7.

Jumlah gen yang sangat rendah dalam genom organisme multiseluler yang kompleks

telah menyebabkan ahli biokimia untuk mempertimbangkan penjelasan lain untuk kompleksitas biologis

dan keanekaragaman. Oligosakarida dan polisakarida, dianugerahi dengan tak tertandingi

variabilitas struktur, adalah pembawa informasi, dan glikokonjugat — kompleks dari

protein dengan oligosakarida dan polisakarida — adalah mediator informasi

ditransfer oleh struktur karbohidrat ini. Unit gula individu adalah "huruf"

kode gula, dan "kata-kata" dan "kalimat" dari kode ini disintesis oleh glikosiltransferase,

glikosidase, dan enzim lainnya. Jumlah total permutasi

untuk enam unit polimer yang dibentuk dari alfabet 20 heksosa monosakarida adalah a

mengejutkan 1,44 1015, sedangkan hanya 6,4 107 hexamers dapat dibentuk dari

20 asam amino dan hanya 4.096 heksanukleotida dapat terbentuk dari empat nukleotida

DNA. Susunan yang luas dari struktur-struktur glycan yang mungkin menambah dimensi glycomic

untuk kompleksitas genom yang dicapai oleh ekspresi protein pada organisme.

Proses migrasi sel, interaksi sel-sel, respon imun, dan

pembekuan darah, bersama dengan banyak proses biologis lainnya, bergantung pada informasi

transfer dimodulasi oleh glikokonjugat. Banyak protein yang terlibat dalam glikokonjugat

formasi milik lektin — suatu kelas protein yang mengikat karbohidrat

dengan spesifisitas dan afinitas tinggi. Lektin adalah penerjemah kode gula. Tabel 7.1

menggambarkan beberapa dari banyak lektin yang dikenal, kedekatan karbohidrat mereka, dan mereka

fungsi. Beberapa contoh kompleks lektin-karbohidrat dan perannya dalam biologi

transfer informasi akan menggambarkan sifat penting dan kompleks ini

interaksi.
Selectins, Rolling Leukocytes, dan Inflammatory Response

Tubuh manusia terus-menerus terpapar pada sejumlah besar bakteri, virus, dan lainnya

zat radang. Untuk melawan agen infeksi dan racun ini, tubuh memiliki

mengembangkan sistem respons inflamasi yang diatur dengan hati-hati. Bagian dari respons itu

adalah migrasi teratur leukosit ke situs peradangan. Leukosit

berguling-guling sepanjang dinding pembuluh darah dan ke situs jaringan peradangan. Ini

gerakan bergulir dimediasi oleh interaksi perekat reversibel antara

leukosit dan permukaan pembuluh darah.

Interaksi ini melibatkan protein adhesi yang disebut selektin, yang ditemukan

baik pada leukosit bergulir dan pada sel-sel endotel dari dinding pembuluh darah.

Selectins memiliki struktur domain karakteristik, yang terdiri dari N-terminal ekstraseluler

Lektin (LEC) domain, domain faktor pertumbuhan epidermis tunggal (E), serangkaian

dari dua hingga sembilan domain konsensus ulang pendek (SCR), sebuah transmembran tunggal

segmen, dan domain sitoplasma pendek. Domain lektin mengikat karbohidrat

dengan afinitas dan spesifisitas tinggi. Selectins dari tiga jenis diketahui: E-selectins,

L-selectins, dan P-selectins. L-Selectin ditemukan pada permukaan leukosit, termasuk

neutrofil dan limfosit, dan berikatan dengan ligan karbohidrat pada endotel

sel (Gambar 7.40). Kehadiran L-selectin adalah komponen yang diperlukan

bergulir leukosit. P-Selectin dan E-selectin terletak di endotelium vaskular

dan ikat dengan ligan karbohidrat pada leukosit. Sel-sel neutrofil khas memiliki

10.000 hingga 20.000 situs yang mengikat P-selectin. Selectin diekspresikan pada permukaan

sel mereka masing-masing oleh paparan molekul sinyal inflamasi, seperti histamin,

hidrogen peroksida, dan bakteri endotoksin. P-Selectins, misalnya, adalah

disimpan dalam butiran intraseluler dan diangkut ke membran sel di dalamnya

detik hingga menit paparan agen pemicu.

Bukti substansial mendukung hipotesis bahwa ligan selectin-karbohidrat

interaksi memodulasi bergulirnya leukosit di sepanjang dinding pembuluh darah. Belajar dengan

Leukosit defisiensi L-selektin dan defisiensi P-selektin menunjukkan bahwa L-selektin memediasi

kepatuhan leukosit yang lebih rendah ke dinding pembuluh darah dan mempromosikan lebih cepat

berguling di sepanjang dinding. Sebaliknya, P-selektin meningkatkan kepatuhan dan

bergulir lebih lambat. Dengan demikian, kecepatan bergulir leukosit dalam respon inflamasi bisa

dimodulasi oleh paparan variabel P-selektin dan selektin-L pada permukaan

sel endotel dan leukosit, masing-masing.

Galektin — Mediator Peradangan, Kekebalan, dan Kanker

Galektin adalah keluarga protein yang sangat terkonservasi dengan pengenalan karbohidrat

domain (CRD) dari sekitar 135 asam amino yang mengikat -galactosides khusus.

Galektin terjadi pada vertebrata dan invertebrata, dan mereka ikut serta

proses seperti adhesi sel, regulasi pertumbuhan, peradangan, imunitas, dan

metastasis kanker. Pada manusia, satu galektin dikaitkan dengan peningkatan risiko jantung

serangan dan lainnya terlibat dalam penyakit radang usus. Struktur

human galectin-1 adalah dimer subunit beta-sandwich antiparalel (Gambar 7.41a).

Laktosa mengikat ujung-ujung dimer yang berlawanan. Studi struktural dari protein dalam

ada dan tidak adanya ligan mengungkapkan bahwa residu asam amino terlibat dalam

Ikatan galaktosa disimpan dalam orientasi yang tepat tanpa adanya ligan oleh a

jaringan berikatan hidrogen dari empat molekul air

C-Reactive Protein — Lektin yang Membatasi Kerusakan Peradangan

Pentraxins adalah lektin yang mengadopsi struktur kuaterner di mana lima

subunit identik bergabung membentuk cincin planar dengan lubang pusat.

Protein C-reaktif adalah pentraxin yang berfungsi membatasi kerusakan jaringan, peradangan akut,

dan reaksi autoimun. Protein C-reaktif bekerja dengan mengikat fosfokolin

bagian pada membran yang rusak. Ikatan protein dengan fosfokolin

tampaknya dimediasi melalui ion kalsium terikat dan hidrofobik

saku berpusat pada Phe66.