Fisiologi stomata saat dihadapkan dengan beberapa kondisi

1. Gelap : jika tumbuhan ditempatkan dalam gelap, maka ion kalium akan kembali
keluar sel penjaga 
2. Kering : Jika tumbuhan mengalami kekurangan air, maka potensial air pada daun
akan turun, termasuk sel penutupmya sehingga stomata akan tertutup.
apabila tumbuhan mengalami kekurangan air, maka potensial air pada
daun akan turun, termasuk sel penutupmya sehingga stomata akan tertutup.
3. Dingin : turunnya suhu akan membuat laju respirasi menurun sehingga kadar CO2
dalam daun juga turun, pH akan naik dan stomataterbuka.
4. Patogen :
5. ABA : menyebabkan membran menjadi bocor sehingga terjadi kehilangan ion
K+ dari sel penjaga dan menyebabkan sel penjaga mengkerut sehingga stomata menutup. 
6. Cahaya : dengan adanya cahaya maka fotosintesis akan berjalan, sehingga CO2
dalam daun akan berkurang dan stomata terbuka.
7. CO2 : Konsentrasi CO2 yang rendah di dalam daun juga menyebabkan stoma
membuka. Karbon dioksida, tekanan parsial CO2 yang rendah dalam daun akan
menyebabkan pH sel menjadi tinggi. Pada pH yang tnggi 6-7 akan merangsang
penguraian pati menjadi gula, sehingga stomata terbuka.
8. Auksin :