TUGAS 6 NAMA : RONA ULI MANURUNG

“BIOTEKNOLOGI
NIM : E1A019090
KELAS : 5D
DOSEN : Drs. Lalu Zulkifli, M.Si.,
MIKROBA” Ph.D.
 PETA KONSEP MATERI
Bioteknologi Mikroba

Sub Materi

5.3 Menggunakan Mikroba

5.2 Mikroorganisme 5.6 Mikroba untuk
untuk Berbagai Aplikasi 5.4 Vaksin 5.7 Diagnostik Mikroba
sebagai alat Membuat Biofuel
Sehari-hari
 5.3 Menggunakan
5.6 Mikroba
Mikroba untuk 5.7 Diagnostik
5.2 Mikroorganisme 5.4 Vaksin untuk Membuat
sebagai alat Berbagai Aplikasi Mikroba
Biofuel
Sehari-hari

A. Strategi untuk melacak

A. Enzim Mikroba A. Aplikasi bioteknologi A. Primer antibody A. Bahan bakar keberadaan bakteri.
B. Transformasi Mikroba B. Jenis-jenis vaksin denghasil etanol B. Pelacakkan
Bakteri -Aplikasi dalam C. Mikroba menjadi Dari jagung mikroorganisme
produk makanan target vaksin B. Mikroba E.Coli
-DNA rekombinan penyebab prnyakit
*Fermentasi sebagai penghasil
-Elektroporasi -Protein terapeutik
C. Microarray untuk melacak
etanol
-Teknik cloning enyakit Menular
*Menghasilkan
dan ekspresi hormone
C. Bioluminesensi dari
- Protein rekombinan BERIKUT MERUPAKAN PENJABARAN
mikroba sel bakteri
DARI MATERI
sebagai *Memanfaatkan
bakteri melawan
reporter
infeksi dari
bakteri lain atau
organisme lainnya
5.2 Mikroorganisme sebagai alat
Mikroorganisme baik dalam keadaan alami atau dalam bentuk yang dimodifikasi secara genetik telah berfungsi
sebagai alat yang berguna . Salah satu bahan dari mikroba yang dapat dijadikan sebagai alat adalah enzim mikroba.

KarenaENZIM
mikroba merupakan sumber enzim yang sangat baik dan nyaman, beberapa enzim pertama yang tersedia
MIKROBA
secara komersial dan diisolasi untuk digunakan untuk kepentingan biologi molekuler adalah DNA polimerase dan
enzim restriksi dari bakteri. Salah satu enzim mikroba yang memiliki fungsi adalah Taq. Taq adalah enzim tahan
panas yang penting untuk PCR yang diisolasi dari mata air panas Archaean termus akuatikus. Taq, DNA polimerase
juga disebut dengan enzim termostabil. Karena kemampuannya untuk tumbuh dan berkembang di bawah panas yang
ekstrem, mikroba ini disebut termofil. Banyak enzim termostabil serupa telah diidentifikasi pada termofil
lainnya. Misalnya, Pfu DNA polimerase, enzim termostabil populer yang banyak digunakan untuk PCR,
berasal dari thermophile Pyrococcus furiosus, spesies Archaea awalnya hadir dalam sedimen laut yang
dipanaskan secara geotermal.
ENZIM MIKROBA

ENZIM
SELULASE ENZIM AMILASE
• Diproduksi oleh E.coli • Disebut enzim yang pencerna
• Mendegradasi selulosa, karbohidrat.
polisakarida yang membentuk • Digunakan untuk mendegradasi
dinding sel tanaman. pati untuk membuat sirup
• Banyak digunakan untuk jagung.
membuat makanan hewani lebih
mudah dicerna.
Contoh : Denim (jeans) yang dicuci dengan bahan campuran selulase dari jamur yang
memiliki enzim selulase seperti Trichoderma reesei , dan Aspergillus niger. Selulase dapat
sedikit mencerna serat selulosa dalam kapas yang digunakan untuk membuat celana,
menghasilkan kain yang lebih lembut. Contoh dari enzim lain seperti proteasesubtilisin,
berasal dari Bacillus subtilis, yang merupakan salah satu komponen berharga dari banyak
deterjen cucian, yang berfungsi untuk menurunkan dan menghilangkan noda protein dari
pakaian.
 1. Transformasi adalah kemampuan bakteri untuk mengambil DNA
dari lingkungan sekitarnya dan merupakan langkah penting dalam
proses kloning DNA rekombinan.
2. Dalam kloning DNA, plasmid rekombinan dapat dimasukkan ke
dalam sel bakteri melalui transformasi sehingga bakteri dapat
mereplikasi plasmid rekombinan.
3. Kebanyakan bakteri tidak dapat mengambil DNA dengan

Transformasi
mudah.
4. Biasanya, DNA yang akan dimasukkan ke dalam bakteri
dimasukkan ke dalam plasmid yang mengandung satu atau lebih
gen resisten antibiotik.

bakteri 5. Vektor plasmid rekombinan dicampur dalam tabung dengan sel

yang kompeten dan campuran ditempatkan di atas es selama
beberapa menit. Sel yang kompeten adalah bakteri yang dibuat
agar lebih reseptif.
6. Sel-sel kompeten harus tetap dingin, sehingga selama waktu
dingin DNA akan tetap menempel pada permukaan luar bakteri,
dan kondisi dingin mungkin juga berfungsi untuk menciptakan
celah dalam struktur lipid dari membrane sel bakteri yang
memungkinkan masuknya DNA.
7. Sel kemudian dipanaskan sebentar (sekitar satu
menit) pada suhu antara 37°C dan 42°C. Selama
proses pemanasan yang singkat ini, DNA
memasuki sel-sel bakteri.
12. Proses ini disebut transformasi karena seseorang dapat
“mengubah” sifat-sifat sel bakteri dengan memasukkan gen asing
ke dalam bakteri. Sel-sel yang ditransformasi telah diubah secara

8. Sel-sel ini dibiarkan tumbuh dalam kaldu kultur. genetik dengan sifat-sifat baru yang dikodekan oleh DNA,
memungkinkan bakteri untuk menghasilkan zat-zat yang biasanya
9. Hanya sel-sel yang ditransformasi dengan DNA
tidak mereka hasilkan.
plasmid yang mengandung gen resisten antibiotik
Selain itu, adapun salah satu teknik umum lainnya yang dipakai
yang sesuai yang akan tumbuh untuk menghasilkan
untuk mengubah sel bakteri, yaitu ELEKTROPORASI.
koloni. Teknik ini disebut pemilihan antibiotic.
10. DNA plasmid direplikasi (dikloning) oleh
bakteri akan berubah, selanjutnya gen dalam
plasmid ditranskripsi dan diterjemahkan menjadi
protein.
11. Sel bakteri yang diubah akan mengekspresikan
protein rekombinan.
ELEKTROPORASI

1. Merupakan salah satu teknik umum lainnya untuk mengubah sel.

2. Menggunakan instrumen yang disebut elektroporator

menghasilkan kejutan listrik singkat yang memasukkan DNA ke
dalam sel bakteri tanpa membunuh sebagian besar dari diri bakteri.

