A. Saeed, H. Abd and G.

Sandstrom

Mikroba etiologi dari akut diare di anak di

bawah usia lima tahun di Khartoum, Sudan
Amir Saeed, Hadi Abd dan Gunnar Sandstrom
Institut Karolinska, Departemen Kedokteran Laboratorium, Divisi Mikrobiologi Klinis F 68
dan Rumah Sakit Universitas Karolinska, Huddinge, SE-141 86 Stockholm, Swedia

Diare merupakan salah satu penyebab utama morbiditas dan mortalitas di seluruh
dunia. Estimasi baru-baru ini
menyarankan para jumlah dari kematian adalah dekat dengan 2,5 juta. Ini studi meneliti satu
penyebab agen diare di anak di bawah 5 tahun dari usia di pinggiran
kota daerah dari Khartoum, Sudan. Sebuah Total dari 437 sampel tinja yang diperoleh dari
anak-anak dengan diare diperiksa oleh budaya dan PCR untuk
bakteri, dengan mikroskop dan PCR untuk parasit dan oleh immunoassay untuk mendeteksi
dari rotavirus A. Of the 437 sampel dianalisis, 211 (48 %) diuji positif untuk diarrhoeagenic E
scherichia coli , 96 (22%) untuk rotavirus A, 36 (8%) untuk Shigella spp., 17 (4%)
untuk Salmonella spp., 8 (2%)
untuk Campylobacter spp., 47 (11 %) untuk Giardia intestinalis dan 22 (5 %) untuk Entamoe
ba histolytica . Semua
isolat dari E. coli (211, 100 %) dan Salmonella (17, 100 %), dan 30 (83 %) isolat dari Shigell
a yang sensitif untuk kloramfenikol; 17 (100 %) isolat dari Salmonella , 200 (94 %) isolat dari
E.
coli dan (78 %) 28 isolat dari Shigella spp. yang sensitif untuk gentamisin. Dalam Sebaliknya
, resistensi terhadap
ampisilin yang ditunjukkan di 100 (47 %) isolat dari E. coli dan 16 (44 %) isolat dari Shigella
spp. Dalam kesimpulan, E. coli terbukti untuk menjadi yang utama penyebab dari diare di m
 Diarrhoea among children in Sudan

uda anak-anak di ini studi, diikuti oleh rotavirus A dan protozoa. Penentuan diare etiologi
dan kerentanan
antibiotik pola dari diare patogen dan meningkatkan kebersihan adalah penting untuk klinis
managemen t dan dikendalikan perencanaan strategis untuk mengurangi beban infeksi.

PENGANTAR
Diare penyakit tetap salah satu dari yang terkemuka penyebab dari kematian pra ventable di negara-negara berkembang, terutama di
kalangan anak-anak di bawah usia 5 tahun. Pada tahun 2008 saja, sekitar sembilan juta anak di bawah 5 tahun meninggal dan sekitar
40% dari kematian tersebut disebabkan oleh pneumonia dan diare (You et al. , 2010). Secara global, diare adalah yang terbesar
kedua penyebab kematian di anak di bawah 5 tahun dari usia, menyebabkan satu di setiap lima kematian. Sayangnya, diare membunuh
lebih banyak anak daripada gabungan AIDS, malaria, dan campak (WHO, 2008).
Diare adalah umum di dalam mengembangkan negara, terutama di daerah-
daerah dengan miskin kebersihan dan sanitasi dan dengan keterbatasan akses ke safe air. Lainnya kondisi, seperti yang kekurangan
gizi, dapat lebih meningkatkan pada risiko dari tertular diare di negara-negara berkembang. Ini faktor dapat
menyebabkan untuk sebuah signi beban penyakit ficant dan negatif ekonomi efek, yang dihasilkan dari biaya
medis, kehilangan dari pekerjaan, lebih rendah kualitas dari kehidupan dan tinggi angka kematian.
Organisme menular , termasuk bakteri, virus, protozoa dan cacing, menyebabkan diare. Ini organisme yang trans- mitted dari tinja dari
satu orang ke mulut dari yang lain, sebuah rute disebut fekal-oral transmisi. Namun,

Singkatan: DAEC, difus mengikuti E. coli ; DEC, diaregenik

E. coli ; EAggEC , E. coli enteroaggregatif ; EHEC, enterohemoragik
E.coli ; EIEC, E. coli enteroinvasif ; EPEC, E. coli enteropatogenik ; ETEC, E. coli enterotoksigenik .

