Mikrobiologi 

Pertanian
Kelas Tnh A dan Prot D
Minggu ke 2
Pengertian, Ruang lingkup,Sejarah dan
peranan
MIKBROBIOLOGI PERTANIAN
Dr. Ir. ERI SULYANTI, MSc
Dr. Yulmira Yanti, MP, SSi
Ir. Reflin, MS
APA YANG KITA LIHAT ?

yang satu ini agak tricky!

kata TEACH terefleksi sebagai LEARN
 Apa itu Mikrobiologi ???
• micron kecil dan biologia =mempelajari
makhluk hidup
• Mempelajari makhluk hidup yang sangat kecil
untuk dilihat dengan mata telanjang (dapat
dilihat dengan mikroskop, ukurannya < 0.1
mm),
• Seperti : Bakteri, jamur, virus, protozoa,
ganggang, dan nematoda
Microorganism Sizes
 Klasifikasi dasar mikroorganisme
•Prokaryotik
Eukaryotik
Ukuran
Ukuranlebih
lebihbesar
kecil
Inti sel diselubungi membran Motokondria ada
tidak memiliki membran inti
Ex:Mitokondria
Algae tidak ada
Protozoa
Ex Fungi
Bacteria
Jamur lendir
Memiliki semua enzim seperti eukaryotik
memiliki semua enzim untuk produksi dan metabolisme energi

Dr.T.V.Rao MD 6
 Klasifikasi Organisme
Kingdoms Organisme

Linnaeus Tumbuhan bakteri, fungi, alga

(1753) tumbuhan
Hewan protozoa, hewan

 Haeckel
(1865) Tumbuhan alga multiseluler,
tumbuhan
Hewan hewan
Protista mikroba
(bakteri, protozoa, alga,
kapang, khamir).
 Whittaker Tumbuhan alga multiseluler, tumbuhan
(1969) Hewan hewan
Sistem Protista protozoa, alga bersel tunggal
5 dunia Fungi kapang, khamir
Monera semua bakteri (prokariotik)

 Woese Archaeobacteria bakteri yang memproduksi

(1977) gas metan, perlu garam tinggi,
perlu suhu tinggi.
Eubacteria semua bakteri (penyebab
penyakit, bakteri tanah dan air,
bakteri fotosintetik).
Eukariotik protozoa, alga, fungi,
tumbuhan, hewan.
Klasifikasi Mikroba system Lima dunia
Mikrobiologi berkisar pada 2 tema utama
yaitu : Dasar dan Aplikasi.
1. Sebagai ilmu dasar → alat penelitian
mempelajari proses hidup (sel mikroba
memiliki kesamaan karakter biokimia
dengan multisel).
2. Sebagai ilmu aplikasi → berperanan pada
bidang kedokteran, pertanian dan
industri.
 Mikrobiologi dapat dibedakan berdasarkan berbagai macam
orientasinya, yaitu :
1. Orientasi Taksonomi
a. virologi : stuktur, susunan dan klasifikasi
virus.
b. bakteriologi : struktur, susunan, dan
klasifikasi bakteri dan mahluk hidup
c. mikologi: stuktur, susunan, dan klasifikasi

yenny liswarni
mahluk hidup termasuk jamur
d. fikologi: stuktur dan susunan klasifikasi mahluk
hidup termasuk ganggang/ alga
e. protozoologi: stuktur, susunan dan klasifikasi
mahluk termasuk protozoa
f. Nematologi: struktur, susunan dan klasifikasi mahluk hidup 11

termasuk nematoda
2. Orientasi Habitat

a. mikrobiologi air : kehidupan dan peranan

mikroba dalam air.

b. mikrobiologi tanah : kehidupan dan

yenny liswarni
peranan mikroba dalam tanah.

c. mikrobiologi laut : kehidupan mikroba

yang hidup dalam habitat air laut. 12
3. Orientasi Problema
a. ekologi mikroba : mempelajari tentang hubungan timbal balik
antara mikroba dan lingkungan hidupnya
b. mikrobiologi patogenik : mempelajari tentang mikroba yang
dapat menimbulkan penyakit
c. mikrobiologi pertanian : mempelajari tentang peranan mikroba

yenny liswarni
dalam bidang pertanian
d. mikrobiologi industri : mempelajari tentang mikroba-mikroba
yang berperan dalam bidang industri
e. mikrobiologi geologi : mempelajari tentang struktur, sifat dan
peranan mikroba dalam bidang geologi
SEJARAH MIKROBIOLOGI
 ROBERT HOOKE

Salah satu penemuan penting

bidang biologi tahun 1665, dengan
bantuan mikroskop sederhana,
Robert Hooke menyatakan bahwa
unit struktur kehidupan terkecil
adalah sel
ANTONY VAN LEEUWENHOEK

