Abstrak
Asam nukleat adalah molekul panjang yang terbuat dari molekul yang lebih kecil yang disebut
nukleotida. Asam nukleat merupakan makromolekul biokimia yang menyimpan dan mentransfer
informasi genetik dalam sel. Fungsi asam nukleat antara lain yaitu menyimpan dan mentransfer
informasi genetik, serta menggunakan informasi genetik untuk mengarahkan sintesis protein baru. Dua
jenis utama asam nukleat yaitu DNA (deoxyribonucleic acid) dan RNA (ribonucleic acid). Fungsi DNA
secara umum adalah untuk menyimpan dan menentukan karakteristik biologis pada setiap mahkluk
hidup yang sesuai dengan pengaturan koneksi pada molekul yang sangat spesifik, sedangkan fungsi
umum RNA yaitu untuk membawa salinan dasar DNA suatu organisme ke dalam protein baru
pembentuk sel. RNA mempunyai berbagai macam jenis dengan fungsi yang beragam pula, antara lain
mRNA, tRNA, rRNA, dan miRNA.
Kata Kunci: Fungsi, asam nukleat, nukleotida, RNA, DNA, jenis RNA, protein.
Pembahasan
1. Definisi Asam Nukleat
Asam nukleat merupakan senyawa kimia yang terbentuk secara alami yang mampu dipecah
untuk menghasilkan asam fosfat, gula, dan campuran basa organik (purin dan pirimidin). Asam
nukleat adalah molekul pembawa informasi utama dari sel, dan dengan mengarahkan proses
sintesis protein, mereka menentukan karakteristik yang diwariskan dari setiap makhluk hidup.
Dua kelas utama asam nukleat adalah asam deoksiribonukleat (DNA) dan asam ribonukleat
(RNA). DNA merupakan blueprint utama untuk kehidupan dan merupakan bahan genetik dalam
semua organisme yang hidup bebas dan juga sebagian besar virus. RNA adalah bahan genetik
virus tertentu, tetapi juga ditemukan di semua sel hidup, di mana ia memainkan peran penting
dalam proses tertentu seperti pembuatan protein.
Messenger RNA (mRNA) adalah subtipe dari RNA. Molekul mRNA membawa sebagian
kode DNA ke bagian lain sel untuk diproses. mRNA dibuat selama transkripsi. Selama
proses transkripsi, satu untai DNA didekodekan oleh RNA polimerase, dan mRNA disintesis.
Secara fisik, mRNA adalah untai nukleotida yang dikenal sebagai asam ribonukleat, dan
beruntai tunggal, seperti yang ditunjukkan pada gambar 2.2.
2.2.2. t-RNA
2.2.3. r-RNA
Ribosomal ribonucleic acid (rRNA) adalah komponen RNA dari ribosom, dan sangat
penting untuk sintesis protein di semua organisme hidup. rRNAmerupakan RNA dengan
jumlah terbanyak dan penyusun ribosom. RNA ini berupa pita tunggal, tidak bercabang, dan
fleksibel, yang ditunjukkan pada gambar 2.4. Lebih dari 80% RNA merupakan rRNA.
Sebenarnya, RNA ribosom (rRNA) tidak menghasilkan protein. rRNA membuat polipeptida
(rakitan asam amino) yang membentuk protein. rRNA terletak di sitoplasma sel, tempat
ribosom ditemukan.
2.2.4. mi-RNA
MikroRNA (miRNA) merupakan RNA yang tidak menyandi (non-coding RNA).
MicroRNA (miRNA) awalnya ditemukan di Caenorhabditis oleh Victor Ambros pada tahun
1993 ketika mempelajari gen lin-14. Pada saat yang sama, Gary Ravkun mengidentifikasi
gen target miRNA pertama. Dua penemuan inovatif tersebut berhasil mengidentifikasi
mekanisme baru regulasi gen posttranskripsi.
2.2.5. si-RNA
siRNA merupakan singkatan dari small interfering Ribonucleic Acid. SiRNA memiliki
panjang 20-25 bp, adalah molekul RNA untai ganda pendek. siRNA telah digunakan sebagai
terapi yang menjanjikan untuk antivirus, antikanker, atau penyakit genetik lainnya. Saat ini,
aplikasi siRNA dalam biomedis masih terbatas karena tingginya biaya, risiko mutasi, efek
onkogenik, serta siRNA yang tidak dapat memasuki sel dengan sendirinya.