mereka berbeda dalam rute masuk yang tepat dari tinja ke mulut dan dalam dosis infeksi yang diperlukan untuk menyebabkan
penyakit. Escherichia coli adalah dianggap untuk menjadi yang etiologi agen dari banyak penyakit, termasuk beberapa yang
mempengaruhi saluran kemih dan usus. Klasifikasi strain E. coli (DEC) diare berdasarkan sifat virulensinya dan terdiri dari enam
kelompok: E. coli enterotoksigenik (ETEC), E. coli enteropatogenik (EPEC), E. coli enteroinvasif (EIEC), E.
coli enterohaemorrhagic (EHEC), enteroaggregative E. coli (EAggEC) dan E. coli yang patuh difus (DAEC) (Nataro &
Kaper, 1998).
Di Sudan, diare adalah salah satu alasan paling umum bagi anak-anak untuk mengunjungi klinik kesehatan, tetapi pengetahuan
tentang agen penyebab kasus diare ini terbatas.
Patogen rotavirus enterik dan Desember adalah yang paling umum penyebab dari diare global (Parashar et al. , 1998) dengan
Desember dikutip sebagai penyebab penting yang paling di negara
berkembang (Gomes et al. , 1991). Rotavirus adalah yang terkemuka penyebab akut infantil gastroenteritis global dan bertanggung
jawab untuk 20 % dari kematian di anak di bawah 5 tahun dari usia (de Zoysa & Feachem, 1985).
Selain rotavirus dan DEC, enteropatogen lain
termasuk Shigella spp., Salmonella spp., Vibrio cholerae dan Campylobacter spp. dapat menyebabkan diare.
Di Sudan kematian bayi adalah 102 per 1000 kelahiran hidup
dan kematian neonatal adalah 51 per 1000 kelahiran hidup . Khartoum adalah yang

000043 G 2015 Para Penulis Dicetak di Inggris Raya

A. Saeed, H. Abd and G. Sandstrom

432 Ini adalah sebuah Buka Akses artikel didistribusikan di

bawah ini hal dari para Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/).

ibu kota dari Sudan dengan sebuah jumlah penduduk dari 5 juta. Hal ini terletak di pusat Sudan dan administratif dibagi menjadi
tujuh daerah. Sekitar 80% dari populasi penduduk Negara Khartoum tinggal di daerah perkotaan (El Tayeb et al ., 2014).
Penyakit infeksi menyebabkan sebagian besar kematian tersebut (UNICEF,
2014), tetapi yang etiologi agen yang biasanya tidak diketahui dan karena penyalahgunaan antibiotik adalah umum. Hal ini
menyebabkan resistensi antibiotik menjadi masalah utama di Sudan.
The Tujuan dari ini studi yang oleh karena itu untuk mengidentifikasi para etiologi diare di Khartoum, Sudan, dan untuk menentukan
kerentanan antibiotik dari organisme terisolasi.

METODE
Koleksi sampel. Sampel feses (satu per subjek) dikumpulkan dalam wadah steril dari anak-anak dengan diare (buang air besar lebih dari tiga kali dalam 24
jam masuk rumah sakit) pada periode Januari 2013 hingga Desember 2013. Semua kotoran disimpan dalam wadah pengumpul dengan media transportasi
Cary-Blair pada suhu 4 u C dan diangkut ke laboratorium mikrobiologi dalam waktu 24 jam. The residu dari setiap sampel setelah budaya pertama di
media disimpan di 270 u C untuk lebih lanjut analisis.

Isolasi dan identifikasi patogen diare. Tinja sampel yang diolah dan dianalisis untuk mikro-organisme dan parasit usus di laboratorium dari University of
Medical Sciences dan Rumah Sakit Teknologi (UMST) (Khartoum, Sudan). Kultur standar dan metode identifikasi digunakan untuk mengidentifikasi
patogen enterik (WHO, 1987). Usus parasit yang diidentifikasi fied oleh langsung mikroskop persiapan preparat basah. Sampel
positif Entamoeba diidentifikasi sampai tingkat spesies dengan PCR untuk membedakan antara E. histolytica dan E. dispar (Saeed et al. , 2011). Untuk kel
ompok A rotavirus, tinja sampel dianalisis menggunakan satu SD BIOLINE Giliran Cepat tes (katalog tidak ada. 14
FK10; Standard Diagnostics) sebagai dijelaskan oleh para produsen.

Untuk DEC, Shigella spp. dan Salmonella spp., sampel tinja yang dikultur pada agar MacConkey, tiosulfat garam sitrat empedu (TCBS)
dan deoksikolat sitrat agar (untuk Shigella spp. , dan Salmonella spp.). Semua piring yang diinkubasi semalam pada 37 u C. Semua sampel yang diuji
untuk Vibrio cholerae , Shigella spp. dan Salmonella sp. morfologi koloni, sifat biokimia dan aglutinasi
dengan antisera spesifik (Mast Diagnostica). Untuk Campylobacter spp., Yang tinja sampel diinokulasi pada berbasis arang menengah selektif darah
bebas (C C DA) ( b io M e' ri e ux) a n d bl o od-
c pada t ain i ng m e dium sel e ct i ve for Cam p y l oba c ter sp p . (bi o M e' ri e ux). Sebuah mu l ti p lex PCR kita i ng ei g ht pr i mer pasangan tertentu
untuk yang virulen gen dari lima berbeda jenis dari Desember digunakan untuk para identifikasi dari E. coli dari yang disubkultur bakteri (Tabel 1)
(Nguyen et al. , 2005).

