Resume Genet II
Resume Genet II
dari ATP dengan aksi enzim adenilatase. AMP siklik berikatan dengan
protein CAP, kompleks CAP-cAMP yang mengikat ke situs CAP
promotor lac, merangsang pengikatan polimerase RNA ke tempat
pengikatannya di promotor lac, dengan tidak adanya jumlah cAMP
yang cukup (yang menghasilkan Alasan yang tidak diketahui dengan
adanya konsentrasi glukosa yang tinggi), CAP connot terikat pada
promotor lac dan operon lac tidak dapat diinduksi.
Hanya kompleks CAP-cAMP yang mengikat promotor lac, dengan tidak adanya
CAMP, CAP tidak mengikat CAMP ini bertindak sebagai molekul efektor, yang menentukan
efek CAP pada transkripsi lac operon. Konsentrasi cAMP intraseluler sensitif terhadap adanya
atau tidak adanya glukosa. Konsentrasi tinggi glukosa menyebabkan penurunan tajam pada
konsentrasi intraseluler cAMP. Glukosa hoe mengontrol konsentrasi cAMP tidak jelas.
Mungkin glukosa, atau beberapa metabolit yang terbentuk dengan adanya konsentrasi glukosa
yang cukup, menghambat aktivitas adenilatase. Enzim yang mengkatalisis pembentukan
cAMP dari ATP. Apapun mekanisme adanya glukosa menghasilkan penurunan konsentrasi
intraseluler cAMP. Dengan tidak adanya (atau di hadapan konsentrasi rendah) cAMP, CAP
tidak dapat mengikat promotor lac operon. Pada gilirannya, RNA polimerase tidak dapat
mengikat secara efisien ke promotor lac tanpa adanya CAP. Hasil keseluruhan dari kontrol
positif transkripsi operon lac oleh kompleks CAP-cAMP adalah bahwa dengan adanya
transkripsi glukosa, lac operon tidak pernah melebihi tingkat yang diinduksi yang tidak
diketahui dengan tidak adanya glukosa. Urutan pasangan molekul lengkap dari wilayah
peraturan lac operon (urutan promotor dan operator) sekarang diketahui. Studi urutan
nukleotida komparatif promoter dan opertor mutan dan wild type (plus in vitro CAP-cAMP,
RNA polimerase, dan teknik pengikatan represif) mulai memberikan informasi rinci tentang
sifat interaksi asam amino protein-nuclei penting ini. Studi ini memberikan contoh bagus
tentang keuntungan mengintegrasikan pendekatan genetik dan biokimia dalam usaha
memahami fenomena biologis.
urutan organisasi dan nukleotida wilayah Angka di bagian bawah memberikan jarak pada
operator promotor operon lac. promotor terdiri pasangan nukleotida dari ujung gen i (awal
dari dua komponen: (1) situs yang mengikat promotor). titik antara urutan rantai nukleotida
protein aktivator katabolisasi (disingkat CAP) - (di situs pengikatan CAP-cAMP) menunjukkan
siklik AMP atau cAMP) kompleks dan (2) situs pusat simetri palindrom yang tidak sempurna
pengikatan RNA polimerase. perhatikan bahwa yang squence dimana urutan nukleotida-
promotor dan operator (represor binding site) pasangan dibaca hampir sama di kedua arah
tumpang tindih sedikit. Segmen yang (diikat oleh palang sejajar). Ini adalah situs
berdekatan dari i represor dan i β-galaktosidase potensial interaksi utama dengan kompleks
gen struktural juga ditunjukkan. mRNA CAP-cAMP.
berlabel linc horizontal menunjukkan posisi di
mana transkripsi operon dimulai (5 'akhir
mRNA).
Hampir semua rincian tentang mekanisme dimana operan lac dan trp diketahui dan
didukung oleh kumpulan data eksperimental yang ekstensif. Namun, operon lain seperti operon
araabinosa (ara) dari E.coli menunjukkan patokan peraturan yang jauh lebih kompleks yang
masih belum sepenuhnya dipahami. Dalam operon lac dan trp, produk dari gen regulator,
represor, berfungsi dengan cara yang negatif, mematikan transkripsi operon. Di sisi lain,
protein aktivator katabolisme (CAP) memberikan kontrol positif terhadap operon lac dengan
merangsang transkripsi operon. Protein pengatur utama dari operon ara menunjukkan efek
regulasi negatif dan positif pada transkripsi gen struktural operon tergantung pada kondisi
lingkungan. Selain itu, komponen peraturan yang mengendalikan transkripsi operon ara
mencakup satu elemen yang bertindak karena lebih dari 200 pasangan nukleotida dari promotor
yang membantu mengendalikannya. Meskipun semua rincian sirkuit peraturan operan ara
belum ditetapkan secara jelas, model kerja saat ini dipresentasikan di sini untuk memberi siswa
sebuah penghargaan atas kompleksitas peraturan beberapa operon bakteri.
