TRANSKRIPSI

Ekspresi Gen
• Gen berekspresi dengan cara mengendalikan .
sifat organisme
• Pengendalian dilakukan melalui pembentukan
enzim/protein yang berperan dalam proses
metabolisme
• Pengendalian pembentukan enzim oleh gen
dilakukan melalui dua tahap : Transkripsi dan
Translasi
 DNA
Rangkaian Ekspresi Gen
INTI
Transkripsi Ribo-
nukletida
mRNA
tRNA

Translasi
Amino-asil-
tRNA

Asam-amino Polipeptida
Ribosom
 TRANSKRIPSI
• TRANSKRIPSI adalah proses pembentukan
RNA dengan DNA sebagai modelnya
5’--AGCTTCTAGCATAGATACAGCTA--3’
3’--TCGAAGATCGTATCTATGTCGAT--5’

5’--AGCUUCUAGCAUAGAUACAGCUA--3’
• TRANSKRIPSI memerlukan perangkat :
-satu utasan DNA sebagai model
-enzim transkiptase
 Model Cetakan : Ruas Penyandi
diapit oleh Promotor dan Terminator
DNA
3’ P T 5’
5’ 3’
T P

5’ 3’ 3’ 5’
RNA RNA
Holoenzim Transkriptase

Faktor σ

Enzim Inti
 Subunit transkriptase E.coli
Subunit Ukuran # Fungsi
Subunit holoenzim transkriptase
β 155,000 1 Penempelan pada DNA
β’ 151,000 1 Situs polimerisasi RNA
α 36,000 2 ?
ω 11,000 1 ?
σ 70,000 1 Mengenali promotor
Subunit pendukung
nusA 69,000 1 Mengenali terminator
ρ 46,000 1 Mengakhiri proses transkripsi
P Gen
T
Proses
Transkripsi
Inti
• Inisiasi
σ
• Sintesis
nusA RNA
• Proses
akhir

RNA
Inisiasi Transkripsi pada Promotor E.coli
3’---TTGACA----TATAAT----CAT---------5’

-35 -10 Awal

• Pengenalan
promotor (kotak -35)
oleh faktor sigma
• Pengudaran heliks
ganda DNA pada
kotak -10
• Sintesis RNA mulai
dari titik awal
 Transkriptase Eukariot
• Polimerase RNA I : (dalam inti) terlibat sintesis
RNA ribosom
• Polimerase RNA II : (dalam inti) terlibat sintesis
pra-mRNA/hnRNA
• Polimerase RNA III : (dalam inti) terlibat
sintesis tRNA
• Transkriptase organel (pada mitokondria atau
kloroplas)
Promotor Beberapa Gen E.coli
 Beberapa promotor Eukariot
Polimerase RNA II

Pra-mRNA
Polimerase RNA II
Regulator

RNA5S
Wilayah promotor
ikut terekspresi
Proses Sintesis Perpanjangan RNA
• Setelah inisiasi selesai faktor sigma akan
melepaskan diri dari enzim inti transkriptase
• Enzim inti akan bekerja lebih cepat tanpa faktor
sigma (karena sigma bekerja sangat teliti)
• Faktor nusA akan bergabung dengan enzim inti
untuk membantu mengenali terminator
• Enzim inti akan berhenti bila sampai pada
terminator
 Kegiatan
•Mengudar pilinan
Transkriptase heliks ganda
DNA

•Membaca
runtunan basa
DNA dan
mensintesis RNA
•Memulihkan
RNA kembali pilinan
heliks ganda
DNA
 Proses Akhir Transkripsi (kasus E.coli)
• Gabungan Enzim-inti dan nusA akan mengenali
terminator
• Berkat adanya struktur ulang balik pada
terminator maka pada RNA akan terbentuk
struktur jepit rambut
• Adanya struktur jepit rambut memberi tanda
pada traskriptase untuk berhenti bekerja
 Terminator E.coli (gen trp L)
Struktur Ulang Balik

RNA
Poli A pada terminator
tanpa faktor rho

Terminator rho
Struktur tidak mengandung
Jepit Rambut PoliA
 Terminator
tanpa/dengan rho
•Pada terminator tanpa
rho RNA akan lepas
begitu transkripsi
berakhir (berkat
adanya ruas poliU)
•Pada terminator rho
akan lepas setelah ada
faktor rho
Terminator Eukariot
•Tanda akhir transkripsi
Polimerase RNA II eukariot (polimerase
RNAII) muncul berupa
signal pemotongan
RNA yang
ditranskripsi