Sensitivitas antimikroba. Antibiotik sensitivitas dari mikro organisme yang diisolasi dari kotoran anak-anak terhadap antibiotik yang berbeda diuji dengan
Mueller-Hinton agar (HIMEDIA) dan teknik difusi cakram standar metode Kirby-Bauer yang dimodifikasi, seperti yang direkomendasikan oleh Klinis dan
Laboratorium Standar Ins Institut (CLSI). Untuk pengujian kerentanan disk (BD), konten disk dan penilaian ukuran zona adalah sebagai berikut; ampisilin
(10 mg) ¢ 17 mm sensitif dan ¡ 13 mm tahan, amikasin (30 m g) ¢ 17 mm sensitif
dan ¡ 14 mm tahan, ceftazidime (30 m g) ¢ 18 mm sens itive dan
¡ 14 mm tahan, gentamisin (10 m g) ¢ 15 mm sensitif dan
¡ 12 mm tahan asam dan nalidiksat (30 m g) ¢ 19 mm sensitif dan ¡ tahan yang 13 mm digunakan.

Analisis statistik . The chi-kuadrat ( x ) tes yang digunakan untuk menentukan dengan statistik signifikansi dari yang data. Sebuah P -
2

Nilai dari , 0,05 itu dianggap statistik signifikan.

HASIL

Terjadinya patogen
Infeksi bakteri adalah penyebab utama diare pada anak-anak, dan di antara para keseluruhan kasus dari bakteri infeksi (Gambar.
1), E. coli menyebabkan 48 %, Shigella spp. menyebabkan 8 %, Salmonella spp. menyebabkan 4%
dan Campylobacter spp. menyebabkan 2%. Tidak ada Vibrio spesies yang terisolasi dari yang 437 sampel.
 Diarrhoea among children in Sudan

Dari E. coli yang terdeteksi, jenis yang paling sering adalah EAEC (43 %), diikuti oleh EPEC (29 %), ETEC (18%) dan EIEC
(9%). Dari 36 isolat Shigella , 36% adalah S. flexneri , diikuti oleh S. sonnei (33%) dan S.
dysenteriae (11%). The Salmonella isolat diwakili dua di fferent serotipe, S. typhi (76%) dan S.
paratyphi (24%). Kedelapan isolat Campylobacter berasal dari C. jejuni .
Rotavirus ditemukan pada 22% anak dengan diare. The virus adalah yang paling umum di dalam 49-60 bulan usia kelompok.
Parasit protozoa ditemukan pada 16% dari 437 anak. Giardia intestinalis ditemukan pada 11% anak, diikuti oleh Entamoeba
histolytica pada 5% anak. Semua mikroorganisme yang diidentifikasi dalam spesimen tinja dijelaskan pada Tabel 2.
Di stribution dari diare di antara 437 anak-anak sesuai dengan usia dan jenis kelamin dalam penelitian ini adalah sebagai berikut:
5 % yang berusia 0-6 bulan, 6 % adalah 7-24 bulan, 5 %
adalah 25-36 bulan, 18 % adalah 37-48 bulan dan 66 % adalah 49-60 bulan. Dari kasus-kasus diare di studi, 240 (55 %) adalah laki-
laki dan 197 (45 %) anak perempuan, memberikan sebuah rasio laki-
laki untuk perempuan dari 1 : 0,82 (Tabel 3). The tingkat dari diare pada kelompok tertua (49-60 bulan) anak-anak dan
di dalam laki-laki w a s s i gnificantly lebih tinggi ( P , 0.00 0 1).

Fitur klinis dan musiman

Dari 437 anak yang mengalami diare, 98% mengalami diare cair dan 2% mengalami diare berdarah. Demam
jelas di 53 % dari yang anak-anak, paling sering anak-anak dengan shigellosis dan rotavirus. Muntah itu terlihat di 55 % dari anak-
anak dan dehidrasi pada 60% dari anak-anak. Infeksi virus cenderung terjadi selama musim dingin, yang infeksi bakteri selama
musim panas dan musim gugur dan parasit infeksi yang terlihat hanya selama satu hujan musim.

