PROTEIN

ASAM AMINO, PEPTIDA DAN PROTEIN

PROTEIN

* MAKROMOLEKUL YANG PALING BANYAK DITEMUKAN

DALAM SEL (50% BERAT KERING BADAN ORANG DEWASA
ADALAH PROTEIN)
* SUSUNAN SEJUMLAH ASAM AMINO DALAM URUTAN YANG
KHAS MELALUI IKATAN PEPTIDA DENGAN FUNGSI YANG
KHAS PULA SEHINGGA PROTEIN JUGA DISEBUT SEBAGAI
POLIPEPTIDA.

• SANGAT BERVARIASI DIMANA RATUSAN JENIS PROTEIN

YANG BERBEDA DAPAT DITEMUKAN DALAM SATU SEL
DENGAN FUNGSI YANG BERBEDA PULA.

Jumlah residu as amino jumlah rantai

Insulin 51 2
Haemoglobin 574 4
Lisosim 129 1
Ribonuklease 124 1
▪ Protein terdiri dari unsur C(45-50%), H(6-
8%), O(19-25%), N(14-20%).
• Mempunyai berbagai peranan biologis.
• Ciri-ciri protein :
BM tinggi, terdiri bisa sampai 20 jenis
asam amino yang dihubungkan melalui
ikatan kovalen, struktur tidak stabil,
spesifik, reaktif, terdapat ik
ion,hidrogen,vanderwalls.
▪ Jenis protein : sederhana dan terkonjugasi
(glikoprotein, lipoprotein, metaloprotein dll)
▪ Protein dioksidasi dan disintesa setiap hari
secara terus menerus pada orang dewasa
(diperbaharui)
▪ Turn over protein 400 gr/hr → 75-80%
dipakai kembali untuk sintesa protein.
• PROTEIN HARUS DIKOMSUMSI SETIAP HARI UNTUK MENUTUPI
KEHILANGAN SEWAKTU TURN OVER.
• NEGATIF NITROGEN BALANCE → PERTUMBUHAN ABNORMAL
• OVER → DISIMPAN DALAM BENTUK LEMAK (PEMBOROSAN)

NILAI GIZI PROTEIN:

-JUMLAH KOMSUMSI
-DAYA SERAP TUBUH
-KOMPOSISI ASAM AMINO
(ESENSIAL DAN NON ESENSIAL)

KEBUTUHAN PROTEIN DIPENGARUHI OLEH

BBRP SITUASI SEPERTI:
- MASA PERTUMBUHAN
- AKTIFITAS
- HAMIL DAN MENYUSUI,
- SAKIT,DLL
 KLASIFIKASI PROTEIN BERDASARKAN FUNGSI
BIOLOGI

1. SEBAGAI ENZIM/PROTEIN KATALITIK

* PROTEIN KHUSUS YG MEMPUNYAI AKTIVITAS

KATALISIS (BIOKATALISATOR)
* LEBIH DARI 2000 JENIS ENZIM SUDAH DIKETAHUI
DG FUNGSI YG KHAS.
EX : UREASE → UREA → AMONIAK + CO2

2. PROTEIN CADANGAN
→PADA TANAMAN / TUMBUHAN
EX : PROTEIN : JAGUNG, GANDUM, BERAS,
KACANG2AN,
→ Pada hewani → OVALBUMIN, KASEIN
3. PROTEIN TRANSPORT

→ MEMBAWA MOLEKUL / ION SPESIFIK MELALUI DARAH

DARI SATU ORGAN KE ORGAN LAIN.
EX : LIPOPROTEIN
HEMOGLOBIN

4. PROTEIN KONTRAKTIL

→ PROTEIN YANG MEMBERIKAN KEMAMPUAN KEPADA SEL

DAN ORGANISME UNTUK BERKONTRAKSI, MENGUBAH
BENTUK / BERGERAK
EX : AKTIN DAN MIOSIN → KONTRAKSI OTOT/
KERANGKA
TUBULIN → PROTEIN PEMBENTUK MIKROTUBUL

5. PROTEIN PERTAHANAN

→ PROTEIN YANG BERFUNGSI UNTUK MEMPERTAHANKAN

ORGANISME DARI SERANGAN SPECIES LAIN ATAU LUKA
EX : FIBRINOGEN DAN TROMBIN, ANTIBODY, BISA ULAR
6. PROTEIN STRUKTURAL

→ MEMBANGUN STRUKTUR BIOLOGI, KEKUATAN , DAN

PROTEKSI
EX :PROTEIN SERABUT KOLAGEN→ TULANG
RAWAN/URAT,
KULIT
ELASTIN→ PADA PERSENDIAN → DAPAT MEREGANG
KEDUA DIMENSI
KERATIN → PROTEIN STRUKTURAL PADA RAMBUT,
KUKU, BULU BURUNG
FIBROIN → SUTRA, JARING LABA-LABA