• Pengamatan
mikroorganisme
pertama
• Menggunakan
mikroskop lensa tunggal
• Antara tahun 1674-
1723, ia menulis hasil
pengamatannya
terhadap bakteri, alga,
protozoa, dan jamur
ANTONY VAN LEEUWENHOEK
 GENERATIO SPONTANEOUS
Aristoteles dan John Needham (1713-1781)

keyakinan awal bahwa beberapa

bentuk kehidupan bisa berasal dari
materi yg tidak hidup atau bahan yang
membusuk, abiogenesis.
Atau,
organisme dapat berasal dari materi
yang tidak hidup
 LOUIS JABLOT
Melakukan percobaan dengan memisahkan air
rebusan jerami ke dalam dua wadah: wadah
yg dipanaskan dan ditutup serta wadah
dipanaskan yang bebas terbuka ke udara.
Hanya wadah terbuka yang mikroorganisme
berkembang. Percobaan Ini menyangkal teori
abiogenesis
Percobaan REDI (1626-1697) dan
JABLOT’S
 yenny liswarni
- menurut Redi  belatung yang terdapat pada
daging berasal dari telur lalat

21
Lazzaro Spallanzani (1729-1799)
- Percobaan menggunakan bahan kaldu
- Labu 1 : kaldu dipanaskan dan dibiarkan terbuka
- Labu 2 : kaldu, lalu ditutup dengan gabus yang disegel
dengan lilin, kemudian dipanaskan

yenny liswarni
22
• Schwann, Friedrich Schroder dan von
Dusch (1830) – Udara masuk ke dalam
labu tetapi hanya setelah melewati
tabung yang dipanaskan atau wol steril
• John Tyndall (1820-1893)
tidak ada pertumbuhan, bentuk tahan
panas bakteri (endospora)
LOUIS PASTEUR (1822 - 1895)
• Tahun 1861 Menentang teori
abiogenesis (Generatio
spontanea)
• Menemukan mikroba yang
menyebabkan fermentasi dan
pembusukan.
• Mengembangkan vaksin anthrax
• Teknik Pasteurisasi
• Father of
bacteriology and
immunology
PERBOCAAN PASTEUR
 Penemuan mikroba penyebab
penyakit

1. Tahun 1813, th 1845 ditemukan

jamur penyebab penyakit pada gandum
2. Tahun 1850 Robert Koch menemukan
bakteri berbentuk batang penyebab
penyakit anthrax pada domba
3. Postulat Koch untuk membuktikan
mikroorganisme penyebab penyakit
 MIKROBIOLOGI PERTANIAN
1. Mulai Th 1800 Sergei Winogradsky ilmuwan mikrobiologi
tanah menunjukkan adanya bakteri penambat nitrogen
2. Hellriegel dan Wilfrath mengembangkan bakteri yang
berasosiasi dengan leguminose dengan membentuk bintil
akar (Rizobium sp)
3. Martinus Wilem menemukan bakteri Azotobacter penambat
nitrogen non simbiotik
4. Montagne 1845, Berkeley 1846, De Bary 1861 menemukan
jamur penyebab penyakit pd kentang (Phythophthora
infestans)
5. Burill menemukan bakteri penyebab bercak pada kentang
6. CABANG MIKROBIOLOGI BARU DINAMAKAN PATOLOGI
TUMBUHAN
7. Mayer 1886 menemukan penyakit mosaik pd tembakau
disebabkan virus
Robert Koch
1843 – 1910
• Tahun 1860 mengembangkan
teknik isolasi dan identifikasi
patogen spesifik yang
menyebabkan penyakit, yg
dikenal dengan Postulat KOCH
• Ia mengisolasi bakteri anthrax
 Postulat Koch
1. Suatu mikroba yang diduga sebagai penyebab

penyakit harus ada pada setiap bagian yang

penyakit
2. Mikroba tersebut dapat diisolasi dari bagian
yg sakit dan dpt ditumbuhkan dalam bentuk
biakan murni
3. Apabila biakan murni tsb disuntikkan pada
bagian tumbuhan yang sehat dan peka, dapat
menimbulkan penyakit yang sama
4. mikroba dapat diisolasi kembali dari bagian
Teori Penyakit
Koch’s Postulates

From the Virtual Microbiology Classroom on ScienceProfOnline.com

ALEXANDER FLEMING
• Tahun 1928 mengamati
pertumbuhan bakteri
staphyloccus aureus pada
cawan petri terhambat
oleh pertumbuhan jamur
kontaminan
• Jamur tersebut adalah
Penicillium notatum, dan
bahan aktifnya dikenal
sebagai penicillin
(antibiotik pertama)
• Reska (1938) –Mikroskop
elektron
• Mikroskop elektron mampu
mengamati spesimen biologi
dengan perbesaran sampai ribuan
kali, untuk mempelajari struktur
virus lebih lengkap
 WATSON, CRICK, FRANKLIN, dan WILKINS

Tahun 1953 Watson dan Crick menemukan struktur DNA.