3. Elektroporasi memiliki beberapa keuntungan yaitu, berlangsung

cepat, membutuhkan lebih sedikit sel, dan juga dapat digunakan
untuk memasukkan DNA ke dalam banyak jenis sel lain termasuk
sel ragi, jamur, hewan, dan tumbuhan , serta lebih efisien.

4. Salah satu kelemahan teknik ini adalah lebih mahal daripada

transformasi bakteri (transformasi kalsium klorida) hal ini
disebabkan oleh biaya elektroporator dan sel kompeten yang dapat
mentolerir sengatan listrik.
 1. Salah satu teknik populer menggunakan bakteri untuk sintesis
dan isolasi protein rekombinan melibatkan pembuatan protein fusi.
2. Salah satu teknik untuk membuat protein fusi adalah
menggunakan metode DNA rekombinan untuk menyisipkan gen
untuk protein yang diinginkan ke dalam plasmid yang mengandung
gen untuk protein terkenal yang berfungsi sebagai “tag ”. Protein

Teknik Kloning
tag kemudian memungkinkan untuk isolasi dan pemurnian protein
rekombinan sebagai protein fusi.
3. Vektor plasmid untuk membuat protein fusi sering disebut vektor

dan Ekspresi
ekspresi karena mereka memungkinkan sel bakteri untuk
memproduksi atau mengekspresikan sejumlah besar protein. Vektor
ekspresi yang umum digunakan termasuk yang mensintesis protein
seperti protein pengikat maltose, glutathione S-transferase,
luciferase, protein fluoresen hijau, danB-galaktosidase.
4. Setelah vektor ekspresi rekombinan yang mengandung gen yang
diinginkan dimasukkan ke dalam bakteri melalui transformasi,
bakteri mensintesis mRNA dan protein dari plasmid. Untaian
mRNA yang ditranskripsi adalah molekul hibrida yang
mengandung pengkodean urutan untuk gen yang diinginkan dan
protein tag. Akibatnya, protein fusi disintesis dari mRNA.

5. Untuk mengisolasi protein fusi dan
memisahkannya dari protein lain, biasanya
menggunakan bakteri, dimana sel-sel dipecah (lisis)
dan dihomogenisasi untuk membuat semacam
milkshake bakteri (milkshake bakteri ekstrak).
Ekstrak kemudian dilewatkan melalui tabung yang
disebut kolom. Kolom diisi dengan manik-manik
plastik yang dilapisi dengan molekul yang akan
mengikat bagian protein tag dari protein fusi. Teknik
ini disebut kromatografi afinitas. karena manik-
manik di kolom memiliki daya tarik, atau "afinitas,"
untuk mengikat protein tag.
6. Teknik protein fusi digunakan untuk menyediakan
protein murni untuk mempelajari struktur dan fungsi
protein dan digunakan untuk mengisolasi insulin dan
protein rekombinan penting lainnya secara medis.
7. Bacillus subtilis adalah mikroba yang umum
digunakan untuk memproduksi protein fusi.
8. Secara khusus, B. subtilis adalah mikroba yang
disukai untuk banyak aplikasi ketika memproduksi
protein fusi untuk protein manusia.
Protein mikroba sebagai reporter
Organisme laut dapat melepaskan cahaya melalui proses
yang dikenal sebagai bioluminesensi. Untuk ikan laut,
bioluminesensi terdapat pada garis sel di sepanjang sisi ikan dan
siripnya serta dapat digunakan untuk menarik pasangan di
lingkungan laut yang gelap.
Bioluminesensi pada banyak spesies laut dibuat oleh bakteri
seperti: Vibrio fisheri yang menggunakan organisme laut sebagai
inang. Bakteri sepertiVibrio telah digunakan sebagai biosensor
untuk mendeteksi bahan kimia penyebab kanker yang disebut
karsinogen, polutan lingkungan, dan kontaminan kimia dan bakteri
dalam makanan. Vibrio fisheri dan strain bioluminescent laut
lainnya yang disebut Vibrio harveyi menciptakan cahaya melalui
aksi gen yang disebut lux gen. alux gen mengkodekan subunit
protein yang membentuk enzim yang disebut luciferase.
Luciferase adalah enzim yang sama yang memungkinkan
kunang-kunang menghasilkan cahaya. Saat ini NSlux gen telah
dikloning dan digunakan untuk mempelajari ekspresi gen dalam
beberapa cara. Misalnya, dengan cloning gen lux menjadi plasmid,
lux plasmid dapat digunakan untuk menghasilkan protein fusi.
Gen lux dapat berfungsi sebagai gen reporter. luks gen telah
digunakan untuk mengembangkan bioassay fluoresen untuk
menguji tuberkulosis (TB).
 LANJUTAN
Untuk bioassay TB, para ilmuwan memperkenalkanlux gen
menjadi virus yang menginfeksi M.tuberkulosis. Air liur dari
pasien yang mungkin terinfeksi M.tuberkulosis dicampur dengan
lux-mengandung virus JikaM.tuberkulosis dalam sampel air liur,
virus menginfeksi sel-sel bakteri ini, yang dapat dideteksi dengan
sinar yang dihasilkan (sel memancarkan sinar).

Sehingga pada intinya gen luks mengkodekan enzim

luciferase yang menggunakan oksigen dan energi yang tersimpan
(ATP) untuk mengubah luciferin menjadi oxyluciferin. Reaksi ini
melepaskan cahaya.luks gen berfungsi sebagai gen reporter,
memungkinkan ahli biologi untuk mempelajari ekspresi gen.
Ekspresi ditunjukkan oleh sel-sel bercahaya. Gen reporter
memiliki banyak peran berharga dalam penelitian dan kedokteran
5.3 Menggunakan Mikroba untuk
Berbagai Aplikasi Sehari-hari
Memanfaatkan potensi besar mikroba untuk membuat makanan dan
untuk mengembangkan dan memproduksi obat baru adalah salah satu
contoh aplikasi bioteknologi mikroba yang paling umum di dalam
kehidupan sehari-hari.