Sensitivitas antimikroba
Semua (211/211) isolat E. coli sensitif terhadap kloramfenikol, sedangkan 206 isolat dari 212 isolat yang diuji sensitif terhadap
ceftazidime, 198 terhadap ciprofloxacin, 200 terhadap gentamisin, 160 terhadap tetrasiklin, 150 terhadap amikasin, 140 terhadap
asam nalidiksat dan hanya 100 t o ampisilin (Tabel 4). Di antara total spesies Shigella ( n 536), 30 sensitif terhadap

Tabel 1. Primer yang digunakan untuk PCR multipleks untuk mendeteksi E. coli diaregenik

primer Gen sasaran Urutan primer bp

LT eltB 59TCTCTATGTGCATACGGAGC39 322

59CCATACTGATTGCCGCAAT39
ST estA 59GCTAAACCAGTAGAGGTCTTCAAAA39 147
59CCCGGTACAGAGCAGGATTACAACA39
VT1 vt1 59GAAGAGTCCGTGGATTACG39 130
59AGCGATGCAGCTATTAATAA39
VT2 vt2 59ACCGTTTTTCAGATTTTGACATA39 298
59TACACAGGAGGCAGTTTCAGACAGT39
eae EA ea 59CACACGAATAAACTGACTAAAATG39 376
59AAAAAACGCTGACCCGACCTAAAT39
SHIG saya 59CTGGTAGGTATGGTGAGG39 320
59CCAGGCCAACAATTATTTCC39
bfpA bfpA 59TTCTTTGGTGCTTGCGTGTCTTTT39 367
59TTTTGTTTGTTGTATCTTTGTAA39
EA pCVD 59CTGGCGAAAGACTGTATCAT39 630
59CAATGTATAGAAATCCGCTGTT39
A. Saeed, H. Abd and G. Sandstrom

kloramfenikol, 28 untuk ciprofloxacin dan gentamicin, 24 untuk ceftazidime, 20 untuk tetrasiklin, 19 untuk amikasin, 18 untuk asam
nalidiksat dan 18 untuk ampisilin (Tabel 5). Di antara para Salmonella spp. ( n 517), sensitivitas terhadap kloramfenikol, gentamisin
dan tetrasiklin ditemukan pada 17 isolat, sedangkan 15 isolat sensitif terhadap ceftazidime dan ciprofloxacin dan 11 isolat sensitif
terhadap amikasin, asam nalidiksat dan amp icillin (Tabel 6). Campylobacter sensitif terhadap semua antibiotik yang diuji kecuali dua
isolat yang resisten terhadap ampisilin.

DISKUSI
Dalam penelitian ini, kami menggunakan kombinasi teknik konvensional dan molekuler untuk menyelidiki agen etiologi

dari anak-anak dengan diare yang tinggal di daerah perkotaan di Khartoum, Sudan. Dari 437 sampel yang diuji, 240 berasal dari
anak laki-laki dan 197 dari perempuan, dengan perbandingan laki-laki dan perempuan 1,2 : 1. Semua anak dalam penelitian ini
berusia di bawah 5 tahun. Jumlah terbesar dari sampel adalah dari yang 49-
60 bulan usia kelompok 287 (66 %), diikuti oleh para 37-48 kelompok umur bulan 79 (18%). Di antara total 437 sampel yang diuji
dalam penelitian ini, bakteri patogen yang terdeteksi di 272 (62%) sampel.
Angka diare lebih tinggi pada anak laki-laki, 240 (55%), dibandingkan pada anak perempuan, 197 (45%), seperti yang dilaporkan
dalam banyak penelitian sebelumnya (Klein et al. , 2006; Moyo et al. , 2011; Shariff et al. , 2003; Sherchand . et al , 2009) dan
rasio laki-laki untuk anak perempuan yang terkena penyakit diare adalah
berbeda dari yang di lain studi, yang ditemukan bahwa laki-laki

(bakteri, virus dan parasit patogen) dalam sampel tinja

 Diarrhoea among children in Sudan

Gambar 1. Jumlah total agen penyebab yang berbeda yang ditemukan pada 437 kasus diare yang termasuk dalam penelitian.

Tabel 2. Mikroorganisme yang teridentifikasi dalam sampel tinja dari kasus diare anak child

Mikroorganisme Jumlah kasus

(%)

Enteroaggregative E. coli (EAEC) 91 (21)

E. coli enteropatogenik (EPEC) 61 (14)
Enterotoksigenik E. coli (ETEC) 39 (9)
Enteroinvasive E. coli (EIEC) 20 (4)
Shigella sonnei 12 (3)
Shigella flexneri 20 (4)
Shigella disentri 4 (1)
Salmonella typhi 13 (2)
Salmonella paratyphi C 4 (1)
Campylobacter jejuni 8 (3)
Giardia intestinalis 47 (11)
Entamoeba histolytica 22 (5)
Rotavirus A 96 (22)
Total 437 (100)

Tabel 3. Jumlah kasus diare anak yang teridentifikasi, dibagi menurut umur dan jenis kelamin anak

Kelompok umur Laki-

laki Perempuan Jumlah (bulan)

