Deteksi dan diagnosis COVID-19 : Review

https://doi.org/10.1016/j.bios.2020.112455

Metode deteksi COVID-19 lainnya melibatkan deteksi langsung partikel virus SARS-CoV-2
menggunakan immunoassay. Misalnya, menggunakan antibodi anti-spike yang dapat
mengikat partikel virus SARS-CoV-2 untuk membuat biosensor efek medan (FET) berbasis
graphene. Biosensor FET ini dapat merespon 16 pfu / mL partikel virus di PBS dalam 10
menit. Namun, ditemukan bahwa larutan yang biasa digunakan untuk menyimpan sampel
virus pernapasan, media transpor universal (UTM), dapat menghasilkan sinyal derau yang
tinggi sehingga LOD dalam UTM menurun menjadi 242 eksemplar / mL. Materi baru atau
metode rekayasa harus dikembangkan untuk mengurangi sinyal kebisingan di biosensor FET,
dan dengan demikian meningkatkan rasio sinyal-ke-kebisingan untuk memungkinkan
skrining sensitivitas tinggi pada pasien COVID-19 beban virus rendah. Selain itu,
menggabungkan sensor FET dengan pra-konsentrasi partikel magnetik sebelum deteksi dapat
meminimalkan efek interferensi pada matriks sampel dengan menarik imunokompleks ke
permukaan sensor melalui medan magnet eksternal, sehingga meningkatkan sensitivitas
deteksi dan menghasilkan rasio noise-sinyal yang tinggi.

Dalam pengaturan klinis nyata, jumlah virus yang rendah telah sering diamati pada beberapa
pasien COVID-19. Metode deteksi partikel virus SARS-CoV-2 ultrasensitif yang dapat
mengidentifikasi pasien COVID-19 secara akurat masih kurang. Selain itu, ekspresi NP lebih
rendah pada sel yang terinfeksi SARS-CoV-2 dibandingkan pada sel yang terinfeksi SARS-
CoV dan MERS-CoV, menunjukkan bahwa konsentrasi NP dalam cairan tubuh pasien
SARS-CoV-2 rendah. Oleh karena itu, teknologi deteksi yang sangat sensitif sangat
dibutuhkan untuk mencapai antigen di tempat perawatan atau deteksi partikel virus. Terakhir,
isi NP SARS-CoV-2 pada jenis sampel yang berbeda dari pasien COVID-19, diambil pada
waktu yang berbeda selama sakit, harus diklarifikasi untuk memverifikasi diagnosis dini dan
potensi prognostik deteksi SARS-CoV-2 NP.

Jenis biosensor lain yang sangat menjanjikan untuk deteksi SARS-CoV-2 di tempat
perawatan yang sangat sensitif adalah biosensor elektrokimia. Biosensor elektrokimia telah
banyak digunakan untuk mendeteksi asam nukleat, protein, antibodi molekul kecil, dan
virus. Mereka adalah sistem penginderaan cerdas yang sederhana dan hemat biaya untuk
deteksi cepat dan sensitifitas tinggi. Dalam sensor elektrokimia (EIS), target dikenali
menggunakan reaksi antigen-antibodi, DNA, RNA, atau peptida nukleat asam (PNA)
hibridisasi atau pengikatan berbasis aptamers, yang masing-masing memiliki selektivitas dan
sensitivitas tinggi untuk target deteksi. Kemudian, interaksi ditentukan menggunakan ukuran
perubahan potensial, arus, konsentrasi ion, konduktansi, kapasitansi atau impedansi. EIS
tanpa label telah mendapat perhatian luas karena sangat sensitif dan dapat mencapai
penginderaan elektrokimia dan karakterisasi yang cepat dari berbagai analit biologis,
termasuk antigen virus, antibodi, dan RNA.
 https://doi.org/10.1016/j.bios.2020.112673

