Glikolisis adalah urutan reaksi yang memetabolisme satu molekul glukosa menjadi dua molekul piruvat

dengan

produksi bersih bersamaan dari dua molekul ATP. Proses ini anaerobik (yaitu, tidak memerlukan O2)
karena

itu berkembang sebelum akumulasi sejumlah besar oksigen di atmosfer. Piruvat bisa lebih jauh

diproses secara anaerob (difermentasi) menjadi laktat (fermentasi asam laktat) atau etanol (fermentasi
alkohol). Dibawah

kondisi aerobik, piruvat dapat sepenuhnya teroksidasi menjadi CO2, menghasilkan lebih banyak ATP,

Glukosa dapat disintesis dari prekursor non-karbohidrat, seperti piruvat dan asam laktat, dalam proses

glukoneogenesis. Meskipun glikolisis dan glukoneogenesis memiliki beberapa enzim yang sama,
keduanya

jalur tidak hanya kebalikan dari satu sama lain. Secara khusus, langkah-langkah glikolisis yang sangat
eksergonik dan tidak dapat diubah adalah

dilewati dalam glukoneogenesis. Kedua jalur dikontrol secara ketat oleh sinyal antar sel dan intraseluler,
dan keduanya

diatur secara timbal balik sehingga glikolisis dan glukoneogenesis tidak berlangsung secara bersamaan
dalam sel yang sama dengan a

tingkat yang signifikan.

glukosa

adalah salah satu monosakarida yang terbentuk dari formaldehida dalam kondisi prebiotik, sehingga
mungkin telah tersedia sebagai a

sumber bahan bakar untuk sistem biokimia primitif. Kedua, glukosa memiliki kecenderungan yang
rendah, relatif terhadap monosakarida lain, terhadap

protein glikosilat secara nonenzimatis. Dalam bentuk rantai terbuka (karbonil), monosakarida dapat
bereaksi dengan amino

kelompok protein untuk membentuk basa Schiff, yang mengatur ulang untuk membentuk ikatan keton
amino yang lebih stabil/ protein yang dimodifikasi secara tidak spesifik seringkali tidak berfungsi secara
efektif. Glukosa memiliki kecenderungan kuat untuk berada di dalam ring

pembentukan dan, akibatnya, kecenderungan yang relatif kecil untuk memodifikasi protein. Ingatlah
bahwa semua gugus hidroksil di dalam cincin

konformasi b-glukosa adalah ekuator, berkontribusi pada stabilitas relatif tinggi ini
glikolisis adalah proses yang hampir universal, nasib produk akhirnya, piruvat, dapat bervariasi pada
organisme yang berbeda.

atau bahkan di jaringan yang berbeda. Dengan adanya oksigen, situasi yang paling umum terjadi pada
organisme multisel dan banyak lagi

uniseluler, piruvat dimetabolisme menjadi karbon dioksida dan air melalui siklus asam sitrat dan
electrontransport.

rantai. Dengan tidak adanya oksigen, fermentasi menghasilkan jumlah energi yang lebih sedikit; piruvat
diubah, atau

difermentasi, menjadi asam laktat dalam fermentasi asam laktat atau menjadi etanol dalam fermentasi
alkohol

…..

prokariotik dan eukariotik. Dalam sel eukariotik, glikolisis terjadi di sitosol. Jalur ini dapat dianggap
sebagai

terdiri dari tiga tahap (Gambar 16.3). Tahap 1, yaitu konversi glukosa menjadi fruktosa 1,6-bifosfat,

terdiri dari tiga langkah: fosforilasi, isomerisasi, dan reaksi fosforilasi kedua. Strategi ini

Langkah awal dalam glikolisis adalah menjebak glukosa di dalam sel dan membentuk senyawa yang
dapat dengan mudah dipecah

unit tiga karbon terfosforilasi. Tahap 2 adalah pemecahan fruktosa 1,6-bifosfat menjadi dua tiga karbon

fragmen. Unit tiga karbon yang dihasilkan ini dengan mudah dapat dipertukarkan. Pada tahap 3, ATP
dipanen saat tiga karbon

fragmen dioksidasi menjadi piruvat

..

