OLOLO
OLOLO
Abstrak
Asam nukleat adalah molekul panjang yang terbuat dari molekul yang lebih kecil yang disebut
nukleotida. Asam nukleat merupakan makromolekul biokimia yang menyimpan dan mentransfer
informasi genetik dalam sel. Fungsi asam nukleat antara lain yaitu menyimpan dan mentransfer
informasi genetik, serta menggunakan informasi genetik untuk mengarahkan sintesis protein baru.
Dua jenis utama asam nukleat yaitu DNA (deoxyribonucleic acid) dan RNA (ribonucleic acid). Fungsi
DNA secara umum adalah untuk menyimpan dan menentukan karakteristik biologis pada setiap
mahkluk hidup yang sesuai dengan pengaturan koneksi pada molekul yang sangat spesifik,
sedangkan fungsi umum RNA yaitu untuk membawa salinan dasar DNA suatu organisme ke dalam
protein baru pembentuk sel. RNA mempunyai berbagai macam jenis dengan fungsi yang beragam
pula, antara lain mRNA, tRNA, rRNA, dan miRNA.
Kata Kunci: Fungsi, asam nukleat, nukleotida, RNA, DNA, jenis RNA, protein.
Pembahasan
1. Definisi Asam Nukleat
Asam nukleat merupakan senyawa kimia yang terbentuk secara alami yang mampu
dipecah untuk menghasilkan asam fosfat, gula, dan campuran basa organik (purin dan
pirimidin). Asam nukleat adalah molekul pembawa informasi utama dari sel, dan dengan
mengarahkan proses sintesis protein, mereka menentukan karakteristik yang diwariskan dari
setiap makhluk hidup. Dua kelas utama asam nukleat adalah asam deoksiribonukleat (DNA)
dan asam ribonukleat (RNA). DNA merupakan blueprint utama untuk kehidupan dan
merupakan bahan genetik dalam semua organisme yang hidup bebas dan juga sebagian
besar virus. RNA adalah bahan genetik virus tertentu, tetapi juga ditemukan di semua sel
hidup, di mana ia memainkan peran penting dalam proses tertentu seperti pembuatan protein.
Messenger RNA (mRNA) adalah subtipe dari RNA. Molekul mRNA membawa
sebagian kode DNA ke bagian lain sel untuk diproses. mRNA dibuat selama transkripsi.
Selama proses transkripsi, satu untai DNA didekodekan oleh RNA polimerase, dan mRNA
disintesis. Secara fisik, mRNA adalah untai nukleotida yang dikenal sebagai asam
ribonukleat, dan beruntai tunggal, seperti yang ditunjukkan pada gambar 2.2.
2.2.2. t-RNA
Transfer RNA atau tRNA adalah jenis RNA yang memiliki antikodon yang akan
berpasangan dengan kodon dalam mRNA. Setiap molekul tRNA membawa asam amino
yang nantinya akan digabungkan menjadi protein (polipeptida) tertentu. tRNA sendiri
adalah molekul RNA dengan struktur L terbalik yang berhubungan. Salah satu ujung tRNA
mengandung loop antikodon yang berpasangan dengan mRNA yang menentukan asam
amino tertentu. Ujung lain dari tRNA memiliki asam amino yang melekat pada gugus OH
melalui ikatan ester.
2.2.3. r-RNA
Gambar 2.4. Struktur r-RNA
(sumber: Difference Between mRNA, tRNA and rRNA. 2017. knowswhy.com)
Ribosomal ribonucleic acid (rRNA) adalah komponen RNA dari ribosom, dan sangat
penting untuk sintesis protein di semua organisme hidup. rRNAmerupakan RNA dengan
jumlah terbanyak dan penyusun ribosom. RNA ini berupa pita tunggal, tidak bercabang,
dan fleksibel, yang ditunjukkan pada gambar 2.4. Lebih dari 80% RNA merupakan rRNA.
Sebenarnya, RNA ribosom (rRNA) tidak menghasilkan protein. rRNA membuat polipeptida
(rakitan asam amino) yang membentuk protein. rRNA terletak di sitoplasma sel, tempat
ribosom ditemukan.
2.2.4. mi-RNA
MikroRNA (miRNA) merupakan RNA yang tidak menyandi (non-coding RNA).
MicroRNA (miRNA) awalnya ditemukan di Caenorhabditis oleh Victor Ambros pada tahun
1993 ketika mempelajari gen lin-14. Pada saat yang sama, Gary Ravkun mengidentifikasi
gen target miRNA pertama. Dua penemuan inovatif tersebut berhasil mengidentifikasi
mekanisme baru regulasi gen posttranskripsi.
