Stress Tolerance
Team Assistant Plant Breeding Technology
Cekaman Biotik
• Cekaman merupakan factor lingkungan biotik dan abiotic yang dapat mengurangi laju proses fisiologi.
/kondisi lingkungan yang dapat memberi pengaruh buruk pada pertumbuhan, reproduksi, dan
kelangsungan hidup tanaman
ISTILAH
• Tanaman menunjukkan berbagai mekanisme pertahanan terhadap patogen dan hama yang dapat diklasifikasikan sebagai
penghindaran(avoidance), resistensi (resistance) dan toleransi (tolerance).
• Tanaman memberikan respon ketahanan terhadap serangan pathogen atau hama dengan menghasilkan atau mengembangkan
fisiologi, morfologi dan senyawa biokimia,yang mampu mengurangi tingkat serangan OPT.
• Terbagi menjadi mekanisme aktif dan pasif
Tumbuhan yang memiliki resistensi pasif bisa terjadi karena tanaman memiliki rintangan mekanis atau kimia, tanaman tidak
cocok dengan substrat pathogen. rintangan mekanis yang termasuk mekanisme ketahanan pasif seperti lapisan lilin /
kutikula, lubang alami, struktur dalam, kanopi tanaman, dan muatan listrik
Mekanisme resistensi aktif hanya muncul ketika inang terserang oleh penyakit. Ketahanan akan terekspresi ketika terjadi
penetrasi dari pathogen, maka inang akan bereaksi dengan mencegah perkembangan pathogen. Umumnya meknisme
resistensi aktif lebih kuat dibandingkan yang pasif. pertahanan histologi, pertahanan seluler, reaksi hipersensitif dan disease
escape
Disease Incident
Disease Severity
•DI x 100
Example
No Genotip No of plant infected Total Plant Disease
e Observation Incident
1 Dije 16 50 ?
2 Rifat 21 50 ?
3 Bima 19 50 ?
4 Iqbal 14 50 ?
5 Danny 23 50 ?
Your Logo or Name Here 15
Disease Incident •DI x 100
DI
x 100 = 16 % No Genotyp No of plant infected Total Plant Disease
e Observation Incident
1 Dije 16 100 16%
DI
x 100 = 10% 2 Rifat 10 100 10%
3 Bima 17 100 17%
4 Iqbal 14 100 14%
DI
x 100 = 17%
5 Danny 19 100 19%
DI
x 100 = 14%
• But wait!!
• Disease incident only show the proportion
DI
x 100 =19% plant infected in population.
• How about intensity of disease in
population?
Your Logo or Name Here 16
Disease Severity
• Disease Severity is quantity or Intensity of disease affecting entities
within a sampling unit.
• Measurement by observation each individu of plant invected in
population.
•DS x 100
Score Rating :
0 = 0 % part of leaf infected
1 = 1 – 25 % part of leaf infected
2 = 25 – 50 % part of leaf infected
3 = 50 – 75% part of leaf infected
4 = 75 – 100% part of leaf infected (Necrosis)
DS
sampel 1 x 100 = 19%
DS
sampel 2 x 100 = 15%
DS
sampel 16 x 100 = …..%
Your Logo or Name Here 18
Disease Severity
No Genotyp No of plant infected Disease Disease
e Incident Severity
1 Dije 16 16% 18%
2 Rifat 10 10% 9%
3 Bima 17 17% 15%
4 Iqbal 14 14% 16%
5 Danny 19 19% 21%
AUDPC
Advantages Disadvantages
1 Dije 18 22 34 41 59 70 ?
2 Rifat 9 18 30 40 54 69 ?
3 Bima 15 24 37 46 61 71 ?
4 Iqbal 16 25 39 51 66 85 ?
5 Danny 21 32 39 47 61 76 ?
AUDPC
(Dije) + ++
+ = 1435
AUDPC
(Bima) + ++
+ = 1447
AUDPC
(Iqbal) + ++
+ = 1617
AUDPC
(Danni) + ++
+ = 1592.5
Your Logo or Name Here 23
Area Under Desease Progress Curve (AUDPC)
N Genotip DS (32 DS (39 DS (46 DS (53 DS (60 DS (67 AUDPC rAUDPC
o
e DAP) DAP) DAP) DAP) DAP) DAP)
Relative
AUDPC
rAUDPC
(Dije) = 0.410
N Genotyp DS (32 DS (39 DS (46 DAP) DS (53 DAP) DS (60 DAP) DS (67 DAP) AUDPC rAUDPC
o
e DAP) DAP)
1 Dije 18 22 34 41 59 70 1435 0.410
2 Rifat 9 18 30 40 54 69 1302 0.372
3 Bima 15 24 37 46 61 71 1447 0.413
4 Iqbal 16 25 39 51 66 85 1617 0.462
5 Danny 21 32 39 47 61 76 1592.5 0.455
• Ulangan 2
N Genotyp DS (32 DS (39 DS (46 DAP) DS (53 DAP) DS (60 DAP) DS (67 DAP) AUDPC rAUDPC
o
e DAP) DAP)
1 Dije 12 23 31 44 54 69 1347.5 0.385
2 Rifat 11 15 32 41 56 67 1281 0.246
3 Bima 14 21 33 47 59 66 1400 0.233
4 Iqbal 18 24 32 48 57 68 1428 0.255
5 Danny 16 27 34 46 53 73 1431.5 0.207
Your Logo or Name Here 26
AUDPC ANOVA DATA
• Ulangan 3
N Genotyp DS (32 DS (39 DS (46 DAP) DS (53 DAP) DS (60 DAP) DS (67 DAP) AUDPC rAUDPC
o
e DAP) DAP)
1 Dije 20 25 30 46 55 64 1386 0.396
2 Rifat 13 21 28 42 51 67 1274 0.245
3 Bima 21 23 26 39 54 63 1288 0.215
4 Iqbal 19 21 29 41 50 68 1291.5 0.231
5 Danny 20 26 33 42 53 63 1368.5 0.198
• Ulangan 4
N Genotyp DS (32 DS (39 DS (46 DS (53 DS (60 DS (67 DS (74 AUDPC rAUDPC
o e DAP) DAP) DAP) DAP) DAP) DAP) DAP)
1 Dije 21 21 31 39 49 61 ? ?
2 Rifat 16 20 32 38 46 67 ? ?
3 Bima 16 23 36 40 48 65 ? ?
4 Iqbal 17 21 34 39 43 63 ? ?
5 Danny 19 26 31 43 51 80 Your ?
Logo or Name Here ?
27
ANOVA AUDPC
No Genotipe Ulangan 1 Ulangan 2 Ulangan 3 Ulangan 4 Rata Rata Genotipe
1 Dije 1435 1347.5 1386 1267 5435.5 1358.875
2 Rifat 1302 1281 1274 1242.5 5099.5 1274.875
3 Bima 1447 1400 1288 1312.5 5447.5 1361.875
4 Iqbal 1617 1428 1291.5 1239 5575.5 1393.875
5 Danny 1592.5 1431.5 1368.5 1403.5 5796 1449
Rata 7393.5 6888 6608 6464.5 27354
SR Db JK KT F Hitung F Tabel
BNJ = 4.202
Ulangan 3 100.696
Perlakuan 4 64.062 16.023 4.032 3.259167 Rifat 1274.875 a
Galat 12 47.687 3.473 Dije 1358.875 b
Total 19 212.467 Bima 1361.875 c
Iqbal 1393.875 d
Danny 1449 e