1.

SEQUENCE SCANNER
Abu abu
Merah : dipotong, namun tidak wajib, karen saat dipotong akan menghasilkan hasil alignment
yang sangat bebeda
Kuning:
Biru :hasil yang digunakan untuk sequencing

TRIMING
Disimpan bentuk fasta

BIOEDIT
CONTING

DOUBLE KLIK CONTIG

COPAS DAN DIDAPATKAN HASIL SEQUENS DNA -> FORMAT FASTA

DISIMPAN FORMAT FASTA

BLAST
NUCLEOTIDE BLAST, CHOOSE FILE, blast
 Standar minimum tracee hold, disesuaikan dengan kajianmasing masing
<99% merupakan spesies baru.
ANALISIS SEQUENCE SELESAI

2. FILOGENETIK
Membandingkan taksa, sehingga bisa tau organisme tsb berasal dari nenek moyang yg sama
atau bukan.
 Fenetik, tidak dibandingkan berdasarkan kekerabatan, hanya similaritasnya. Bisa
menggunakan karakter fenotip selain DNA.

MARKER

IN GROUP :
OUT GROUP:
 TAKSON YANG TIDAK MEMILIKI KEKERABATAN DG TAKSA IN GROUP, BISA DAIAMBIL
DARI GENUS LAIN
 BUKAN BAGIAN DARIPADA INGROUP DAN MEMPUNYAI SESUATU YG BERBEDA DARI

ALLIGNMRNT DENGAN MEGA

FILOGENI MEGA
3. HAPLOTYPE
Mengetahui adanya similaritas antar spesies. DNAsp dan Network
Semakin Mendekati 1 maka kekerabatannya semakin jauh.