2.2.5. si-RNA
siRNA merupakan singkatan dari small interfering Ribonucleic Acid. SiRNA memiliki
panjang 20-25 bp, adalah molekul RNA untai ganda pendek. siRNA telah digunakan
sebagai terapi yang menjanjikan untuk antivirus, antikanker, atau penyakit genetik lainnya.
Saat ini, aplikasi siRNA dalam biomedis masih terbatas karena tingginya biaya, risiko
mutasi, efek onkogenik, serta siRNA yang tidak dapat memasuki sel dengan sendirinya.
2.2.6. RNAi
Interferensi RNA (RNAi) adalah proses penting, yang digunakan oleh banyak
organisme berbeda untuk mengatur aktivitas gen. RNAi dianggap sebagai mekanisme
pertahanan alami yang telah berevolusi untuk melindungi organisme dari virus RNA. Sel
dapat mengenali RNA untai ganda (dsRNA) sebagai pengganggu. Ketika hal ini terjadi,
enzim Dicer bekerja untuk memotong RNA asing menjadi potongan-potongan kecil yang
disebut siRNA. Potongan RNA ini terdiri dari sekitar 22 nukleotida panjangnya. Satu untai
siRNA kemudian berikatan dengan mRNA virus target secara spesifik berurutan. Hal ini
menciptakan sinyal untuk menghancurkan mRNA, sehingga mengganggu produksi lebih
lanjut dari protein virus yang diperlukan untuk mereplikasi virus.
2.2.7. s-RNA
Ketika pemahaman tentang transkripsi bakteri terus berkembang, menjadi jelas
bahwa small non-coding RNA (sRNA) memainkan peran regulasi yang sangat penting.
Panjang sRNA biasanya 50-400 nukleotida, sRNA pasca transkripsi mengatur ekspresi
gen, biasanya dengan memasangkan basa dengan satu atau lebih target mRNA. sRNA
memberikan keuntungan lebih daripada regulator protein karena mereka bertindak cepat,
relatif murah secara metabolik, dan menyediakan cara tambahan untuk menanggapi sinyal
lingkungan.
2.2.8. sn-RNA
Small nuclear RNA (snRNA) adalah salah satu dari banyak spesies RNA kecil yang
dibatasi oleh nukleus; beberapa snRNA terlibat dalam splicing atau reaksi pemrosesan
RNA lainnya. snRNAs ini, seperti halnya dengan bentuk-bentuk non-coding RNA dalam
inti, tidak pernah menghasilkan protein tetapi memainkan peran penting dalam
memfasilitasi dan mengatur aktivitas genetik.
2.2.9. RNA switches
Riboswitch pertama kali ditemukan dalam sistem alami. Pergantian RNA yang terjadi
secara alami ini biasanya ditargetkan ke arah metabolit umum, mengubah aktivitas genetik
sebagai respons terhadap keadaan metabolisme sentral, dan dianggap memainkan peran
penting dalam mempertahankan homeostasis dengan memberikan mekanisme pengaturan
umpan balik positif atau negatif. Riboswitch alami telah ditemukan yang mengubah
stabilitas struktur sekunder untuk mengubah laju berbagai proses ekspresi gen, termasuk
pemutusan transkripsi, inisiasi terjemahan, dan degradasi transkrip.
2.2.10. Catalytic RNA
Ribozim adalah enzim asam ribonukleat (RNA) yang dapat mengkatalisasi reaksi
kimia. Ribozim mengkatalisasi reaksi spesifik dengan cara yang mirip dengan enzim
protein. Disebut juga RNA katalitik, ribozim ditemukan dalam ribosom di mana mereka
bergabung dengan asam amino bersama untuk membentuk rantai protein. Ribozim juga
berperan dalam reaksi-reaksi vital lainnya seperti splicing RNA, transfer biosintesis RNA,
dan replikasi virus.
2.2.11. Sca RNA
Cajal body-specific RNAs (scaRNAs) adalah kelas RNA nukleolar kecil (snoRNAs)
yang secara khusus terlokalisasi ke tubuh Cajal, sebuah organel nuklir yang terlibat dalam
biogenesis ribonucleoprotein nuklir kecil (snRNPs atau snurps). ScaRNA memandu
modifikasi (metilasi dan pseudouridilasi) dari RNA polimerase II yang mentranskripsikan
RNA spliceosomal U1, U2, U4, U5, dan U12.
2.2.12. RNA p
RNA polimerase adalah enzim yang bertanggung jawab untuk menyalin urutan DNA
ke dalam urutan RNA, pada saat proses transkripsi. Sebagai molekul kompleks yang terdiri
dari subunit protein, RNA polimerase mengontrol proses transkripsi, di mana informasi
yang disimpan dalam molekul DNA disalin ke dalam molekul baru mRNA. Transkripsi
merupakan langkah penting dalam menggunakan informasi dari gen dalam DNA kita untuk
membuat protein. Protein adalah molekul kunci yang memberi struktur sel dan
membuatnya tetap berjalan.