7. PROTEIN PENGATUR
MENGATUR AKTIVITAS SELULER ATAU FISIOLOGI

EX :HORMON INSULIN→ METABOLISME GULA

HORMON PARATIROID → MENGATUR TRANSPORTASI
Ca++, P.
 ASAM AMINO
➢ STRUKTUR UMUM

COOH (karboksil)

l
(Amina) H2N – C – H (hidrogen)

l
R
R DIBEDAKAN :

- STRUKTUR (Gugus samping)

- KELARUTAN
- MUATAN LISTRIK
- UKURAN
➢ MEMPUNYAI ATOM C ASIMETRIK KECUALI – GLISIN –

COOH COOH

NH2–C – H H – C – NH2

CH3 CH3
L – ALA D – ALA

ISOMER OPTIK ( STEREO ISOMER )

- UMUMNYA ASAM AMINO YG ADA DI ALAM BENTUK L
- RASEMASI

➢ ASAM AMINO LARUT DALAM AIR TETAPI TIDAK LARUT

DALAM PELARUT NON POLAR
➢ DALAM LARUTAN DAPAT TERIONISASI
- SEBAGAI ASAM ( DONOR PROTON )
SENYAWA AMFOTER
- SEBAGAI BASA ( AKSEPTOR PROTON)

H H

R – C – COO - R – C – COO - + H+

NH3+ NH2

H H

R – C – COO - + H + R – C – COOH

NH3+ NH3+

SIFAT INI DAPAT BERFUNGSI UNTUK :

- MENENTUKAN ASAM AMINO PENYUSUN PROTEIN
- MEMISAHKAN ASAM AMINO PENYUSUN PROTEIN
 PENGGOLONGAN ASAM AMINO BERDASARKAN
POLARITAS GUGUS R PADA PH 7

1. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R NON POLAR

Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Phe, Trp.

2. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R POLAR TIDAK BERMUATAN

Gly, Ser,Thr, Cys, Tyr, Asn, Gln.

3. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R BERMUATAN NEGATIF (-)

Asp dan Glu

4. ASAM AMINO DENGAN R BERMUATAN (+)

Lys, Arg, His
 1. ASAM AMINO DG R NON POLAR
( Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Phe, Trp )
2. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R POLAR TIDAK BERMUATAN
(Gly, Ser,Thr, Cys, Tyr, Asn, Gln)
3. ASAM AMINO DENGAN GUGUS R BERMUATAN NEGATIF (-)
(Asp dan Glu )
4. Asam amino dengan R bermuatan (+)
(Lys, Arg, His)
SIFAT ASAM BASA (MENGION) ASAM AMINO

Pk 2

pI

pK 1
BEBERAPA INFORMASI:
1. AS. AMINO ALANIN MEMPUNYAI 2 KUTUB YG DAPAT MENGION:
1. GUGUS KARBOKSIL PADA pH 2,34.
2. GUGUS AMINA PADA PH 9,69.

2. ASAM AMINO MEMPUNYAI 2 DAERAH BERDAYA BUFFER YANG

BAIK YAITU PADA DAERAH YANG RELATIF DATAR PADA GRAFIK
(Ph 2 – 3 dan Ph 9 – 10) DAN MEMPUNYAI DAYA BUFFER
TERBURUK PADA Ph 6,02 (PI)

3. PADA pH 6,02 MUATAN AS. AMINO = 0 (ZWITTER ION/

MENGION SEMPURNA). PADA SAAT INI A. AMINO AKAN
MENGENDAP. pH INI DISEBUT pH ISOELEKTRIK (PI).

PI = (PK1 + PK2)/2

pH DIBAWAH PI --→ MUATAN A.AMINO + (POSITIF)

pH DIATAS PI --→ MUATAN A.AMINO - (NEGATIF)
pH = PI -------→ MUATAN A. AMINO (0) (NETRAL)

4. AS. AMINO YG BERBEDA DAPAT DIPISAHKAN DARI YG LAIN

ATAS KECEPATAN MIGRASI MASING2 AS. AMINO JIKA MOLEKUL
INI DITEMPATKAN PD SUATU MEDAN LISTRIK PD PH TERTENTU.
HARGA PK BAGI GUGUS MENGION ASAM AMINO
A.AMINO pK1 pK2 pK 3
(COOH) ( NH3+) (R)

GLISIN 2,34 9,6

ALANIN 2,34 9,69
LEUSIN 2,36 9,6
SERIN 2,21 9,15 13,6 (OH)
THREONIN 2,33 10,43
GLUTAMIN 2,17 9,13
ASPARTAT 2,09 9,82 3,86 (COOH)
GLUTAMAT 2,19 9,67 4,25 (COOH)
HISTIDIN 1,82 9,17 6,0 (NH+)
SISTEIN 1,71 10,78 8,33 (SH)
TIROSIN 2,2 9,11 10.07 (OH)
LISIN 2,18 8,95 10,53 (NH3+)
ARGININ 2,17 9,04 12,48 (NH3+)

1. ELEKTROFORESIS KERTAS
METODA PEMISAHAN
2. KHROMATOGRAFI PENUKAR ION
ASAM AMINO 3. AMINO ACID ANALYZER
 BEBERAPA REAKSI SPESIFIK ASAM AMINO
1. REAKSI PEMBENTUKAN IKATAN PEPTIDA

R1 O H H H20

H 2N – C - C + N – C – COOH -------→

H OH H R2
H2O

R1 O H

H 2N - C - C - N - C - COOH

H H R2

→ dipeptida, tripeptida, tetrapeptida, pentapeptida, oligopeptida, polipeptida.

