Sejarah dan Klasifikasi Mikrobiologi

Mikroba dalam Kehidupan Kita

1. Makhluk hidup yang terlalu kecil untuk dilihat dengan mata telanjang disebut
mikroorganisme.

2. Mikroorganisme penting dalam menjaga keseimbangan ekologi

bumi.
3. Beberapa mikroorganisme hidup pada manusia dan hewan lain dan
dibutuhkan untuk menjaga kesehatan.
4. Beberapa mikroorganisme digunakan untuk menghasilkan makanan dan bahan kimia.

5. Beberapa mikroorganisme menyebabkan penyakit.

Mikroba, juga disebut mikroorganisme, adalah makhluk hidup kecil yang
secara individu biasanya terlalu kecil untuk dilihat dengan mata telanjang.
Kelompok tersebut meliputi bakteri, fungi (ragi dan kapang), protozoa, dan alga
mikroskopis. Ini juga termasuk virus, entitas non-seluler yang terkadang
dianggap mengangkangi batas antara kehidupan dan non-kehidupan.
Penamaan dan Klasifikasi Nomenklatur
Mikroorganisme

• Dalam sistem tata nama yang dirancang oleh Carolus Linnaeus (1735),
setiap organisme hidup diberi dua nama.
• Kedua nama tersebut terdiri dari genus dan julukan tertentu, keduanya
digarisbawahi atau dicetak miring.
Nomenklatur ilmiah memberi setiap organisme dua nama — genus (jamak:
genera) adalah nama depan dan selalu menggunakan huruf besar; julukan
spesifik (nama spesies) mengikuti dan tidak menggunakan huruf besar.
Organisme ini dirujuk oleh genus dan julukan spesifik, dan kedua nama
tersebut digarisbawahi atau dicetak miring. Sesuai kebiasaan, setelah nama
ilmiah disebutkan satu kali, dapat disingkat dengan inisial marga diikuti
julukan spesifik.
Nama ilmiah dapat, antara lain, mendeskripsikan organisme, menghormati
peneliti, atau mengidentifikasi habitat suatu spesies. Contohnya, perhatikan
Staphylococcus aureus, bakteri yang biasa ditemukan pada kulit manusia.
Staphylo- menggambarkan susunan sel yang berkelompok; -coccus
menunjukkan bahwa mereka berbentuk seperti bola. Julukan spesifiknya,
aureus, adalah bahasa Latin untuk emas, warna banyak koloni bakteri ini
Genus dari bakteri Escherichia coli (eshʹer-IK-ē-ah KŌ-lī, atau KŌ-lē) dinamai dari
nama seorang ilmuwan, Theodor Escherich, sedangkan julukan spesifiknya, coli,
mengingatkan kita bahwa E. coli hidup di usus besar , atau usus besar
Jenis Mikroorganisme
1. Bakteri adalah organisme uniseluler. Karena mereka tidak memiliki inti, sel-sel tersebut digambarkan
sebagai prokariotik.

2. Kebanyakan bakteri memiliki dinding sel peptidoglikan; mereka membelah dengan pembelahan biner, dan mereka mungkin
memiliki flagela.

3. Bakteri dapat menggunakan berbagai macam bahan kimia untuk nutrisinya.

4. Archaea terdiri dari sel prokariotik; mereka kekurangan peptidoglikan di dinding sel mereka.

5. Archaea termasuk metanogen, halofil ekstrim, dan termofil ekstrim.

Metanogen menghasilkan metana sebagai produk limbah dari respirasi. Halophiles ekstrim
(halo = garam; philic = mencintai) hidup di lingkungan yang sangat asin seperti Great Salt Lake
dan Laut Mati. Thermophiles ekstrim (therm = heat) hidup di air belerang panas, seperti mata air
panas di Taman Nasional Yellowstone. Archaea tidak diketahui menyebabkan penyakit pada
manusia
6. Jamur (jamur, kapang, dan khamir) memiliki sel eukariotik (sel dengan nukleus
sejati). Kebanyakan jamur multiseluler.
7. Jamur memperoleh nutrisi dengan menyerap bahan organik dari lingkungannya.
8. Protozoa adalah eukariota uniseluler.
9. Protozoa memperoleh makanan dengan penyerapan atau konsumsi melalui
struktur khusus.
10. Alga adalah eukariota uniseluler atau multiseluler yang memperoleh makanan melalui
fotosintesis.
11. Alga menghasilkan oksigen dan karbohidrat yang digunakan oleh organisme lain.

12. Virus adalah entitas nonseluler yang merupakan parasit sel.

13. Virus terdiri dari inti asam nukleat (DNA atau RNA) yang dikelilingi oleh selubung protein.
Mungkin ada amplop yang mengelilingi mantel.

