UJIAN TENGAH SEMESTER

MIKROBIOLOGI LANJUT

OLEH

NI KADEK DWI APRILIANTI

21822110003

PROGRAM PASCASARJANA
PROGRAM STUDI BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS UDAYANA
DENPASAR
2021
UjianTengah Semester (UTS I)
Mata KuliahMikrobiologi Lanjut
Hari/Tgl. : Jumat, 15 Oktober 2021
Dosen: Dr. Yan Ramona, M.App.Sc., Ph.D.
Waktu: Sampai hari minggu sore jam 17.00 (17 Oktober 2021)

1. Jelaskan dan beri contoh nyata peran bakteri dalam kehidupan kita!
2. Dalam suatu percobaan elektroporesis didapatkan data sebagai berikut:

St A+B A+C B+C

3000 bp

2000 bp

1500 bp

1200 bp

900 bp

700 bp

Dari data tersebut;

a. Buat kurva standar yang menunjukkan hubungan antara jarak pergerakan dari well dan pasang
basa yang dikandung oleh bands!
b. Tentukan banyaknya pasang basa (bp) pada fragment yang dipotong dengan enzim-enzim
restriksi A+B, A+C, dan B+C!
c. Konstruksi restriction sites dari keriga enzim tersebut (A, B, dan C) pada plasmid yang
berukuran 4600 bp.
d. Bila konsentrasi DNA yang di loading pada sumur 2, 3, dan 4 adalah 100 ng/µl dan banyaknya
DNA yang diloading sebanyak 20 µl, tentukanlah berat DNA pada masing-masing band yang
terbentuk!
3. Suatu fungi menggunakan glukosa untuk menghasilkan ATP dengan dua cara sebagai berikut:

a. Berapa ratio antara kecepatan katabolisme glukosa secara anaerobik dan aerobik?
b. Berapa konsumsi oksigen yang diharapkan (mol O2 per mol glukoca)?
c. Berapa CO2 yang dilepaskan (mol CO2 per mol glukosa)?

4. Suatu galur sel mamalia B yang tumbuh di kultur jaringan memiliki panjang untai ganda 3 meter
per sel. Diketahui bahwa lama fase S dari sel tersebut adalah 5 jam. Jika kecepatan sintesis DNA
baru pada sel ini adalah 50 mikron per menit, berapa banyak replication fork yang harus dibentuk
selama proses replikasi tersebut?
JAWABAN

1. Peran bakteri dalam kehidupan kita adalah bakteri yang hidup di dalam tubuh manusia
merupakan koloni bakteri yang bermanfaat. Peran mikrobioma adalah membantu mencerna
makanan, mengatur sistem imun, dan perlindungan terhadap bakteri patogen. Mikrobioma
berada di kulit, sistem gastrointestinal, saluran napas, dan saluran urogenital saluran yang
berhubungan langsung dengan dunia luar sehingga dapat terpajan langsung oleh faktor
eksternal, seperti makanan, udara, dan obat-obatan. Setiap individu memiliki respons berbeda
pada metabolisme mikrobioma. Selain peran bakteri dalam tubuh manusia, bakteri juga
perperand alam beberapa bidang lainnya, yaitu bidang pangan dan bidang industri. Dengan
contoh antara lain sebagai berikut.

• Lactobacillus lactis dapat mengendapkan kasein dari susu untuk proses pembuatan
buttermilk.

• Lactobacillus bulgaricus berperan dalam proses pembuatan yoghurt Acetobater

xylinum berperan dalam proses pembuatan nata de coco.

• Lactobacillus sp. Berperan dalam proses pembuatan terasi.

• Streptococcus thermophilus dan Propionibacterium shermanii berperan dalam proses

pembuatan keju.

• Clostridium thermocellus berperan dalam pembuatan kertas.

• Thermus aquaticus berperan menghilangkan rambut kulit dalam industri kulit.

• Rhizobium radicicola dan Nitrosococcus berperan mengikat nitrogen pada industri

pertanian.

• Methanobacterium dan Methanobacillus berperan dalam pembuatan biogas.

2. a. Buat kurva standar yang menunjukkan hubungan antara jarak pergerakan dari well dan
pasang basa yang dikandung oleh bands!