Pembentukan ikatan peptida
 Peptida
◼ Asam amino dapat membentuk rantai karena gugus
amino (–NH2) AA dapat bereaksi dengan gugus
karboksilat (–COOH) AA lainnya. Molekul rantai yang
terbentuk dinamakan peptida, jika rantainya relatif
pendek (<10 AA) disebut oligopeptida, jika rantainya
panjang disebut polipeptida atau protein (50 - 2000
residu AA). Ikatan yang terbentuk antar AA dinamakan
ikatan peptida.
◼ Karena reaksi pembentukan peptida membebaskan 1
molekul air, AA penyusun polipeptida disebut residu.
◼ Penyebutan urutan AA dimulai dari AA yang memiliki
gugus –NH2 (residu terminal amino/ujung N) hingga
yang memiliki gugus –COOH bebas (residu termanal
karboksil/ujung C).
Contoh: pentapeptida
2. REAKSI WARNA DENGAN NINHIDRIN
AS.AMINO DG NINHIDRIN BERLEBIHAN MEMBENTUK SENYAWA
BERWARNA UNGU/BIRU

O O
H
l C OH C OH
R – C – COOH + C -→ C
l C OH C
NH2 ll ll H
O O

ASM AMINO NINHIDRIN NINHIDRIN

TEREDUKSI

+ NH3+ + CO2 + R – COOH + NINHIDRIN --→ PIGMEN

WARNA UNGU/
BIRU
Ciri khas reaksi ini mengeluarkan gas CO2
 O O
ll ll
C C

C = N–C + 3H2O + H+

C C
ll l
O O -

Senyawa berwarna ungu/ biru

- MENENTUKAN / MENDETEKSI ASAM AMINO SECARA KUANTITATIF

- Dapat mendeteksi asam amino secara kolorimetrical
- Prolin dan Hidroksiprolin → kuning
- Asparagin → coklat
Contoh: tripeptida
H H

HOOC - CH – CH2 - CH2 - C - N - CH - C - N - CH2 - COOH

NH2 O CH2 O

SH

GLUTATION ( GLUTAMILSISTEINILGLISIN)

CONTOH LAINNYA:

INSULIN → 2 RANTAI POLIPEPTIDA (51 RESIDU ASAM AMINO)

HAEMOGLOBIN → 4 RANTAI POLIPEPTIDA (574 AS. AMINO)
GRAMISIDIN → 10 RESIDU ASAM AMINO → ANTIBIOTIK

ENKIFALIN → 10 RESIDU ASAM AMINO → OBAT BIUS (ANALGESIK)

Tyr – Gly – Gly - Phe – Met– Tyr – Gly – Gly– Phe – Leu

BRADIKININ → 9 ASAM AMINO → PENGHAMBAT PEMBENGKAKAN JARINGAN

Arg– Pro – Pro- Gly – Phe – Ser – Pro – Phe - Arg

3. REAKSI PEMBENTUKAN SISTIN DARI 2 AS.AMINO
SISTEIN → IKATAN DISULFIDA

COOH COOH
l l
NH2 – C – CH2 – SH + SH – CH2 – C – NH2 ---→
l l
H H

COOH COOH
l l
NH2 – C – CH2 – S - S – CH2 – C – NH2
l l
H H
IKATAN
DISULFIDA
 TEKNIK PEMISAHAN ASAM AMINO

1. ELEKTROFORESIS KERTAS

KERTAS FILTER YG DIBASAHI Spot mengandung campuran

BUFFER PADA pH tertentu asam amino

+ ANION o KATION -
------- -------→
T1

........

T2
.. . .. . . SEMPROT DG
NINHIDRIN
COCOKKAN DG MARKER
 2.
CHROMATO
GRAPHY
PENUKAR
ION
 Kromatografi penukar ion
❑ Merupakan metode untuk
memisahkan,mengidentifikasi,menghitung jml asam
amino dlm larutan
❑ Kolom kromatografi mgd granula resin sintetik mgd
gugus bermuatan tetap.Resin dgn gugus anion (resin
penukar kation) dan resin dgn gugus kation (resin
penukar anion).
❑ Resin mgd asam sulfonat (-SO3-) diberi muatan Na+
❑ Lar asam (pH=3) camp as amino dituang ke kolom,
dibiarkan tersaring perlahan. As am berbentuk kation dg
muatan total positif, saat mengalir menukar ion Na+
berikatan dgn -SO3- pada resin. AA mu paling positif
menukar Na+ paling pertama,terikat paling kuat pada
resin,bergerak ke bawah kolom dg kecepatan plg
rendah.