•Setelah RNA dipotong

terjadi penambahan
ujung poliA pada
ujung 3’ pra-mRNA
 RNA Hasil Transkripsi
• mRNA : berfungsi sebagai model
pembentukan protein dalam translasi,
berstruktur linear
• tRNA : berfungsi sebagai pembawa asam
amino dan penterjemah kodon mRNA,
membentuk lipatan tiga dimensi
• rRNA : berfungsi sebagai kerangka
ribosom dan mengenali tRNA dan rRNA
dalam proses translasi
 RNA Hasil Transkripsi
_____________________________________
Jenis # dalam % gen % gen
RNA sel bakteri eukariot
-------------------------------------------------------------

mRNA 2 % 90 % 60 %
tRNA 10 % 10 % 40%
rRNA 88 %
_____________________________________
Struktur sekunder Ujung 3’ACC,
tRNA penempelan
asam amino

Simpul D
Simpul
TψC
Basa
termodifikasi Simpul
Variasi
Simpul
Kodon
 Basa Asli Basa termodifikasi

A i6A m’A

Basa-basa G
tRNA yang m’G Gm
termodifikasi
I Im

U ψ
D T

C m5C
s 2C
 Struktur tersier tRNA

Simpul D

Simpul Ujung
Variasi penerima
asam
Simpul amino
Antikodon
 rRNA (RNA ribosom)
Ribosom Ribosom
bakteri eukariot
70S 80S
60S
30S
40S
50S

rRNA5S rRNA16S rRNA5S rRNA18S

rRNA28S
rRNA23S
rRNA5.8S
rRNA16S Struktur rRNA
rRNA5S

rRNA menunjukan
tipe pelipatan yang
sama untuk
berbagai spesies
walaupun runtunan
basanya berbeda

rRNA23S
 PROSES PASCATRANSKRIPSI
• Proses pascatranskripsi adalah proses yang
berlangsung terhadap RNA setelah transkripsi
selesai
• Bentuk mRNA, tRNA dan rRNA yang ada
dalam proses translasi bukan merupakan
bentuk yang ada saat translasi, tetapi
merupakan hasil pengolahan pascatranskripsi
 Proses Pascatranskripsi mRNA

hnRNA

mRNA bakteri tidak

mengalami proses mRNA
pascatranskripsi; terlihat
bahwa ribosom mulai
menempel pada mRNA
ketika transkripsi belum mRNA eukariot mengalami
selesai proses pascatranskripsi
Pascatranskripsi mRNA Eukariot
Transkripsi
menghasilkan hnRNA

Pemasangan tudung
pada ujung 5’

Pemasangan ekor
poliA pada ujung 3’
AAAAAA
Pemotongan intron
 Pemotongan intron
hnRNA tersusun
dari intron dan
ekson

Dengan
pemotongan
Intron Ekson intron akan
terbentuk
mRNA
 Pra-tRNA
tRNA dibentuk oleh suatu operon (kelompok
gen yang diapit oleh satu pasangan promotor-
terminator, sehingga terbentuk dalam suatu
RNA besar yang mengandung banyak tRNA
 Pascatranskripsi
tRNA
Pemotongan Pra-tRNA
menjadi tRNA individual
Penambahan ACC di
ujung 3 tRNA tertentu
Pemotongan intron
tRNA tertentu
Modifikasi basa tertentu
 Proses Pascatranskripsi rRNA
• Pada E. coli rRNA dibentuk oleh tujuh operon
{rrnA, rrnB, rrnC,..rrnH}
• pra-rRNA E.coli mengandung rRNA5S,
rRNA23S, rRNA16S, dan sejumlah tRNA
sebagai penyelang
• melalui proses pascatranskripsi akan
dipisahkan komponen rRNA satu dari yang lain,
serta dari tRNA
Pascatranskripsi rRNA
TRANSKRIPSI VIRUS
Sintesis mRNA
 Transkripsi Balik

• Transkripsi balik adalah pembentukan

DNA dengan RNA sebagai modelnya
• Disintesis oleh ezim Transkriptase Balik
• Di alam digunakan dalam perbanyakan
retrovirus
• Dalam rekayasa genetik digunakan untuk
mengklonkan gen tanaman melalui
pembentukan cDNA
Transkripsi Balik {perbanyakan retrovirus}
Replikasi dan Ekspresi retroviridea
Terim
a
Kasih