multicenter fBIRN
T karakteristik
dia sinyal / noise rasio
magnetik
mempelajari populasi subjek yang beragam
Iowa GE 1.5 CV / i TR quadrature head UNM Siemens 1.5 Sonata RO quadrature head UMN Siemens 3.0 Trio TR quadrature head MGH
Siemens 3.0 Trio TR quadrature kepala Duke / UNC GE 4.0 NV / i TR quadrature kepala Duke / UNC GE 1.5 NV / i TR quadrature kepala BWH
GE 3.0 VH / i GE TR Riset Coil UCSD Siemens 1.5 Symphony RO quadrature head UCI Phillips / Picker 1.5 Eclipse RO kepala quadrature
Stanford GE 3.0 CV / NVi Kepala quadrature elips UCLA Siemens 3.0 Allegro TR kepala quadrature
inisiatif yang berfokus padainfrastruktur cyber yang
olaborasi ilmu biomedis berskala besar dengan
yang mungkin tidak tersedia di setiap lokasi; (2) memanfaatkanmuncul (jaringan berkecepatan tinggi,
kemampuan untuk mengumpulkan kelompok besar stribusi komputasi kinerja tinggi, dan yang
subjek dengan cara yang cukup cepat; (3) kemampuan perlukan). kemampuan perangkat lunak dan integrasi
untuk menggeneralisasi temuan, atau membatasi ata). Inisiatif fBIRN termasuk tim dari 11
temuan hanya pada jenis tertentu; (4) ini memberikan boratorium penelitian yang berlokasi di The
peluang untuk membandingkan metode analisis niversity of Iowa (Iowa), Rumah Sakit Umum
gambar jika data dibagikan antara situs. Massachusetts (MGH), Rumah Sakit Brigham dan
Melakukan studi di seluruh lokasi dan Wanita (BWH), Pusat Medis Universitas Duke (Duke),
menggabungkan data membutuhkan pemahaman niversitas North Carolina ( UNC), Universitas
tentang perbedaan kualitas gambar yang timbul dari alifornia Irvine (UCI), Universitas California Los
pengumpulan data di seluruh pabrikan, kekuatan ngeles (UCLA), Universitas California San Diego
lapangan, gulungan gradien, dan gulungan RF. UCSD), Universitas New Mexico (UNM), Universitas
Perbedaan dalam distorsi gambar, kehalusan gambar, Minnesota (UMN), dan Stanford. Kelompok ini
rasio signal-to-noise, dan implementasi urutan dapat mempelajari disfungsi otak regional yang berkaitan
menghasilkan data yang sulit untuk digabungkan. engan perkembangan dan pengobatan skizofrenia.
Misalnya, pada 3 T, dibandingkan dengan 1,5 T, kami Sejauh pengetahuan kami, ada sangat sedikit
berharap bahwa sinyal MR akan lebih besar, sehingga ekerjaan yang diterbitkan tentang komparabilitas
memberikan gambar dengan SNR superior. emindaian yang diperoleh di seluruh situs dan vendor.