WELL BP MIGRASI

I 3000 3.1 cm

II 2000 4.2 cm
III 1500 4.8 cm

IV 1200 5.8 cm

V 900 6.9 cm

VI 700 7.8 cm
b. banyaknya pasang basa (bp) pada fragment yang dipotong dengan enzim-enzim restriksi A+B,
A+C, dan B+C adalah sebagai berikut

KONFIGURASI
R. E
I II
A+B 1000 3600
A+C 2000 2600
B+C 1700 2900

c. Konstruksi restriction sites dari keriga enzim tersebut (A, B, dan C) pada plasmid yang berukuran
4600 bp.
A
1000

2000 B

4600

1700

d. berat DNA pada masing-masing band yang terbentuk adalah

berat DNA = % BP n x 200 = … ng

A+ B = 21.7% x 200 = 4340 ng.

A + C = 43.5% x 200 = 8600 ng.

B + C = 41.3% x 200 = 8.260 ng.

4. Suatu galur sel mamalia B yang tumbuh di kultur jaringan memiliki panjang untai ganda 3 meter
per sel. Diketahui bahwa lama fase S dari sel tersebut adalah 5 jam. Jika kecepatan sintesis DNA baru
pada sel ini adalah 50 mikron per menit, berapa banyak replication fork yang harus dibentuk selama
proses replikasi tersebut?

Panjang untai ganda = 3 meter

Fase S = 5 jam
Kecepatan sintesis = 50 mikron/ menit

1 jam = 60 menit
5 jam = 60 x 5
= 300 menit

Fase S

S = v.t

S = 300 . 50

= 15.000 mikron

Banyak replication yang terbentuk :

1 m = 1.000.000 mm

3 m = 3 x 1.000.000

= 3.000.000 mm

Jadi, setelah diperoleh panjangnya dalam mm maka dapat dihitung sebagai berikut.

!.###.###
$%.###
= 200

Dari hasil diatas, dapat disimpulkan banyak replication fork yang harus terbentuk adalah

200 replication fork.

 3. Dari soal diatas dapat dirumuskan jawaban sebagai berikut.

a. Ratio antara kecepatan katabolisme glukosa melalui proses aerob dan anaerob

Aerob : C6H12O6 + 6O2 + ⇄ 6CO2 + 6H2O

Anaerob : C6H12O6 ⇄ 2C2H5OH + 2CO2

![#] ' ![)] ' ![*] ' ![+]

𝑟1 = − !%
= − ( !%
= + ( !%
=+ ( !%

![#] ' ![-] ' ![*]

𝑟2 = − !%
= + , !%
= + , !%

' ![)] ' ![*] ' ![+]

− ( !%
= + ( !%
=+ ( !%

' ![-] ' ![*]

+ , !%
= + , !%

' ![)] ' ![*] ' ![+]

− ( !%
= + . !%
=+ ( !%

' ![-]
+ , !%

' ![/,] ' ![*/,] ' ![0,/]

− ( !%
= + . !%
=+ ( !%

' ![*,01/0]
+ , !%

Keterangan:

A = C6H12O6

B = O2

C = CO2
 D = H2 O

E = C2H5OH

Dik:
1 mol glukosa menghasilkan 36 ATP

Separuh dari ATP yang dihasilkan adalah secara anaerobik

Jawab:

b. Konsumsi Oksigen yang diharapkan (mol O2 per mol glukosa yang dikonsumsi)

234567648 /,
mol O2 = 234567648 *(0',/( x mol C6H12O6

(
mol O2 = ' x 0,5 = 3

c. Karbondioksida yang dilepaskan (mol CO2 per mol glukosa)

Secara Aerobik
234567648 */,
mol CO2 = 234567648 *(0',/( x mol C6H12O6

(
mol CO2 = ' x 0,5 = 3

Secara Anaeroibik

234567648 */,
mol CO2 = 234567648 *(0',/( x mol C6H12O6

,
mol CO2 = ' x 0,5 = 1

Jadi, 1 mol glukosa membutuhkan 3 mol O2 dan melepaskan 4 mol CO2