Nama

: Siti Holifah

NIM

: 4311413004

Prodi

: Kimia

Mata Kuliah : Kimia Komputasi

Bahan Diskusi BAB II
1. Untuk menentukan sifat-sifat molekul air dengan metode perangkat lunak HyperChem
a. Metode perhitungan HyperChem yang diperkirakan cocok untuk menentukan
perhitungan sifat-sifat molekul air adalah dengan menggunakan metode perhitungan
semiempiris, hal ini dikarenakan pada metode perhitungan semiempiris dapat digunakan
dalam sistem yang besar dan menghasilkan fungsi gelombang elektronik yang baik
sehingga sifat elektroniknya dapat diprediksi, begitu sifat elektoniknya dapat diprediksi
maka sifat molekulnya apat diprediksi atau ditentukan.
b. Prameternya adalah ikatan hidrogen, sudut dan panjang ikatan.
2. Menurut saya pernyataan tersebut adalah benar dan mungkin metode semiempiris
merupakan metode yang paling sesuai dalam tujuan menganalisis sifat suatu senyawaa
organik sederhana (BM rendah) karena apabila menggunakan metode mekanika molekul
molekulnya adalah molekul yang besar, sedangkan apabila dengan menggunakan metode
ab initio tidak dapat diketahui muatan atom, momen dipol dan energi totalsistem, karena
motode ab initio bukanlah penyelesaian eksak namun metode ab initio merupakan
konsep perhitungan yang umum dari persaan schrodinger. Oleh karena alasan tersebut
makan metode semiempiris adalah metode yang paling tepat dalam menyelesaikan tujuan
tersebut. Dan Yang paling penting, metode ini cepat.Meskipun hal ini mungkin tidak
penting bagi molekul kecil, hal ini penting untuk biomolekul. Keuntungan lain adalah
untuk sistem molekul tertentu dan baik untuk parameterisasi, metode ini dapat
menghitung nilai-nilai yang lebih dekat untuk bereksperimen dari tingkat teknik abinitio
yang lebih rendah.
3. Operator Hamilton
a. Hasil perhitungan potensi elektrostatik dapat digunakan untuk memprediksi posisi awal
serangan proton (atau ion-ion lainnya) selama reaksi.
o potensi elektrostatik
o r titik adalah posisi probe positif charge. ZA adalah biaya nuklir pada atom terletak di
posisi RA. (r') fungsi adalah kepadatan elektronik. Dalam persamaan di atas, pertama

istilah represents kontribusi dari inti untuk potensi elektrostatik dan istilah yang kedua
adalah kontribusi elektronik. Mengganti elektron kepadatan ekspresi:
o Penjumlahan kedua adalah di atas semua orbital sistem. Persamaan ini digunakan dalam
HyperChem ab initio dan DFT perhitungan untuk menghasilkan kontur plot potensi
elektrostatik. Jika kita memilih pendekatan dimana kita mengabaikan efek tumpang
tindih
b. Yang dianggap tetap jika menggunakan pendekatan BO adalah suku pertama
4. Salah satu penerapan kimia komputasi dalam bidang farmasi adalah pada desain obat.
Desain obat adalah proses interasi yang dimulai dengan penentuan senyawa yang
menunjukkan sifat biologi yang penting dan diakhiri dengan langkah optimasi, baik dari
profil aktivitas maupun sintesis senyawa kimia. Tanpa pengetahuan yang lengkap tentang
proses biokimia yang bertanggung jawab terhadap aktivitas biologis, hipotesis desain
obat pada umumnya didasarkan pada pengujian kemiripan struktural dan membedakan
antara molekul aktif dan tidak aktif. Kombinasi anata setrategi untuk mensintesis dan uji
aktivitasnya dapat menjadi sangat rumit dan memerlukan waktu yang lama untuk sampel
pada pemanfaatan obat, untuk itu dilakukan pendekatan teoritis yang dapatmenghitung
secara kuantitatif tentang hubungan antara aktivitasbiologis terhadap perubahan struktur
senyawa yang dikenaldengan istilah QSAR.
5. Keakuratan dari mekanika molekul atau metode mekanika kuantum semi empiris

tergantung pada database yang digunakan untuk parameterisasi metode. Hal ini berlaku
untuk jenis molekul dan data fisik dan kimia dalam database. Metode ini sering
memberikan hasil terbaik untuk kelas terbatas molekul atau fenomena. Kelemahan dari
metode ini adalah anda harus memiliki parameter yang tersedia sebelum menjalankan
perhitungan. Mengembangkan parameter memakan waktu.sifat sistem kimia yang dapat
diprediksi adalah seperti sudut ikatan, torsions, interaksi van der waals, ikatan hidrogen,
dan potensial elektrostatik.