2.2.6. RNAi
Interferensi RNA (RNAi) adalah proses penting, yang digunakan oleh banyak
organisme berbeda untuk mengatur aktivitas gen. RNAi dianggap sebagai mekanisme
pertahanan alami yang telah berevolusi untuk melindungi organisme dari virus RNA. Sel
dapat mengenali RNA untai ganda (dsRNA) sebagai pengganggu. Ketika hal ini terjadi,
enzim Dicer bekerja untuk memotong RNA asing menjadi potongan-potongan kecil yang
disebut siRNA. Potongan RNA ini terdiri dari sekitar 22 nukleotida panjangnya. Satu untai
siRNA kemudian berikatan dengan mRNA virus target secara spesifik berurutan. Hal ini
menciptakan sinyal untuk menghancurkan mRNA, sehingga mengganggu produksi lebih
lanjut dari protein virus yang diperlukan untuk mereplikasi virus.
2.2.7. s-RNA
Ketika pemahaman tentang transkripsi bakteri terus berkembang, menjadi jelas bahwa
small non-coding RNA (sRNA) memainkan peran regulasi yang sangat penting. Panjang
sRNA biasanya 50-400 nukleotida, sRNA pasca transkripsi mengatur ekspresi gen, biasanya
dengan memasangkan basa dengan satu atau lebih target mRNA. sRNA memberikan
keuntungan lebih daripada regulator protein karena mereka bertindak cepat, relatif murah
secara metabolik, dan menyediakan cara tambahan untuk menanggapi sinyal lingkungan.
2.2.8. sn-RNA
Small nuclear RNA (snRNA) adalah salah satu dari banyak spesies RNA kecil yang
dibatasi oleh nukleus; beberapa snRNA terlibat dalam splicing atau reaksi pemrosesan RNA
lainnya. snRNAs ini, seperti halnya dengan bentuk-bentuk non-coding RNA dalam inti, tidak
pernah menghasilkan protein tetapi memainkan peran penting dalam memfasilitasi dan
mengatur aktivitas genetik.
2.2.9. RNA switches
Riboswitch pertama kali ditemukan dalam sistem alami. Pergantian RNA yang terjadi
secara alami ini biasanya ditargetkan ke arah metabolit umum, mengubah aktivitas genetik
sebagai respons terhadap keadaan metabolisme sentral, dan dianggap memainkan peran
penting dalam mempertahankan homeostasis dengan memberikan mekanisme pengaturan
umpan balik positif atau negatif. Riboswitch alami telah ditemukan yang mengubah stabilitas
struktur sekunder untuk mengubah laju berbagai proses ekspresi gen, termasuk pemutusan
transkripsi, inisiasi terjemahan, dan degradasi transkrip.
2.2.10. Catalytic RNA
Ribozim adalah enzim asam ribonukleat (RNA) yang dapat mengkatalisasi reaksi kimia.
Ribozim mengkatalisasi reaksi spesifik dengan cara yang mirip dengan enzim protein.
Disebut juga RNA katalitik, ribozim ditemukan dalam ribosom di mana mereka bergabung
dengan asam amino bersama untuk membentuk rantai protein. Ribozim juga berperan
dalam reaksi-reaksi vital lainnya seperti splicing RNA, transfer biosintesis RNA, dan replikasi
virus.
2.2.11. Sca RNA
Cajal body-specific RNAs (scaRNAs) adalah kelas RNA nukleolar kecil (snoRNAs) yang
secara khusus terlokalisasi ke tubuh Cajal, sebuah organel nuklir yang terlibat dalam
biogenesis ribonucleoprotein nuklir kecil (snRNPs atau snurps). ScaRNA memandu
modifikasi (metilasi dan pseudouridilasi) dari RNA polimerase II yang mentranskripsikan
RNA spliceosomal U1, U2, U4, U5, dan U12.
2.2.12. RNA p
RNA polimerase adalah enzim yang bertanggung jawab untuk menyalin urutan DNA
ke dalam urutan RNA, pada saat proses transkripsi. Sebagai molekul kompleks yang terdiri
dari subunit protein, RNA polimerase mengontrol proses transkripsi, di mana informasi yang
disimpan dalam molekul DNA disalin ke dalam molekul baru mRNA. Transkripsi merupakan
langkah penting dalam menggunakan informasi dari gen dalam DNA kita untuk membuat
protein. Protein adalah molekul kunci yang memberi struktur sel dan membuatnya tetap
berjalan.
3. Fungsi Asam Nukleat
3.1. Fungsi DNA
3.1.1. Kumpulan Informasi
DNA berfungsi untuk membawa informasi genetik. Informasi dalam DNA disimpan
sebagai kode yang terdiri dari empat basis kimia: adenin (A), guanin (G), sitosin (C), dan
timin (T). DNA manusia terdiri dari sekitar 3 miliar basa, dan lebih dari 99% basa sama pada
semua orang. Urutan dari basa-basa ini menentukan informasi yang tersedia untuk
membangun dan memelihara suatu organisme.