Data yang digunakan dalam penelitian ini aat ini, salah satu deskripsi yang lebih baik dari
dikumpulkan sebagai bagian dari Penelitian Pencitraan erbedaan dalam urutan pencitraan anatomi dan
Fungsional Skizofrenia Testbed Biomedical engukuran volumetrik yang dihasilkan di seluruh
Informatics Research Network (fBIRN). BIRN adalah rutan pulsa adalah kuantifikasi kesalahan pengukuran
National Institutes of Health (NIH) YNational Center ada
for Research Resources (NCRR) yang disponsori
Iowa 1.5 70 4,000 12 220 Â 220 256 192 192 122 4,0 1 T / R Head UNM 1.5 70 4.000 11 220 Â 220 256 Â 192 130 4.0 1 R / O Head UMN 3.0 68
4,000 13 220 Â 165 256 Â 192 145 4.0 1 Head T / R MGH 3.0 15 7,850 7 220 Â 220 256 Â 256 256 4,0 4.0 1 T / R Kepala Duke / UNC 4.0 56
9.000 4 220 Â 165 256 Â 192 125 4.0 1 T / R Kepala Duke / UNC 1.5 70 4.000 12 220 Â 220 256 Â 192 125 4.0 1 Kepala T / R BWH 3.0 66
4,000 7 220 Â 220 256 Â 192 122 4,0 1 Kepala T / R UCSD 1.5 72 4,000 13 220 Â 220 256 Â 192 300 4.0 1 Kepala R / O UCI 1,5 75 8,144 12
220 Â 220 256 Â 256 93 4,0 1 Kepala R / O Stanford 3.0 68 5.000 12 220 Â 220 256 Â 192 122 4.0 1 T / R Kepala
PENGUKURAN SINYAL KE-KEBISINGAN DAN KONTRAS KEPADA KEBISINGAN DI STUDI PENCITRAAN MULTICENTER FBIRN 141
dan lapangan. kekuatan (Tabel 1).
BAHAN DAN METODE
caudate.1 Sebagai langkah pertama menuju
mengidentifikasi dan mengukur sumber varians dalam Enam mata pelajaran setuju untuk berpartisipasi dalam
penelitian di Stanford dan University of Minnesota. Persetujuan
data gambar di seluruh situs, penelitian ini berupaya
Badan Peninjauan Internasional (IRB) diperoleh di semua lokasi, dan
untuk mengukur perbedaan dalam kualitas gambar persetujuan informasi terpisah diperoleh dari masing-masing subjek
yang diukur sebagai rasio signal-to-noise dan rasio di setiap lokasi. Subjek melakukan perjalanan ke masing-masing
kontras-terhadap-kebisingan di seluruh situs, vendor, situs dan dicitrakan dua kali
142 MAGNOTTA ET AL.
Gambar 1. Contoh ROI yang digunakan untuk pengukuran SNR dan CNR. Gambar menunjukkan udara (putih), CSF (abu-abu gelap), materi
abu-abu (abu-abu terang), dan materi putih (hitam). ROI ditampilkan dengan lebar tiga voxel hanya untuk keperluan visualisasi. Gambar
ini menunjukkan ROI yang ditekuk secara manual untuk subjek ini.
dalam 48 jam. Satu subjek keluar di tengah studi dan dengan demikian data dari hanya lima subjek dikumpulkan pada sepuluh pemindai di
sembilan lokasi. UCLA tidak dapat berpartisipasi dalam bagian penelitian ini karena pemindai mereka belum diinstal.
Gambar
AkuisisiT2gambar PRM yang dikumpulkan sebagai bagian dari studi
fMRI yang lebih besar adalah subjek dari analisis yang disajikan dalam
laporan ini. Analisis lebih lanjut dari data fMRI lainnya saat ini sedang berlangsung.2Y4 Protokol untuk akuisisiTspin-echo cepat2 gambaradalah
coregister T2PRM scan. ROIcoregistered digunakan untuk memperoleh pengukuran intensitas citra dari mean dan empat momen pertama dari
distribusi intensitas gambar dalam setiap ROI menggunakan BRAINS2. Pengukuran terpisah diperoleh untuk kedua sesi pemindaian.
Berdasarkan distribusi intensitas gambar, pengukuran SNR (materi abu-abu) dan CNR (materi abu-abu / materi putih) untuk gambar diperoleh.
