Sindanita Yulianty 1906885

Tugas Biosistematika dan Evolusi (8 April 2020)

Klasifikasi Numerik
Dosen pengampu: Prof. Topik Hidayat, M.Si., Ph.D.
A. Tugas:
Karakte A B C D
r
1 1 1 0 0
2 1 1 0 0
3 1 1 1 0
4 1 1 1 0
5 1 1 1 0 Keterangan:
6 1 1 1 0 0 = Pleisomorphic (karakter primitif)
7 0 1 0 0 1 = Apomorphic (karakter lebih maju)
8 0 1 0 0
9 0 1 0 0
10 1 0 1 0
11 1 0 0 1

B. Jawaban
1. Fenetika
a. Koefisien kesamaan
Kesamaan AB = 6/11 = 0,54≈ 0,6 Kesamaan BC = 5/11 = 0,45≈ 0,5
Kesamaan AC = 8/11 = 0,72≈ 0,7 Kesamaan BD = 1/11 = 0,09≈ 0,1
Kesamaan AD = 4/11 = 0,36≈ 0,4 Kesamaan CD = 5/11 = 0,45≈ 0,5

b. Matriks kesamaan
A B C D
A 1
B 0,6 1
C 0,7 0,5 1
0,
D 0,4 0,1 1
5

c. Klastering
Pasangan taksa dengan kesamaan di atas 0,5 adalah taksa AB = 0,6 dan AC =0,7.

Taksa AB untuk memudahkan disebut P, maka matriksnya menjadi seperti berikut:

 Sindanita Yulianty 1906885

P C D
P 1
C ? 1
D ? 0,5 1

Selanjutnya dihitung kembali koefisien kesamaan:

Kesamaan PC = 0,7 + 0,5 = 1,2/2 = 0,6
Kesamaan PD = 0,4 + 0,1 = 0,5/2 = 0,25 ≈ 0,3
Maka matriksnya menjadi:
P C D
P 1
C 0,6 1
D 0,3 0,5 1

Klastering ke-2 adalah pasangan taksa AC, disebut Q.

P Q
P 1
Q ? 1
Selanjutnya menghitung koefisien kesamaan PQ.
Kesamaan PQ = 0,5 + 0,2 = 0,7/2 = 0,35 ≈ 0,4

Sehingga matriksnya menjadi:

P Q
P 1
Q 0,4 1

Pohon Finetik (Fenogram):

 Sindanita Yulianty 1906885

2. Kladistika
Menambahkan outgroup:
Karakter Outgroup A B C D
1 0 1 1 0 0
2 0 1 1 0 0
3 0 1 1 1 0
4 0 1 1 1 0
5 0 1 1 1 0
6 0 1 1 1 0
7 0 0 1 0 0
8 0 0 1 0 0
9 0 0 1 0 0
10 0 1 0 1 0
11 0 1 0 0 1
Jumlah perubahan 8 9 5 1
evolusi
Maka dugaan urutan evolusinya adalah: D-C-A-B.
Untuk membangun kladogram melihat karakternya:
D = 000 000 000 01
C = 001 111 000 10
A = 111 111 000 11
B = 111 111 111 00
Maka kladogramnya sebagai berikut:
 Sindanita Yulianty 1906885

Interpretasi:
1. Dugaan urutan kemunculan dari primitif ke maju adalah D-C-A-B
2. Karakter :
 Sinapomorf:
Pada ABC = (3),(4),(5),(6)
Pada AB = (1),(2)
 Autapomorf (ciri khas)
Pada B = (7),(8),(9)