Nama :

Berty Veibrita Sinaga

Nim

1407025008

SISTEMATIKA VIRUS
Virus telah disebut sejak zaman kuno. Namun, asal ini organisme kecil yang membawa
informasi genetik yang hanya dalam mantel protein masih belum diketahui. Masalah utama
adalah fosil tidak virus pernah telah terdeteksi. Jadi asal usul sulit untuk berspekulasi.
Partikel-partikel ini terlalu kecil dan terlalu rapuh untuk proses fossilisation atau bahkan
untuk pelestarian asam nukleat urutan dalam daun jaringan atau serangga di amber.
Dengan demikian studi virus asal mengandalkan virus yang terisolasi di masa kini, atau
dari bahan yang paling beberapa dekade lama.
Sistematika molekuler virus
Cabang baru dari virus sistematika molekuler membantu dalam memahami dan
hubungan yang jauh dari asal-usul penting rombongan virus. Para peneliti telah diurutkan
sekarang semua atau sebagian DNA dan RNA dikenal jenis virus, termasuk yang terbesar
(cacar - dan masuk) dan terkecil (gemini - dan virus gerbang lainnya). Urutan selular
membantu dalam memahami evolusi virus selama berabad-abad.
Sebagai contoh, Geminiviruses adalah sekelompok virus dan masing-masing subtipe
memiliki gen yang berbeda dan komponen genom. Perbedaan namun dapat ditelusuri
kembali ke asal-usul yang sama ketika mempertimbangkan keragaman geografis, dan
perbedaan genetik kendaraan atau host yang membawa virus.
Demikian pula Potyviruses keluarga kuno virus dan genom bervariasi diantara subtipe
dan tidak dibagi oleh semua anggota. Ini dikirim oleh kutu daun sementara rymo- dan
triticiviruses ditransmisikan tungau, dan ipomoviruses whitefly ditransmisikan. Ini telah
ditemukan diturunkan dari virus jamur.
Leluhur tunggal ?
Menelusuri kembali evolusi keturunan virus dapat berspekulasi berasal daripada leluhur
tunggal yang mengandung RNA fungsi atau dari organisme (berisi DNA dalam kasus-kasus
virus DNA). Retrovirus seperti HIV virus, serta pararetroviruses, retrotransposons dan

retroposons berbagi asal yang sama fungsi transkripsi terbalik. Ini berarti virus ini memiliki
enzim yang beralih berbasis RNA genetika ke keturunan berbasis DNA.
Selain itu beberapa hewan virus - seperti picornaviruses dan alphaviruses - memiliki asal-usul
dalam virus tanaman yang tidak memiliki struktur yang sama, komponen genom, organisasi
atau jumlah gen. Picornaviruses bulat kecil (ssRNA, 1 genom komponen menginfeksi
binatang) memiliki hubungan dengan comoviruses (kecil bulat, 2 genom komponen
tumbuhan) dan Potyviridae (berserabut, 1 atau dua komponen genom, tumbuhan).
Dari studi evolusi itu jelas bahwa ada dapat telah tidak ada satu asal virus sebagai organisme.
Dengan demikian, dapat menjadi tidak sederhana "pohon keluarga" untuk virus. Fitur mereka
hanya umum adalah peran mereka sebagai parasit obligat yang memerlukan sejumlah untuk
menyebarkan.
Evolusi virus
Evolusi telah mulai dari awal hidup di air, serta timeline kolonisasi tanah kering oleh
organisme. Virus dari hampir semua utama kelas organisme - binatang, tanaman, jamur dan
bakteri archaea - mungkin berkembang dengan mereka host di laut dan virus muncul dari air
dengan mereka host yang berbeda.
Kebanyakan virus tanah tanaman mungkin berevolusi dari orang-orang di ganggang hijau
yang muncul +/-1000 juta tahun yang lalu.
Mana virus berasal ?
Ada tiga hipotesis mengenai asal-usul virus:
Progresif, atau escape, hipotesis menyatakan bahwa virus muncul dari unsur-unsur genetik
yang memperoleh kemampuan untuk bergerak di antara sel;
Hipotesis regresif, atau pengurangan, menegaskan bahwa virus adalah sisa-sisa organisme;
Hipotesis virus-pertama menyatakan bahwa virus coevolved dengan host selular mereka saat
ini.
Hipotesis progresif
Menurut hipotesis ini virus berasal melalui proses progresif. Mobile movable potongan
bahan genetik yang mampu bergerak dalam suatu genom, memperoleh kemampuan untuk
keluar satu sel dan memasuki lain.
Hipotesis regresif