0–6 7 13 20
7–24 9 19 28
25–36 8 15 23
37–48 23 56 79
49–60 193 94 287
Total 240 197 437
nilai P ( x -tes)
2
, 0,0001
P
A. Saeed, H. Abd and G. Sandstrom

dan anak perempuan sama - sama terpengaruh (Mashoto et al. , 2014). Mayoritas sampel positif 366 (84%) ditemukan pada anak-
anak yang lebih tua dari 2 tahun, terutama mereka yang berusia 4-5 tahun seperti disebutkan di atas. The prevalensi dari diare pada
anak di atas 2 tahun ditemukan menjadi signifikan Hig h er ( P , 0,01). Cont sebuah minated tangan adalah salah
satu dari yang paling umum rute untuk transmisi dari makanan-ditanggung infeksi, yang mungkin menjadi salah
satu alasan mengapa diare adalah tinggi di usia kelompok 4-5 tahun, sebagai miskin tangan mencuci praktek di ini kelompok usia
yang umum.
Prevalensi diare yang disebabkan oleh bakteri secara signifikan lebih tinggi daripada yang disebabkan oleh virus dan infeksi parasit,
berbeda dengan hasil yang dilaporkan dalam penelitian lain di berbagai negara (Nitiema et al. , 2011). Hal ini mungkin karena
berbeda dengan sebelumnya. studi, kami menyelidiki keberadaan subkelompok DEC yang berbeda dan Campylobacter, dan temuan
ini meningkatkan deteksi bakteri sebagai agen penyebab diare.
E. coli itu yang paling sering terdeteksi patogen, di kontras dengan temuan yang dipublikasikan bagi negara-negara berkembang
lainnya (Aryal, 1996; Maharjan . Et al , 2007; Mandomando . Et al , 2007; Sherchand et .
Al , 2009). E. coli itu terdeteksi di 48 % (211) dari tinja sampel. EAEC adalah yang paling umum terdeteksi jenis dari
E. coli di anak-anak di ini studi, hadir di 43 % (91) dari kasus,
menunjukkan bahwa itu adalah yang utama penyebab dari diare (Olesen et al. ,
2005), sedangkan beberapa sebelumnya studi menyimpulkan bahwa itu tidak terkait dengan diare (Bonkoungou et al. ,
2012). Namun, mereka penelitian dilakukan selama kering musim, yang dapat menjelaskan dengan perbedaan. Oleh karena
itu E. coli

dapat dianggap sebagai spesies penyakit diare yang paling sering diisolasi pada anak-anak di Khartoum.
Spesies Shigella terdeteksi pada 36 (8%) sampel tinja, dengan isolat S. flexneri yang paling sering, 56 % (20/36), diikuti oleh S.
sonnei , 33% (12/36) dan S. dysenteriae, 11% (4/36). Penelitian lain di Tanzania dan di Yordania telah melaporkan hasil serupa
untuk shigellosis (Moyo et al. , 2011; Youssef et al. , 2000). Salmonella sp. diisolasi dari 4% sampel tinja dalam penelitian
ini. Persentase ini serupa dengan yang diperoleh dalam penelitian lain di Afrika Timur, di Mozambik dan Tanzania,
di mana prevalensinya sekitar 3% (Mandomando et al. , 2007; Moyo et al. , 2011).
Di
antara Salmonella spp., S. typhi telah terdeteksi di 76 % (13/17) dari kasus dan S. paratyphi C di 24 % (4/17). Ini adalah yang pertam
a studi untuk mendeteksi C. jejuni di Sudan. Pada kenyataannya, Campylobacter adalah tidak pada satu sistem deteksi di penyelidikan
laboratorium rutin pada etiologi dari diare di Sudan.
Rotavirus adalah patogen kedua yang paling umum terdeteksi dalam penelitian kami, mendukung peran terdokumentasi dengan
baik dari rotavirus diare pada anak-anak di negara-negara berkembang (Bonkoungou et al. , 2010; Nitiema . Et
al , 2011; O'Ryan et . Al , 2005; Rodrigues dkk . , 2007). The Mayoritas kasus rotavirus terdeteksi pada anak-anak berusia di atas
2 tahun.
Parasit usus selalu menjadi masalah kesehatan masyarakat yang penting di negara berkembang, terutama di daerah tropis dan
subtropis (Easow et al. , 2005). Prevalensi parasit usus yang menyebabkan diare itu ditemukan sekitar 16% (69/437) dalam
penelitian ini, di antaranya G. intestinalis mewakili 68% (47/69) dan Entamoeba histolytica , 32% (22/69). Hasil
ini mengkonfirmasi temuan sebelumnya yang dilaporkan untuk Lembah Kathmandu (Shrestha et al. , 2009; Thapa Magar et
al. , 2011).
Adanya darah dalam 2% (9/437) sampel mungkin disebabkan oleh Entamoeba histolytica . Rendahnya angka positif parasit usus
yang ditemukan dalam penelitian ini mungkin disebabkan oleh sumber air minum yang digunakan, lokasi WC umum yang jauh dari
rumah dan ketersediaan WC di sebagian besar rumah.