Tahap 1

Glukosa memasuki sel melalui protein transpor spesifik (Bagian 16.2.4) dan memiliki satu nasib utama:
itu terfosforilasi

oleh ATP untuk membentuk glukosa 6-fosfat. Langkah ini penting karena dua alasan: (1) glukosa 6-fosfat
tidak dapat berdifusi

melalui membran, karena muatan negatifnya, dan (2) penambahan gugus fosforil dimulai

mendestabilkan glukosa, sehingga memfasilitasi metabolisme selanjutnya. Transfer gugus fosforil dari
ATP kegugus hidroksil pada karbon 6 glukosa dikatalisis oleh heksokinase
Kinase adalah enzim yang mengkatalisis transfer gugus fosforil dari ATP ke

akseptor. Hexokinase, kemudian, mengkatalisis transfer gugus fosforil dari ATP ke berbagai gula enam
karbon.

(heksosa), seperti glukosa dan manosa. Hexokinase, seperti adenylate kinase, membutuhkan Mg 2 +
(atau ion logam divalen lain seperti Mn 2 +) untuk aktivitas. Ion logam divalen membentuk kompleks
dengan

ATP.

pengikatan glukosa, satu lobus berputar 12 derajat terhadap lobus lainnya, mengakibatkan pergerakan
lobus

tulang punggung polipeptida sebanyak 8 Å. Celah antara lobus menutup, dan glukosa yang terikat
menjadi dikelilingi

oleh protein, kecuali gugus hidroksil karbon 6, yang akan menerima gugus fosforil dari ATP. Penutupan

celah dalam heksokinase adalah contoh yang mencolok dari peran kecocokan yang diinduksi dalam aksi
enzim. Perubahan struktural yang diinduksi glukosa signifikan dalam dua hal. Pertama, lingkungan di
sekitar glukosa

menjadi jauh lebih nonpolar, yang mendukung sumbangan dari gugus fosforil terminal ATP. Kedua,
sebagaimana dicatat dalam

Bagian 9.4.3, perubahan konformasi yang diinduksi substrat dalam kinase memungkinkannya untuk
mendiskriminasi H2O sebagai a

substrat. Jika heksokinase kaku, molekul H2O menempati situs pengikatan untuk-CH2OH glukosa akan

menyerang gugus fosforil ATP, membentuk ADP dan Pi. Dengan kata lain, kinase yang kaku juga akan
menjadi sebuah

ATPase. Menarik untntuk dicatat bahwa kinase lain yang mengambil bagian dalam glikolisis piruvat
kinase, fosfogliserat kinase,

dan fosfofruktokinase juga mengandung celah antara lobus yang menutup ketika substrat terikat,
meskipun strukturnya. Jika heksokinase kaku, molekul H2O menempati situs pengikatan untuk-CH2OH
glukosa akan

menyerang gugus fosforil ATP, membentuk ADP dan Pi. Dengan kata lain, kinase yang kaku juga akan
menjadi sebuah

ATPase. Menarik untuk dicatat bahwa kinase lain yang mengambil bagian dalam glikolisis piruvat kinase,
fosfogliserat kinase,

dan fosfofruktokinase juga mengandung celah di antara lobus yang menutup ketika substrat terikat,
meskipun strukturnya

enzim ini berbeda dalam hal lain. Penutupan celah yang diinduksi substrat adalah ciri umum kinase.
..