Virologists beberapa merasa virus dapat berasal melalui regresif, atau reduktif, proses.
Bakteri tertentu yang adalah parasit intraselular obligat, seperti spesies Chlamydia dan
Rickettsia , berevolusi dari nenek moyang yang hidup bebas. Virus dengan demikian bisa
telah berevolusi dari organisme yang lebih kompleks, mungkin hidup bebas yang kehilangan
informasi genetik dari waktu ke waktu sebagai ini menjadi parasit dalam replikasi mereka.
Virus virus DNA besar di nucleocytoplasmic (NCLDVs) menggambarkan hipotesis ini.
Hipotesis Virus-pertama
Hipotesis ini menunjukkan bahwa virus yang ada sebelum sel. Koonin dan Martin (2005)
hipotesis bahwa virus yang ada di dunia pre-cellular sebagai swa-replikasi unit.
Hipotesis yang untuk memilih ?
Tak satu pun dari hipotesis mungkin benar. Sampai saat ini, tidak ada penjelasan yang
jelas untuk origin(s) virus ada. Dan jadi virus telah muncul dari mobile elemen genetik yang
memperoleh kemampuan untuk bergerak di antara sel atau mereka mungkin diturunkan dari
sebelumnya organisme yang hidup bebas yang diadaptasi strategi replikasi parasit atau
mungkin telah ada sebelum, dan menyebabkan evolusi kehidupan, selular.
PENGERTIAN VIRUS
Virus adalah parasit berukuran mikroskopik yang menginfeksi sel organisme biologis.
Virus hanya dapat bereproduksi di dalam material hidup dengan menginvasi dan
memanfaatkan sel makhluk hidup karena virus tidak memiliki perlengkapan selular untuk
bereproduksi sendiri. Dalam sel inang, virus merupakan parasit obligat dan di luar inangnya
menjadi tak berdaya. Biasanya virus mengandung sejumlah kecil asam nukleat yang
diselubungi semacam bahan pelindung yang terdiri atas protein, lipid, glikoprotein, atau
kombinasi ketiganya. Genom virus menyandi baik protein yang digunakan untuk memuat
bahan genetik maupun protein yang dibutuhkan dalam daur hidupnya.
Istilah virus biasanya merujuk pada partikel-partikel yang menginfeksi sel-sel eukariota
(organisme multisel dan banyak jenis organisme sel tunggal), sementara istilah bakteriofag
atau fag digunakan untuk jenis yang menyerang jenis-jenis sel prokariota (bakteri dan
organisme lain yang tidak berinti sel).
Virus sering diperdebatkan statusnya sebagai makhluk hidup karena ia tidak dapat
menjalankan fungsi biologisnya secara bebas. Karena karakteristik khasnya ini virus selalu

