com
doi: 10.1093/femsec/fix084
Tanggal Publikasi Akses Lanjutan: Perspektif 22 Juni
2017
PERSEKTIVE
ABSTRAK
NS Bacillus cereus kelompok mengandung patogen vertebrata seperti: B. antraks dan B. cereus dan patogen invertebrata B. thuringiensis
(Bt). Biopestisida mikroba berdasarkanBt secara luas diakui sebagai salah satu produk insektisida yang paling aman dan paling tidak
merusak lingkungan yang tersedia. Namun demikian, insiden keracunan makanan baru-baru ini mendorong tinjauan Otoritas Keamanan
Makanan Eropa yang berpendapat bahwaBt menimbulkan risiko kesehatan yang setara dengan B.cereus, agen penyebab diare. Namun,
pemeriksaan kritis terhadap data yang tersedia, dan insiden terbaru ini, tidak memberikan bukti kuat bahwaBtmenyebabkan diare.
Meskipun tingkat yang relatif tinggiB. cereus-spora mirip dapat terjadi pada makanan, genotip menunjukkan bahwa ini adalah strain
yang terjadi secara alami daripada biopestisida. Selain itu, genotipe MLST dari>2000 isolat menunjukkan bahwa genotipe biopestisida
tidak pernah diisolasi dari infeksi klinis. Data MLST menunjukkan bahwaB. cereuskelompok heterogen dan terbentuk dari clades yang
berbeda dengan perbedaan substansial dalam biologi, ekologi dan asosiasi inang. Kelompok yang memiliki risiko terbesar (theantraks
clade) berhubungan jauh dengan clade yang mengandung semua biopestisida. Data terbaru ini mendukung pandangan lama bahwaBt
dan terutama strain yang digunakan dalam biopestisida Bt sangat aman bagi manusia.
Kata kunci: Bacillus cereus kelompok; biokontrol; biopestisida; keamanan makanan; filogeni
PENGANTAR bahwa mikroba ini tidak dapat menginfeksi vertebrata secara oral,
inhalasi, atau injeksi. Kami lebih suka bahwa mikroba pilihan kami tidak
Mari kita mulai dengan eksperimen pikiran. Apa yang ingin kita, sebagai
berasosiasi dengan manusia, bahkan secara komensal, dan akan lebih
ilmuwan dan regulator, ingin ketahui agar dapat dengan yakin
baik jika ceruk biologi dan ekologinya dijelaskan dengan baik. Jika kita
merekomendasikan bahwa agen pengontrol mikroba aman untuk
sangat berhati-hati, kita mungkin ingin menunda memberikan
diterapkan pada tanaman yang tumbuh? Kita perlu yakin bahwa komponen
pendapat ilmiah yang kuat sampai produk semacam itu digunakan di
aktif utama dari biopestisida kita tidak memiliki kesempatan untuk
lapangan selama beberapa tahun, mungkin selama beberapa dekade.
berinteraksi dengan reseptor pada sel manusia. Kami ingin tahu
memungkinkan penggunaan kembali, distribusi, dan reproduksi tanpa batas dalam media apa pun, asalkan karya aslinya dikutip dengan benar.
