERLU PENGOLAHAN

POLIKISTRONIK

TIDAK MEMILIKI CAP & POLY-A

TAIL.

Prokaryotic Cell

Eukaryotic Cell

VIRUS?
ORGANISMA TIDAK
MEMPUNYAI

SEMPURNA!

CIRI REPRODUKSI &

PERTUMBUHAN HANYA JIKA BERADA
DALAM SUATU SEL.

VIRUS
BENTUK

DILUAR SEL : VIRION

VIRION SEDERHANA , TERDIRI DARI :
* INTI (CORE) : DNA/RNA
* NUKLEOKAPSID : PROTEIN
VIRION KOMPLEKS :

INTI, NUKLEOKAPSID, ENVELOP

(LIPID BILAYER), ENZIM (SEBAGIAN)

Contoh : virus PMK (DNA),virus AI (RNA)

Influenza Virus

BIOMOLEKUL:

SENYAWA-SENYAWA KIMIA YG SECARA ALAMI

HANYA DITEMUKAN DALAM TUBUH
ORGANISMA ATAU SISA ORGANISMA (SETELAH
ORGANISMA TERSEBUT MATI)

ATOM-ATOM PENYUSUN BIOMOLEKUL :

C, H, O, N, S, P

FUNGSI BIOMOLEKUL :

A. KOMPONEN STRUKTURAL SEL :

PENYUSUN TUBUH ORGANISMA,
MISAL: MEMBRAN SEL,
SITOSKELETON, MATRIKS SEL
B. KOMPONEN FUNGSIONAL SEL :
DIPERLUKAN UNTUK MELAKSANAKAN
FUNGSI-FUNGSI KEHIDUPAN,
MISAL : ENZIM , HORMON, ANTIBODI, DNA,
RNA, ATP.

C. CADANGAN ENERGI ;
MISAL: TRIASILGLISEROL, GLIKOGEN

D.

LIMBAH :
TIDAK MEMPUNYAI FUNGSI
SISA METABOLISME
MISAL : UREUM , ASAM URAT

PEMBAGIAN BIOMOLEKUL
BERDASAR KERUMITAN STRUKTUR &
BERAT MOLEKULNYA :
A.

B.

SENYAWA SEDERHANA :
ASAM AMINO, ASAM LEMAK
MAKROMOLEKUL :
POLISAKARIDA,
POLIPEPTIDA (PROTEIN)
POLINUKLEOTIDA (DNA, RNA)

PEMBAGIAN BIOMOLEKUL
BERDASAR KELARUTANNYA
1.

SENYAWA HIDROFILIK :
PROTEIN, GLUKOSA, ASAM AMINO
2. SENYAWA HIDROFOBIK :
TRIASILGLISEROL, KOLESTEROL
ESTER
3. SENYAWA AMPIFILIK :
PENYUSUN MEMBRAN SEL :
SFINGOMIELIN, KOLESTEROL,
SEREBROSIDA

MAKROMOLEKUL :
BERUPA POLIMER

:
- HOMOPOLIMER :
UNIT PEMBENTUK (MONOMER)
SAMA
- HETEROPOLIMER :
UNIT PEMBENTUK TIDAK SAMA

JENIS-JENIS POLIMER :
A.

POLINUKLEOTIDA ( ASAM NUKLEAT):

HETEROPOLIMER DENGAN UNIT
PEMBENTUKNYA : NUKLEOTIDA
(BASA N, PENTOSA, ASAM FOSFAT).
IKATAN ANTAR UNIT : FOSFODIESTER
UJUNG RANTAI : 5 (FOSFAT)
3 (HIDROKSI)

B. POLIPEPTIDA : HETEROPOLIMER
UNIT PEMBENTUK :ASAM AMINO
IKATAN ANTAR UNIT : IKATAN PEPTIDA

UJUNG RANTAI :
UJUNG N (NH2, AMINO)
UJUNG C (COOH, KARBOKSI)

C, POLISAKARIDA :
HOMO/HETEROPOLIMER
UNIT PEMBENTUKNYA :

GULA SEDERHANA :
GLUKOSA, GALAKTOSA,
MANNOSA, FRUKTOSA
GULA AMINO :
GLUKOSAMIN, GALAKTOSAMIN
ATAU ASAM URONAT :
ASAM GLUKURONAT

FUNGSI POLISAKARIDA :
TERUTAMA SEBAGAI CADANGAN
ENERGI & KOMPONEN STRUKTURAL SEL.
IKATAN ANTAR

UNIT :
IKATAN GLIKOSIDA

UJUNG

RANTAI :
TIDAK ADA NAMA KHUSUS

PENURUNAN SIFAT MAKHLUK HIDUP

GEN

1865 MENDEL:
MELAKUKAN PERCOBAAN DENGAN
KACANG POLONG & MENEMUKAN
BAHWA SIFAT-SIFAT ORGANISMA
DIWARISKAN DARI INDUK KE ANAK
TURUNNYA MELALUI SUATU FAKTOR
PEWARISAN (HEREDITARY FACTOR).
SAAT ITU BELUM DISEBUT GEN

1944 AVERY, MAC LEOD &

Mc. CARTHY

MEMBUKTIKAN BAHWA GEN ADALAH DNA

1953

WATSON & CRICK

MENEMUKAN STRUKTUR HELIKS GANDA DNA

BAGAIMANA SUATU MOLEKUL, DNA

MEMPENGARUHI SINTESA PROTEIN?

