MAKALAH
untuk memenuhi tugas Matakuliah
Biologi Sel dan Molekuler
yang dibina oleh Dr. Umie Lestari, M. Si
.
Oleh
Alvina Putri Purnama Sari 150341806202
Intan Lestari Mulyaning Tyas 150341805827
Dyah Kusuma Wardhani S.A. 150341806212
BAB II
1
PEMBAHASAN
2
Gambar 1. Kenakeraragaman plastid (A) sebuah proplastida dati cell akar pada
tanaman kacang
3
Gambar 2. Penampakan kloroplas dari mikroskop elektron
4
Gambar 3. Kloroplas
5
transpor elektron dalam membran tilakoid dalam banyak cara yang sama
dengan sebuah elektron bergerak sepanjang rantai respirasi di mitokondria.
Klorofil yang memperoleh elektronnya dari air (H 2O), menghasilkan O2
sebagai produk. Selama proses transpor elektron, H+ dipompa melintasi
membran tilakoid, dan dihasilkan gradient elektrokimia proton yang
mendorong sintesis ATP dalam stroma. Sebagai langkah terakhir dalam seri
reaksi ini, elektron yang berenergi tinggi (bersama-sama dengan H +) ke
NADP+, sehingga mengubahnya menjadi NADPH. Semua reaksi ini terbatas
pada kloroplas.
b. Dalam reaksi fiksasi karbon (juga disebut "reaksi gelap"), ATP dan NADPH
yang dihasilkan oleh reaksi transfer elektron fotosintesis berfungsi sebagai
sumber energi dan mengurangi tenaga, masing-masing, untuk mendorong
konversi CO2 menjadi karbohidrat . Reaksi fiksasi karbon yang dimulai pada
stroma kloroplas dan dilanjutkan dalam sitosol, menghasilkan sukrosa dan
banyak molekul organik lainnya dalam daun tanaman. Sukrosa tersebut
diekspor ke jaringan lain sebagai sumber
molekul organic kedua dan energi untuk
pertumbuhan.
Dengan demikian, pembentukan ATP,
NADPH, dan O2 (yang membutuhkan energi
cahaya langsung) dan konversi CO2 ke
karbohidrat (yang membutuhkan energi cahaya
hanya secara tidak langsung) adalah proses
terpisah (Gambar 5), meskipun mekanisme
umpan balik yang rumit antar dua interkoneksi.
6
D. Fixation Carbon Dikatalisis oleh Ribulosa bifosfat karboksilase
Kita telah melihat sebelumnya dalam bab ini bagaimana sel menghasilkan
ATP dengan menggunakan sejumlah besar energi bebas yang dilepaskan ketika
karbohidrat teroksidasi menjadi CO2 dan H2O. Jelas, karena itu, reaksi sebaliknya,
di mana CO2 dan H2O digabungkan untuk membuat karbohidrat, harus menjadi
salah satu yang sangat menguntungkan yang dapat terjadi hanya jika digabungkan
dengan yang lain, reaksi yang sangat menguntungkan yang mengendarainya.
Gambar 6 menggambarkan pusat reaksi dari fiksasi karbon, di mana
sebuah atom karbon anorganik diubah menjadi karbon organik: CO 2 dari atmosfer
digabungkan dengan senyawa lima karbon ribulosa 1,5-bifosfat ditambah air
untuk menghasilkan dua molekul tiga karbon dari senyawa 3-phosphoglycerate.
Reaksi "karbon-fixing" ini, yang ditemukan pada tahun 1948, adalah dikatalisis
dalam stroma kloroplas oleh enzim besar yang disebut ribulosa bifosfat
karboksilase. Karena setiap molekul kompleks bekerja lamban (pengolahan hanya
sekitar 3 molekul substrat per detik dibandingkan dengan 1000 molekul per detik
dari molekul enzim). Ribulosa bifosfat karboksilase seringkali merupakan lebih
dari 50% dari total protein kloroplas, dan diperkirakan menjadi protein yang
paling melimpah di Bumi.