Aplikasi Bioteknologi
Mikroba

Produk makanan

Protein terapeutik
PRODUK MAKANAN
1. Mikroba digunakan untuk membuat banyak makanan,
termasuk roti, yogurt, keju, dan asinan kubis serta
minuman seperti bir, anggur, sampanye, dan minuman
keras.
2. Salah satu cara untuk membuat keju dari susu yang
dikoagulasi adalah dengan mengolah susu dengan larutan
asam, tetapi keju dengan rasa terbaik biasanya dibuat
dengan menggunakan enzim. renin.
3. Renin mengkoagulasi susu untuk
menghasilkan dadih dengan mencerna sejumlah protein
yang disebut kasein, yang merupakan komponen utama
susu.
4. Kasein yang dicerna membentuk campuran protein
yang tidak larut yang menggumpal (menggumpal) dalam
proses yang mirip dengan apa yang terjadi ketika susu
rusak.
5. Penelitian mengkloning renin dan
mengekspresikannya dalam sel bakteri dan jamur seperti
Aspergillus niger. Rennin rekombinan (sekarang disebut
chymosin) dari mikroba banyak digunakan oleh pembuat
keju sebagai pengganti murah untuk mengekstraksi renin
dari anak sapi.
6. Renin adalah bahan makanan DNA rekombinan pertama.
7. Untuk beberapa jenis keju, strain bakteri tertentu menggunakan bakteri
asam laktat (Lactococcus lactis, L. acidophilus) untuk koagulasi. Bakteri ini
mendegradasi kasein dan menggunakan enzim yang disebutlaktase untuk
memecah gula dalam susu yang akhirnya digunakan oleh bakteri untuk
fermentasi.
8. Fermentasi adalah proses yang disebabkan oleh aktivitas mikroba yang
menghasilkan banyak produk makanan dan minuman termasuk berbagai
roti, bir, anggur, sampanye, yogurt, dan keju. Salah satu aplikasi awal
mikroorganisme pembuatan bir dan anggur melibatkan fermentasi oleh
ragi.
9. Fermentasi Ragi dan bakteri tertentu mampu menghasilkan energi dari
gula (glukosa). Ragi seperti S. cerevisiae (kiri), yang ditunjukkan di sini,
menyebabkan adonan roti mengembang;
10. Bakteri anaerob yang mengalami fermentasi asam laktat menjadikan
asam laktat (laktat) sebagai produk seperti limbah; alcohol. Bakteri
fermentasi menghasilkan etanol dan karbon dioksida (CO .)2) sebagai
produk limbah.
11. Mikroba yang menggunakan oksigen untuk produksi ATP
disebutaerobik karena mereka menjalani metabolisme tergantung oksigen
(aerobik).

