Genetika Bakteri

Chrysanti, dr., M.Kes

Departemen Ilmu Kedokteran Dasar
Divisi Mikrobiologi

Halaman 2

Sejarah
• DNA pertama kali ditemukan oleh Frederick Miescher pada tahun 1869.
• Phoebus AT Levine, menemukan bahwa DNA mengandung fosfat,
gula lima karbon (pentosa siklik), dan basa yang mengandung nitrogen
tahun 1920-an.
• Rosalind Franklin menemukan struktur heliks dengan x-ray
kristalografi.
• James Watson dan Francis Crick menggambarkan tiga dimensi
struktur molekul DNA pada tahun 1950-an.

Halaman 3

Anatomi Molekul DNA dan RNA

• DNA adalah rantai heliks ganda dari nukleotida . Heliksnya ganda
untai dipelintir bersama, disebut sebagai " tangga spiral "
• Nukleotida adalah kombinasi kompleks dari yang berikut ini:
• Sebuah gugus fosfat (PO4)
• Pentosa lima karbon siklik (karbon dalam pentosa adalah
• bernomor 1 ′ sampai 5 ′) gula (deoksiribosa), yang menyusun
• "Pegangan tangan dan sisi"
• Basa yang mengandung nitrogen, atau "anak tangga", baik purin atau a
• pirimidin

Halaman 4
Halaman 5

Halaman 6

• Purin terdiri dari cincin fusi sembilan atom karbon dan nitrogen.
Ada dua purin dalam molekul: adenin (A) dan guanin (G) .
• Pirimidin terdiri dari sebuah cincin tunggal yang terdiri dari enam atom karbon dan
nitrogen.
Ada dua pirimidin dalam molekul: timin (T) dan sitosin
(C) .

Halaman 7

• DNA juga terlibat dalam produksi RNA.

• Dalam RNA , timin basa nitrogen digantikan oleh urasil , yang lain
pirimidin.
• RNA adalah untai tunggal dan pendek , dan berisi ribosa gula.
• Genetika bakteri semakin penting dalam mikrobiologi diagnostik
laboratorium .
• Tes diagnostik baru telah dikembangkan yang didasarkan pada identifikasi
urutan RNA atau DNA unik ada di setiap spesies bakteri .
• Teknik polymerase chain reaction (PCR) adalah sarana penguatan
urutan DNA tertentu dan mendeteksi sejumlah kecil bakteri
hadir dalam spesimen.

Halaman 8

Terminologi
• Genotipe sel adalah potensi genetik dari DNA suatu
organisme.
• Semua karakteristik bakteri dikodekan di dalam DNA dan itu
memiliki potensi untuk diekspresikan.
• Beberapa gen adalah gen silent , diekspresikan hanya di bawah tertentu
kondisi.
• Gen yang selalu diekspresikan bersifat konstitutif .
• Gen yang diungkapkan hanya dalam kondisi tertentu yang
diinduksi .
• Fenotipe sel terdiri dari ciri - ciri genetik a
sel yang benar-benar diekspresikan dan dapat diamati .

Halaman 9

Genom Bakteri
• Kromosom bakteri (juga disebut genom) terdiri dari a
tunggal , ditutup , sepotong melingkar dari dsDNA yang supercoiled untuk fit dalam
sel.
• Berat molekul DNA bervariasi dari yang terkecil tanpa dinding yang hidup bebas
organisme, ( Mycoplasma ) dari 3x10 9 pasangan basa dan menyandikan 100.000
protein menjadi E. coli dengan berat Mol 5x10 6 pasang basa.

Halaman 10

• Gen adalah urutan DNA spesifik yang kode untuk asam amino
urutan dalam satu protein (misalnya, satu gen sama dengan satu polipeptida ).
• Di depan setiap gen pada untai DNA adalah area yang belum ditranskripsi
mengandung daerah promotor , yang dikenali oleh RNA polimerase
untuk memulai transkripsi . Area ini mungkin juga berisi peraturan
daerah tempat molekul dapat menempel dan menyebabkan penurunan
atau peningkatan transkripsi

Halaman 11

Halaman 12
Halaman 13

Halaman 14

Elemen Ekstrachromosomal
• Banyak bakteri memiliki informasi tambahan pada potongan lingkaran kecil
ekstrachromosomal, dsDNA disebut plasmid .
• Mereka tidak penting untuk pertumbuhan bakteri.
• Gen yang mengkode resistensi antibiotik ( racun atau virulensi lainnya
faktor ) sering terletak di plasmid.
• Jumlah plasmid yang ada dalam sel bakteri bisa berkisar dari satu
( nomor salinan rendah ) hingga ratusan ( nomor salinan tinggi ).
• Plasmid terletak di sitoplasma sel dan mereplikasi diri sendiri
dan diteruskan ke sel anak , mirip dengan DNA kromosom.
• Kadang kala juga ditularkan (nonseksual ) dari satu bakteri
spesies ke spesies lain melalui konjugasi (transfer horizontal genetik
materi melalui kontak sel-ke-sel ).

