Di Jawa, pada tahun 418 Biksu Fa hien (biksu dari China 337 - 422) melihat hanya
sedikit penganut agama Buddha. Gunawarman, seorang missionaris Buddha dari Kashmir, pergi
ke Sri Lanka, kemudian ke Jawa pada tahun 423. Biksu Hwi – ning pada tahun 664 tinggal
selama 3 tahun di Kaling (Holing), menerjemahkan kitab – kitab Hinayana dengan bantuan biku
lokal, Jnanabhadra. Zaman Mataram Kuno (abad ke – 8 - 10), raja – ada yang beragama Buddha
dan ada yang beragama Hindu. Dinasti Syailendra meninggalkan banyak Candi di sekitar
Magelang, dan Yogyakarta sekarang, seperti Candi Mendut, Candi Pawon, Candi Sewu, Candi
Plaosan dan lain – lain. Candi yang paling besar adalah Candi Borobudur, yang dibangun oleh
Samaratungga mulai tahun 824, yang mencerminkan bagaimana Therawada, Mahayana, dan
Wajrayana menyatu secara harmonis. Wangsa Syailendra disebut sebagai penganut Buddhayana,
sebagaimana tertulis dalam Negarakretabhumi karya Pangeran Wangsakerta. Selain sudah maju
di spiritual, kehidupan beragama Buddha saat it jug maju secara ekonomi, politik, sosial dan
budaya.
Di zaman Majapahit (1293 – 1429) yang memiliki semangat Bhineka Tunggal Ika, Siwa
Buddha tidak berbaur dalam keseluruhan sistemnya, sehingga lebih tepat dinamakan paralelisme.
Menurut kitab Negarakertagama keduanya tetap terpisah, berbeda ajaran, berbeda pendeta dan
tempat peribadatan. Secara formal agama Buddha di Nusantara lenyap bersamaan dengan
jatuhnya kerajaan Majapahit yang besar dan bersatu (1429) karena perang saudara dan
munculnya kerajaan Islam. Tidak didapati sumber yang dapat mengungkapkan kehidupan rakyat
yang beragama Buddha di bawah kekuasaan Islam. Catatan sejarah dalam konteks kerajaan di
Nusantara ini hanya sebatas tentang penguasa. Dan juga, masalah pengaruh agama Buddha yang
masih bertahan, paling tidak mengenai sikap hidup, perilaku, kepercayaan dan kebatinan yang
dikenal sebagai kejawen.