Uji kepekaan antimikroba menunjukkan bahwa di antara 211 isolat E. coli yang diuji, 100% isolat adalah
 Diarrhoea among children in Sudan

Tabel 4. Sensitivitas antimikroba isolat E. coli ( n 5 211)

Antibiotik Sensitif (%) Sedang (%) Tahan (%)

Amikasin 150 (71) 0 62 (29)

Ampisilin 100 (47) 12 (6) 100 (47)
Ceftazidime 206 (97) 0 6 (3)
Ciprofloxacin 198 (93) 2 (1) 12 (6)
Kloramfenikol 211 (100) 0 0
Gentamisin 200 (94) 3 (2) 9 (4)
Asam nalidiksat 140 (66) 0 72 (34)
Tetrasiklin 160 (75) 2 (1) 50 (24)

Tabel 5. Sensitivitas antimikroba Shigella spp. isolat ( n 5 36)

Antibiotik Sensitif (%) Sedang (%) Tahan (%)

Amikasin 19 (53) 3 (4) 14 (39)

Ampisilin 18 (50) 2 (6) 16 (44)
Ceftazidime 24 (67) 4 (11) 8 (22)
Ciprofloxacin 28 (78) 5 (14) 3 (8)
Kloramfenikol 30 (83) 2 (6) 4 (11)
Gentamisin 28 (78) 4 (11) 4 (11)
Asam nalidiksat 19 (53) 5 (14) 12 (33)
Tetrasiklin 20 (56) 8 (22) 8 (22)

terbukti sensitif terhadap kloramfenikol, sedangkan 97% (206/211) menunjukkan sensitivitas terhadap ceftazidime, 94% (200/211)
terhadap gentamisin, 93% (198/211) terhadap ciprofloxacin dan 75 % (160/211) terhadap tetrasiklin. Sangat sedikit isolat yang resisten
terhadap antibiotik yang berbeda tetapi di antaranya 34% (62/211) resisten terhadap asam nalidiksat dan 47% (100/211) resisten
terhadap ampisilin. Penelitian sebelumnya menemukan bahwa ciprofloxacin adalah 100% (8) efektif terhadap E. coli dan tetrasiklin
efektif dalam 29% (101) dari kasus, tapi yang 50 % (8) dari ini bakteri yang resisten terhadap ampisilin (Al-Gallas dkk. , 2007;
Kaminski dkk. , 1994). Di antara yang 36 isolat dari para Shigella spp. diuji di sini, 83 % (30/36) yang sensitif terhadap kloramfenikol
dan 78% (28/ 36) yang peka terhadap ciprofloxacin dan gentamisin, sedangkan 44% ( 16/36) dari isolat resisten terhadap ampisilin dan
39% (14 / 36) menjadi amikasin. Bodhidatta dkk. (2002) menemukan bahwa 100% (56/56) isolat bakteri yang diuji sensitif terhadap
ciprofloxacin, tidak seperti dalam penelitian kami. Ini mungkin karena penggunaan empiris antibiotik ini dan perkembangan resistensi
di Sudan. Kloramfenikol, gentamisin dan tetrasiklin adalah antimikroba yang paling
efektif untuk Salmonella spp. dengan sensitivitas 100 % (17/17) , diikuti oleh 88% (15/17) terhadap ciprofloxacin dan ceftazidime. Hal
ini dalam kontras dengan temuan Mandomando et al. (2007) bahwa 92% (12) isolat Salmonella sensitif terhadap kloramfenikol dan
85% (11) terhadap tetrasiklin. Itu studi juga menemukan bahwa 62% (8) dari Salmonella isolat resisten terhadap ampisilin dan 8% ( 1)
asam nalidiksat. Temuan resistensi yang jauh lebih rendah terhadap ampisilin dalam penelitian kami our

Tabel 6. Sensitivitas antimikroba isolat Salmonella ( n 5 17)

Antibiotik Sensitif (%) Sedang (%) Tahan (%)

Amikasin 11 (64) 3 (18) 3 (18)

A. Saeed, H. Abd and G. Sandstrom

Ampisilin 11 (64) 2 (12) 4 (24)

Ceftazidime 15 (88) 2 (12) 0
Ciprofloxacin 15 (88) 0 2 (12)
Kloramfenikol 17 (100) 0 0
Gentamisin 17 (100) 0 0
Asam nalidiksat 11 (64) 2 (12) 4 (24)
Tetrasiklin 17 (100) 0 0

mungkin karena Salmonella tidak menjadi masalah utama di Khartoum, Sudan. Dalam penelitian ini, kloramfenikol, gentamisin
dan sefalosporin generasi ketiga adalah antibiotik yang paling efektif melawan bakteri penyebab diare, sedangkan amikasin,
ampisilin dan asam nalidiksat adalah yang paling tidak efektif. Namun, penggunaan kloramfenikol pada anak tidak dianjurkan
(Mandomando et al. , 2007).
Penelitian ini menunjukkan bahwa frekuensi diare pada anak laki-laki lebih tinggi daripada anak perempuan. Kesadaran tentang
pencegahan penyakit menular, peningkatan kebersihan dan pengobatan yang tepat diperlukan untuk mengurangi beban penyakit
menular yang dapat dicegah di kalangan anak kecil di Khartoum.

