Nama : Ditha Ayunda Amelia

NIM : 1711012220001
Mata Kuliah : Metabolisme Biomolekuler

Protocadherin-10
Protein yang digunakan untuk melihat interaksi ligan terhadap molekul protein pada tulisan
ini adalah protocadherin-10. Ia merupakan protein yang ada pada manusia dengan kode PDH10.
Ada beberapa nama lain dari protein ini antara lain OL-PDH dan PDH19. Gen ini termasuk
dalam family gen protocadherin yang merupakan subfamily dari super cadherin. M-RNA
mengkodekan pemikiran reseptor neuron terkait cadherin untuk memainkan peran dalam
pembentukan dan fungsi koneksi sel-sel tertentu di otak. Adapun bentuk dari protein secara 3D
yaitu sebagai berikut.

Pada struktur protein ini terdapat 25 jenis ligan yang merupakan asam amino. Salah satu ligan
yang disoroti pada tulisan ini adalah ligan dengan kode [NAG]702:A dengan struktur sebagai
berikut.
Jenis ikatan yang terjadi pada ligan tersebut adalah ikatan hidrogen yang ditandai dengan garis
putus-putus berwarna biru. Ikatan ini menghubungkan antar 2 asam amino NAG (N-
asetilglukosamin). Menurut Yuwono (), ikatan hidrogen banyak terdapat dalam suatu sistem
biologis salah satunya dalam protein. Ikatan ini menyebabkan terjadinya pasangan antar-untaian
(interstrand) antarbasa nukleotida. Pada protein ikatan ini terjadi antara gugus NH dan O pada
rantai utama α-heliks. Gugus O pada residu asam amino n berikatan hidrogen dengan gugus NH
pada residu n + 4.