terasosiasi dengan penyakit tertentu, baik pada manusia (misalnya virus influenza dan HIV),
hewan (misalnya virus flu burung), atau tanaman (misalnya virus mosaik tembakau)
Sejarah virus
Menurut para ahli biologi, virus merupakan organisme peralihan antara makhluk hidup
dan benda mati. Dikatakan peralihan karena virus mempunyai ciri-ciri makhluk hidup,
misalnya mempunyai DNA (asam deoksiribonukleat) dan dapat berkembang biak pada sel
hidup. Memiliki ciri-ciri benda mati seperti tidak memiliki protoplasma dan dapat
dikristalkan. Para penemu virus antara lain D. Iwanoski (1892) pada tanaman tembakau,
dilanjutkan M. Beijerinck (1898), Loffern dan Frooch (1897) menemukan dan memisahkan
virus penyebab penyakit mulut dan kaki (food and mouth diseases), Reed (1900) berhasil
menemukan virus penyebab kuning (yellow fever), Twort dan Herelle (1917) penemu
Bakteriofage, Wendell M. Stanley (1935) berhasil mengkristalkan virus mosaik pada
tembakau. Pengetahuan tentang virus terus berkembang sampai lahir ilmu cabang biologi
yang mempelajari virus disebut virology.
1. Ciri-ciri Virus
Berukuran ultra mikroskopis
Parasit sejati/parasit obligat
Berbentuk oval, bulat, batang, huruf T, kumparan
Kapsid tersusun dari protein yang berisi DNA saja atau RNA
Dapat dikristalkan
Aktivitasnya harus di sel makhluk hidup
2. Struktur dan anatomi Virus
Untuk mengetahui struktur virus secara umum kita gunakan bakteriofage (virus T),
strukturnya terdiri dari:
a. Kepala
Kepala virus berisi DNA dan bagian luarnya diselubungi kapsid. Satu unit protein yang
menyusun kapsid disebut kapsomer.
b. Kapsid
Kapsid adalah selubung yang berupa protein. Kapsid terdiri atas kapsomer. Kapsid juga dapat
terdiri atas protein monomer yang yang terdiri dari rantai polipeptida. Fungsi kapsid untuk
memberi bentuk virus sekaligus sebagai pelindung virus dari kondisi lingkungan yang

merugikan virus.
c. Isi tubuh
Bagian isi tersusun atas asam inti, yakni DNA saja atau RNA saja. Bagian isi disebut sebagai
virion. DNA atau RNA merupakan materi genetik yang berisi kode-kode pembawa sifat
virus. Berdasarkan isi yang dikandungnya, virus dapat dibedakan menjadi virus DNA (virus
T, virus cacar) dan virus RNA (virus influenza, HIV, H5N1). Selain itu di dalam isi virus
terdapat beberapa enzim.
d. Ekor
Ekor virus merupakan alat untuk menempel pada inangnya. Ekor virus terdiri atas tubus
bersumbat yang dilengkapi benang atau serabut. Virus yang menginfeksi sel eukariotik tidak
mempunyai ekor.
Virus terkecil berdiameter hanya 20 nm (lebih kecil daripada ribosom), sedangkan virus
terbesar sekalipun sukar dilihat dengan mikroskop cahaya.
Asam nukleat genom virus dapat berupa DNA ataupun RNA. Genom virus dapat terdiri
dari DNA untai ganda, DNA untai tunggal, RNA untai ganda, atau RNA untai tunggal. Selain
itu, asam nukleat genom virus dapat berbentuk linear tunggal atau sirkuler. Jumlah gen virus
bervariasi dari empat untuk yang terkecil sampai dengan beberapa ratus untuk yang
terbesar. Bahan genetik kebanyakan virus hewan dan manusia berupa DNA, dan pada virus
tumbuhan kebanyakan adalah RNA yang beruntai tunggal.
Bahan genetik virus diselubungi oleh suatu lapisan pelindung. Protein yang menjadi
lapisan pelindung tersebut disebut kapsid. Bergantung pada tipe virusnya, kapsid bisa
berbentuk bulat (sferik), heliks, polihedral, atau bentuk yang lebih kompleks dan terdiri atas
protein yang disandikan oleh genom virus. Kapsid terbentuk dari banyak subunit protein
yang disebut kapsomer.
3. Reproduksi Virus
Cara reproduksi virus dikenal sebagai proliferasi yang terdiri dari:
a. Daur litik (litic cycle)
1. Fase Adsorbsi (fase penempelan)
Ditandai dengan melekatnya ekor virus pada sel bakteri. Setelah menempel virus
mengeluarkan enzim lisoenzim (enzim penghancur) sehingga terbentuk lubang pada dinding
bakteri untuk memasukkan asam inti virus.
2. Fase Injeksi (memasukkan asam inti)
Setelah terbentuk lubang pada sel bakteri maka virus akan memasukkan asam inti (DNA)

