KARIMA PRATIWI

162210101059
C1-1

DATA HASIL ELEKTROFORESIS

1. Berikut hasil Elektroforesis Agarosa dari DNA plasmid yang diisolasi dari 4 koloni
transforman bakteri yang berbeda dan DNA Genom/kromosom yang diisolasi dari
bakteri X.
Berdasarkan gambar tersebut apa yang bisa kalian simpulkan?

1. Plasmid dari transforman 1

2. Plasmid dari transforman 2
3. DNA Kromosom
4. Plasmid dari transforman 3
M : Marka DNA 1 Kb

Jawab :
Berdasarkan hasil elektroforesis agarosa dari DNA plasmid diatas, transforman 1
terlihat pita-pita DNA yang terbentuk antara lain 1 pita tipis dan 2 pita tebal.
Plasmid dari transforman 2 terdapat 2 pita tipis dan 1 pita tebal. Pada transforman 3
terdapat terdapat 1 pita tebal. Dan untuk plasmid dari transforman 4 terdapat 2 pita
tipis dan 1 pita tebal. Secara keseluruhan pita-pita tersebut mengumpul atau tidak
menyebar. Tingkat ketebalan pita DNA ditentukan dari kemurnian atau proses
ekstraksi yang kurang tepat pada sampel yang diamati. Dari beberapa transforman
pada jumlah pita terdapat perbedaan, dimana jumlah pita dapat menunjukkan adanya
molekul DNA dengan beberapa ukuran yang berbeda setiap transformannya.
 Dikatakan bahwa pita DNA yang tebal dan mengumpul (tidak menyebar)
menunjukkan konsentrasi yang tinggi (transformasi 3) dan DNA total yang diekstrak
dalam kondisi utuh. Apabila DNA pita terlihat menyebar berarti ada ikatan antara
molekul DNA yang terputus pada saat proses ekstraksi berlangsung. Enzim restriksi
sangat berpengaruh dimana enzim ini berperan untuk memotong DNA dengan cara
yang spesifik.

2. Berikut Elektroforegram plasmid yang direstriksi dengan enzim restriksi tertentu.

Tentukan ukuran dari pita a, b dan c dalam pb (pasangan basa)

M Marka DNA 1 Kb
1. Plasmid utuh
2. Plasmid diporong dengan enzim
restriksi MluI
3. Plasmid dipotong dg enzim
restriksi NdeI dan XhoI
4. Plasmid dipotong dengan enzim
XhoI

Jawab:
Ukuran marka DNA Jarak migrasi marka
Dalton (bp) Log pb (x) (cm) (y)
Pita 1 : 10000 4,000 1,5
Pita 2 : 8000 3,903 1,65
Pita 3 : 6000 3,778 1,9
Pita 4 : 5000 3,699 2
Pita 5 : 4000 3,602 2,2
Pita 6 : 3000 3,477 2,45
Pita 7 : 2600 3,415 2,65
Pita 8 : 2000 3,301 3
Pita 9 : 1600 3,204 3,45
Pita 10 : 1000 3,000 4,1
Pita 11 : 750 2,875 4,6
 Persamaan regresi a= 12,238
b= -2,748;
r= -0,984
y= bx + a
y= -2,748x + 12,238
Ukuran sampel (Da)  Panjang pita A (2 cm)
2 = -2,748x + 12,238
x = 3,726
antilog x = 5321,083 bp
 Panjang pita B (3,45 cm)
3,45 = -2,748x + 12,238
x = 3,198
antilog x = 1577,612 bp
 Panjang pita C (1,9 cm)
1,9 = -2,748x + 12,238
x = 3,762
antilog x = 5780,960 bp

Jadi, kesimpulan dari perhitungan diatas adalah panjang pita A= 5321,083 bp; pita B=
1577,612 bp dan pita C= 5780,960 bp.