REFERENSI
Al-Gallas, N., Bahri, O., Bouratbeen, A., Ben Haasen, A. & Ben Aissa,
R. (2007). Etiologi diare akut pada anak dan dewasa di Tunis, Tunisia, dengan penekanan pada diaregenik Escherichia coli : prevalensi, fenotip, dan
epidemiologi molekuler. Am J Trop Med Hyg 77, 571–582.
Aryal, B. K. (1996). Serologis analisis dari Escherichia coli yang diisolasi dari berbagai spesimen klinis dengan minat khusus dalam
gastroenteritis . Tesis PhD , Universitas Tribhuvan, Nepal.
Bodhidatta, L., Vithayasai, N., Eimpokalarp, B., Pitarangsi, C., Serichantalergs, O. & Isenbarger, DW (2002). Bakteri patogen enterik pada anak-
anak dengan disentri akut di Thailand: meningkatnya pentingnya Campylobacter yang resisten terhadap kuinolo . Kesehatan Masyarakat J Trop Med
Asia Tenggara 33, 752–757.
Bonkoungou, I. J. O., Tosic, I., Bon, F., Benon, B., Coulibaly, S. O., Haukk sebuah , K., Traor e' , A . S . & Barro, N. (2010 ) . Epidemiologi dari in
feksi rotavirus pada anak-anak dengan diare akut di Burkina Faso. BMC Pediatr 10, 94.
Bonkoung o u, I. J. O., Lienemann, T., Martikainen, O., Dembel e' , R., Tosic, I., Traor e' , A . S., Siitonen, A., Barro, N. & Haukka, K. (2012). Esc
herichia coli diaregenik terdeteksi oleh PCR 16-plex pada anak-anak dengan dan tanpa diare di Burkina Faso. Mikrobiol Clin Menginfeksi 18, 901–906.
de Zoysa, I. & Feachem, RG (1985). Intervensi untuk pengendalian penyakit diare di kalangan anak-anak di : kemoprofilaksis. Organ Kesehatan
Dunia Banteng 63, 295–315.
Easow, J. M., Mukhopadhyay, C., Wilson, G., Guha, S., Jalan, B. Y. & Shivananda, PG (2005). Protozoa oportunistik yang muncul dan profil
infestasi protozoa patogen usus pada anak - anak di Nepal barat . Nepal Med Coll J 7, 134–137.
El Tayeb, S., Abdalla, S., Van den Bergh, G. & Heuch, I. (2014). Penggunaan layanan kesehatan oleh orang-orang yang terluka di Negara Bagian
Khartoum, Sudan. Kesehatan Int .
Gomes, TA, Rassi, V., MacDonald, KL, Ramos, SR, Trabulsi,
LR, Vieira, MA, Guth, BE, Candeias, JA, Ivey, C. & penulis lain (1991). Enteropatogen terkait dengan akut
diare penyakit di perkotaan bayi di S sebuah~ o Paulo, Brasil. J Menginfeksi Dis 16 4 , 331–337.
Kaminski, N., Bogomolski, V. & Stalnikowicz, R. (1994). Diare bakteri akut di ruang gawat
darurat: implikasi terapeutik dari hasil kultur tinja . J Accid Emerg Med 11, 168-171.
Klein, EJ, Boster, DR, Stapp, JR, Wells, JG, Qin, X., Clausen,
CR, Swerdlow, DL, Braden, CR & Tarr, PI (2006). Etiologi diare di bagian gawat darurat rumah sakit anak: studi kohort prospektif. Clin Infect Dis 43,
807–813.

Maharjan, R., Lekhak, B., Shrestha, CD & Shrestha, J. (2007). Deteksi bakteri patogen enterik ( Vibrio cholerae dan Escherichia
coli O157) pada kasus diare anak . Sci Dunia 5, 23-26.
 Diarrhoea among children in Sudan