ke dalam tubuh sel bakteri. Jadi kapsid virus tetap berada di luar sel bakteri dan berfungsi
lagi.
3. Fase Sintesis (pembentukan)
DNA virus akan mempengaruhi DNA bakteri untuk mereplikasi bagian-bagian virus,
sehingga terbentuklah bagian-bagian virus. Di dalam sel bakteri yang tidak berdaya itu
disintesis virus dan protein yang dijadikan sebagai kapsid virus, dalam kendali DNA virus.
4. Fase Asemblin (perakitan)
Bagian-bagian virus yang telah terbentuk, oleh bakteri akan dirakit menjadi virus
sempurna. Jumlah virus yang terbentuk sekitar 100-200 buah dalam satu daur litik.
5. Fase Litik (pemecahan sel inang)
Ketika perakitan selesai, maka virus akan menghancurkan dinding sel bakteri dengan
enzim lisoenzim, akhirnya virus akan mencari inang baru.
b. Daur lisogenik (lisogenic cycle)
1. Fase Penggabungan
Dalam menyisip ke DNA bakteri DNA virus harus memutus DNA bakteri, kemudian
DNA virus menyisip di antara benang DNA bakteri yang terputus tersebut. Dengan kata lain,
di dalam DNA bakteri terkandung materi genetik virus.
2. Fase Pembelahan
Setelah menyisip DNA virus tidak aktif disebut profag. Kemudian DNA bakteri
mereplikasi untuk melakukan pembelahan.
3. Fase Sintesis
DNA virus melakukan sintesis untuk membentuk bagian-bagian viirus
4. Fase Perakitan
Setelah virus membentuk bagian-bagian virus, dan kemudian DNA masuk ke dalam akan
membentuk virus baru
5. Fase Litik
Setelah perakitan selesai terjadilah lisis sel bakteri. Virus yang terlepas dari inang akan
mencari inang baru
4. Klasifikasi Virus
Menurut klasifikasi Bergey, virus termasuk ke dalam divisio Protophyta, kelas
Mikrotatobiotes dan ordo Virales (Virus). Pada tahun 1976 ICTV (International Commite on
Taxonomy of Virus) mempublikasikan bahwa virus diklasifikasikan struktur dan komposisi

tubuh, yakni berdasarkan kandungan asam. Pada dasarnya virus dibedakan atas dua golongan
yaitu virus DNA dan virus RNA.
a. Virus DNA mempunyai beberapa famili:
1. Famili Parvoviridae seperti genus Parvovirus
2. Famili Papovaviridae seperti genus Aviadenovirus
3. Famili Adenoviridae seperti genus Mastadenovirus
4. Famili Herpesviridae seperti genus Herpesvirus
5. Famili Iridoviridae seperti genus Iridovirus
6. Famili Poxviridae seperti genus Orthopoxvirus
b. Virus RNA mempunyai beberapa famili:
1. Famili Picornaviridae seperti genus Enterivirus
2. Famili Reoviridae seperti genus Reovirus
3. Famili Togaviridae seperti genus Alphavirus
4. Famili Paramyvoviridae seperti genus Pneumovirus
5. Famili Orthomyxoviridae seperti genus Influensavirus
6. Famili Retroviridae seperti genus Leukovirus
7. Famili Rhabdoviridae seperti genus Lyssavirus
8. Famili Arenaviridae seperti genus Arenavirus
5. Peran Virus dalam Kehidupan Manusia
a. Virus yang menguntungkan, berfungsi untuk:
1. Membuat antitoksin
2. Melemahkan bakteri
3. Memproduksi vaksin
4. Menyerang patogen
b. Virus yang merugikan, penyakit-penyakit yang disebabkan virus antara lain:
1. Pada Tumbuh-tumbuhan
Mozaik pada daun tembakau Tobacco Mozaic Virus
Mozaik pada kentang Potato Mozaic Virus
2. Mozaik pada tomat Tomato Aucuba Mozaic Virus
Kerusakan floem pada jeruk Citrus Vein Phloem Degeneration
3. Pada Hewan