Tahap2. Pembentukan Fruktosa 1,6-bifosfat dari Glukosa 6-fosfat

Langkah selanjutnya dalam glikolisis adalah isomerisasi glukosa 6-fosfat menjadi fruktosa 6-fosfat.
Ingatlah bahwa rantai terbuka

bentuk glukosa memiliki gugus aldehida pada karbon 1, sedangkan bentuk rantai terbuka fruktosa
memiliki gugus keto pada

karbon 2. Jadi, isomerisasi glukosa 6-fosfat menjadi fruktosa 6-fosfat merupakan konversi dari aldosa
menjadi a

ketosa. Reaksi yang dikatalisis oleh fosfoglukosa isomerase mencakup langkah-langkah tambahan
karena keduanya glukosa 6-fosfat

dan fruktosa 6-fosfat hadir terutama dalam bentuk siklik. Enzim pertama-tama harus membuka cincin
beranggota enam

glukosa 6-fosfat, mengkatalisis isomerisasi, dan kemudian mendorong pembentukan cincin beranggota
lima fruktosa 6-

fosfat. Reaksi fosforilasi kedua mengikuti

langkah isomerisasi. Fruktosa 6-fosfat difosforilasi oleh ATP menjadi

fruktosa 1,6-bifosfat (F-1,6-BP). Awalan bis- dalam bifosfat berarti dua gugus monofosfat terpisah

ada, sedangkan awalan di- dalam difosfat (seperti dalam adenosin difosfat) berarti bahwa dua gugus
fosfat adalah

hadir dan dihubungkan oleh ikatan anhidrida. Reaksi ini dikatalisis oleh fosfofruktokinase (PFK), enzim
alosterik yang mengatur kecepatan glikolisis.

16.1.4. Isomerase fosfat triosa Menyelamatkan Fragmen Tiga Karbon

Gliseraldehida 3-fosfat berada pada jalur langsung glikolisis, sedangkan fosfat dihidroksiaseton tidak.
Kecuali a

ada sarana untuk mengubah dihidroksiaseton fosfat menjadi gliseraldehida 3-fosfat, sebuah fragmen
tiga karbon yang berguna.
untuk menghasilkan ATP akan hilang. Senyawa ini adalah isomer yang dapat dengan mudah diubah
menjadi: dihidroksiaseton

fosfat adalah ketosa, sedangkan gliseraldehida 3-fosfat adalah aldosa. Isomerisasi tiga karbon ini

gula terfosforilasi dikatalisis oleh isomerase fosfat triosa (TIM; Gambar 16.5). Reaksi ini cepat dan

reversibel. Pada kesetimbangan, 96% triosa fosfat adalah dihidroksiaseton fosfat. Namun, reaksi terus
berlanjut

mudah dari dihidroksiaseton fosfat menjadi gliseraldehida 3-fosfat karena reaksi glikolisis selanjutnya

hapus produk ini. Banyak yang diketahui tentang mekanisme katalitik dari triosa fosfat isomerase. TIM
mengkatalisis transfer hidrogen

atom dari karbon 1 menjadi karbon 2 dalam mengubah dihidroksiaseton fosfat menjadi gliseraldehida 3-
fosfat, sebuah

oksidasi-reduksi intramolekul. Isomerisasi ketosa menjadi aldosa ini berlangsung melalui enediol

menengah (Gambar 16.6).

Kristalografi sinar-X dan penelitian lain menunjukkan bahwa glutamat 165 (lihat Gambar 16.5) berperan
sebagai asam basa umum.

katalisator. Namun, gugus karboksilat ini sendiri tidak cukup mendasar untuk menarik proton menjauh
dari atom karbon

berdekatan dengan gugus karbonil. Histidin 95 membantu katalisis dengan menyumbangkan proton
untuk menstabilkan muatan negatif itu

berkembang pada gugus karbonil C-2.

Dua ciri enzim ini patut diperhatikan. Pertama, TIM menampilkan kehebatan katalitik yang luar biasa. Ini
mempercepat isomerisasi

faktor 1010 dibandingkan dengan laju yang diperoleh dengan katalis basa sederhana seperti ion asetat.
Memang, k cat / K M

rasio isomerisasi gliseraldehida 3-fosfat adalah 2 × 108 M-1 s-1, yang mendekati batas yang dikontrol
difusi.