1
2 Ekologi Mikrobiologi FEMS, 2017, Jil. 93, No.7
Untuk pestisida mikroba terlaris di dunia, Bacillus thuringiensis (Bt), keluarga lima makan mie keju; tiga anggota keluarga juga makan salad
kami memiliki semua informasi ini (Siegel 2001; Federici dan Siegel dan ketiga anggota ini jatuh sakit diare (EFSA2016). Sampel makanan
2007). Tidak hanyaBt aman untuk vertebrata tetapi sejumlah ulasan, dianalisis untuk agen penyebab dugaan: salad mengandung 3× 104
termasuk kelompok kerja IOBC/WPRS, telah menyimpulkan bahwa Bt CFU g1 dari Bt; mie keju mengandung 6.0× 103 CFU g1 dari SMNS Bt
juga merupakan salah satu produk teraman yang tersedia dalam hal diidentifikasi sebagai tidak dapat dibedakan dari Bt aizawa strain yang
dampak pada serangga non-target (Hassan 1992; Glare dan merupakan bahan aktif biopestisida Xen-Tari yang dioleskan pada
O'Callaghan2000). Bt oleh karena itu merupakan bagian penting yang tanaman rujak yang bersangkutan. Ulangi pengambilan sampel salad
ramah lingkungan dari kit alat manajemen hama modern. Satu- dari supermarket tempat ditemukannya produk asli yang dibeliBt
satunya kelompok pestisida lain yang mungkin lebih aman adalah konsentrasi 4 × 104 dan 1,5 × 105 CFU
produk baculovirus, yang biasanya memiliki kisaran inang yang sangat
sempit seperti genus atau spesies serangga (Huber1988), dan G1.
merupakan pasar kecil karena harus diproduksi di ulat. Terlepas dari Tingkat bukti ini tidak dapat dipercaya berimplikasi Bt sebagai
akumulasi data biologis, ekologi dan keamanan selama beberapa penyebab infeksi karena ada dua kemungkinan agen etiologi yang
dekade, penggunaanBt sekarang di bawah ancaman di Eropa. Secara terlibat. Namun, kita dapat menggunakan literatur ilmiah untuk
injeksi / gavage biasanya lebih besar dari 108 spora, yang bagi manusia dari 1010 CFU ml1 tidak mempengaruhi tikus (Berlitz dkk. 2012) dan selama 5
akan setara dengan dosis di wilayah 1011 spora (Siegel 2001). Untuk hari sukarelawan manusia dapat mengkonsumsi 1 g per hari (~ 1011
menempatkan ini dalam perspektif, itu adalah dosis yang ditemukan spora) dari produk yang diformulasikan (Thuricide) berdasarkan: Bt
pada~10.000 kg salad dalam insiden keracunan makanan Jerman di tanpa efek buruk (Siegel 2001). Studi epidemiologis mengkonfirmasi
atas. hasil tes toksisitas akut. Aplikasi seluruh kota dariBt ke Auckland di
Khususnya, sulit untuk menemukan bukti dosis oral Bt biopestisida yang Selandia Baru dan ke Victoria di British Columbia tidak menghasilkan
cukup tinggi untuk menyebabkan infeksi atau gejala lain pada vertebrata. dampak yang dapat dideteksi pada masalah kesehatan dibandingkan
Tikus diberi makan 109 spora per hari selama 730 hari berhasil tidak dengan daerah yang tidak disemprot di kota-kota tersebut, meskipun
mengalami efek buruk (Siegel 2001); dosis 1012 tidak memiliki efek pada peningkatan tingkat spora Bt kurstaki dapat dipulihkan dari usap
domba atau tikus (Siegel 2001). Studi tikus khususnya menilai enam strain hidung penduduk, mengkonfirmasikan bahwa telah ada paparan
berbeda selama 3 minggu. Sebuah konsentrasi (Federici dan Siegel 2007).
4 Ekologi Mikrobiologi FEMS, 2017, Jil. 93, No.7
Terjadinya Bt dan Bc dalam makanan dan Juga keliru bagi regulator untuk menyimpulkan dari studi ini bahwa
lingkungan membatasi residu semprotan pada tanaman akan secara substansial
mengurangi paparan terhadap Bt dalam makanan. Misalnya, hanya 5 dari 40
Mengingat studi eksperimental di atas tentang keamanan Bt untuk galur (12,5%) yang diuji memiliki karakteristik profilBtbiopestisida.