Selain deteksi cepat komponen genetik virus menggunakan biosensor, akan menarik untuk
menerapkan penginderaan langsung dan mudah dari seluruh partikel virus atau epitop antigen
permukaan yang sesuai. Strategi ini dapat digunakan untuk pengembangan alat diagnostik
atau skrining untuk COVID-19. Ada beberapa studi penelitian relevan yang dilaporkan sejauh
ini. Misalnya, immunosensor graphene field-effect transistor (Gr-FET) ultrasensitif baru-baru
ini dilaporkan sebagai upaya menuju skrining sederhana dan cepat untuk COVID-19.
Permukaan graphene difungsikan dengan SARS-CoV-2 spike S1 subunit protein antibody
(CSAb) atau reseptor ACE2. Hibridisasi protein S1 bermuatan sedikit positif (yang berisi
domain pengikat reseptor, RBD) dengan reseptor CSAb / ACE2 yang tidak dapat bergerak
mengubah konduktansi / resistansinya melalui efek medan, yang dapat dibaca secara elektrik
dengan cara yang sensitif. Imunosensor Gr-FET ini dapat dengan cepat mengidentifikasi
(dalam waktu sekitar 2 menit) dan secara akurat menangkap lonjakan protein S1 COVID-19
pada LOD hingga 0,2 pM, secara waktu nyata dan tanpa label. Meskipun seluruh partikel
virus corona, bukan protein antigen murni, perlu diuji untuk validasi pengujian, dan uji klinis
kemudian diperlukan, pekerjaan ini merupakan studi bukti konsep awal dan
mendemonstrasikan potensi teknologi Gr-FET untuk deteksi cepat dan sensitif virus
corona. Menariknya, perangkat biosensing graphene berbasis field-effect transistor (FET) lain
yang dilapisi dengan antibodi spesifik terhadap protein lonjakan SARS-CoV-2 telah
dilaporkan untuk deteksi langsung SARS-CoV-2. Partikel virus yang dimasukkan ke
permukaan graphene yang dilapisi antibodi menghasilkan perubahan listrik yang dapat
dibaca. Sensor COVID-19 FET ini tidak hanya mendeteksi media transpor protein antigen
SARS-CoV-2 untuk sampel swab, tetapi juga mendeteksi virus dan virus yang dikultur dalam
sampel klinis. LOD untuk deteksi sampel klinis (n = 19 pasien dan subjek normal) mencapai
2,42 × 10 2salinan / mL. Ukuran sampel klinis yang lebih besar akan diperlukan untuk lebih
memvalidasi potensi klinisnya untuk deteksi virus. Namun demikian, mengingat
kompleksitas sampel klinis, pengembangan bahan baru untuk sensor FET yang dapat
mengatasi masalah interaksi non-spesifik dan efek skrining yang terkait dengan sampel klinis
diperlukan untuk memberikan deteksi yang lebih akurat. Salah satu masalah utama di sini
adalah sensitivitas pengujian tinggi dengan alarm palsu minimum, yang perlu dicapai untuk
memfasilitasi aplikasi praktis. Para peneliti telah mengembangkan sensor graphene dan
teknologi FET untuk mendeteksi sel, eksosom, dan biomolekul dalam biofluida selama
beberapa tahun terakhir. Salah satu pekerjaan terbaru pada biosensor Gr-FET untuk deteksi
eksosom dapat mencapai LOD hingga level partikel tunggal dalam waktu 10 menit,
ditingkatkan dengan dekorasi nano permukaan dari titik karbon tertentu. Pendekatan titik
karbon telah meningkatkan batas deteksi untuk eksosom, dan diharapkan peningkatan serupa
untuk deteksi COVID-19: eksosom menunjukkan banyak sifat yang mirip dengan SARS-
CoV-2, termasuk ukuran partikel yang setara (50-200 nm), antigen permukaan yang
melimpah dengan molekul, struktur bola inti-cangkang, dll. Oleh karena itu, secara teoritis
masuk akal untuk menggunakan kembali teknologi ultrasensitif ini untuk deteksi COVID-
19. Pekerjaan saat ini berfokus pada fabrikasi sensor Gr-FET yang dapat diskalakan wafer
menuju penyaringan SARS-CoV-2 yang sensitif, cepat, di lapangan, dan hemat biaya.