12. Mikroba hidup di daerah di mana oksigen langka atau tidak
ada, seperti usus hewan, air dalam, atau tanah. karena organisme
ini harus bertahan hidup tanpa oksigen, mereka telah
mengembangkan kemampuan untuk memperoleh energi dari gula
tanpa adanya oksigen (kondisi anaerob) proses ini disebut dengan
fermentasi.
13. Mikroba yang menggunakan fermentasi disebut anaerob.
14. Dalam kondisi anaerobik oksigen hanya sedikit atau tidak
ada, sehingga NADH dan piruvat tidak dapat digunakan untuk
membuat ATP. Berbeda dengan kondisi aerob.
15. Fermentasi memungkinkan banyak anaerob untuk mendaur
ulang NADH menjadi NAD+ tanpa adanya oksigen, dan
beberapa anaerob mampu melakukan fermentasi atau respirasi
aerobik tergantung pada ada atau tidak adanya oksigen.
16. Dua jenis fermentasi yang paling umum adalah fermentasi
asam laktat dan fermentasi alkohol (etanol).
17. Bakteri asam laktat lainnya, Lactobacillus sakei, ditemukan
secara alami pada daging dan ikan segar. L. sakei berfungsi
sebagai biopreservatif alami dalam produk daging seperti sosis,
di mana ia menangkal pertumbuhan mikroba lain yang tidak
diinginkan yang akan merusak makanan atau menyebabkan
penyakit. Selain asam laktat, mikroba ini menghasilkan molekul
yang disebutbakteriosin, yang bertindak sebagai agen
antimikroba alami untuk membunuh mikroba lain.
18. Dalam fermentasi asam laktat, elektron dari NADH digunakan untuk
mengubah piruvat menjadi asam laktat.
19. Dalam fermentasi alkohol, elektron dari NADH mengubah piruvat
menjadi etanol. NAD+. Pada langkah akhir fermentasi, NAD+ diregenerasi
ketika elektron dikeluarkan dari NADH dan ditransfer ke piruvat untuk
membuat laktat atau etanol.
20. Selama fermentasi alkohol, gas karbon dioksida juga diproduksi sebagai
produk limbah. Jenis fermentasi lain membuat asinan kubis, dari kubis
menghasilkan produk bermanfaat seperti asam asetat dalam cuka, asam sitrat
dalam jus buah, serta aseton dan metanol, dua bahan kimia yang sering
digunakan di laboratorium untuk membersihkan peralatan gelas.
21. Produk makanan dari mikroba ini memiliki keunggulan karena diproduksi
lebih efisien dan murah dibandingkan dengan cara lain. Fermentasi asam
laktat juga terjadi pada sel otot manusia selama latihan berat.
22. Saccharomyces cerevisiae, yang sangat baik pada fermentasi alkohol.
23 Pada produksi anggur, produksi beberapa anggur juga bergantung pada
bakteri asam laktat seperti: Oenococcus oeni, yang akan mengubah asam
malat pahit yang terbentuk selama fermentasi menjadi asam laktat yang lebih
lembut dan dengan demikian memberikan rasa dan aroma yang lebih lembut
pada anggur.
24. Produksi yoghurt biasanya melibatkan campuran bakteri yang sering kali
mengandung strain mikroba fermentasi asam laktat anaerob seperti:
Streptokokus termofilus, regangan yang disebut Lactobacillus (Lactobacillus
delbrueckii dan Lactobacillus bulgaricus), dan strain lain yang disebut
Lactococcus (Lactococcus lactis
PROTEIN TERAPEUTIK
Perkembangan teknologi DNA rekombinan dengan
cepat menyebabkan penggunaan bakteri dapat digunakan
untuk menghasilkan produk medis yang penting seperti
protein terapeutik.
Produksi insulin sebagai contoh bagaimana
mikroba dapat digunakan untuk membuat protein
terapeutik. Hal ini dikarenakan insulin adalah molekul
rekombinan pertama yang diekspresikan dalam bakteri
untuk digunakan pada manusia.
Memproduksi insulin rekombinan pada bakteri
Ketika insulin disekresikan ke dalam aliran darah
oleh pancreas, maka insulin memainkan peran penting
dalam metabolisme karbohidrat. Salah satu fungsi insulin
adalah untuk merangsang pengambilan glukosa ke dalam
sel tubuh seperti sel otot, dimana glukosa dapat dipecah
untuk menghasilkan ATP sebagai sumber energi. Diabetes
melitus terjadi ketika sel beta tidak memproduksi insulin.
Kurangnya insulin menyebabkan peningkatan konsentrasi
glukosa darah, yang dapat menyebabkan sejumlah
masalah kesehatan seperti tekanan darah tinggi, sirkulasi
yang buruk, katarak, dan kerusakan saraf.
Orang dengan diabetes tipe I (Diabetes melitus) memerlukan suntikan insulin
secara teratur untuk mengontrol kadar gula darah mereka. Sebelum teknologi DNA
rekombinan, insulin yang digunakan untuk mengobati diabetes dimurnikan dari
pankreas babi dan sapi sebelum disuntikkan ke penderita diabetes. Proses
pemurniannya rumit, mahal, dan sering kali menghasilkan kumpulan insulin yang
tidak murni.. Pada tahun 1982, tercipta insulin manusia rekombinan, yang disebut
Humulin yang merupakan produk bioteknologi pertama yang disetujui untuk
aplikasi manusia oleh Food and Drug Administration (FDA) AS.
Memproduksi insulin manusia pada bakteri rekombinan merupakan salah
satu kemajuan signifikan dalam bioteknologi, dikarenakan bakteri pada umumnya
tidak memproduksi insulin. Insulin manusia terdiri dari dua polipeptida yang
disebut rantai atau subunit A (21 asam amino) dan B (30 asam amino). Keduanya
saling mengikat satu sama lain dengan ikatan disulfida untuk menciptakan
hormon aktif. Di pankreas, sel beta mensintesis kedua rantai insulin sebagai satu
polipeptida yang disekresikan dan kemudian secara enzimatik dipotong (dibelah)
dan dilipat untuk bergabung dengan dua subunit. Ketika gen manusia untuk
insulin dikloning dan diekspresikan dalam bakteri, gen untuk masing-masing
subunit diklon ke dalam plasmid vektor ekspresi terpisah yang mengandung lacZ
gen yang mengkode enzim B-galaktosidase (B-gal) dan kemudian digunakan
untuk mengubah bakteri. Karena gen insulin terhubung ke lacZ gen, ketika bakteri
mensintesis protein dari plasmid ini, bakteri menghasilkan protein yang
mengandung: B-gal yang melekat pada protein insulin manusia untuk membuat a
B-protein fusi gal-insulin. Membuat protein fusi memungkinkan para ilmuwan
untuk mengisolasi dan memurnikan protein yang diinginkan seperti insulin. B-gal,
melepaskan protein insulin; kemudian, rantai insulin A dan B murni dicampur
bersama dalam kondisi yang memungkinkan kedua subunit untuk mengikat dan
membentuk hormon aktif, hormon rekombinan siap digunakan pasien sebagai
obat suntik.
Menggunakan Mikroba melawan Mikroba lainnya
Antibiotik adalah zat yang dihasilkan oleh mikroba
yang menghambat pertumbuhan mikroba lain. Antibiotik
adalah salah satu jenis obat antimikroba. Penisilin adalah
antibiotik pertama yang digunakan secara luas pada manusia.
mikroba melindungi diri dari organisme lain dengan
membuat zat antimikroba. Alexander Fleming adalah ahli
mikrobiologi yang, pada tahun 1928, menemukan koloni
jamur ituPenicillium notatum menghambat pertumbuhan
bakteri Stafilokokus aureus. Para ilmuwan menggunakanP.
notatum untuk mengisolasi obat yang mereka sebut penisilin,
yang kemudian diproduksi secara massal dan digunakan
untuk mengobati infeksi bakteri pada manusia.
Kebanyakkan antibiotic yang diisolasi dari bakteri, dan
sebagian besar zat ini menghambat pertumbuhan bakteri lain.
Antibiotik dan obat antimikroba lainnya mempengaruhi sel
bakteri dengan cara mencegah bakteri untuk bereplikasi atau
membunuh mikroba secara langsung , yang tentu saja juga
mencegah sel yang terkena untuk bereplikasi. Antibiotik
dapat merusak dinding sel atau mencegah sintesisnya.
Antibiotik hanya efektif melawan bakteri; tetapi tidak bekerja
melawan virus seperti yang menyebabkan flu. Resistensi bakteri terhadap
antibiotik telah menjadi masalah utama. Penggunaan yang tidak tepat dan
penggunaan antibiotik yang berlebihan pada manusia dan hewan ternak
telah menyebabkan peningkatan dramatis bakteri resisten antibiotic.
Resistensi terhadap satu antibiotik sering menyebabkan resistensi terhadap
banyak obat lain. Akibatnya, obat antimikroba baru yang berbahaya bagi
bakteri dengan cara yang berbeda perlu dikembangkan. Salah satu ahli
mikrobiologi kelautan menemukan strain baru mikroba laut dengan
antibiotik baru dan senyawa antikanker. Cara lain untuk membuat obat
antimikroba baru adalah dengan mempelajari patogen bakteri dan
mengidentifikasi racun dan sifat yang digunakan bakteri penyebab penyakit
untuk menciptakan penyakit. Dengan memahami faktor-faktor yang terlibat
dalam penyakit, para ilmuwan dapat mengembangkan strategi baru untuk
memblokir replikasi bakteri. Sebuah perusahaan Florida bernama Oragenics
menerima persetujuan FDA untuk memulai uji klinis bentuk rekombinan
dari Streptococcus mutans untuk mengevaluasi keamanan dan
kemanjurannya untuk mengurangi kerusakan gigi. Tidak seperti strain
alami dariS. mutans ditemukan di rongga mulut, strain rekombinan tidak
dapat memetabolisme gula untuk menghasilkan asam laktat. Karena asam
laktat melarutkan email dan dentin pada gigi, itu menyebabkan gigi
berlubang dan kerusakan gigi. Para ilmuwan akan mencoba menggunakan
rekombinanS. mutans untuk menjajah rongga mulut dan menggantikan
strain alami dari S. mutans dan kemudian menentukan apakah kerusakan
gigi berkurang. Baru-baru ini, para ilmuwan di University of California–
Los Angeles (UCLA) menciptakan lolipop bebas gula yang mengandung
bahan dalam licorice yang membunuhS.mutans.
5.4 Vaksin
Vaksin pertama di dunia dikembangkan pada tahun 1796 ketika Edward Jenner
menunjukkan bahwa virus cacar sapi hidup dapat digunakan untuk memvaksinasi manusia
terhadap cacar. Cacar sapi menghasilkan lecet dan luka pada ambing sapi dan
menghasilkan bisul kulit serupa pada manusia. Berdasarkan klaim seorang pemerah susu
bahwa infeksi cacar sapi melindunginya dari cacar, Jenner menyiapkan vaksinnya. Dia
mengambil cairan dari lepuh cacar sapi pada pemerah susu dan menggunakan jarum yang
mengandung cairan ini untuk menggaruk kulit sukarelawan yang sehat. Paparan cairan
cacar sapi telah merangsang sistem kekebalan relawan Jenner untuk mengembangkan
perlindungan terhadap cacar. Eksperimen ini menunjukkan potensi vaksinasi.
Vaksin biasanya diberikan di usia 2 hingga 15 bulan, vaksin yang biasa yang digunakan
adalah vaksin DPT, yang memberikan perlindungan selama beberapa tahun terhadap tiga
racun bakteri yang disebut Dtoksin difteri, Ptoksin ertussis, dan Tracun etanus. Difteri
dapat menyebabkan masalah pernapasan, kelumpuhan, dan gagal jantung. Pertusis
menyebabkan batuk rejan, yang melibatkan episode kelumpuhan batuk yang sangat parah
sehingga bayi sulit makan, minum, atau bernapas. Tetanus dapat menyebabkan rahang
terkunci, mencegah pembukaan mulut. Vaksin anak lainnya adalah MMR (Melang
Mumps-Rubella), perlindungan terhadap penyakit campak. Kemudian OPV, memberi
perlindungan terhadap untuk virus polio, yaitu jenis virus yang menginfeksi neuron di
sumsum tulang belakang, menyebabkan kelumpuhan yang menghancurkan.
Primer pada Antibodi
Virus atau molekul individu seperti protein atau lipid yang dSistem
kekebalan pada manusia dan hewan lain sangat kompleks. Banyak sel di
seluruh tubuh bekerja sama dengan cara yang rumit untuk mengenali bahan
asing yang telah memasuki tubuh kita dan melakukan serangan untuk
menetralisir atau menghancurkan bahan tersebut. Zat asing yang merangsang
respon imun disebut antigen. Yang termasuk antigen adalah bakteri, jamur,
dan itemukan pada serbuk sari. Sistem kekebalan biasanya merespon antigen
sebagian dengan memproduksi antibodi. Respon ini disebut imunitas yang
diperantarai antibody.
Cara antigen untuk meransang pembentukkan antibody adalah
dengan proses yaitu, menanggapi paparan antigen awal, yang terdiri dari sel
utuh atau molekul individu, dengan cara , sel B membelah berulang kali
untuk membentuk banyak sel B lainnya (klon). Sel B berdiferensiasi
menjadi sel plasma, yang menghasilkan antibodi spesifik terhadap antigen.
Selama proses ini, sel B memori terbentuk. Jenis sel yang mengenali dan
mengikat antigen adalah limfosit B atau leukosit. Limfosit T (sel T)
memainkan peran penting dalam membantu sel B mengenali dan merespon
antigen. Setelah terpapar antigen, sel B berkembang untuk membentuk sel
plasma, yang memproduksi dan mengeluarkan antibodi. Sebagian besar
antibodi dilepaskan ke dalam aliran darah, tetapi ada juga antibodi dalam air
liur, air mata, dan cairan yang melapisi sistem pencernaan dan lain-lain.
LANJUTAN……….