Tetelo pada Unggas New Castle Disease Virus

Cacar pada sapi Vicinia Virus
SLidah biru pada biri-biri Orbivirus
Tumor kelenjar susu monyet Monkey Mammary Tumor Virus
4. Pada Manusia
Influensa Influenzavirus
AIDS Retrovirus
SARS Coronavirus
Flu burung Avianvirus
6. Pertahanan Diri Terhadap Serangan Virus
Kemampuan virus untuk menyebabkan penyakit disebut virulensi. Virulensi virus ditentukan
oleh:
a. keberadaan dan aktivitas reseptor pada permukaan inang yang memudahkan virus untuk
melekat
b. kemampuan virus menginfeksi sel
c. kecepatan replikasi virus dalam sel inang
d. kemampuan sel inang dalam menahan serangan virus
Sebagian besar virus masuk ke tubuh manusia melalui mulut dan hidung, kulit yang luka.
Jika ada virus yang masuk, sel tubuh akan mempertahankan dengan menghasilkan sel fagosit,
antibodi, dan interferon (protein khas)
Contoh pengaruh virus dalam perikanan :
Satu virus baru yang dapat menyebabkan kematian secara masal telah menyerang ikan
mas (Cyprinus carpio) dan koi (Cyprinus carpio koi) dilaporkan mulai terjadi pada awal
Tahun 1996 di Inggris (Ilouze, et al., 2006a), musim semi Tahun 1998 di Israel (Perelberg, et
al., 2003) dan Korea (Choi, et al., 2004) dan menyebar ke Amerika Utara, Eropa dan Asia
Tenggara (Dishon, et al., 2002) termasuk Indonesia. Di Jepang, wabah penyakit ini terjadi
pada Oktober 2003 di Danau Kasumigura yang merupakan tempat utama produksi budidaya
ikan mas (Haramoto, et al., 2007), sedangkan di Amerika, isolat virus sudah didapatkan pada
Tahun 1998 dan wabah penyakit ini sudah menyebabkan kematian pada ikan mas liar di
Sungai Chadakoin pada Tahun 2004 (Grimmett, et al., 2006). Penyakit ini dapat menyerang
berbagai ukuran ikan mulai larva hingga induk, biasanya terjadi pada kisaran suhu 18-28 oC
dan dapat menyebabkan kematian 80-100% (Perelberg, et al., 2003; Gilad, et al., 2003;

Ilouze, et al., 2006a). Pada ikan sakit, paling sering teramati luka pada insang, sisik, ginjal,
limfa, jantung dan sistem gastrointestinal (Ilouze, et al., 2006a). Secara visual pada bagian
eksternal tubuh, dapat teramati adanya warna sisik yang gelap dan nekrosis insang yang akut
(Choi, et al., 2004) dan hemoragik pada dasar sirip punggung, sisip dada, dan sirip anus
(Grimmett, et al., 2006), sedangkan secara histologi dapat teramati adanya perubahan pada
insang berupa kehilangan lamela (Pikarsky, et al., 2004).
Serangan virus ini telah menyebabkan kerugian yang sangat besar pada industri
akuakultur mengingat dua jenis ikan yang diserang merupakan komoditas utama ikan
konsumsi dan ikan hias. Di Israel, penyakit ini telah menyebar ke 90% budidaya ikan mas di
semua bagian negara (Perelberg, et al., 2003). Hal serupa juga terjadi di Indonesia,
penyebaran penyakit ini telah melintasi hampir semua daerah budidaya ikan mas. Kegiatan
budidaya yang intensif, pameran ikan koi dan perdagangan aktif domestik dan internasional
yang hampir tidak ada pembatasan dan pemeriksaan atau penerapan program karantina
merupakan penyebab penyebaran yang sangat cepat penyakit ini secara global (Gilad, et al.,
2003, Pikarsky, et al., 2004).

