Fotorespirasi adalah proses Rubisco mengikat O2 dan menghasilkan CO2.

Fotorespirasi bekerja
berlawanan dengan fotosintesis yang mengikat CO2 dan menghasilkan O2. Hal inilah yang
mengakibatkan fotorespirasi menjadi proses biokimia yang kurang menguntungkan bagi
produktivitas tumbuhan. Fotorespirasi disebut juga dengan asimilasi cahaya oksidatif yang
terjadi pada mesofil daun. Fotorespirasi biasanya terjadi pada tanaman jenis C3, seperti kedelai
dan padi.

Karbondioksida masuk ke dalam jaringan tumbuhan melalui stomata yang terbuka. Namun
ketika siang hari dan cuaca sangat panas, stomata akan menutup untuk mengurangi penguapan
air. Menutupnya stomata ini akan mengakibatkan suplai CO2 menuju jaringan daun terganggu
sehingga dalam ruang antar sel daun terjadi penurunan konsentrasi CO2 dan peningkatan
konsentrasi O2 hasil fotosintesis.

Keadaan ini akan memicu terjadinya proses fotorespirasi. Dalam keadaan normal enzim rubisco
akan mengikat CO2 dan menggabungkannya dengan ribulosa bifosfat menjadi 3-fosfogliserat.
Namun ketika terjadi fotofosforilasi, rubisco justru akan mengikat O2 dan menjalani siklus
calvin menghasilkan molekul berkarbon dua. Peroksisom dan mitokondria akan memecah
molekul berkrbon 2 tersebut dan melepaskan CO2.