Dengan kata lain, langkah pembatas laju dalam katalisis adalah pertemuan substrat dan enzim yang
dikendalikan oleh difusi. TIM adalah

sebuah contoh dari enzim yang sempurna secara kinetik (Bagian 8.2.5). Kedua, TIM menekan reaksi
samping yang tidak diinginkan, yaitu

dekomposisi antara enediol menjadi metil glioksal dan fosfat anorganikDalam larutan, reaksi yang tidak
berguna secara fisiologis ini 100 kali lebih cepat dari isomerisasi. Oleh karena itu, TIM harus mencegah
terjadinya

enediol meninggalkan enzim. Perantara labil ini terperangkap di situs aktif oleh pergerakan loop 10
residu (lihat Gambar 16.5). Loop ini berfungsi sebagai penutup di situs aktif, menutupnya saat enediol
ada dan

membukanya kembali saat isomerisasi selesai. Di sini kita melihat contoh yang mencolok tidak hanya
dari kesempurnaan katalitik, tetapi juga dari

percepatan reaksi yang diinginkan sehingga berlangsung lebih cepat daripada reaksi alternatif yang tidak
diinginkan. Jadi,

dua molekul gliseraldehida 3-fosfat dibentuk dari satu molekul fruktosa 1,6-bifosfat oleh

aksi sekuensial aldolase dan triosa fosfat isomerase. Ekonomi metabolisme terbukti dalam reaksi ini

urutan. Isomerase menyalurkan dihidroksiaseton fosfat ke dalam jalur glikolitik utama satu set terpisah

reaksi tidak diperlukan.

16.1.5. Transformasi Energi: Fosforilasi Digabungkan dengan Oksidasi

Glyceraldehyde 3-phosphate oleh Thioester Intermediate

Langkah-langkah sebelumnya dalam glikolisis telah mengubah satu molekul glukosa menjadi dua
molekul gliseraldehida 3-

fosfat, tetapi belum ada energi yang diekstraksi. Sebaliknya, sejauh ini dua molekul ATP telah
diinvestasikan. Kita

sampai sekarang ke serangkaian langkah yang memanen sebagian energi yang terkandung dalam
gliseraldehida 3-fosfat. Inisial

Reaksi dalam urutan ini adalah konversi gliseraldehida 3-fosfat menjadi 1,3-bifosfogliserat (1,3-BPG), a

Reaksi dikatalisis oleh gliseraldehida 3-fosfat dehidrogenase. 1,3-Bisphosphoglycerate adalah asil fosfat.
Senyawa semacam itu memiliki potensi transfer fosforil yang tinggi; salah satunya

gugus fosforil ditransfer ke ADP pada langkah berikutnya dalam glikolisis. Reaksi dikatalisis oleh
gliseraldehida 3-

fosfat dehidrogenase sebenarnya merupakan hasil penjumlahan dari dua proses: oksidasi aldehida
menjadi asam karboksilat oleh NAD +

dan bergabungnya asam karboksilat dan ortofosfat untuk membentuk produk asil-fosfat. Reaksi
pertama cukup menguntungkan secara termodinamika dengan perubahan energi bebas standar, D G ° ´,
sekitar -12

kkal mol-1 (-50 kJ mol-1), sedangkan reaksi kedua cukup tidak menguntungkan dengan perubahan
energi bebas standar

besarnya sama tetapi tanda sebaliknya. Jika kedua reaksi ini terjadi secara berurutan, reaksi kedua akan
terjadi

memiliki energi aktivasi yang sangat besar sehingga tidak berlangsung pada tingkat yang signifikan
secara biologis. Kedua proses ini haruslah
digabungkan sehingga oksidasi aldehida yang disukai dapat digunakan untuk mendorong pembentukan
asil fosfat. Bagaimana ini

reaksi digabungkan? Kuncinya adalah zat antara, yang terbentuk sebagai hasil oksidasi aldehida, yang
lebih tinggi energi bebasnya

daripada asam karboksilat gratis. Bahan antara ini bereaksi dengan ortofosfat untuk membentuk produk
asil-fosfat.