E. Setiap Fiksasi Molekul CO2 Membutuhkan Tiga Molekul ATP dan Dua
Molekul NADPH
Reaksi sebenarnya di mana CO2 tetap penuh energi menguntungkan
karena reaktivitas dari energi yang kaya senyawa ribulosa 1,5-bifosfat, yang
7
ditambahkan pada masing-masing molekul CO2 ditambahkan (lihat Gambar 14-
39). Jalur metabolisme pathway yang rumit menghasilkan ribulosa 1,5-bifosfat
membutuhkan baik NADPH dan ATP. Siklus fiksasi karbon ini (disebut juga
siklus Calvin) adalah garis pada Gambar 14-40. Ini dimulai ketika 3 molekul CO2
yang difiksasi oleh ribulosa bifosfat karboksilase untuk menghasilkan 6 molekul
3-phosphoglycerate (mengandung 6 x 3 = 18 atom karbon dalam semua: 3 dari
CO2 dan 15 dari ribulosa 1,5-bifosfat). 18 atom karbon kemudian menjalani siklus
reaksi yang melahirkan kembali 3 molekul ribulosa 1,5-bifosfat yang digunakan
dalam langkah awal fiksasi karbon (mengandung 3 x 5 = 15 atom karbon). Hal ini
membuat 1 molekul gliseraldehida 3-fosfat (3 atom karbon) sebagai keuntungan
bersih.
Setiap molekul CO2 yang dikonversi menjadi karbohidrat membutuhkan
total 3 molekul ATP dan 2 molekul NADPH.
8
stroma kloroplas selama periode kapasitas fotosintesis berlebih. Hal ini terjadi
melalui reaksi dalam stroma yang merupakan kebalikan dari reaksi dalam
glikolisis: mereka mengkonversi glyceraldehydes 3-fosfat menjadi glukosa 1-
fosfat, yang kemudian digunakan untuk menghasilkan gula nukleotida ADP-
glukosa, prekursor langsung dari pati. Pada malam hari tanaman memecah pati
untuk membantu mendukung kebutuhan metabolisme tanaman. Strach
menyediakan bagian penting dari diet semua hewan yang memakan tumbuhan.
9
Fotorespirasi sangat dibutuhkan dan harus dilakukan pada tanaman yang
tumbuh di tempat yang panas atau kondisi kering, sehingga tanaman tersebut
dapat menutup stomata (pori-pori pertukaran gas dalam daun, (masing-masing
disebut stoma)) untuk menghindari kehilangan air yang berlebihan. Hal ini
mengakibatkan kadar CO2 dalam daun akan menurun, sehingga mendukung
fotorespirasi. Sebuah adaptasi khusus terjadi pada daun di banyak tanaman,
seperti jagung dan tebu, yang tumbuh di tempat yang panas dan lingkungan
kering. Pada tanaman ini, siklus fiksasi karbon hanya terjadi dalam kloroplas pada
sel khusus yaitu sel seludang berkas pengangkut (bundle sheath cells) yang
mengandung ribulosa bifosfat karboksilase. Sel-sel ini terlindung dari udara dan
dikelilingi oleh lapisan khusus dari sel mesofil yang menggunakan energi yang
didapat oleh kloroplas mereka untuk "memompa" CO2 ke dalam sel seludang
berkas pengangkut. Dengan adanya hal ini, maka akan mampu memasok ribulosa
bifosfat karboksilase dengan konsentrasi CO2 tinggi, sehingga sangat mengurangi
fotorespirasi.
Pompa CO2 dihasilkan oleh siklus reaksi yang dimulai dalam sitosol sel-
sel mesofil. Langkah fiksasi CO2 dikatalisis oleh enzim yang mengikat karbon
dioksida (sebagai bikarbonat) dan menggabungkannya dengan molekul aktif yaitu
molekul tiga karbon (phosphoenol-pyruvate) untuk menghasilkan molekul empat
karbon. Molekul empat karbon berdifusi ke dalam bundle sheath cells, yang akan
dipecah untuk melepaskan CO2 dan menghasilkan molekul dengan tiga karbon.
