Secara garis besar di dalam sistem pembiayaan terdapat berbagai sumber, sebagai berikut:
1. Pemerintah pusat yang berkaitan dengan Departemen Kesehatan, yaitu seperti:
a. Anggaran Pengembangan Sektoral (DIP) b.Anggaran Rutin (DIK) 2. Bantuan Pembangunan Sarana Kesehatan, yaitu seperti: a. Subsidi Bantuan Biaya Operasional (SBBO) rumah sakit b. Pemerintah Daerah Tingkat 1 / Propinsi