Perilaku yang sangat dominan dari Badak Jawa adalah perilaku
soliternya. Badak jantan maupun Badak betina memiliki perilaku yang soliter, kecuali badak betina yang masih memiliki anak perilaku yang kadang terjadi adalah badak yang masih muda hidup berdua atau berkoloni dalam satu kelompok kecil dalam waktu yang singkat saat dewasa.
Teritoriat yang dicari oleh seekor badak jawa sangatlah luas,
badak jantan mampu menguasai teritorial sebesar 12-20 Km2 dan badak betina mampu menguasai teritorial 3-14 Km2.
Badak betina cenderung bisa berada di teritorial manapun tanpa
harus ada pertarungan yang berarti di antara spesiesnya. Badak Jawa sangat jarang berkomunikasi secara vokal, berbeda sekali dengan badak sumatera. Komunikasi tidak langsunglah cara mereka dalam berkomunikasi kotoran,urin, dan tanda garutan merupakan tanda- tanda komunikasi yang lebih domunan dipakai dalam komunikasi.
Badak Jawa memiliki masa kehamilan yang cukup lama yaitu
antara 16 sampai 19 bulan dan waktu tepatnya tidak pernah bisa diketahui.