SNR dihitung sebagai
Berarti
SNR 1⁄4 GM
1Þ
Standar DeviasiAIR ð
Pengukuran terpisah diperoleh untuk daerah ganglia kortikal dan basal. Pengukuran CNR didefinisikan sebagai
Berarti
CNR 1/4 Standard GM DeviasiÀ BerartiWM
AIR ð2Þ
Untuk dua dimensi pemeriksaan MRI, SNR terkait dengan bidang pandang (FOVx  FOVy),jumlah rata-rata ( NEX), bandwidth (BW), ukuran
matriks (Nx  Ny), kerapatan proton (r), TE, TR, T1, T2, dan konstanta (K). Untuk penelitian ini, kami mengasumsikan bentuk persamaan berikut.
hai
SNR 1⁄4 K Â & Â 1 À eÀ TR=T1 Â eÀ TE=T2
FOV
 x
FOV
Nx  Ny y
 slice ketebalan
Â
r
ffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffi NEX  Nx  Ny BW
ð3Þ
Mengingat bahwa kali gema yang digunakan adalah relatif singkat ke T1 dari materi
abu-abu, kurang dari 1/10 T1,pemulihan longitudinal
magnetisasi selama Data Akuisisi diabaikan.
Kepadatan proton dalam persamaan sebelumnya adalah untuk perkiraan pertama yang berhubungan secara linear dengan kekuatan medan dari
medan magnet statis,B0.11 Oleh karena itu, SNR terkait linier dengan medan magnet utama, dan r dapat diganti dengan B0. Persamaan (3) dapat
ditulis sebagai
mana K adalah karakteristik pemindai dan koil, B0 adalah kekuatan medan
magnet utama, dan M terkait dengan parameter pemindaian. Menyusun
ulang persamaan memungkinkan seseorang untuk memecahkan K konstan untuk setiap pemindai. Untuk analisis ini, asumsi-asumsi berikut dibuat
dari literatur untuk berekor dan putamen berdasarkan beberapa penelitian.12Y15 Demikian pula, T1 nilai untuk materi abu-abu dari 1.200 ms selama
12,16,17
1,5 T, 1.350 ms selama 3 T,
dan 1.500 ms di 4 T yang digunakan dalam analisis ini seperti yang dilaporkan dalam literatur.
HASIL
Hasil untuk SNR sangat stabil di seluruh pemindai 1,5-T dengan nilai mulai dari
Tabel 3. Pengukuran SNR
Bidang Lapangan (T) SNR basal ganglia SNR kortikal GM SNR WM CNR GM-WM
Iowa 1.5 42.9 51.8 35.0 9.9 UNM 1.5 43.4 50.2 32.9 10.4 UMN 3.0 50.1 62.2 39.6 12.6 MGH 3.0 108.7 108.2 81.1 28.4 Duke / UNC 4.0 56.9 70.4 44.3
12.6 Duke / UNC 1.5 41.3 49.3 31.3 9.7 BWH 3.0 44.4 51.5 33.9 10.4 UCSD 1.5 42.5 48.2 32.6 9.9 UCI 1.5 46.2 53.9 36.4 11.1 Stanford 3.083.1 24.2
104.2 121.9144 MAGNOTTA ET AL.
41,3 hingga 43,3 (Gbr. 2) untuk ROI ganglia basal. SNR berbeda kurang dari 5% di lima situs 1.5-T meskipun
perbedaan dalam parameter perangkat keras dan pemindaian yang digunakan untuk mengumpulkan gambar ada
(Tabel 3). Perbedaan ini termasuk jumlah gema dalam urutan gema putaran cepat, jenis gulungan, dan produsen
pemindai yang berbeda. Situs dengan scanner 1,5-T memang memiliki paling sedikit penyimpangan dalam hal
parameter pemindaian. Sebagai kelompok, SNR di bidang yang lebih tinggi meningkat. Pengukuran SNR berkisar
antara 44,5 hingga 108,7 pada 3 T, dan 50,8 pada 4 T. Pada bidang yang lebih tinggi, variabilitas dalam ukuran lebih
besar, dan ini signifikan secara statistik (uji Levene's, df = 1,89, p G 0,001). Variabilitas ini pada 3 T menghasilkan
perbedaan 60% dalam nilai SNR di ekstrem. Parameter dan kumparan pindaian yang digunakan pada sistem medan
tinggi juga lebih bervariasi. Analisis ANOVA mengungkapkan bahwa ada efek situs (F = 52,78, p G 0,0001), tidak
ada
Gambar 3. CNR untuk materi abu-abu dan materi putih. Grafik menunjukkan nilai CNR individual untuk setiap pemindaian di setiap situs.