Siklus pompa akan berakhir ketika molekul tiga karbon ini dikembalikan ke sel
mesofil dan diubah kembali ke bentuk aslinya yang aktif. Karena CO2 awalnya
ditangkap dan diubah menjadi senyawa empat karbon, maka tanaman dengan
kondisi ini disebut tanaman C4. Sedangkan tanaman lain disebut tanaman C3
karena CO2 ditangkap kemudian diubah ke dalam senyawa tiga karbon 3-
phosphoglycerate (Gambar 8).
10
Gambar 8. Pompa CO2 pada tanaman C4
11
G. Fotosintesis Tergantung pada Fotokimia dari Molekul Klorofil
Reaksi-transfer elektron fotosintesis di kloroplas
menghasilkan ATP dan NADPH yang diperlukan untuk mendorong
produksi karbohidrat dari CO2 dan H2O. Sinar matahari diserap oleh
molekul klorofil memasok energi yang dibutuhkan. Proses konversi
energi dimulai ketika kuantum cahaya (foton) mengeksitasi molekul
klorofil, sehingga menyebabkan elektron dalam klorofil berpindah
dari molekul orbital yang satu ke molekul orbital lain yang
mempunyai energi yang lebih tinggi. Molekul yang tereksitasi tidak
stabil dan cenderung cepat kembali ke aslinya (ke bagian yang
tereksitasi pertama kali). Hal ini dapat terjadi pada salah satu dari tiga
cara berikut:
1. Dengan mengubah energi ekstra menjadi panas (gerakan molekul)
atau beberapa kombinasi dari panas dan cahaya dari panjang
gelombang yang lebih panjang (fluoresensi). Hal terjadi ketika
sebuah molekul klorofil terisolasi dalam larutan menyerap energi Gambar 9.
cahaya. Struktur Kimia
klorofil
2. Dengan mentransfer energi (tetapi bukan elektron) secara langsung
ke molekul klorofil tetangga/yang berada di dekatnya dengan proses yang
disebut transfer energi resonansi.
3. Dengan mentransfer elektron berenergi tinggi yang bermuatan negatif untuk
molekul lain di dekatnya, yaitu sebuah akseptor electron. Setelah itu, klorofil
bermuatan positif kembali ke keadaan semula untuk kembali ke bentuk aslinya
dengan sebuah elektron berenergi rendah dari beberapa molekul lain, yang
disebut donor elektron.
12
H. Sebuah Pusat Reaksi Fotokimia ditambah Kompleks Antena Membentuk
Sebuah Fotosistem
Kompleks multiprotein besar yang disebut fotosistem, mengkatalisis
konversi energi cahaya ditangkap dalam molekul klorofil yang tereksitasi menjadi
bentuk yang dapat digunakan/bermanfaat. Sebuah fotosistem terdiri dari dua
komponen yang terkait erat yaitu sebuah kompleks antena, yang terdiri dari ikatan
protein menjadi satu set besar molekul pigmen yang memungkinkan energi
cahaya untuk diubah menjadi energi kimia.
Kompleks antena berperan dalam menangkap energi cahaya. Dalam
kloroplas terdapat sejumlah kompleks membran protein yang berbeda (dikenal
sebagai kompleks pemanen cahaya), yang secara bersama-sama dapat mengikat
ratusan molekul klorofil per pusat reaksi. Hal ini terjadi di membran tilakoid.
Kompleks antena juga mengandung pigmen aksesori yang disebut carotenoids,
yang melindungi klorofil dari oksidasi dan dapat membantu mengumpulkan
cahaya dari panjang gelombang lain. Ketika cahaya mengeksitasi molekul klorofil
di kompleks antena, energi dengan cepat dipindahkan dari satu molekul ke yang
lain melalui transfer energi resonansi hingga sampai pada sepasang molekul
klorofil khusus di pusat reaksi fotokimia. Setiap kompleks antena bertindak
seperti sebuah corong, yang mengumpulkan energi cahaya dan secara langsung
mengikatnya pada site spesifik sehingga dapat digunakan secara efektif.