vertebrata, adalah relevan untuk dicatat tingkat dan komposisi Bt Kelemahan lain dalam penelitian ini adalah bahwa tes PCR hanya menyaring
produk yang biasa digunakan untuk mengendalikan hama ulat di dua gen cry (menangis1Aa dan menangis1Ab) yang terjadi secara luas di
pertanian organik dan program pengelolaan hama terpadu. Tidak banyak alam Bt isolat (Crickmore dkk. 1998) jadi tes ini tidak cukup sensitif
seperti kebanyakan insektisida kimia sintetik,Bt biopestisida dapat untuk secara andal mengidentifikasi strain apa pun yang memiliki asal
diterapkan selambat-lambatnya sehari sebelum panen karena catatan biopestisida. Dalam studi lanjutan, Frederiksendkk. (2006) menggunakan
keamanannya. Produk seperti Biobit, Dipel, Foray dan Thuricide, serta plasmid dan menangis profil gen untuk menentukan apakah SM galur
banyak lainnya yang digunakan di berbagai negara di seluruh dunia kelompok memiliki genotipe yang identik dengan Bt biopestisida. Fredriksen
didasarkan pada isolat HD-1 dariBt kurstaki. Selain spora yang hidup, dkk. (2006) menemukan bahwa 18% dari 128 isolat memiliki profil plasmid
produk ini mengandung empat protein insektisida: Cry1Aa, Cry1Ab, yang berkarakteristik Bt strain yang digunakan dalam produk komersial.
Cry1Ac dan Cry2Aa (Crickmoredkk.1998; Schnepfdkk. 1998). Demikian Ketika genotipe ini hadir dalam konsentrasi tinggi (CFU> 10.000 g1), strain ini
Tabel 1. ST yang terkait dengan jurusan Bt serovar yang digunakan dalam pengendalian hama serangga semuanya diperoleh dari serangga dan sumber
lingkungan. Urutan nomor ST unik didefinisikan di sini sesuai dengan profil alel unik dalam skema MLST yang dikembangkan oleh Priestdkk. (2004) dan
dihosting oleh pub.mlst.org. Asal isolat yang cocok dengan profil alel dari galur biopestisida ini telah dieksplorasi: semua diperoleh dari atau bahan lingkungan
(tanaman, tanah), tidak ada yang ditemukan dari studi klinis pada manusia. Total strain dalam database pub.mlst: 2095: 18 dari diare; 42 dari kotoran; 47
darah; 5 muntah; 9 saluran pernapasan; 7 luka. ST ini dicocokkan dengan database SuperCAT yang lebih luas yang mengumpulkan informasi dari semua
skema MLST yang tersedia dariB. cereus kelompok serta seluruh data genom (http://mlstoslo.uio.no). Informasi tentang asal dan karakteristik isolat ditentukan
dari database di atas atau dari referensi yang terdaftar untuk isolat.
dipelajari oleh McIntyre dkk. (2008), Bt terjadi pada makanan yang pasang surut Bt strain menyebabkan infeksi yang kita harapkan untuk
dikonsumsi di empat wabah ini (10%) berdasarkan deteksi menangis melihat ST kromosom mereka dalam infeksi klinis. Pertanyaan dari
gen dan kristal. MeskipunBt dapat diperoleh dari makanan, tidak B. cereus situs web pubMLST (http://pubmlst.org/bcereus/), yang
pernah ditemukan dalam spesimen tinja klinis, tidak seperti SM ( mendefinisikan ST di atas (Jolley dan Maiden 2010), atau gabungan
McIntyre, dkk.2008). Mengingat tingginya prevalensiBt pada tanaman SUPERCAT B. cereus basis data (Tourasse, Okstad dan Kolst.2010)
dan tanaman yang disemprot, dan harapan bahwa Bt harus bereplikasi belum mengidentifikasi satu kasus pun, hingga saat ini, di mana infeksi
di usus untuk menyebabkan infeksi (Ceuppens dkk. 2012b), tidak dapat klinis atau kasus diare dikaitkan dengan salah satu dari:Bt biopestisida
disimpulkan bahwa Bt adalah agen penyebab dari data ini. Oleh karena ST. Meskipun masih ada beberapa ambiguitas tentang ST yang tepat
itu kami tidak akan setuju dengan interpretasi EFSA Opinion tentang dariBt aizawa regangan dalam produk Xen-Tari, no aizawa strain
artikel ini yang menggambarkan 'B. thuringiensis keracunan makanan pernah dikaitkan dengan infeksi vertebrata. Basis data SUPERCAT
terkait' (hal 22, paragraf 3.2.2). Dalam studi sebelumnya oleh Jackson berisi data tentang 2341 isolat, 490 di antaranya telah pulih dari infeksi
dkk.(1995), tinja dari 18 orang selama wabah keracunan makanan vertebrata atau yang membawa pX01 atau pX02antraks plasmid
diperiksa, dan pada 4 orang sampel tersebut memiliki kristal dan virulensi.