Basa DNA berpasangan satu sama lain, A dengan T dan C dengan G, untuk
membentuk unit yang disebut pasangan basa. Setiap basa juga melekat pada molekul gula
dan molekul fosfat. Bersama-sama, basa, gula, dan fosfat disebut nukleotida. Nukleotida
disusun dalam dua untaian panjang yang membentuk spiral yang disebut heliks ganda.
Struktur double helix agak seperti tangga, dengan pasangan basa membentuk anak tangga
dan molekul gula dan fosfat membentuk potongan sisi tangga vertikal.
3.1.2. Pengendali Aktivitas Sel
Bukan DNA itu sendiri yang mengontrol fungsi seluler, melainkan protein yang
dikodekan oleh DNA. Urutan nukleotida yang membentuk DNA adalah "kode" bagi sel untuk
membuat ratusan jenis protein; protein inilah yang berfungsi untuk mengendalikan dan
mengatur pertumbuhan sel, pembelahan, komunikasi dengan sel lain dan sebagian besar
fungsi seluler lainnya. Inilah sebabnya mengapa DNA dikatakan untuk "membawa" atau
"menyimpan" informasi dalam bentuk urutan nukleotida.
3.1.3. Fungsi Evolusioner
Salah satu fungsi utama dari setiap materi herediter adalah untuk direplikasi dan
diwariskan. Untuk menciptakan generasi baru, informasi genetik perlu diduplikasi dan
ditransmisikan secara akurat. Struktur DNA memastikan bahwa informasi yang dikodekan
dalam setiap untaian polinukleotida direplikasi dengan akurasi yang baik.
Perubahan urutan nukleotida dalam materi genetik memungkinkan pembentukan
alel baru. Alel adalah gen yang memiliki lokus (posisi pada kromosom) yang sama, tetapi
memiliki sifat bervariasi yang disebabkan mutasi pada gen asli. Misalnya, orang yang
memiliki golongan darah B memiliki gen tertentu yang menghasilkan protein permukaan
tertentu pada sel darah merah. Protein ini berbeda dari antigen permukaan pada mereka
yang memiliki golongan darah A. Demikian pula, orang dengan anemia sel sabit memiliki
alel hemoglobin yang berbeda dibandingkan dengan mereka yang tidak menderita penyakit
tersebut.
Kehadiran variabilitas ini memungkinkan setidaknya beberapa populasi untuk
bertahan hidup ketika ada perubahan tiba-tiba dan drastis ke lingkungan. Misalnya, orang
yang membawa alel bermutasi untuk hemoglobin berisiko mengalami anemia sel sabit.
Namun, mereka juga memiliki peluang lebih tinggi untuk bertahan hidup di daerah di mana
ada penyakit malaria. Mutasi dan adanya variabilitas ini memungkinkan populasi untuk
berevolusi dan beradaptasi dengan keadaan yang berubah.
3.1.4. Pengontrol Sintesis Melalui RNA
Protein terdiri dari rantai asam amino. Jenis dan urutan asam amino menentukan
jenis protein. DNA mengontrol produksi protein yang berbeda, yang disebut sintesis protein.
Kode untuk membuat protein berasal dari gen, yang merupakan bagian kecil dari DNA.
Setiap gen bertindak sebagai kode atau serangkaian instruksi untuk membuat protein
tertentu.
Sebagian besar gen mengandung informasi yang dibutuhkan untuk membuat
molekul fungsional yang disebut protein. (Beberapa gen menghasilkan molekul lain yang
membantu sel menyusun protein.) Perjalanan dari gen ke protein sangat kompleks dan
dikontrol secara ketat di dalam setiap sel. Hal terdiri dari dua langkah utama: transkripsi dan
translasi.
Asam nukleat adalah polimer dari monomer nukleotida. Setiap nukleotida terdiri dari tiga
bagian: gula 5 karbon, gugus fosfat, dan basa nitrogen. Seperti monosakarida, nukleotida dan
rantai nukleotida pendek melakukan fungsi seluler yang penting. Adenosine triphosphate (ATP)
adalah pembawa energi penting dalam organisme hidup. ATP terdiri dari adenin, gula ribosa,
dan tiga gugus fosfat yang terikat secara berurutan. Ikatan dari tiga gugus fosfat anionik dalam
satu baris memaksa beberapa ion negatif menjadi berdekatan, suatu keadaan yang tidak
menguntungkan. Reaksi yang menghilangkan kelompok fosfat terluar (membentuk adenosin
difosfat, atau ADP) melepaskan energi untuk digunakan dalam reaksi kimia lainnya. Dinukleotida
seperti NAD+, NADP+, dan FAD bertindak sebagai koenzim, menghasilkan energi dengan
mentransfer elektron dari satu reaksi ke reaksi lainnya.