Pusat reaksi fotokimia adalah transmembran kompleks protein-pigmen
yang terletak di jantung fotosintesis. Hal ini diperkirakan telah berevolusi lebih
dari 3 milyar tahun yang lalu dalam bakteri fotosintesis primitif. Pasangan khusus
molekul klorofil di pusat reaksi bertindak sebagai perangkap ireversibel untuk
eksitasi quanta karena elektron yang tereksitasi segera dikirimkan ke rantai
elektron akseptor tetangga di kompleks protein (Gambar 11). Dengan
memindahkan elektron berenergi tinggi dengan cepat menjauhi klorofil, pusat
reaksi fotokimia mentransfernya ke lingkungan yang jauh lebih stabil. Dengan
demikian, elektron diposisikan sesuai untuk digunakan dalam reaksi selanjutnya.
Hal ini memerlukan lebih banyak waktu, dan hasil produksi dari cahaya yang
mengandung elektron berenergi tinggi diberikan ke dalam rantai transpor elektron.
13
Gambar 10. Komplek Antena dan reaksi fotokimia dalam fotosystem
Gambar 11. Elektron carier dalam reaksi fotokimia pada bakteri ungu
14
berdekatan untuk kembali ke bentuk tidak tereksitasi (Gambar 12). Dalam reaksi
lambat, donor elektron memiliki elektron pengganti yang hilang, sedangkan
elektron berenergi tinggi yang dihasilkan oleh klorofil yang terkesitasi ditransfer
ke rantai transpor elektron (Gambar 12). Energi eksitasi dalam klorofil biasanya
akan dilepaskan sebagai fluoresensi atau panas sehingga digunakan untuk
membuat donor elektron yang kuat (sebuah molekul yang membawa elektron
energi tinggi) yang sebelumnya tidak ada.
15
dua fotosistem dalam kloroplas tanaman yang lebih tinggi juga menghasilkan
kuinon yang membawa elektron energi tinggi. Namun, karena air memberikan
elektron untuk fotosistem ini, maka fotosintesis pada tumbuhan tidak seperti yang
ada pada bakteri ungu yang melepaskan sejumlah besar gas oksigen.
16
fotosistem II mengkatalisis reaksi 2H2O + 4foton 4H + 4e + O2. Mekanisme
ini memastikan bahwa tidak ada oksidasi molekul air yang dilepaskan sebagai
bahaya, seperti radikal oksigen yang sangat reaktif. Pada dasarnya semua oksigen
di atmosfer bumi telah diproduksi dengan cara ini.
Inti dari pusat reaksi di fotosistem II adalah homolog dengan pusat reaksi
bakteri dan juga menghasilkan elektron donor yang kuat dalam bentuk molekul
kuinon yang dilarutkan dalam lapisan membran lipid bilayer. Kuinon melewatkan
elektron ke pompa H+ yang disebut sitokrom b6-f-kompleks, yang menyerupai
sitokrom b-c1 kompleks dalam rantai respirasi pada mitokondria. Sitokrom b6-f-
kompleks memompa H+ ke dalam ruang tilakoid melintasi membran tilakoid (atau
keluar dari sitosol melintasi membran plasma dalam cyanobacteria), dan
menghasilkan gradien elektrokimia yang mendorong sinthesis ATP oleh ATP
sintase.
Akseptor elektron terakhir dalam rantai transpor elektron adalah
fotosistem tahap kedua, yaitu fotosistem I, yang menerima elektron ke dalam
lubang kekurangan elektron yang diciptakan oleh cahaya dalam molekul klorofil
pada pusat reaksinya. Setiap elektron yang masuk fotosistem I akhirnya didorong
ke level energi sangat tinggi yang memungkinkan untuk diteruskan ke pusat
17
sulfur-besi dalam ferredoxin dan kemudian ke NADP + untuk menghasilkan
NADPH.