karakteristik tipe fag dari Bt, tetapi juga adanya agen etiologi yang
lebih masuk akal, virus Norwalk. Tidak ada penelitian yang Sekali lagi, kita dapat menggunakan jaring kita secara lebih luas
memberikan data dan juga tidak mengklaim bahwaBt galur yang untuk menentukan apakah ada ST yang digambarkan sebagai Bt
diidentifikasi menyebabkan wabah atau berasal dari Bt biopestisida. pernah dikaitkan dengan infeksi klinis. Di sini kita fokus pada isolat di
Singkatnya, semua kasus di manaBt sembuh dari infeksi berhubungan clade 2, seperti yang ada di 'antraks' clade atau clade 1 sudah dapat
dengan penekanan kekebalan, baik sebagai akibat dari pembakaran, dianggap lebih berbahaya bagi vertebrata (Gbr. 1). Di clade 2, hanya
trauma besar atau perawatan medis dan tidak ada bukti yang ada beberapa genotipe yang telah ditemukan dari kedua sumber klinis
meyakinkan bahwa salah satu jenis yang diteliti adalah penyebab dan dijelaskan oleh orang lain sebagaiBt (pakistan ST18 dan
diare. darmstadiensis ST56) serta a SM genotipe yang sesuai dengan Bt
Terlepas dari banyaknya penelitian dan data yang dihasilkan HD-771 dijelaskan oleh Tourasse dkk. (2006). Genotipe lain awalnya
selama 50 tahun terakhir yang mendukung keamanan Bt, pendapat dilaporkan terdiri dari campuran produsen dan non-produsen Cry
EFSA membuat klaim mengejutkan bahwa 'kontribusi sebenarnya dari (Raymonddkk. 2010b) kemudian terbukti merupakan campuran dari
kedua spesies [B. cereus dan B. thuringiensis] untuk penyakit gastro- genotipe yang berbeda (data B. Raymond tidak dipublikasikan).
intestinal dan non-gastrointestinal yang saat ini tidak diketahui'. Dasar Dengan demikian, hanya segelintir isolat yang memiliki genotipe yang
dari pernyataan ini adalah bahwa laboratorium klinis tidak secara rutin berpotensi terkait dengan inklusi Cry dalam satu konteks dan dalam
menyaringSM isolat untuk badan inklusi Cry, dan oleh karena itu tidak konteks lain dalam menginfeksi manusia. Sangat masuk akal bahwa
diketahui apakah infeksi ini disebabkan oleh Bt atau SM Klaim ini kepemilikan plasmid pembawa toksin Cry adalah kejadian sementara
mengabaikan kumpulan data substansial pada klinis SM infeksi atau baru-baru ini dalam genotipe ini dan bahwa infeksi pada manusia
kelompok yang telah muncul sejak penerapan multilocus sequence dikaitkan dengan klon yang kekurangan sintesis toksin Cry. Entri basis
typing (MLST) (Maiden dkk. 1998; Pendetadkk. 2004). Skema MLST data juga dapat mengalami kesalahan. Genotipe dan klon ini tentu saja
untukSM bervariasi, tetapi skema asli menggunakan tujuh lokus, tidak dipelajari dengan baik, dan laporan yang diterbitkan tentang
mencakup 2838 bp gen rumah tangga yang didistribusikan secara luas genotipe ini tidak berisi rincian tentang asal-usul mereka atau
di seluruh genom (Priest dkk. 2004). Sementara teknik MLST sedang bagaimana strain diketik sebagaiBt.