Situs dikelompokkan berdasarkan kekuatan bidang. Sebanyak sepuluh pengukuran (5 mata pelajaran 2 pengukuran) harus ada untuk
semua situs. Beberapa situs (UCI dan BWH) memiliki masalah teknis yang menghasilkan data tidak lengkap untuk beberapa pengukuran.
memiliki SNR yang lebih besar), setiap situs
bandingkan dengan masing-masing situs lain dengan
efek kunjungan (F = 0,57, p = 0,492), efek lapangan menggunakan perbandingan rata-rata kuadrat terkecil.
(rendah vs tinggi) (F = 48,18, p G 0,0001), tidak ada asil penelitian menunjukkan bahwa hanya 60% dari
efek produsen (F = 0,19, p = 0,665). Meskipun ada erbandingan tikar abu-abu basal-
efek bidang keseluruhan (bidang yang lebih tinggi
PENGUKURAN SINYAL KE-KEBISINGAN DAN KEBISINGAN PADA KEBUTUHAN PENELITIAN FBIRN MULTICENTER STUDI 145
Gambar 4. Contoh ROI yang digunakan untuk pengukuran SNR dan CNR cocok dari pengukuran pemindaian yang ditentukan
diperoleh di University of Iowa untuk pemindaian yang dikumpulkan pada pemindai Brigham and Women's. Gambar menunjukkan
udara (putih), CSF (abu-abu gelap), materi abu-abu (abu-abu terang), dan materi putih (hitam). ROIS ditampilkan dengan lebar tiga
voxels hanya untuk keperluan visualisasi.
Ini berlaku meskipun keduanya hanya menerima dan
mengirim / menerima gulungan kepala digunakan dan
ROI ter memiliki SNR yang lebih besar di bidang yang perbedaan halus ada dalam parameter pemindaian.
lebih tinggi dibandingkan dengan pemindai lapangan Secara umum, scanner lapangan lebih tinggi secara
yang lebih rendah. signifikan meningkatkan SNR menggunakan parameter
Pengukuran SNR di daerah kortikal stabil pada 1,5 T
pencitraan yang sama untukT2PRMcepat spin
seperti daerah ganglia basal; namun, daerah ini
memiliki rasio SNR yang lebih tinggi dibandingkan gambargema dianalisis dalam penelitian ini. Namun,
dengan daerah ganglia basal. Pada 1,5 T, SNR berkisar ditemukan bahwa tidak semua pemindai 3-T dalam
antara 48,3 hingga 53,9, sedangkan pemindai 3-T penelitian ini memiliki manfaat yang sama dari
berkisar antara 62,9 hingga 121,9. Pada 4 T, nilai SNR peningkatan bidang.
untuk materi abu-abu kortikal adalah 76,6. Ini secara Scannerlapangan lebih tinggi juga dipamerkan varian
signifikan lebih tinggi dari pengukuran SNR yang yang lebih besar dalam nilai-nilai SNR yang diperoleh,
diperoleh di daerah ganglia basal (p = 0,0003). sebagian karena variabilitas dalam parameter
Pengukuran CNR sekali lagi serupa pada pemindai pemindaian digunakan. Mengoptimalkan parameter
1,5-T mulai dari 9,5 hingga 10,2 dengan peningkatan pemindaian pada bidang yang lebih tinggi untuk
umum di bidang yang lebih tinggi (10,1Y28,9 pada 3 T menjelaskan berbagai T1 dan T2 relaksasi kali lebih di-
dan 10,9 pada 4 T) (Gbr. 3). Hasil CNR dirangkum
berkerut nilai-nilai SNR yang diperoleh seperti yang
dalam Gambar. 3.