Mandomando, I. M., Macete, E. V., Ruiz, J., Sanz, S., Abacassamo, F., Vall e` s, X., Sacarlal, J., Navia, M. M., Vila , J. & penulis lain (2007).
Etiologi diare pada anak di bawah 5 tahun dirawat di rumah sakit pedesaan di selatan Mozambik. Am J Trop Med Hyg 76, 522–527.
Mashoto, KO, Malebo, HM, Msisiri, E. & Peter, E. (2014). Prevalensi, kejadian satu minggu dan pengetahuan tentang penyebab diare: survei rumah
tangga balita dan orang dewasa di distrik Mkuranga, Tanzania. Kesehatan Masyarakat BMC 1 4, 985.
Moyo, SJ, Gro, N., Matee, MI, Kitudu, J., Myrmel, H., Mylvaganam, H., Maselle, S. Y. & Langeland, N. (2011). Agen etiologi spesifik usia diare
pada anak-anak yang dirawat di rumah sakit berusia kurang dari lima tahun di Dar es Salaam, Tanzania. BMC Pediatr 11, 19.
Nataro, J. P. & Kaper, J. B. (1998). Escherichia coli yang bersifat diare . Clin Microbiol Rev 11, 142-201.
Nguyen, T. V., Le Van, P., Le Huy, C., Gia, K. N. & Weintraub, A. (2005). Deteksi dan karakterisasi Escherichia coli diaregenik dari anak kecil di
Hanoi, Vietnam. J Clin Mikrobiol 43, 755-760.
Nitiema, LW, Nordgren, J., Ouermi, D., Dianou, D., Traore, AS, Svensson, L. & Simpore, J. (2011). Beban rotavirus dan enteropatogen lain di
antara anak-anak dengan diare di Burki na Faso. Int J
Menginfeksi Dis 15, e646–e652.
O'Ryan, M., Prado, V. & Pickering, LK (2005). Pembaruan milenium tentang penyakit diare pediatrik di negara berkembang. Semin Pediatr Infect
Dis 16, 125–136.
Olesen, B., Neimann, J., B o¨ ttiger, B., Ethelberg, S., Schieller u p, P., Jensen, C., Helms, M., Scheutz, F., Olsen, KEP & lainnya penulis
(2005). Etiologi diare pada anak kecil di Denmark: studi kasus kontrol. J Clin Mikrobiol 43, 3636–3641.
Parashar, UD, Bresee, JS, Gentsch, JR & Glass, RI (1998).
Rotavirus. Muncul Menginfeksi Dis 4, 561–570.

Rodrigues, A., de Carvalho, M., Monteiro, S., Mikkelsen, C. S., Aaby, P., Molbak, K. & Fischer, TK (2007). Surveilans rumah
sakit dari rotavirus infeksi dan penularan nosokomial penyakit rotavirus antara anak-anak di Guinea-Bissau. Pediatr Menginfeksi Dis J 26, 233-237.
Saeed, A., Abd, H., Eveng sebuah˚ rd, B. & Sandstr o¨ m, G. (2011). Epidemiologi infeksi entamoeba di Sudan. Afr J Mikrobiol Res 5, 3702–
3705.
Shariff, M., Deb, M. & Singh, R. (2003). Sebuah studi tentang diare di antara anak-anak di Nepal timur dengan referensi khusus untuk
rotavirus. Mikrobiol J Med India 21, 87-90.
Sherchand, J. B., Yokoo, M., Sherchand, O., Pant, A. R. & Nakogomi,
O. (2009). Beban enteropatogen terkait penyakit diare di rumah sakit anak-anak, Nepal. Sci Dunia 7, 71-75.
Shrestha, SK, Rai, SK, Vitrakoti, R. & Pokharel, P. (2009). Infeksi parasit pada anak sekolah di daerah
Thimi, Lembah Ka thmandu. J Nep Assoc Med Lab Sci 10, 31-33.
Thapa Magar, D., Rai, S. K., Lekhak, B. & Rai, K. R. (2011). Belajar dari infeksi parasit antara anak-anak dari Sukumbasi Basti di Kathmandu
lembah. Nepal Med Coll J 13, 7–10.
UNICEF (2014). Tingkat & Tren Kematian Anak. Laporkan 2014. Perkiraan Dikembangkan oleh para PBB Inter-
lembaga Grup untuk Anak Kematian Estimasi. New York, NY: Dana Anak-anak Perserikatan Bangsa - Bangsa .
WHO (1987). Program pengendalian penyakit diare. Dalam Manual
untuk Laboratorium Investigasi dari akut enterik Infeksi . Jenewa: Organisasi Kesehatan Dunia.
WHO (2008). Beban Penyakit Global: Pembaruan 2004 . Jenewa: Organisasi Kesehatan Dunia.
Anda, D., Wardlaw, T., Salama, P. & Jones, G. (2010). Tingkat dan tren kematian balita, 1990–2008. Lancet 375, 100-103.
Youssef, M., Shurman, A., Bougnoux, ME, Rawashdeh, M., Bretagne, S. & Strockbine, N. (2000). Bakteri, virus, dan parasit patogen enterik yang
terkait dengan diare akut pada anak-anak yang dirawat di rumah sakit dari Yordania utara. FEMS Immunol Med Microbiol 28,
257–263.