digantikan oleh sekuensing seluruh genom, metode yang lebih tua Singkatnya, kami memiliki banyak data tentang apakah atau tidak
masih merupakan alat yang sensitif untuk membedakan genotipe Bt genotipe dikaitkan dengan infeksi klinis. Fakta bahwa tidak satu pun
kromosom dan telah menghasilkan database substansial pada ribuan dari banyak infeksi klinis yang terkait denganSM sensu lato yang
isolat selama lebih dari 10 tahun. pernah ditemukan disebabkan oleh genotipe biopestisida menegaskan
Yang terpenting untuk diskusi ini, kuncinya Bt galur biopestisida hasil pengujian keamanan selama beberapa dekade dan studi
memiliki jenis urutan yang dapat dikenali (STs) yang tidak dibagi epidemiologi di seluruh kota. Fakta bahwa hanya sejumlah kecil isolat
dengan yang diketahui SM strain (Tabel 1). Mengingat tingkat spora klinis yang menjalani pengujian MLST yang pernah terbukti secara
biopestisida dalam makanan dan lingkungan, jika biopestisida genotip tidak dapat dibedakan.
6 Ekologi Mikrobiologi FEMS, 2017, Jil. 93, No.7
dapat dibedakan dari klon juga digambarkan sebagai Bt juga harus memberi kita di beberapa clades, tidak semua Bt strain diharapkan sama amannya,
kepercayaan diri. seperti yang disarankan oleh diskusi di atas. Strain lebih dekat
hubungannya denganantraks lebih sering dikaitkan dengan infeksi
Filogeni adalah indikator risiko infeksi yang lebih baik vertebrata, memberi kita harapan akan risiko yang lebih besar. Analisis
filogenetik ini mendukung data dari uji keamanan akut yang
untuk vertebrata daripada pembawa gen enterotoksin
menunjukkan bahwa:B. antraks setidaknya satu juta kali lebih
Beberapa SM spesialis, serta pendapat EFSA, membuat argumen berbahaya bagi vertebrata daripada noda biopestisida Bt (Siegel 2001).
bahwa Bt bisa berbahaya bagi vertebrata karena bakteri ini membawa Secara kritis, garis keturunan yang mengandung strain biopestida dari
gen hemolitik enterotoksin yang dianggap bertanggung jawab atas serovarisraelensis, morrisoni (strain tenebrionis), kurstaki dan aizawa
kemampuan SM menyebabkan diare (Granum dan Lund 1997; Stenfors tidak mungkin terkait dengan infeksi pada manusia (Gbr. 1). Informasi
Arnesen, Fagerlund dan Granum2008; EFSA2016). Sangat penting terbaru yang tersedia di database SuperCat mengkonfirmasi analisis
untuk dicatat bahwa itu adalah emetikSM strain yang menyebabkan sebelumnya ini: 72% dari 548 isolat diantraks clade (clade 1 atau cluster
kasus keracunan makanan yang paling serius karena produksi toksin III) sangat mirip B. antraks itu sendiri atau telah dikaitkan dengan
cereulide yang berbeda, dan strain ini sebagian besar terbatas pada infeksi vertebrata, sementara hanya 29% dari 866 isolat di kelas 2 yang
tidak ada data yang kuat untuk menunjukkan bahwa manusia mungkin Ceuppens S, Van de Wiele T, Rajkovic A dkk. Dampak di-
merupakan pengecualian. Analisis filogenetik diferensiasi ekologi di mikrobiota testis dan kondisi gastrointestinal pada kelangsungan hidup
seluruhSM kelompok menunjukkan bahwa ada sangat sedikit strain Bt dan pertumbuhan in vitro Bacillus cereus. Mikrobiol Makanan Int J
dengan risiko tinggi untuk vertebrata (Guinebretière dkk. 2010; 2012b;155:241–6.