18
fotosistem I, yang perubahan energinya dibutuhkan untuk melewatkan elektron
secara efisien dari air ke NADP+. Penggunaan dua fotosistem secara terpisah
membuat energi dari kuanta cahaya tersedia untuk hal ini. Selain itu, ada cukup
energi tersisa untuk mengaktifkan rantai elektron transportasi yang
menghubungkan dua fotosistem untuk memompa H+ melintasi membran tilakoid
(atau membran plasma cyanobacteria), sehingga sintase ATP dapat memanfaatkan
beberapa energi cahaya yang diturunkan untuk produksi ATP.
19
Kegiatan relatif arus elektron siklik dan nonsiklik diatur oleh sel untuk
menentukan berapa banyak energi cahaya yang diubah menjadi energy reduksi
(NADPH) dan berapa banyak yang diubah menjadi fosfat berenergi tinggi (ATP).
20
Gambar 18. Hubungan aliran H+ dan orientasi dari ATP sintase
di mitokondria dan kloroplas
21
Tahap pertama, electron berenergi tinggi (derivate dari oksidasi molekul
makanan, dari reaksi cahaya atau dari sumber lain) ditransfer sepanjang jalaur
pembawa electron di membran. Proses transpor elektron ini melepaskan energi
yang digunakan untuk memompa proton melewati membran sehingga
menyebabkan gradien elektrokimia proton. Gradien ion tersebut merupakan
bentuk simpanan energi yang dapat digunakan ketika ion tersebut kembali
mengalir berlawanan dengan membrane bawah gradien elektrokimia. Tahap
kedua, aliran H+ mengembalikan gradien elektrokimia melalaui mesin protein
yang disebut ATP sintase dengan katalis ATP dari ADP dan fosfat anorganik (Pi).
22
Gambar 20. Proses Transport Elektron
23
Meskipun perbedaan-perbedaan dalam jenis dan lokasi, komponen inti dari enzim
cenderung sangat mirip dalam semua organisme.
Seperti yang ditunjukkan oleh nama-nama dari berbagai jenis protein, ada
dua subunit utama untuk enzim sintesis ATP, FO dan F1. subunit FO O bukan
nol dinamakan demikian karena ia mengikat oligomycin, yang penting untuk
beberapa aspek sintesis ATP. Ini bagian dari ATP sintase yang tertanam dalam
membran mitokondria, sementara F1, yang hanya singkatan dari Fraksi 1, di
dalam matriks mitokondria itu. Ada kemungkinan bahwa subunit ini adalah, pada
satu waktu, protein benar-benar terpisah yang dimiliki, selama sejarah evolusi,
telah terintegrasi ke dalam satu struktur yang sangat lazim di alam.
Proses sintesis ATP memerlukan beberapa energi, dan enzim sintase ATP
dilengkapi untuk memenuhi kebutuhan ini. subunit FO menggunakan gradien
proton untuk menghasilkan energi yang diperlukan untuk sintesis aktual ATP,
yang terjadi dalam subunit F1. Sebuah gradien proton adalah jenis gradien
elektrokimia di mana energi potensial yang disebabkan oleh perbedaan muatan
melintasi membran yang digunakan untuk bahan bakar berbagai proses biokimia.
Kadang-kadang, gradien proton sebenarnya tujuan akhir, dalam kasus ini, ATP
sebenarnya bisa dikonsumsi untuk menyediakan energi yang diperlukan.
Struktur dan fungsi ATP sintase hampir sama pada semua organisme.
Subunit yang berbeda kadang-kadang terlibat, dan nomor dan pengaturan dari
subunit yang berbeda kadang-kadang digunakan, tetapi pada intinya, protein yang
domain dan proses biokimia yang terlibat sangat mirip. Kemiripan ini membuat
ATP sintase yang menarik dari sudut pandang evolusi. Kenyataan bahwa enzim
telah begitu terawat dengan baik di sebagian besar organisme sepanjang sejarah
menunjukkan bahwa struktur yang dikembangkan sangat awal dalam sejarah
evolusi. Para ahli biologi percaya bahwa dua subunit F yang membentuk inti dari
enzim benar-benar melayani fungsi sebagian besar yang awalnya tidak
berhubungan, tapi akhirnya mampu mengikat bersama untuk membentuk sintase
yang sangat berguna.
