Implikasinya di sini adalah karena Asn dan Gln sensitif terhadap deaminasi pada
suhu tinggi, tingkat residu yang lebih tinggi dalam protein termofilik sebagian dapat
menyebabkan ketidakstabilan. Kandungan Cys, Met dan Trp, yang mudah teroksidasi
pada suhu tinggi, juga rendah protein metastabil.
Secara general, interaksi polar (baik jembatan garam dan ikatan hidrogen
fraksional) dalam protein nonpolar bertanggung jawab atas stabilnya termal protein
dalam organisme termofilik dan termofilik. Lingkungan tersebut difasilitasi oleh
kandungan Ile yang tinggi. Ketika ingin meningkatkan stabilitas struktural protein
sekitar 20 kkal/mol jika setiap jembatan garam dalam protein, di mana konstanta
dielektrik sekitar 4. 4.444 organisme juga terbukti mengandung jumlah pasangan ion
protein yang jauh lebih tinggi dan jumlah molekul air terkubur yang secara signifikan
lebih tinggi yang berpartisipasi dalam jembatan ikatan hidrogen intersegmental
dibandingkan dengan organisme mesofilik. Secara keseluruhan, tampaknya interaksi
kutub (baik jembatan garam dan ikatan hidrogen antarmolekul) dalam protein nonpolar
bertanggung jawab atas stabilitas termal protein organisme termofilik dan termofilik.
Panas dan lingkungan seperti itu difasilitasi oleh kandungan Ile yang tinggi.
Jika keadaan kering, Protein memiliki struktur statis, yaitu fluiditas fragmen
polipeptida terbatas. Saat kadar air meningkat, hidrasi dan penetrasi sebagian air ke
dalam rongga permukaan akan menyebabkan protein membengkak. Keadaan
pembengkakan ini, di mana protein dan air berubah dari keadaan amorf menjadi
keadaan seperti spons, mencapai maksimum jika kadar air 0,3-0,4 g air/g protein pada
suhu kamar. Pembengkakan protein meningkatkan fluiditas dan fleksibilitas rantai, dan
molekul protein menyajikan struktur cairan yang lebih dinamis. Jika dipanaskan,
struktur fleksibel dinamis ini dapat memberikan lebih banyak air untuk memasuki
jembatan garam dan ikatan hidrogen peptida daripada dalam keadaan kering,
menyebabkan aditif seperti garam dan gula mempengaruhi stabilitas termal protein
dalam larutan berair. Gula seperti sukrosa, laktosa, glukosa dan gliserin dapat
menstabilkan protein dan mencegah denaturasi panas