3.5. Koenzim
Nukleotida adalah senyawa kimia dengan tiga komponen: basa yang mengandung nitrogen,
gula pentosa, dan satu atau lebih gugus fosfat. Meskipun dikenal sebagai unit struktural asam
nukleat, DNA dan RNA, yang menyimpan dan mentransfer informasi genetik dalam organisme,
nukleotida berpartisipasi dalam hampir semua proses biokimia. Salah satu fungsi nukleotida ini
adalah sebagai koenzim. Koenzim adalah molekul organik non-protein yang membantu enzim
dalam mengkatalisasi reaksi spesifik.
Molekul yang mengandung adenin juga merupakan koenzim penting, yang berfungsi
membawa gugus fungsi kimiawi yang dibutuhkan untuk aktivitas enzim. Tiga koenzim penting
yang mengandung adenosin adalah koenzim A (CoA), FAD, dan NAD+. CoA membawa
kelompok asetil ke dalam siklus Krebs (jalur metabolisme sentral di mitokondria), dan FAD dan
NAD+ membawa elektron berenergi tinggi dari siklus Krebs ke sistem transportasi elektron, di
mana energi mereka digunakan untuk mensintesis ATP dari ADP dan fosfat anorganik.
Kesimpulan
Asam nukleat adalah molekul pembawa informasi utama dari sel, dan dengan mengarahkan
proses sintesis protein, mereka menentukan karakteristik yang diwariskan dari setiap makhluk hidup.
Fungsi asam nukleat antara lain adalah pembentuk dasar molekul, koenzim, pembawa energi, serta
fungsi sebagai RNA dan DNA. Dua jenis utama asam nukleat yaitu DNA (deoxyribonucleic acid) dan
RNA (ribonucleic acid). DNA adalah asam nukleat beruntai ganda yang mengandung informasi genetik
makhluk hidup.RNA adalah molekul polimer yang terlibat dalam berbagai peran biologis untuk
mengkode, dekode, regulasi, dan ekspresi gen. Fungsi DNA secara umum adalah untuk menyimpan
dan menentukan karakteristik biologis pada setiap mahkluk hidup yang sesuai dengan pengaturan
koneksi pada molekul yang sangat spesifik. Fungsi umum RNA yaitu untuk membawa salinan dasar
DNA suatu organisme ke dalam protein baru pembentuk sel. RNA memiliki berbagai jenis yang memiliki
fungsi yang berbeda-beda pula, antara lain mRNA, tRNA, rRNA, miRNA, siRNA, sRNA, dan scnRNA.
Daftar Pustaka
Encyclopedia Britannica. (2019). Nucleic acid | chemical compound. [online] Available at:
https://www.britannica.com/science/nucleic-acid [Accessed 19 Feb. 2019].
Nature.com. (2019). mRNA / messenger RNA | Learn Science at Scitable. [online] Available at:
https://www.nature.com/scitable/definition/mrna-messenger-rna-160 [Accessed 19 Feb. 2019].
Wiley.com. (2019). Concepts in Biochemistry - Structure Tutorials. [online] Available at:
https://www.wiley.com/college/boyer/0470003790/structure/tRNA/trna_intro.htm [Accessed 19 Feb.
2019].
R Burke, C. (2012). Catalytic RNA. [online] Available at: http://www.els.net/WileyCDA/ElsArticle/refId-
a0000870.html [Accessed 19 Feb. 2019].
Nelson, David L., and Michael M. Cox. (2000). Nucleotides and Nucleic Acids In Lehninger Principles
of Biochemistry, 3rd ed. New York: Worth Publishers
Newworldencyclopedia.org. (2019). Nucleotide - New World Encyclopedia. [online] Available at:
http://www.newworldencyclopedia.org/entry/Nucleotide#Several_nucleotides_function_as_coenzymes
[Accessed 19 Feb. 2019].
Fotedar, D. (2019). Difference Between mRNA, tRNA and rRNA | KnowsWhy.com. [online]
Knowswhy.com. Available at: https://www.knowswhy.com/difference-between-mrna-trna-and-rrna/
[Accessed 19 Feb. 2019].