Tujuan lain dari produksi antibodi adalah untuk memberikan perlindungan yang tahan lama terhadap
antigen. Selama proses perkembangan sel B, beberapa sel B menjadi sel “memori”, yang memiliki
kemampuan untuk mengenali benda asing yang akan masuk kedalam tubuh selama bertahun-tahun, dan
dapat memberikan tanggapan, tumbuh dan menghasilkan lebih banyak sel plasma dan antibodi, dan
memberikan perlindungan jangka panjang bagi tubuh terhadap antigen. Antibodi bersifat sangat spesifik
untuk antigen. Antibodi akan menutup antigen, salah satu sel sejenis leukosit yang disebut makrofag
akan dapat lebih sering mengenali antigen tersebut. Makrofag adalah sel yang sangat efektif dalam
fagositosis. Dalam fagositosis, makrofag menelan antigen yang dilapisi antibodi; kemudian, organel
dalam makrofag disebut lisosom melepaskan enzim pencernaan yang mendegradasi antigen. Ketika
antigen adalah sel asing seperti bakteri, beberapa antibodi terlibat dalam mekanisme yang memecah sel
melalui proses yang disebut lisis sel.

Ketika antigen adalah sel asing seperti bakteri, beberapa antibodi terlibat dalam mekanisme yang
memecah sel melalui proses yang disebutlisis sel. Namun terkadang produksi antibodi alami kita tidak
cukup untuk melindungi kita dari patogen seperti cacar, virus penyebab hepatitis, dan virus.Human
Immunodeficiency Virus (HIV), penyebab dari Acquired Immune Deficiency Syndrome (AIDS).
Ketika antigen adalah sel asing seperti bakteri, beberapa antibodi terlibat dalam mekanisme yang memecah sel melalui
proses yang disebutlisis sel. Namun terkadang produksi antibodi alami kita tidak cukup untuk melindungi kita dari
patogen seperti cacar, virus penyebab hepatitis, dan virus.Human Immunodeficiency Virus (HIV), penyebab dari
Acquired Immune Deficiency Syndrome (AIDS).

