Mutasi kromosom mengakibatkan perubahan struktur sel bakteri antara lain perubahan struktur ribosom yang berfungsi sebagao target site perubahan struktur dinding sel atau membran plasma menjadi impermeabel terhadap obat, perubahan reseptor permukaan dan hilangnya dinding sel bakteri menjadi bentuk L (L-form) atau sferoplast (sudigdoadi, 2001)
B. Resistensi dengan perantaraan plasmid
Plasmid adalah elemen genetik ekstra kromosom yang mampu mengadakan replikasi secara otonom. Pada umumnya plasmid membawa gen pengkode resisten antibiptika. Gen yang berlokasi pada plasmid lebih mobil bila dibandingkandengan yang berlokasi pada kromosom. Oleh karena itu gens resistensi yang berlokasi pada plasmid dapat di transfer dari satu sel ke sel lainnya. (sudigdoadi, 2001)
C. Resistensi dengan perantaraan transposon
Transposon dapat berupa insertion squence dan transpososn kompleks. Transposon adalah struktur DNA yang dapat bermigrasi melalui genom suatu organisme. Struktur ini bisa merupakan bagian dari plasmid dan bakteriofage tapi dapat juga berasal dri kormosom.