24
Gambar 21. Kompenen ATP Sintase
25
Jika kloroplas terisolasi dengan cara meninggalkan membran dalam
mereka secara utuh, membran ini dapat terbukti memiliki permeabilitas selektif,
yang mencerminkan adanya transporter tertentu. Paling menonjol, banyak
gliseraldehida 3-fosfat diproduksi oleh fiksasi CO2 di stroma kloroplas diangkut
keluar dari kloroplas oleh sistem antiport efisien yang mengubah gula fosfat tiga-
karbon untuk mengalirkan kea rah dalam dari fosfat anorganik.
Gliseraldehida 3-fosfat biasanya menyediakan sitosol dengan sumber yang
melimpah dari karbohidrat, dimana sel menggunakannya sebagai titik awal bagi
banyak biosyntheses-lain termasuk produksi sukrosa untuk ekspor. Tetapi disini
tidak semua molekul tersedia. Sekali gliseraldehida 3-fosfat mencapai sitosol, itu
dengan mudah diubah (oleh bagian dari jalur glikolisis) menjadi 1,3-
phosphoglycerate dan kemudian 3-phosphoglycerate, menghasilkan satu molekul
ATP dan salah satu NADH. Akibatnya, ekspor gliseraldehida 3-fosfat dari
kloroplas tidak hanya menyediakan sumber utama karbon tetap ke seluruh sel,
tetapi juga tenaga reduksi dan ATP yang dibutuhkan untuk metabolisme diluar
kloroplas.
BAB III
PENUTUP
26
A. Kesimpulan
1. Kloroplas adalah salah satu organel sel yang tergolong ke dalam plastida,
selain kromoplas (plastida berwarna) dan leukoplas (plastida tidak
berwarna). Di dalam sel tumbuhan, kloroplas berfungsi ibarat pabrik
energi. Kloroplas menyerap energi cahaya (matahari) dan mengubahnya
menjadi ATP (Adenosin Tri Phospat) melalui proses reaksi yang dikenal
dengan istilah fotosintesis.
2. Kloroplas menyerupai mitokondria tetapi mempunyai struktur lain yang
membedakannya. Dibandingkan dengan mitokondria, kloroplas
mempunyai membran internal tambahan (membran tilakoid) dan ruang
internal (ruang tilakoid). Proses transpor elektron terjadi di membran
tilakoid, untuk membuat ATP H+ dipompa ke dalam ruangan tilakoid, dan
arus balik H+ melalui ATP sintse kemudian menghasilkan ATP dalam
stroma kloroplas,yang berperan dalam reaksi biosintesis di kloroplas.
3. Fotosintesis atau fotosintesa merupakan proses pembuatan makanan yang
terjadi pada tumbuhan hijau dengan bantuan sinar matahari dan enzim-
enzim. Fotosintesis adalah suatu proses biokimia yang dilakukan
tumbuhan, alga, dan beberapa jenis bakteri untuk memproduksi energi
terpakai (nutrisi) dengan memanfaatkan energi cahaya.
B. Saran
Pembaca perlu mengkaji literatur lebih lanjut dan lebih luas lagi mengenai
kloroplas dan fotosintesis untuk menambah pengetahuan mengenai hal tersebut
karena dalam penyusunan makalah ini merujuk pada Bruce Alberts.
DAFTAR PUSTAKA
27
Alberts, dkk. 2008. Molecular Biology of The Cell Fifth Edition. Garland Science
Taylor & Francis Group: The United State of America
Campbell, dkk. 2009. Biology Eighth Edition. Pearson Benjamin Cummings: San
Fransisco.
28