Jenis Vaksin: Bagaimana Vaksin Dibuat?

Vaksin adalah bagian dari patogen atau seluruh organisme yang dapat diberikan kepada manusia atau hewan melalui
mulut atau suntikan untuk merangsang sistem kekebalan tubuh terhadap infeksi oleh patogen tersebut. Ketika orang atau
hewan divaksinasi, sistem kekebalan mereka mengenali vaksin sebagai antigen dan merespons dengan membuat
antibodi dan sel memori B.

Empat strategi utama umumnya digunakan untuk menciptakan respon imun menggunakan vaksin :

1. Vaksin subunit dibuat dengan menyuntikkan bagian dari struktur virus atau bakteri, biasanya protein atau lipid dari
mikroba, yang ditanggapi oleh sistem kekebalan. Contoh, vaksin untuk penyakit tetanus, antraks, hepatitis dan
meningokokus.

2. Vaksin yang dilemahkan melibatkan penggunaan bakteri atau virus hidup yang telah dilemahkan karena penuaan atau
dengan mengubah kondisi pertumbuhannya untuk mencegah replikasinya setelah dimasukkan ke dalam penerima.
Contoh, vaksin sabin untuk polio, MMR, TBC, kolera, dan cacar air (varicella).

3. Vaksin yang tidak aktif (dimatikan) dibuat dengan membunuh patogen dan menggunakan mikroorganisme yang mati
atau tidak aktif untuk vaksin. Contoh, vaksin DPT, dan vaksin influenza (flu).

4. Vaksin berbasis DNA. Vaksin ini terdiri dari plasmid yang mengandung gen untuk enzim manusia (tirosinase).
Kekebalan dari vaksinasi dapat memudar seiring
waktu. Akibatnya, banyak vaksin memerlukan
imunisasi pemacu suntikan setiap beberapa tahun
untuk merangsang kembali sistem kekebalan
sehingga akan terus memberikan tingkat
perlindungan antibodi dan sel memori kekebalan.
Misalnya, vaksin DPT efektif selama sekitar 10
tahun, seperti halnya vaksin tetanus, dan vaksin flu
yang mungkin Anda terima memerlukan suntikan
tahunan karena jenis virus influenza baru
berkembang setiap tahun. Vaksin yang dilemahkan
dan tidak aktif termasuk di antara vaksin pertama
yang dikembangkan. Banyak bakteri melepaskan
protein ke dalam media pembulatan, dan protein ini
dapat dimurnikan dan dicampur dengan senyawa
yang akan membantu merangsang respons imun
saat disuntikkan ke manusia.
Contohnya, hepatitis B adalah virus yang ditularkan melalui
darah yang ditularkan melalui paparan cairan tubuh, hubungan
seksual, dan transfusi darah yang terkontaminasi. Hepatitis B
menyebabkan penyakit hati yang mematikan. Ketika vaksin untuk
hepatitis B pertama kali disiapkan, para ilmuwan mengisolasi virus
dari darah pasien yang terinfeksi dan kemudian menggunakan
teknik biokimia untuk memurnikan protein virus. Protein ini
kemudian disuntikkan ke manusia sebagai vaksin. .Saat ini sebagian
besar vaksin subunit, termasuk vaksin untuk hepatitis B, dibuat
menggunakan pendekatan DNA rekombinan di mana vaksin
diproduksi di mikroba. Untuk memproduksi vaksin subunit
rekombinan untuk hepatitis B, para ilmuwan mengkloning gen
untuk protein pada permukaan luar virus menjadi plasmid. Ragi
yang diubah dengan plasmid ini digunakan untuk mengekspresikan
sejumlah besar protein virus sebagai protein fusi, yang kemudian
dimurnikan dan digunakan untuk memvaksinasi orang terhadap
infeksi hepatitis B.
Idealnya, sistem kekebalan dapat menjadi paling efektif selama tahap awal paparan agen infeksi, ketika selsel kekebalan dapat menyerang
patogen segera setelah mereka masuk ke dalam tubuh. Virus penyebab penyakit menggunakan sejumlah cara rumit untuk menginfeksi sel,
bereplikasi, dan menyebabkan penyakit. Contohnya, human immunodeficiency virus-1 (HIV-1), agen penyebab AIDS, menginfeksi sel kekebalan
manusia dengan mengikat sel dan menyuntikkan genom RNA-nya. HIV dan virus lain yang mentranskripsi genom RNA menjadi DNA disebut
retrovirus. . Setelah genom virus disalin, itu ditranskripsi untuk membuat RNA dan diterjemahkan untuk menghasilkan protein virus yang
berkumpul untuk membuat lebih banyak partikel virus yang dilepaskan dari sel yang terinfeksi.

Bakteri dan Virus yang Menjadi Target untuk Vaksin

Patogen berubah sepanjang waktu, memunculkan strain yang resistan terhadap obat dan vaksin serta strain baru bakteri dan virus penyebab
penyakit. Beberapa target vaksin utama termasuk demam berdarah, Hepatitis C dan E, penyakit menular seksual seperti herpes, gonore dan infeksi
klamidia, resisten methicillin. Stafilokokus aureus (MRSA), penyakit pneumokokus, rotavirus, dan Virus West Nile. e. Selain itu, penyakit
manusia nonpatogen seperti penyakit Alzheimer, multiple sclerosis, alergi, kecanduan obat, diabetes, dan hipertensi menjadi target vaksin
terapeutik. Flu disebabkan oleh sejumlah besar virus yang termasuk dalam influensa keluarga virus. Ilmuwan sedang mempertimbangkan
pengembangan "laboratorium global" untuk memantau jenis virus influenza di seluruh dunia, mereplikasi virus ini, dan kemudian menggunakan
teknik DNA rekombinan untuk memproduksi vaksin subunit sebagai tanggapan terhadap jenis virus baru yang terdeteksi. Influenza A merupakan
salah satu ancaman potensial terbesar bagi kesehatan manusia melalui pandemi, wabah global. . Strain pandemi influenza A telah muncul di masa
lalu. Pada tahun 1918, virus influenza menewaskan sedikitnya 20 juta orang. Variasi pada influenza A disebabkan oleh dua glikoprotein yang
disebut hemagglutinin (HA) dan neuraminidase (NA), yang menonjol dari permukaan virus. Flu burung adalah subtipe influenza A yang disebut
H5N1 karena variasi dari dua protein yang terkandung dalam galur ini (disingkat H dan N bila digunakan dalam nama galur).
Tuberkulosis (TBC), disebabkan oleh bakteri Mycobacterium tuberculosis. Penyebaran TBC telah efektif
dikendalikan di banyak wilayah di dunia dengan penggunaan antibiotik dan vaksin. Tetapi, M.tuberkulosis
telah terbukti sangat mahir dalam mengembangkan galur baru yang resisten terhadap pengobatan. Sehingga
WHO menyatakan TB sebagai kesehatan global darurat, dan sejumlah inisiatif penelitian diluncurkan.