Mari kita pertimbangkan mekanisme gliseraldehida 3-fosfat dehidrogenase secara rinci (Gambar 16.8).
Pada langkah 1, file

substrat aldehida bereaksi dengan gugus sulfhidril dari sistein 149 pada enzim untuk membentuk
hemitioasetal. Langkah 2 adalah

transfer ion hidrida ke molekul NAD + yang terikat erat dengan enzim dan berdekatan dengan sistein

residu. Reaksi ini didukung oleh deprotonasi hemithioacetal oleh histidin 176. Produk ini

Reaksi adalah koenzim tereduksi NADH dan zat antara tioester. Perantara tioester ini memiliki energi
bebas

dekat dengan reaktan. Pada langkah 3, ortofosfat menyerang tioester untuk membentuk 1,3-BPG dan
membebaskan sistein

residu. Perpindahan ini terjadi hanya setelah NADH yang terbentuk dari oksidasi aldehida meninggalkan
enzim dan

telah diganti dengan NAD + kedua. Muatan positif pada NAD + dapat membantu mempolarisasi
perantara tioester ke

memfasilitasi serangan ortofosfat.

Contoh ini menggambarkan esensi transformasi energi dan metabolisme itu sendiri: energi yang
dilepaskan oleh karbon

oksidasi diubah menjadi potensi transfer fosforil yang tinggi. Oksidasi yang menguntungkan dan
fosforilasi yang tidak menguntungkan

reaksi digabungkan dengan zat antara tioester, yang mempertahankan banyak energi bebas yang
dilepaskan dalam oksidasi

reaksi. Di sini kita melihat penggunaan zat antara terikat enzim kovalen sebagai mekanisme
penggandengan energi. Energi bebas

profil reaksi gliseraldehida 3-fosfat dehidrogenase, dibandingkan dengan proses hipotetis di

dimana reaksi berlangsung tanpa perantara ini, mengungkapkan bagaimana perantara ini
memungkinkan proses yang menguntungkan untuk dijalankan

yang tidak menguntungkan

16.1.6. Pembentukan ATP dari 1,3-Bisphosphoglycerate

Tahap terakhir dalam glikolisis adalah pembentukan ATP dari metabolit glukosa tiga karbon
terfosforilasi.

Phosphoglycerate kinase mengkatalisis transfer gugus fosforil dari asil fosfat 1,3-

bisphosphoglycerate menjadi ADP. ATP dan 3-fosfogliserat adalah produknya. Pembentukan ATP dengan
cara ini disebut sebagai fosforilasi tingkat substrat karena donor fosfat, 1,3-

BPG, adalah substrat dengan potensi transfer fosforil yang tinggi. Kami akan membandingkan cara
pembentukan ATP ini dengan yang di

ATP mana yang terbentuk dari gradien ionik pada Bab 18 dan 19.

Dengan demikian, hasil dari reaksi dikatalisis oleh gliseraldehida dehidrogenase 3-fosfat dan
fosfogliserat

kinase adalah:

1. Glyceraldehyde 3-phosphate, sebuah aldehyde, dioksidasi menjadi 3-phosphoglycerate, sebuah asam

karboksilat.

2. NAD + secara bersamaan direduksi menjadi NADH.

3. ATP terbentuk dari Pi dan ADP dengan mengorbankan energi oksidasi karbon.

Perlu diingat bahwa, karena aksi aldolase dan triosa fosfat isomerase, dua molekul gliseraldehida 3-

fosfat terbentuk dan karenanya dua molekul ATP dihasilkan. Molekul ATP ini membentuk keduanya

molekul ATP yang dikonsumsi pada tahap pertama glikolisis.