PERLU DIBAHAS STRUKTUR DNA & RNA

Language of Genetics
Central Dogma
Proteins

Genotype

DNA

RNA
Transcription

Phenotype

Protein
Translation

DNA (DEOXYRIBONUCLEIC ACID)

KOMPOSISI

:
BASA : ADENIN (A) GUANIN (G)
TIMIN (T)
SITOSIN (C)
GULA : 2- DEOKSI RIBOSA
BERKAS (UTAS) : GANDA :
- KOMPLEMENTER
- ANTIPARALEL

INFORMASI GENETIK DALAM

RANGKAIAN NUKLEOTIDA :
1.

2.

SUMBER INFORMASI BAGI SINTESIS

SEMUA MOLEKUL PROTEIN PADA SEL
MAUPUN ORGANISMA.
INFORMASI YANG DIWARISKAN
KEPADA SEL-SEL ANAK ATAU
GENERASI BERIKUTNYA

KEDUA FUNGSI DI ATAS PERLU

SYARAT :
1.

2.

MOLEKUL DNA HARUS BERFUNGSI

SEBAGAI TEMPLATE (CETAKAN)---->
TRANSKRIPSI UNTUK MOLEKUL RNA.
REPLIKASI INFORMASI KEDALAM
MOLEKUL-MOLEKUL DNA TURUNAN
NYA

KEDUA UTAS MOLEKUL DNA YANG

BARU :
*

MASING-MASING MENGANDUNG 1
UTAS YANG KOMPLEMENTER DARI
MOLEKUL INDUK BERUTAS GANDA

*SETIAP SEL TURUNAN

MENGANDUNG
MOLEKUL DNA DENGAN INFORMASI
IDENTIK DENGAN YANG DIMILIKI SEL
INDUKNYA

BEDA DNA DENGAN RNA

JENIS

PENTOSA :

DEOKSI RIBOSA (PADA DNA) &

RIBOSA (PADA RNA)

JENIS BASA NITROGEN :

ADENIN, TIMIN, GUANIN, SITOSIN

(PADA DNA)

ADENIN, URASIL, GUANIN, SITOSIN

(PADA RNA)

DNA :

SUATU MOLEKUL PANJANG

BERBENTUK DOUBLE HELIX

SETIAP SEGMEN SPESIFIK DARI DNA

MENGANDUNG INSTRUKSI UNTUK
MEMBUAT PROTEIN SPESIFIK

SEGMEN SPSESIFIK INI DISEBUT GEN

RNA
-MAKROMOLEKUL

(POLIPEPTIDA)
YANG TERBENTUK DARI RANTAI
PANJANG UNIT-UNIT ASAM AMINO
- TERDAPAT 20 MACAM ASAM AMINO
PEMBENTUK PROTEIN
- 3 JENIS NUKLEOTIDA MENENTUKAN 1
JENIS ASAM AMINO (TRIPLET CODE)

MUTASI PADA URUTAN DNA

MENYEBABKAN

PERUBAHAN URUTAN
ASAM AMINO -----> PERUBAHAN
PROTEIN

MUTASI

: TITIK (DELESI, INSERSI)

FRAME SHIFT MUTATION

SEL
Inti

kromosom gen
Sitoplasma
Sel somatis orgs tkt tinggi :
1 set krom. diploid (46 krom) :
23 ps kromosom homolog yi
22 ps autosom +
1 ps krom sex (XX dan XY)

Ada 2 jenis pembelahan sel :

MEIOSIS dan MITOSIS

Haploid

genome / genome - N
krom haploid dr suatu spesies + gen2nya.
Pd mans mengandung 3,5 X 10 9 bp terdiri
1,7 X 107 nukleosom
Diploid genome 2N
1 set krom dr suatu spesies dan gen2nya.
Pd mans mengandung 7 X109bp terbg dlm
23 krom mengkode 3 juta ps gen

Pada kenyataan pd mans hanya trdpt

30.000 100.000 protein esensial. Jadi
ada bag DNA yg tdk diekspresikan
non coding DNA
Ada segmen2 DNA merupakan :
- gen2 struktural
- Gen2 regulator