Malaria disebabkan oleh parasit protozoa Plasmodium falciparum dan ditularkan oleh serangga. Di seluruh
dunia, Plasmodium strain mengembangkan resistensi terhadap obat antimalaria yang paling umum
digunakan. Meskipun obat ini telah efektif di beberapa bagian dunia, angka kematian akibat malaria masih
meningkat. Sekitar setengah miliar kasusPlasmodium Infeksi terjadi pada anak-anak dan menyebabkan
hampir 3 juta kematian.

Di sisi lain, lebih dari 33 juta orang terinfeksi oleh HIV di seluruh dunia. Kebutuhan akan vaksin untuk
mengobati dan menghentikan penyebaran HIV sangat penting jika kita ingin mengekang penyakit yang
menghancurkan ini dan pada akhirnya menghilangkan epidemi AIDS. Beberapa vaksin untuk pencegahan
infeksi HIV atau pengobatan orang yang terinfeksi HIV telah dicoba pada manusia; sebagian besar vaksin ini
menargetkan protein permukaan virus, tetaapi Pada tahun 2007, vaksin yang menjanjikan dari Merck gagal
dalam uji klinis fase II. Salah satu kendala yang dihadapi para ilmuwan vaksin HIV adalah tingginya tingkat
mutasi HIV. Akibatnya, vaksin multi subunit yang disebut koktail yang mengandung campuran banyak
protein virus, bersama dengan obat antivirus yang menghalangi replikasi virus mungkin merupakan strategi
yang lebih efektif untuk memerangi HIV daripada hanya menggunakan vaksin atau obat antivirus saja.
5.5 Genom Mikroba
Tujuan dari MGP (Program Genom Mikroba),
adalah untuk mengurutkan seluruh genom
mikroorganisme yang memiliki potensi aplikasi
dalam biologi lingkungan, penelitian, industri, dan
kesehatan, seperti bakteri penyebab tuberkulosis,
gonore, dan kolera, serta genom protozoa.
Pengurutan Genom Mikroba
Pengurutan genom mikroba penting karena :
1. Dengan mengurutkan genom mikroba, para
ilmuwan akan dapat mengidentifikasi banyak
rahasia bakteri, dari gen yang terlibat dalam
metabolisme sel bakteri dan pembelahan sel hingga
gen yang menyebabkan penyakit manusia dan
hewan.
2. Para peneliti akan menemukan gen bakteri yang
memungkinkan para ilmuwan untuk
mengembangkan jenis mikroba baru yang dapat
digunakan dalam bioremediasi dan untuk
mengurangi karbon dioksida atmosfer dan gas
rumah kaca lainnya.
3.Untuk menemukan organisme penyebab penyakit dalam
makanan dan air, untuk mendeteksi senjata biologis. , untuk
mensintesis plastik, untuk membuat produk makanan yang lebih
baik, dan
4. Untuk menghasilkan bakteri yang diubah secara genetik sebagai
biosensor untuk mendeteksi zat berbahaya, di antara banyak contoh
lainnya.
Bakteri melakukan banyak aktivitas biokimia, yang
tercermin dalam genom mereka. Dari genom mikroba yang
diurutkan hingga saat ini, sekitar 45% gen yang diidentifikasi
menghasilkan protein dengan fungsi yang tidak diketahui, dan
sekitar 25% gen yang ditemukan menghasilkan protein yang unik
untuk genom bakteri yang diurutkan. Oleh karena itu potensi
untuk mengidentifikasi gen dan protein baru dengan sifat unik
yang mungkin memiliki aplikasi penting dalam bioteknologi
sangat tinggi.
Salah satu mikroba pertama yang ditargetkan untuk studi
genom adalah Vibrio kolera, yang biasanya ditemukan di perairan
tercemar di wilayah dunia dengan praktik sanitasi yang buruk.
Bakteri ini menyebabkan penyakit kolera.
Studi Metagenomik Mengurutkan genom dari
Komunitas Mikroba
Metagenomik melibatkan pengurutan genom
untuk seluruh komunitas mikroba. Proyek
metagenomics mengurutkan genom mikroba dari
sampel lingkungan air, udara, dan tanah serta dari
lautan di seluruh dunia, gletser, tambang hampir
setiap sudut dunia. Saat ini sejumlah proyek
metagenomics telah diluncurkan di seluruh dunia,
yang melibatkan tim peneliti internasional yang
mengurutkan mikroba laut dan mikroba tanah (ada
proyek "terragenome" yang sedang berjalan).
Ekspedisi ini memiliki potensi besar untuk
mengidentifikasi mikroba dan gen baru dengan fungsi
baru, termasuk gen yang bernilai komersial. Misalnya,
proyek Laut Sargasso mengidentifikasi ratusan gen
fotoreseptor. Beberapa mikroorganisme
mengandalkan fotoreseptor untuk menangkap energi
cahaya yang digunakan untuk menggerakkan
fotosintesis.
Proyek Microbiome manusia
Proyek Mikrobiome Manusia memiliki beberapa tujuan
utama, termasuk:
■ Menentukan mikrobioma inti manusia.
■ Memahami bagaimana kita memperoleh dan memelihara
komunitas mikroba.
■ Memahami bagaimana perubahan mikrobioma dapat
dikorelasikan dengan perubahan kesehatan manusia dan kondisi
(seperti stres dan diet) yang memengaruhi mikrobioma.
■ Mengembangkan metode baru, termasuk alat bioinformatika,
untuk mendukung analisis mikrobioma.
■ Mengatasi implikasi etika, hukum dan sosial yang diangkat oleh
penelitian mikrobioma manusia. Menangani masalah etika, hukum
dan sosial adalah tujuan dari Proyek Genom Manusia (HGP)
Mikrobioma air liur juga sangat mirip dari individu ke
individu, dan database Mikrobioma Oral Manusia telah dibuat dari
studi ini; itu berusaha untuk mengembangkan hubungan antara
mikrobioma mulut dan kesehatan mulut. Lebih dari 700 jenis
mikroba tumbuh di mulut saja, berkontribusi terhadap masalah
kesehatan mulut seperti bau mulut, pembentukan plak, dan
kerusakan gigi.
 Apa aplikasi potensial dari genom sintetik dan
Membuat genom sintetis: Genom Sintetis Fungsional diproduksi biologi sintetik?
untuk Strain Bakteri
JCVI mengklaim bahwa tujuan akhir mereka
Pada tahun 2010 para ilmuwan JCVI menerbitkan laporan pertama adalah menciptakan mikroorganisme yang dapat
dari fungsi genom sintetis. Dalam proyek ini mereka merancang dan digunakan untuk mensintesis biofuel. Kemungkinan
telah mensintesis lebih dari seribu segmen 1.080-bp yang mencakup lain ada, seperti menciptakan mikroba sintetik
seluruh genom bakteri 1,08-Mb Mycoplasma mycoides. Untuk merakit dengan genom yang direkayasa untuk bioremediasi,
segmen ini dengan benar, segmen memiliki urutan 80-bp di setiap memproduksi bahan bakar alternatif, mensintesis
ujungnya, yang tumpang tindih dengan urutan tetangganya. Urutan ini produk biofarmasi baru, mengembangkan bakteri
dikloning diE. coli. Kemudian, menggunakan ragi Saccharomyces yang diprogram secara genetik untuk membantu
cerevisiae, mereka merakit urutan menjadi sebelas rakitan 10-kb kita menyembuhkan, dan membuat “genom
terpisah, yang akhirnya digabungkan untuk sepenuhnya menjangkau prostetik.”
keseluruhan M. mycoides genom. Genom yang dirakit, yang disebut
JCVIsyn1.0, kemudian ditransplantasikan ke kerabat dekatM.
capricolum sebagai sel penerima, menghasilkan sel baru dengan
genotipe JCVI-syn1.0 dan fenotipe galur baru M. mycoides. Genom
sintetis secara efektif me-rebootM. capricolum yang merupakan sel
penerima untuk berubah kemudian dari satu bentuk ke bentuk lainnya.
Venter dan lainnya telah menggunakan teknologi DNA rekombinan
untuk membuat salinan sintetik genom virus. Karya ini tidak
menciptakan kehidupan dari benda mati, karena didasarkan pada
pengubahan satu galur hidup menjadi galur lain.