Raymonddkk. 2010b; Raymond dan Bonsall2013). Ini akan mencakup Cornforth DM, Matthews A, Brown SP dkk. Kerja sama bakteri
subsp.konkukian, yang awalnya diisolasi dari seorang prajurit yang menyebabkan kesalahan sistematis dalam penilaian risiko patogen
terluka parah oleh ranjau darat (Hernandez, Ramisse dan Ducoureau karena kegagalan hipotesis tindakan independen. Patologi PLoS
1998). Isolat itu memang menimbulkan risiko yang lebih besar bagi 2015;11:e1004775.
tikus daripada galur biopestisidaBt (Hernandez dkk. 2000). Yang Crickmore N, Zeigler DR, Feitelson J dkk. Revisi nomen-
terpenting,Bt konkukian dapat dengan kuat ditempatkan di antraks clature untuk Bacillus thuringiensis protein kristal pestisida.
clade dan jauh terkait dengan semua strain biopestisida (Han dkk.2006; Mikrobiol Mol Biol R 1998;62:807–13.
Raymonddkk. 2010b; Raymond dan Bonsall2013); itu juga tidak terbukti Damgar PH. Produksi enterotoksin diare oleh strain
patogen bagi serangga. Berdasarkan diferensiasi ekologi di seluruhSM dari Bacillus thuringiensis terisolasi dari komersial Bacillus
grup, kami tidak akan merekomendasikan lisensi apa pun Bt produk thuringiensisberbasis insektisida. FEMS Immunol Med Mic1995;12
Hernandez E, Ramise Fo, Gros P dkk. Infeksi super oleh basil- Raymond B, Johnston PR, Wright DJ dkk. Mikrobiota usus tengah adalah
lus thuringiensis H34 atau 3a3b dapat menyebabkan kematian tidak diperlukan untuk patogenisitas Bacillus thuringiensis untuk
pada tikus yang terinfeksi virus influenza A. FEMS Immunol Med larva ngengat diamondback. Mikrobiol Lingkungan 2009;11:2556–
Mic2000;29:177–81. 63. Raymond B, Lijek RS, Griffiths RIdkk. Konsekuensi ekologis
Huber J. Keamanan Baculoviruses digunakan sebagai insektisida biologis. menelan Bacillus cereus pada Bacillus thuringiensis infeksi dan
Dalam: Penilaian Risiko untuk Rilis yang Disengaja. Berlin: Springer, pada flora usus dari host lepidopteran. J Invert Pathol2008;99:103–
1988, 65–71. 11.
Itova-Aoyolo C, Drif L, DeBarjac H dkk. Isolasi beberapa Raymond B, SA Barat, Griffin AS dkk. Dinamika kerjasama
spesies dari Bacillus thuringiensis dari populasi ngengat bunga virulensi bakteri di lapangan. Sains 2012;337:85–8. Raymond B,
matahari Eropa, Homoeosoma nebuella. Mikroba Lingkungan Appl Wyres KL, Sheppard SKdkk. Fakta lingkungan-
1995;61:4343–7. menentukan epidemiologi dan struktur genetik populasi dari
Jackson SG, Goodbrand RB, Ahmed R dkk. Bacillus cereusdan Bacillus cereus kelompok di lapangan. Patologi PLoS2010b;6
Bacillus thuringiensis diisolasi dalam penyelidikan wabah :e1000905.
gastroenteritis. Lett Appl Microbiol 1995;21:103–5. Rosenquist H, Smidt L, Andersen SR dkk. Kejadian dan tanda-