INTERAKSI

GENOTIP X LINGKUNGAN

TIM ASISTEN TPT 2020

INTERAKSI GENOTIP X LINGKUNGAN DALAM FENOTIP

P = G + E + GxE

 P   G   E   GE
2 2 2 2
INTERAKSI GENOTIP X LINGKUNGAN

• Lingkungan: semua aspek di luar tanaman yang mendukung

pertumbuhan dan perkembangan tanaman dalam upaya tanaman
mencapai hasil optimum
• Lingkungan yang dapat diprediksi
• Jenis tanah, kesuburan tanah, kerapatan tanaman
• Lingkungan yang tidak dapat diprediksi
• Curah hujan, kelembaban, suhu
PENYEBAB INTERAKSI DAN JENIS GXE

• heterogenitas varians genotipe di lingkungan

• Korelasi tidak sempurna dari penampilan genotipik di seluruh
lingkungan
GENOTYPE X ENVIRONMENT

Semakin kecil E dan GxE yang lebih dapat diprediksi

adalah kinerja genotip sebagai rasio G / P (Heritabilitas
rasa luas) menjadi lebih tinggi.

Secara statistik interaksi GxE signifikan ketika

genotipe berbeda secara signifikan dalam respon
mereka terhadap perubahan lingkungan
 STRATEGI GXE

 Adaptasi luas (General Adaptability)– Tanaman mampu berkinerja

secara konsisten baik di berbagai lingkungan (tinggi rata-rata di
seluruh lingkungan)
 Adaptasi khusus (Specific adaptability) – tanaman mampu tumbuh
dengan baik pada spesifik lokasi tertentu.
 PENDEKATAN ANALISIS GXE

1. Untuk menentukan apakah ada interaksi GxE yang signifikan

ANOVA

2. Untuk menentukan sifat interaksi GxE

Analisis Stabilitas

3. Untuk menentukan mengapa interaksi GxE ada

Pemeriksaan faktor lingkungan, iklim, tanah, dll.
 ANOVA
Metode klasik partisi varians total menjadi efek utama dan interaksi antara
efek utama
Model untuk data dua arah adalah:

Xij = + gi + ej + (ge)ij
 Xij adalah mean lebih dari r replikasi genotipe engan di lingkungan j
  adalah arti utama atas semua genotipe dan lingkungan
 gi adalah efek dari genotipe I
 ej adalah efek lingkungan j
 (ge) ij adalah efek interaksi dari genotip dengan lingkungan
ANALISIS VARIANS UNTUK SATU LINGKUNGAN SATU MUSIM (MODEL 1 :
GENOTIP ACAK)

Source df MS Expected Mean Square Ftest

Blocks r-1 MS1
MS2/MS3
Genotype g-1 MS2 2 e + r  2 g
Error (r-1)(g-1) MS3 2 e

 Varians genetik : 2g =(MS2 – MS3)/r

 Nilai varians genetik bias oleh faktor lingkungan, musim
interaksi genotip x lingkungan, interaksi genotip x musim,
dan interaksi genotip x lingkungan x musim
 ANALISIS VARIANS UNTUK SATU LINGKUNGAN, DUA ATAU LEBIH MUSIM
(MODEL 1 : GENOTIP ACAK, MUSIM ACAK)

Source df MS Expected Mean Square Ftest

Years y -1 MS1 MS1/ MS4
Blocks/Years y(r-1) MS2
Genotype g-1 MS3 2e + r2gy + ry2g MS3/ MS4
Genotype x
Years (g-1)(y-1) MS4 2e + r2gy MS4/ MS5
Error y(r-1)(g-1) MS5 2 e

Varians genetik : 2g = (MS3 – MS4)/ry

 ANALISIS VARIANS UNTUK SATU MUSIM, DUA ATAU LEBIH LINGKUNGAN
(MODEL 1 : GENOTIP ACAK, LINGKUNGAN ACAK)

Source df MS Expected Mean Square Ftest

Locations l -1 MS1 MS1/ MS4
Blocks/locations l(r-1) MS2
Genotype g-1 MS3 2e + r2gl + rl2g MS3/ MS4
Genotype x
Locations (g-1)(l-1) MS4 2e + r2gl MS4/ MS5
Error l(r-1)(g-1) MS5 2e

• Varians genetik : 2g = (MS3 – MS4)/rl

 ANALISIS VARIANS UNTUK LEBIH DARI SATU MUSIM LINGKUNGAN
(model 1 : genotip acak, lingkungan acak, musim acak)
Source df MS Expected Mean Square Ftest
Years y-1 MS1
Locations l -1 MS2
Blocks/Years/
locations yl(r-1) MS3
Years x
Locations (y-1)(l-1) MS4
Genotype g-1 MS5 2e + r2gly + ry2gl + rl2gy + rly2g Ftest
MS6/MS8
Genotype x
Years (g-1)(y-1) MS6 2e + r2gly + rl2gy
Genotype x
Locations (g-1)(l-1) MS7 2e + r2gly + ry2gl MS7/MS8
Genotype x
Years x
Locations (g-1)(y-1)(l-1) MS8 2e + r2gly MS8/MS9
Error yl(r-1)(g-1) MS9 2e