SEQUENCE SCANNER
Abu abu
Merah : dipotong, namun tidak wajib, karen saat dipotong akan menghasilkan hasil alignment
yang sangat bebeda
Kuning:
Biru :hasil yang digunakan untuk sequencing
TRIMING
Disimpan bentuk fasta
BIOEDIT
CONTING
BLAST
NUCLEOTIDE BLAST, CHOOSE FILE, blast
Standar minimum tracee hold, disesuaikan dengan kajianmasing masing
<99% merupakan spesies baru.
ANALISIS SEQUENCE SELESAI
2. FILOGENETIK
Membandingkan taksa, sehingga bisa tau organisme tsb berasal dari nenek moyang yg sama
atau bukan.
Fenetik, tidak dibandingkan berdasarkan kekerabatan, hanya similaritasnya. Bisa
menggunakan karakter fenotip selain DNA.
MARKER
IN GROUP :
OUT GROUP:
TAKSON YANG TIDAK MEMILIKI KEKERABATAN DG TAKSA IN GROUP, BISA DAIAMBIL
DARI GENUS LAIN
BUKAN BAGIAN DARIPADA INGROUP DAN MEMPUNYAI SESUATU YG BERBEDA DARI
FILOGENI MEGA
3. HAPLOTYPE
Mengetahui adanya similaritas antar spesies. DNAsp dan Network
Semakin Mendekati 1 maka kekerabatannya semakin jauh.