Halaman 15

Elemen Genetik Seluler

• Potongan DNA tertentu bergerak dan dapat melompat dari satu tempat ke dalam
kromosom ke tempat lain ( gen melompat ).
• Sepotong DNA bergerak adalah elemen urutan penyisipan (IS) . ini
kira-kira 1000 pasang basa dengan pengulangan terbalik pada masing-masingnya
akhir.
• Setiap kode elemen IS hanya untuk satu gen , enzim transposase itu
memungkinkan elemen IS untuk keluar masuk DNA.
• The Efek utama dari IS elemen pada bakteri adalah bahwa ketika sebuah IS elemen
menyisipkan dirinya ke tengah-tengah gen , itu mengganggu dan menginaktivasi yang
gen.
Halaman 16

Mutasi
• Mutasi adalah perubahan yang terjadi pada kode DNA dan sering (tidak
selalu; “Mutasi diam-diam” tidak mengubah protein)
mengakibatkan perubahan pada protein yang dikodekan atau dalam pencegahannya
sintesis .
• Mekanisme mutasi:
• Substitusi dasar
• Mutasi pergeseran bingkai
• Penyisipan transposon

Halaman 17

Substitusi basa
• Mutasi mungkin hasil dari perubahan satu basa nukleotida (sebuah titik
mutasi) yang mengarah ke perubahan dalam asam amino tunggal dalam protein .
Mutasi pergeseran bingkai
• Hal ini terjadi ketika satu atau lebih pasangan yang ditambahkan atau dihapus dengan
produksi
protein tidak aktif.
• Hasil mutasi dari penyisipan atau penghapusan yang mengarah ke genom
gangguan gen atau mutasi frame-shift, atau keduanya.
Penyisipan transposon
• Ini terjadi ketika transposon diintegrasikan ke dalam DNA yang dapat menyebabkan
perubahan besar pada gen.

Halaman 18

• Mutasi spontan terjadi pada bakteri dengan kecepatan sekitar 1 dari 10 9

sel .
• Mutasi juga terjadi sebagai akibat kesalahan selama replikasi DNA di
suatu tingkat dari sekitar 1 di 10 7 sel .
• Paparan bahan kimia dan fisik tertentu bisa sangat meningkat
tingkat mutasi.

Halaman 19

Rekombinasi Genetik
• rekombinasi genetik adalah metode dimana gen yang ditransfer
atau dipertukarkan antara daerah homolog ( serupa) pada dua DNA
molekul.
• Metode ini menyediakan cara bagi organisme untuk mendapatkan yang baru
kombinasi jalur biokimia dan salinan dengan perubahannya
lingkungan Hidup.

Halaman 20

Mekanisme Transfer Gen

• Materi genetik dapat ditransfer dari satu
bakteri ke yang lain dalam tiga cara dasar:
• Transformasi
• Transduksi
• Konjugasi

Halaman 21

Transformasi
• Transformasi adalah pengambilan dan penggabungan DNA telanjang ke dalam a
sel bakteri , setelah DNA diambil, itu bisa
dimasukkan ke dalam genom bakteri melalui rekombinasi .
• Jika DNA adalah plasmid melingkar dan sel penerima adalah kompatibel ,
yang plasmid dapat mereplikasi dalam sitoplasma dan akan ditransfer ke
sel anak .
• Streptococcus pneumoniae , Neisseria gonorrhoeae , dan H. influenzae ,
lakukan ini secara alami .
• Prosedur kloning , metode transformasi yang digunakan untuk memperkenalkan
plasmid yang dimanipulasi secara genetik menjadi bakteri, seperti E. coli ,

Halaman 22

Transformasi bakteri. DNA bebas atau "telanjang" diambil oleh seorang yang kompeten
sel bakteri. Setelah pengambilan, DNA dapat mengambil salah satu dari tiga kursus:
(1) diintegrasikan ke dalam materi genetik bakteri yang ada;
(2) itu terdegradasi; atau
(3) jika itu adalah plasmid yang kompatibel, itu dapat bereplikasi di sitoplasma.

Halaman 23

Transduksi
• Transduksi adalah transfer gen bakteri oleh bakteriofag
(bakteri yang terinfeksi virus) dari satu sel ke sel lainnya.
• Bakteriofag terdiri dari dikelilingi kromosom (DNA atau RNA)
oleh mantel protein. Ketika fag menginfeksi sel bakteri , ia menyuntikkannya
genom ke dalam sel bakteri , meninggalkan lapisan protein di luar.
• Fag kemudian dapat mengambil jalur litik , di mana bakteriofag
DNA mengarahkan sel bakteri untuk mensintesis DNA dan fag fag
protein dan mengemasnya menjadi partikel fag baru .
• Sel bakteri kemudian melisis (fase litik), melepaskan fag baru ,
yang dapat menginfeksi sel bakteri lain.

Halaman 24

Sebuah fag menyuntikkan DNA ke dalam sel bakteri. Ekor fag bergabung dengan reseptor
dari dinding sel bakteri dan menyuntikkan DNA ke dalam bakteri. Satu dari dua kursus
kemudian dapat diambil. Dalam siklus litik, kromosom bakteri direplikasi
terganggu; Komponen fag dibentuk dan dirangkai menjadi partikel fag. Itu
sel bakteri dilisis, melepaskan fag dewasa. Dalam siklus lisogenik, DNA fag
dimasukkan ke dalam materi genetik bakteri, dan gen yang dikodekan pada fag
DNA dapat diekspresikan dari situs ini. Di lain waktu, fag mungkin "diinduksi",
dan siklus litik kemudian terjadi.

Halaman 25

Konjugasi
• Konjugasi adalah transfer materi genetik dari bakteri donor
saring ke regangan penerima
• Kontak dekat diperlukan di antara dua sel. Dalam sistem E. coli ,
strain donor (F +) memiliki faktor kesuburan (faktor F) pada plasmid
yang membawa gen untuk transfer konjugatif.
• Strain donor menghasilkan embel-embel permukaan berongga yang disebut sex
pilus, yang mengikat ke sel F penerima dan membawa kedua sel masuk
kontak jarak dekat.
• Transfer DNA kemudian terjadi. Baik gen plasmid dan kromosom
dapat ditransfer dengan metode ini.

Halaman 26

Konjugasi bakteri. Sel F + terhubung dengan sel F melalui sex pili.

DNA kemudian ditransfer dari satu sel ke sel lainnya