Bersama penelitian dari Franklin dan Wilkins untuk
menemukan struktur molekul DNA
Peranan Mikroorganisme
dibidang Pertanian
 RUANG LINGKUP

• MIKROBA SEBAGAI PATOGEN TANAMAN

• PUPUK HAYATI (BIOFERTILIZER)
• PENGENDALIAN HAYATI (BIOLOGICAL
CONTROL)
• BIOREMEDIASI
Mikroba sebagai Patogen Tanaman
……patogen
Cendawan, Bakteri, Virus dan Nematoda
Peranan Mikroba Di Bidang Kesuburan
Tanah (Biofertilizer)
1. Mikroba dapat melarutkan dan menyediakan
mineral seperti N,P, Fe dan unsur lain.
2. Mikroba dapat menghasilkan vitamin, asam
amino, auxin dan giberelin yang dapat
menstimulir pertumbuhan tanaman.
3. Mikroba menguntungkan menghasilkan hormon
tumbuh yang diperlukan tanaman.
MIKROBA PELARUT FOSFAT
 MIKROBA DALAM PENGENDALIAN HAYATI

Pengertian pengendalian hayati

TIndakan untuk mereduksi kepadatan inokulum/aktivitas pathogen penyakit sehingga

tidak menimbulkan gejala pada tanaman
 dengan menggunakan satu atau lebih mikroorganisme
 dengan melalui manipulasi lingkungan inang atau
antagonistic

Meningkatkan aktivitas mikroorganisme

o sifat antagonism secara langsung kompetisi & antibiosis
o secara tidak langsung
induksi ketahanan tanaman

Agensia hayati
Mikroorganisme hidup diperoleh dari alam dapat berupa jamur, bakteri,
actinomycetes, virus yg dapat menekan, menghambat & atau memusnahkan
Uji antagonistik antara Pseudomonad Bakteri Pseudomonad fluoresen sebagai
fluoresen dengan patogen R. solanacearum agensia hayati
 Bioremediasi
Strategi atau proses yang menggunakan
mikroorganisme, tanaman maupun enzim dari
mikroba maupun tanaman untuk menetralkan sifat
beracun dari kontaminan (detoxify) di dalam tanah
maupun lingkungan lainnya.
Mikroorganisme yang digunakan termasuk:
- Bakteri (Aerobik dan anaerobik)
- Jamur
- Actinomycetes
 Beberapa mikroba untuk bioremediasi
• Deinococcus radiodurans : bakteri yang telah dimodifikasi secara genetik
agar mampu merombak pelarut atau logam berat, termasuk toluene dan
ion mercury dari limbah yang banyak mengandung radioaktif nuklir
• Geobacter sufurreducens : bakteria yang dapat mengubah uranium
terlarut dalam air atau tanah menjadi bentuk tidak larut (non-soluble),
bentuk yang dapat diambil.
• Dehalococcoides ethenogenes : bakteri yang digunakan pada 10 negara
bagian di US untuk membersihkan pelarut klor yang dapat menyebabkan
kanker. Bakteri ini terdapat alami baik dalam tanah maupun air dan
mampu merombak pelarut lebih cepat
• Enzim dari bakteri, Thermus brockianus, yang ditemukan di taman
nasional Yellowstone, dapat mengurai hydrogen peroxide 80.000 kali
lebih cepat dibandingkan dengan tradisional dan dengan senyawa kimia
lain.
• Alcaligenes eutrophus, bakteri yang secara alami mengurai 2,4-D,
herbisida ke 3 terbanyak digunakan di Amerika.
 PSEUDOMONAS
 Rekayasa genetika bakteri (Pseudomonas) dengan plsmid
yang memproduksi enzim untuk mendegradasi octane dan
berbagai senyawa organik dari minyak bumi.
Daftar mikroorganisme hasil rekayasa genetika

GEMs XENOBIOTICS
Pseudomonas putida Mono-and dichloro
aromatic compounds
P.diminuta Parathion
P.oleovorans Alkane
P.cepacia 2,4,5-Trichlorophenol
Acinetobacter species 4-Chlorobenzene
Alcaligenes species 2,4-Dichlorophenoxy
acetic acid
 Pemanfaatan jamur untuk BIOREMEDIASI
 Candida dapat mendegradasi formaldehyde.
 Gibeberella dapat mendegradasi cyanide.
 Pengomposan dapat digunakan untuk mendegradasi sampah
rumah tangga
JAMUR AKAR PUTIH
 Jamur akar putih dapat mendegradasi polutan organik dalam
tanah dan limbah, seperti : Phanerochaete chrysosporium
 Pentachlorophenol, dichlorodiphenyl trichloroethane (e.g.
DDT), bahkan TNT (trinitrotoluene) dapat didegradasi
dengan jamur akar putih.
MIKORIZA
Mikoriza dapat mengurangi toksisitas logam berat terhadap
tanaman pada tanah-tanah tercemar (Baldrian dalam Munir,
2006).


TERIMA KASIH