Operon E. coli arabinosa (ara) mengandung tiga gen struktural (araB, araA dan araD)
yang mengkodekan tiga enzim yang terlibat dalam katabolisme arabinosa. Ketiga gen ini
ditransversikan pada mRNA tunggal yang dimulai pada promotor yang disebut PBAD .
(Transport aktif arabinosa ke dalam sel dilakukan dengan produk gen arE, araB dan araG.
Gen ini berada di lokasi yang cukup jauh dari operon araBAD yang diminati di sini dan tidak
akan dibahas lebih jauh. Protein pengatur utama dari operon ara (protein araC) dipetik dari
transkrip yang dimulai pada promotor yang disebut Pc. Promotor Pc hanya sedikit di atas 100
pasang nukleotida dari Pbad, namun kedua promotor memprakarsai transkripsi dalam arah
yang berlawanan. Protein araC bertindak sebagai regulator negatif (resresor) transkripsi gen
struktural araB, araA, dan araD dari promotor Pbad saat arabinose dan CAMP hadir. Dengan
demikian, tergantung pada ada tidaknya molekul efektor arabinosa dan CAMP, produk gen
pengatur araC dapat memberikan efek positif atau negatif pada transkripsi gen struktural araB,
araA, dan araD. Karena operon ara tunduk pada represi katabolit seperti operon lac (lihat bagian
sebelumnya), dan dengan demikian mengendalikan positif CAP dan CAMP, induksi operon
ara bergantung pada efek regulasi positif dari dua protein, protein araC dan CAP (Protein
penggerak catabolite pengikatan CAMP). Situs pengikat untuk kedua protein ini dan untuk
RNA polimerase semuanya nampak terletak di wilayah operon ara yang secara historis disebut
araI (I untuk induksi), terletak di antara tiga gen struktural operon dan gen regulator (araC)
Awalnya, para ilmuwan yang mempelajari peraturan operon ara berpikir bahwa semua
situs pengikat protein pengatur araC dan kompleks CAMP-CAP berada di wilayah ara I.
Penemuan yang mengejutkan adalah bahwa penindasan operon ara bergantung pada
pengikatan protein araC di sebuah situs yang disebut araO2 (O untuk operator, 2 karena
merupakan operator ara kedua yang diidentifikasi) yang terletak 211 pasang nukleotida di hulu
(relatif terhadap arah transkripsi Dari Pbad) dari situs pengikat protein araC di araI. (Operator
araO1 - operator ara pertama yang diidentifikasi - mengendalikan transkripsi gen peraturan
araC yang dimulai di Pc). Model yang sekarang diterima untuk penindasan operon ara adalah
protein araC harus diikat (sebagai dimer) di situs ara I dan situs araO2, dan bahwa protein ini
kemudian saling mengikat dari loop DNA. Sebenarnya, sekarang ada evedensi yang cukup
besar dalam mendukung model ini. Misalnya, jika lima pasang nukleotida diikutsertakan atau
dihapus di wilayah antara ara I, dan ara02, represi normal operon tidak dapat terjadi. Penyisipan
atau penghapusan semacam itu akan memutar satu situs pengikat protein araC di tengah heliks
ganda (berlawanan muka) dibandingkan dengan tempat pengikatan protein araC lainnya. Ini
mungkin akan menyulitkan atau tidak mungkin bagi dimer araC yang terikat pada ara I dan
araO2 untuk berinteraksi dan dari lingkaran yang diperlukan untuk represi.
Dengan jelas, regulasi transkripsi operon ara E.coli jauh lebih kompleks daripada
regulasi transkripsi operon lac dari bakteri ini. Akan menarik untuk menentukan apakah
mekanisme pembentukan loop ini biasanya ditaati dalam regulasi transkripsi operon lain dalam
prokariota atau gen pada eukariota.
Pertanyaan
1. Bagaimana operon yang dapat diinduksi dan represif dibedakan? (Hanif
Amirusdi P
Jawab :Dengan tidak adanya molekul efektor, dapat diinduksi Operon akan dimatikan,
sedangkan operon yang tertindas akan dihidupkan.
2. Apa aja macam operon yang diatur oleh atenuasi ? (Hanif Amirusdi Puteno)
Jawab :. Enam operon (trp, tbr, ilv, leu, phe, dan his) diketahui diatur oleh atenuasi
namaun, Pengaturan transkripsi dengan atenuasi tidak terlepas dari operon trp, dari ini,
trp dan mungkin juga diatur oleh represi. his operon. Yang telah lama dianggap dapat
ditindas sekarang diyakini diatur sepenuhnya oleh atenuasi. Meskipun detail kecil
bervariasi dari operon ke operon. Fitur utama redaman sama untuk semua enam operon.