16.1.7. Generasi ATP Tambahan dan Pembentukan Piruvat

Dalam langkah glikolisis yang tersisa, 3-fosfogliserat diubah menjadi piruvat dengan konversi bersamaan

ADP menjadi ATP. Reaksi pertama adalah penataan ulang. Posisi gugus fosforil bergeser dalam konversi
3-

fosfogliserat menjadi 2-fosfogliserat, reaksi yang dikatalisis oleh mutase fosfogliserat. Secara umum,
mutase adalah

enzim yang mengkatalisis pergeseran intramolekul suatu kelompok kimia, seperti gugus fosforil.
Fosfogliserat

Reaksi mutase memiliki mekanisme yang menarik: gugus fosforil tidak begitu saja berpindah dari satu
karbon ke karbon lainnya.

Enzim ini membutuhkan sejumlah katalitik 2,3-bifosfogliserat untuk mempertahankan residu histidin
situs aktif dalam

bentuk terfosforilasi. .. Pemeriksaan reaksi parsial pertama mengungkapkan bahwa mutase berfungsi
sebagai fosfatase yang diubahnya 2,3-

bisphosphoglycerate menjadi 2-phosphoglycerate. Namun, gugus fosforil tetap terkait dengan enzim. Ini
gugus fosforil kemudian dipindahkan ke 3-fosfogliserat untuk membentuk 2,3-bifosfogliserat.

Pada reaksi selanjutnya, enol dibentuk oleh dehidrasi 2-fosfogliserat. Enolase mengkatalisis
pembentukan

fosfoenolpiruvat (PEP). Dehidrasi ini secara nyata meningkatkan potensi transfer gugus fosforil. Sebuah
enol

fosfat memiliki potensi transfer fosforil yang tinggi, sedangkan ester fosfat, seperti 2-fosfogliserat, dari

alkohol biasa memiliki yang rendah. D G ° ´ dari hidrolisis ester fosfat dari alkohol biasa adalah -3 kkal
mol-1 (-

13 kJ mol-1), sedangkan fosfoenolpiruvat adalah -14,8 kkal mol-1 (- 62 kJ mol-1). Mengapa

fosfoenolpiruvat

memiliki potensi transfer fosforil yang tinggi? Gugus fosforil menjebak molekul dalam bentuk enol yang
tidak stabil.

Ketika gugus fosforil telah didonasikan ke ATP, enol mengalami konversi menjadi lebih stabil

keton yaitu, piruvat.

Dengan demikian, potensi transfer fosforil yang tinggi dari fosfoenolpiruvat muncul terutama dari
kekuatan pendorong yang besar dari

konversi enol-keton selanjutnya. Oleh karena itu, piruvat terbentuk, dan ATP dihasilkan secara
bersamaan. Secara virtual

transfer ireversibel gugus fosforil dari fosfoenolpiruvat ke ADP dikatalisis oleh piruvat kinase. Karena

molekul ATP yang digunakan untuk membentuk fruktosa 1,6-bifosfat telah diregenerasi, dua molekul

ATP yang dihasilkan dari fosfoenolpiruvat adalah "keuntungan".

Hasil Energi dalam Konversi Glukosa menjadi Piruvat

Reaksi bersih dalam transformasi glukosa menjadi piruvat adalah:

Jadi, dua molekul ATP dihasilkan dalam konversi glukosa menjadi dua molekul piruvat. Reaksi dari

glikolisis diringkas dalam Tabel 16.3.

Perhatikan bahwa energi yang dilepaskan dalam konversi anaerobik glukosa menjadi dua molekul
piruvat adalah -21 kkal mol-1 (-

88 kJ mol-1). Kita akan melihat di Bab 17 dan 18 berapa banyak lebih banyak energi yang dapat
dilepaskan dari glukosa di hadapan

oksigen.
..