Asam nukleat adalah polimer dari monomer nukleotida. Setiap nukleotida terdiri dari tiga
bagian: gula 5 karbon, gugus fosfat, dan basa nitrogen. Seperti monosakarida, nukleotida dan
rantai nukleotida pendek melakukan fungsi seluler yang penting. Adenosine triphosphate
(ATP) adalah pembawa energi penting dalam organisme hidup. ATP terdiri dari adenin, gula
ribosa, dan tiga gugus fosfat yang terikat secara berurutan. Ikatan dari tiga gugus fosfat
anionik dalam satu baris memaksa beberapa ion negatif menjadi berdekatan, suatu keadaan
yang tidak menguntungkan. Reaksi yang menghilangkan kelompok fosfat terluar (membentuk
adenosin difosfat, atau ADP) melepaskan energi untuk digunakan dalam reaksi kimia lainnya.
Dinukleotida seperti NAD+, NADP+, dan FAD bertindak sebagai koenzim, menghasilkan
energi dengan mentransfer elektron dari satu reaksi ke reaksi lainnya.
3.5. Koenzim
Nukleotida adalah senyawa kimia dengan tiga komponen: basa yang mengandung
nitrogen, gula pentosa, dan satu atau lebih gugus fosfat. Meskipun dikenal sebagai unit
struktural asam nukleat, DNA dan RNA, yang menyimpan dan mentransfer informasi genetik
dalam organisme, nukleotida berpartisipasi dalam hampir semua proses biokimia. Salah satu
fungsi nukleotida ini adalah sebagai koenzim. Koenzim adalah molekul organik non-protein
yang membantu enzim dalam mengkatalisasi reaksi spesifik.
Kesimpulan
Asam nukleat merupakan molekul pembawa informasi utama dari sel, dan dengan
mengarahkan proses sintesis protein, mereka menentukan karakteristik yang diwariskan dari setiap
makhluk hidup. Asam nukleat memiliki fungsi antara lain adalah pembentuk dasar molekul, koenzim,
pembawa energi, serta fungsi sebagai RNA dan DNA. Dua jenis utama asam nukleat yaitu DNA
(deoxyribonucleic acid) dan RNA (ribonucleic acid). DNA adalah asam nukleat beruntai ganda yang
mengandung informasi genetik makhluk hidup, sedangkan RNA adalah molekul polimer yang terlibat
dalam berbagai peran biologis untuk mengkode, dekode, regulasi, dan ekspresi gen. Fungsi DNA
secara umum adalah untuk menyimpan dan menentukan karakteristik biologis pada setiap mahkluk
hidup yang sesuai dengan pengaturan koneksi pada molekul yang sangat spesifik. Fungsi umum RNA
yaitu untuk membawa salinan dasar DNA suatu organisme ke dalam protein baru pembentuk sel.
RNA memiliki berbagai jenis yang memiliki fungsi yang berbeda-beda pula, antara lain mRNA, tRNA,
rRNA, miRNA, siRNA, sRNA, dan scnRNA.
Daftar Pustaka
Encyclopedia Britannica. (2019). Nucleic acid | chemical compound. [online] Available at:
https://www.britannica.com/science/nucleic-acid [Accessed 19 Feb. 2019].
Nature.com. (2019). mRNA / messenger RNA | Learn Science at Scitable. [online] Available at:
https://www.nature.com/scitable/definition/mrna-messenger-rna-160 [Accessed 19 Feb. 2019].
Wiley.com. (2019). Concepts in Biochemistry - Structure Tutorials. [online] Available at:
https://www.wiley.com/college/boyer/0470003790/structure/tRNA/trna_intro.htm [Accessed 19 Feb.
2019].
R Burke, C. (2012). Catalytic RNA. [online] Available at: http://www.els.net/WileyCDA/ElsArticle/refId-
a0000870.html [Accessed 19 Feb. 2019].
Nelson, David L., and Michael M. Cox. (2000). Nucleotides and Nucleic Acids In Lehninger Principles
of Biochemistry, 3rd ed. New York: Worth Publishers
Newworldencyclopedia.org. (2019). Nucleotide - New World Encyclopedia. [online] Available at:
http://www.newworldencyclopedia.org/entry/Nucleotide#Several_nucleotides_function_as_coenzymes
[Accessed 19 Feb. 2019].
Fotedar, D. (2019). Difference Between mRNA, tRNA and rRNA | KnowsWhy.com. [online]
Knowswhy.com. Available at: https://www.knowswhy.com/difference-between-mrna-trna-and-rrna/
[Accessed 19 Feb. 2019].