GEN STRUKTURAL
Suatu

gen yg memberikan informasi

(kode) pd sintesis suatu protein
segmen DNA ini menentukan urutan
asam amino rantai polipeptida / prot

KROMOSOM
ADALAH

GEN-GEN YANG BERBARIS DI

SEPANJANG DNA, YANG TERKUMPUL
DALAM SUATU STRUKTUR ---->
KROMOSOM
MANUSIA : 46 KROMOSOM :

22 PASANG AUTOSOM

1 PASANG SEKS KROMOSOM

KROMOSOM

KROMOSOM

ALEL
DALAM

TUBUH MANUSIA TERDAPAT 2 SET

KROMOSOM YANG SALING BERPASANGAN
PASANGAN DALAM MASING-MASING
KROMOSOM DISEBUT : ALEL
ALEL SETIAP GEN MENEMPATI TEMPAT
(LOKUS) YANG SAMA PADA KROMOSOM
YANGBERPASANGAN
FUNGSI ; MENGONTROL KARAKTERISTIK
YG SAMA

BERDASAR DOMINANSINYA, ALEL

DIBAGI :
1. ALEL DOMINAN
2. ALEL RESESIF

MEIOSIS
Pd

hewan terjadi selama pembentukan

gamet / sel seks (sel telur,sperma) - haploid
Ada 2 kali pembelahan sel 4 sel anak
msg2 mengandung 1 dr tiap jenis krom
(juml krom=sel induk)
Sel anak (haploid) secara genetik tidak
identik dg sel induk (diploid)

MITOSIS :
Pembelahan

sel somatis sel anak

(daughter cells) yg secara genetik
identik dg sel induk (parent cell)

MITOSIS :

KROMOSOM (dlm inti sel)

Struktur

spt benang pd sel, virus dimana

didptkan komponen2 yg berhubungan dg
faktor keturunan
Kromosom eukaryotik mengandung 1
mol DNA double helix yg sangat besar
mengandung banyak sekali gen
Dibagi dlm bag2 tiap bag mengawasi
trait tertentu

KROMATIN:serat2 yg menyusun krom

eukaryotik
GEN :
Terletak dlm kromditurunkan
ALLELE :
Btk alternatif suatu gen pd posisi yg sm dlm
suatu ps krom dan mempengaruhi trait yg
sama

SEX LINKED GENE :

Gen2 pd krom sex yg tdk berkaitan dg
perkembangan sex tetapi berkaitan dg
trait2 yg lain
TRAIT :
Aspek tertentu individu mis tinggi badan

KROMOSOM HOMOLOG :
Krom yg berps pd sel diploid
Memp morfologi yg sm + mengandung
gen2 yg membawahi sifat2 yg sm
CROSSING OVER (PERSILANGAN) :
Proses pertukaran materi genetik antara
kromatid2 dr krom yg homolog selama
meiosis

CELL CYCLE

CELL CYCLE :

REGULASI CELL CYCLE

Cdk

(Cyclin dependent kinase)

MPF (Maturation Promoting Factor)
p53 menghambat siklus sel
p27 menghambat Cdk

Interphase: Interphase generally lasts at least 12 to 24 hours in mammalian tissue.

During this period, the cell is constantly synthesizing RNA, producing protein and
growing in size. By studying molecular events in cells, scientists have determined
that interphase can be divided into 4 steps: Gap 0 (G0), Gap 1 (G1), S (synthesis)
phase, Gap 2 (G2). Gap 0 (G0): There are times when a cell will leave the cycle and
quit dividing. This may be a temporary resting period or more permanent. An
example of the latter is a cell that has reached an end stage of development and will
no longer divide (e.g. neuron).
Gap 1 (G1): Cells increase in size in Gap 1, produce RNA and synthesize protein.
An important cell cycle control mechanism activated during this period (G1
Checkpoint) ensures that everything is ready for DNA synthesis. (Click on the
Checkpoints animation, above.)
S Phase: To produce two similar daughter cells, the complete DNA instructions in
the cell must be duplicated. DNA replication occurs during this S (synthesis) phase.
Gap 2 (G2): During the gap between DNA synthesis and mitosis, the cell will
continue to grow and produce new proteins. At the end of this gap is another control
checkpoint (G2 Checkpoint) to determine if the cell can now proceed to enter M
(mitosis) and divide.
Mitosis or M Phase: Cell growth and protein production stop at this stage in the cell
cycle. All of the cell's energy is focused on the complex and orderly division into
two similar daughter cells. Mitosis is much shorter than interphase, lasting perhaps
only one to two hours. As in both G1 and G2, there is a Checkpoint in the middle of
mitosis (Metaphase Checkpoint) that ensures the cell is ready to complete cell
division. Actual stages of mitosis can be viewed at Animal Cell Mitosis.

SEKIAN
DAN
TERIMA KASIH