terlihat pada parameter urutan besar konstan dihitung
Pemindai dan konstanta koil K adalah variabel lintas untuk situs MGH (Tabel 4). SNR lebih besar di daerah
pemindai dan tidak dipengaruhi oleh produsen materi abu-abu lebih dekat ke koil penerima (ROI
pemindai. Nilai untuk K berkisar antara 0,594 (BWH) kortikal) dibandingkan dengan materi abu-abu di
hingga 1,4 (Stanford), keduanya merupakan pemindai tengah koil (ROI basal) (Gbr. 4). Peningkatan SNR dan
GE 3 T. Koil yang digunakan di Stanford adalah koil CNR pada kekuatan medan yang lebih tinggi dan
buatan lokal, sedangkan koil yang digunakan di BWH variasi besarnya adalah sumber potensial bias situs
adalah koil kepala quadrature yang dikembangkan oleh dalam studi yang diperoleh di seluruh sistem ini.
pabrikan. Ada beberapa sumber untuk variasi dalam Pendekatan berikut dapat diambil untuk
sensitivitas koil di bidang yang lebih tinggi. Telah menghilangkan bias situs: (1) parameter pemindaian
diketahui secara umum bahwa pemuatan dan dapat disesuaikan untuk memberikan langkah SNR /
penyetelan yang tergantung pada sampel menghambat CNR serupa di seluruh kekuatan lapangan, (2) teknik
kinerja kumparan besar terutama pada bidang yang pemrosesan gambar dapat dikembangkan yang kebal
lebih tinggi. Ada beberapa metode yang diusulkan terhadap perbedaan SNR / CNR , atau (3) pendekatan
untuk memperbaiki tuning asimetri ini, tetapi mereka statistik dapat digunakan untuk mengendalikan
tidak diimplementasikan secara rutin.18,19 Meskipun faktor-faktor ini seperti menggunakan SNR sebagai
subjeknya sama dari satu situs ke situs lainnya, posisi kovariat ketika menganalisis data ini.
dalam koil adalah variabel. Artefak pergeseran Kualitas koil penerima juga merupakan sumber
intensitas lokal adalah sumber variasi potensial dalam
variabilitas yang potensial di seluruh pemindai.
SNR antar koil.20,21 Artefak ini dapat dihasilkan dari
Karakteristik kumparan ini dapat sangat bervariasi
pemuatan koil asimetris, penyetelan arus batang yang
pada bidang yang lebih tinggi, yang masih merupakan
tidak tepat, atau ukuran elemen kumparan yang tidak
teknologi berkembang untuk pemindai klinis. Semua
sesuai.22 pemindai 1,5-T menerima data menggunakan
kumparan pabrikan standar. Telah ada pengembangan
dan pengujian substansial dari sistem ini selama 20
PEMBAHASAN tahun terakhir. Kumparan yang digunakan pada
pemindai 3-T mencakup bermacam-macam kumparan
SNR dan CNR yang diukur lintas vendor dan gulungan yang berbeda dengan tidak ada dua kumparan yang
cukup seragam pada pemindai kekuatan medan 1,5-T. sama. Ini mungkin memainkan peran penting dalam
temuan bahwa tidak semua pemindai 3-T memiliki Urutan(B0 Â M)
Konstanta parameter
SNR yang lebih besar secara signifikan dibandingkan
urutan (B0 Â M)
dengan pemindai 1.5T. Peningkatan variasi dalam level Scanner dan konstanta
SNR yang diukur pada bidang yang lebih tinggi kumparan (K)
Scanner dan konstanta
kemungkinan sebagian disebabkan oleh kumparan (K)
Scanner dan kumparan
konstan (K)
Iowa 50.2 0.858 UNM 48.5 0.894 UMN 49.7 1.01 MGH 158.8
0.616 Duke / UNC 4.0 T 67.3 0.845 Duke / UNC 1.5 T 49.5 0.835
Situs
BWH 74.7 0.594 UCSD 31.2 1.36 UCI 48.6 0.760 Stanford 74.4
konstanta parameter 1.40
146 MAGNOTTA ET AL.