PRESENTASI ANALISIS JURNAL

BIOTEKNOLOGI
Dosen
Pembimbing:

Kholifah Holil, M.Si

UIN Malang

ANALISIS KEANEKARAGAMAN GENETIK AYAM DI BANGLADES

DENGAN MENGGUNAKAN RAPD MARKER

Oleh kelompok VII

06520025

Pendahuluan

Material and method

Material and method

Koleksi Sampel
Tahap pengambilan sampel

Naked Neck

White Leghorn

Koleksi darah dan ekstraksi

DNA

20 decamer primer

Selek
si
prime
r

1Diampilifikasi
2 unit Taq DNA polimerase
1
10
dengan thermal cycler

+
+
+

Denatura
si
Annealin
g

Elongas
Amplifikasi DNA dengan
PCR

Amplifikasi dengan
Elektoforesis

kesamaan
indeks (Si) = 2N
AB / (NA + NB)
Band
Jika
hasil
tidak
adaPCR
=ada
1 =0

OPA 12

OPA 18

OPA 16

OPA 20

Angka Lokus Polimorfik

2
0
1
9
1
9
1
8
1
3
1
2
1
2

Presentase Lokus
Polimorfik
51,8
%
48,7
%
48,7
%
46,2
%
33,3
%
30,8
%
30,8
%

Gen diversity
0,22
0,21
0,20
0,16
0,13
0,12
0,12

Similarity Index (Si)

90,03
%
86,88
%
85,29
%
83,39
%
82,45
%
82,25
%
79,68
%

Merupakan
jarak
genetik
yang
menunjukkan
tingkat
kekerabatan
dalam
populasi
mauapaun
antar
populasi

Pembahasa
n
RAPDMarker
Markeruntuk
untukmempelajari
mempelajarikeragaman
keragaman
RAPD
genetikapada
padaayam
ayamasli
asliBangladesh
Bangladeshdan
danjuga
juga
genetika
membandingkan
dengan
jenis
lainnya.
Meskipun
membandingkan dengan jenis lainnya. Meskipun
tidakada
adapenilaian
penilaianyang
yangspesifik
spesifikuntuk
untuk
tidak
menemukanperbedaan
perbedaanpada
padapopulasi-populasi
populasi-populasi
menemukan
ayamsecara
secaraefektif,
efektif,tekhnik
tekhnikRAPD
RAPDcukup
cukup
ayam
menunjukkanpolimorfism
polimorfismuntuk
untukanalisis
analisispopulasi.
populasi.
menunjukkan

Pembahas
an
Persamaanindeks
indekspopulasi
populasiintra
intra(S(S),
1),
Persamaan
1
digambarkan
lebih
tinggi
pada
populasi
digambarkan lebih tinggi pada populasi
ayamasli
asliBangladesh
Bangladeshdaripada
daripadagenetika
genetika
ayam
populasiayam
ayamyang
yangasing.
asing.Secara
Secara
populasi
relatif,variasi
variasigenetik
genetikterendah
terendahdapat
dapat
relatif,
diamatipada
padapopulasi
populasiCL
CLdan
danBL
BL
diamati
dibandingkan
pada
populasi
asing
yang
dibandingkan pada populasi asing yang
mungkinbisa
bisadipengaruhi
dipengaruhioleh
olehstruktur
struktur
mungkin
populasidan
dansejarah
sejarahseleksi.
seleksi.
populasi

Pembaha
san
Pengamatan jarak genetik diantara
pasangan populasi lokal dan asing (FZ
vs. RIR, FZ vs WL, NN vs RIR)
menunjukkan hubungan yang dekat
diantara beberapa pasangan dari
mereka. Hubungan gen yang dekat
diantara populasi lokal dan asing hal ini
bisa diajukan pada pemerintah
Bangladesh untuk meningkatkan
populasi ayam lokal dengan cara
menyilangkan ayam lokal dengan ayam
asing RIR dan WL.

Pembahasa
n

Jarak genetik tertinggi adalah pada

ayam CB dan CL,hal ini menunjukkan
hubungan yang jauh diantara mereka.
Bisa disebabkan karena CB dan CL
merupakan ayam asing dari keturunan
dan asal usul yang berbeda.
Jarak geogarafis merupakan salah satu
faktor penting yang mempengaruhi
kekerabatan dari genetika populasi
(Wright, 1943).

Pembaha
san
Tingkat perbedaan
populasi tertinggi (GST=
0.34) dan rendahnya
tingkat gen flow
(Nm=0.98). Nilai ini
menunjukkan bahwa nilai
genetik dari setiap
populasi ayam itu
berbeda.

SEKIAN