Sejarah Virus | Asal Mula Penemuan

Virus
Sejarah Penemuan Virus. Asal mula keberadaan virus sudah terdeteksi sejak zaman
Mesir Kuno, ketika Firaun Ramses meninggal dunia pada tahun 1196 SM karena sejenis
penyakit yang saat ini di duga disebabkan oleh virus Smallpox. Sebelum itu, pada tahun
sekitar 1400 SM, Memphis yang saat itu merupakan ibukota Mesir Kuno pernah terserang
sejenis penyakit poliomyelitis yang juga di sebabkan oleh virus. Tapi karena minimnya
pengetahuan di aman itu, kejadian-kejadian tersebut di abaikan begitu saja dan biasanya
malah di anggap sebagai kutukan.
Lalu pada tahun 1000 SM, di Cina juga terjadi endemik yang di sebabkan oleh virus
Smallpox. Namun penelitian baru di lakukan pada 1798 ketika Edward Jenner pertama kali
menemukan vaksin. Tanpa tahu bahwa vaksin tersebut merupakan antibodi buatan untuk
mencegah pertumbuhan virus. Pada tahun 1880, Louis Pasteur dan Robert Koch melalui
suatu penelitian, mengemukakan "germ theory" yaitu bahwa mikroorganisme merupakan

penyebab penyakit. Tanpa tahu secara spesifik mikroorganisme seperti apa itu. Lalu pintu
pengetahuan pun mulai terbuka ketika Adolf Mayer salah mengambil kesimpulan akan
penyebab penyakit Mozaik pada tembakau.
Pada abad 1883, ketika Adolf Mayer melakukan penelitian mengenai penyakit mosaik
pada tanaman tembakau. Penyakit ini bukan sembarang penyakit, tetapi penyakit menular
yang dapat menghambat pertumbuhan tanaman tembakau dan membuat daun tanaman
memiliki bercak-bercak. Jika tanaman yang sehat bersentuhan dengan tanaman sakit, maka
penyakit tersebut akan menular. Penelitian Adolf Mayer tersebut tidak dapat menemukan
sembarang mikroba yang menjadi penyebab penyakit ini. Lalu dia mengambil kesimpulan
bahwa penyakit mosaik di sebabkan oleh bakteri yang sangat kecil sehingga tidak dapat di
lihat dengan mikroskop.
Penelitian itu di lanjutkan oleh Dimitri Ivanowsky dari Rusia pada tahun 1892, dia
menemukan bahwa getah daun tembakau yang sudah disaring dengan penyaring bakteri
masih dapat menimbulkan penyakit mosaik. Ivanowsky lalu menyimpulkan dua
kemungkinan, yaitu bahwa bakteri penyebab penyakit tersebut berbentuk sangat kecil
sehingga masih dapat melewati saringan, atau bakteri tersebut mengeluarkan toksin yang
dapat menembus saringan.
Kemungkinan kedua ini dibuang pada tahun 1897 setelah Martinus Beijerinck dari
Belanda menemukan bahwa agen infeksi di dalam getah yang sudah disaring tersebut dapat
bereproduksi karena kemampuannya menimbulkan penyakit tidak berkurang setelah
beberapa kali ditransfer antartanaman.Patogen mosaik tembakau disimpulkan sebagai bukan
bakteri, melainkan merupakan contagium vivum fluidum, yaitu sejenis cairan hidup pembawa
penyakit.
Hal serupa juga di laporkan oleh Loeffler dan Frosch, pada tahun 1898, bahwa dari hasil
penelitiannya, penyebab penyakit mulut dan kaki sapi juga dapat melewati filter yang tidak
dapat dilewati bakteri. Namun demikian, mereka menyimpulkan bahwa patogennya adalah
bakteri yang sangat kecil.
Baru pada tahun 1935, setelah Wendell Meredith Stanley, seorang ahli biokimia Amerika Serikat,
berhasil menemukan kristal berbentuk jarum. Saat kristal tersebut di simpan dalam botol, tidak
menunjukan adanya aktivitas kehidupan. Tetapi saat kristal tersebut di larutkan dan diusapkan pada
permukaan daun yang sehat, daun tersebut menjadi terserang penyakit mosaik. Stanley adalah orang yang
menamakan virus itu Tobacco Mosaic Virus (TMV). Dan karena penemuannya itu, dia menerima
hadiah Nobel dalam bidang kimia pada tahun 1946.