5.6 Mikroba untuk Membuat Biofuel
Produksi bahan bakar nabati berpotensi
sebagai sumber energi alternatif dan mengurangi
pemanasan global akibat pembakaran bahan bakar
fosil. Untuk menghasilkan etanol, mikroba
pemfermentasi alkohol mengubah glukosa dan gula
lain dalam biji-bijian menjadi etanol, tetapi proses
ini tidak hemat biaya atau efisien.
Dibutuhkan banyak biji jagung untuk
menghasilkan etanol dalam jumlah yang relatif
kecil. Meskipun, seperti yang dilihat, biomassa
selulosa seperti batang jagung merupakan sumber
gula yang tersedia dan berlimpah untuk membuat
etanol, tetapi pemecahan glukosa dari selulosa
bukanlah hal yang sederhana. Proses pemecahannya
adalah dengan memecah selulosa menjadi molekul
glukosa individu, yang kemudian dapat digunakan
untuk membuat etanol melalui proses fermentasi.
.
Beberapa teknik menggunakan perawatan kimia untuk
membantu melonggarkan struktur selulosa, tetapi bahan kimia ini
justru menghambat banyak mikroba yang dapat digunakan untuk
membuat etanol. Sehingga saat ini, teknologi DNA rekombinan
sedang digunakan untuk memproduksi E. coli dengan peningkatan
kemampuan untuk menghasilkan etanol, serta bakteri dengan
peningkatan kemampuan untuk memfermentasi gula menjadi
etanol dengan fermentasi alkohol. Yang lain telah direkayasa
secara genetic E. coli untuk mensekresi kan enzim pendegradasi
selulosa.
Meskipun potensi masa depan biofuel tidak jelas, diharapkan
penelitian selama beberapa tahun ke depan akan menghasilkan
peningkatan yang signifikan dalam produksi biofuel.

5.7 Diagnostik Mikroba
Teknik molekuler untuk mendeteksi dan
melacak mikroba dengan sebuah pendekatan yang
disebutdiagnostik mikroba.
Strategi Deteksi Bakteri
1. Teknik molekuler seperti analisis restriksi panjang
fragmen polimorfisme (RFLP), PCR, dan sekuensing
DNA, dapat digunakan untuk identifikasi bakteri.
2. Jika genom patogen besar dan menghasilkan
terlalu banyak fragmen enzim restriksi, yang
mencegah visualisasi pita DNA individu pada gel
agarosa, DNA dapat dikenai analisis Southern blot.
3. Jika dokter mencurigai adanya infeksi bakteri atau
virus, sampel termasuk darah, air liur, feses, dan
cairan serebrospinal dari pasien dapat digunakan
untuk mengisolasi bakteri dan virus patogen. DNA
dari patogen yang dicurigai kemudian diisolasi dan
dilakukan teknik molekuler seperti PCR
4. PCR merupakan alat penting untuk pengujian diagnostik di
laboratorium mikrobiologi klinis dan banyak digunakan untuk
mendiagnosis infeksi yang disebabkan oleh mikroba seperti virus
hepatitis (A, B, dan C), Chlamydia trachomatis dan Neisseria
gonorrhoeae ( keduanya menyebabkan penyakit menular seksual),
HIV-1, dan banyak bakteri dan virus lainnya.
Pelacakan Mikroorganisme Penyebab Penyakit
Salmonella dapat menginfeksi saluran usus manusia yang
menyebabkan diare dan muntah yang parah, gejala yang biasa
disebut keracunan makanan.
Microarray untuk Melacak Penyakit Menular
Microarrays telah menciptakan pendekatan baru untuk
mendeteksi dan mengidentifikasi patogen dan untuk memeriksa
respon host terhadap penyakit menular. Pendekatan microarray
juga digunakan untuk mempelajari perubahan ekspresi gen yang
terjadi ketika suatu organisme terinfeksi patogen memberikan
“penanda" untuk infeksi oleh organisme tertentu.