14. Kelompok utama parasit hewan multiseluler adalah cacing pipih dan
cacing gelang, secara kolektif disebut cacing.
15. Tahapan mikroskopis dalam siklus hidup cacing diidentifikasi dengan prosedur
mikrobiologi tradisional.
Klasifikasi Mikroorganisme
Pada tahun 1978, Carl Woese merancang sistem klasifikasi berdasarkan
organisasi seluler organisme. Ini mengelompokkan semua organisme dalam tiga
domain sebagai berikut:

1. Bakteri (dinding sel mengandung kompleks protein-karbohidrat yang disebut

peptidoglikan)
2. Archaea (dinding sel, jika ada, kekurangan peptidoglikan)
3. Eukarya, yang meliputi: ● Protista (jamur lendir, protozoa,
dan alga) ● Jamur (khamir uniseluler, jamur multiseluler,
dan jamur)
3 Domain
Sejarah Singkat Mikrobiologi
Teori Biogenesis
Pada tahun 1858, Rudolf Virchow menantang kasus pembangkitan spontan
dengan konsep biogenesis, berhipotesis bahwa sel hidup hanya muncul dari sel
hidup yang sudah ada sebelumnya. Karena dia tidak dapat memberikan bukti
ilmiah, argumen tentang generasi spontan berlanjut hingga tahun 1861, ketika
masalah tersebut akhirnya diselesaikan oleh ilmuwan Prancis Louis Pasteur.
Zaman Keemasan Mikrobiologi
Zaman Keemasan Mikrobiologi Periode dari 1857 hingga 1914 dengan tepat
dinamai Zaman Keemasan Mikrobiologi. Kemajuan pesat, yang dipelopori
terutama oleh Pasteur dan Robert Koch, mengarah pada pembentukan
mikrobiologi. Penemuan termasuk agen dari banyak penyakit dan peran
kekebalan dalam mencegah dan menyembuhkan penyakit
Fermentasi dan Pasteurisasi
Salah satu langkah kunci yang membangun hubungan antara mikroorganisme dan
penyakit terjadi ketika sekelompok pedagang Prancis meminta Pasteur untuk mencari tahu
mengapa anggur dan bir memburuk. Mereka berharap dapat mengembangkan metode
yang dapat mencegah pembusukan ketika minuman tersebut dikirim jarak jauh. Pada saat
itu, banyak ilmuwan percaya bahwa udara mengubah gula dalam cairan ini menjadi
alkohol. Pasteur menemukan bahwa mikroorganisme yang disebut ragi mengubah gula
menjadi alkohol tanpa adanya udara. Proses ini, yang disebut fermentasi, digunakan untuk
membuat anggur dan bir. Asam dan pembusukan disebabkan oleh mikroorganisme yang
berbeda, yang disebut bakteri. Di hadapan udara, bakteri mengubah alkohol menjadi cuka
(asam asetat). Solusi Pasteur untuk masalah pembusukan adalah dengan memanaskan bir
dan anggur secukupnya untuk membunuh sebagian besar bakteri yang menyebabkan
pembusukan. Proses tersebut, yang disebut pasteurisasi, sekarang biasa digunakan untuk
mengurangi pembusukan dan membunuh bakteri yang berpotensi berbahaya di dalam
susu serta di beberapa minuman beralkohol.
Teori Kuman Penyakit
• Bukti pertama bahwa bakteri benar-benar menyebabkan penyakit berasal dari
Robert Koch (kōk) pada tahun 1876. Koch, seorang dokter Jerman, adalah saingan
Pasteur dalam perlombaan untuk menemukan penyebab antraks, penyakit yang
menghancurkan sapi dan domba di Eropa. Koch menemukan bakteri berbentuk
batang yang sekarang dikenal sebagai Bacillus anthracis (bah-SIL-lus an-THRĀ-sis)
dalam darah sapi yang mati karena antraks. Dia membudidayakan bakteri pada
nutrisi dan kemudian menyuntikkan sampel kultur ke hewan yang sehat. Ketika
hewan-hewan ini sakit dan mati, Koch mengisolasi bakteri dalam darah mereka dan
membandingkannya dengan bakteri yang awalnya diisolasi. Dia menemukan bahwa
dua set kultur darah mengandung bakteri yang sama.
Vaksinasi
Edward Jenner (1796)
Kelahiran Kemoterapi Modern: Mimpi
tentang "Peluru Ajaib"
• Pengobatan penyakit dengan menggunakan zat kimia disebut kemoterapi.
(Istilah ini juga umumnya mengacu pada pengobatan kimiawi untuk
penyakit tidak menular, seperti kanker.) Bahan kimia yang diproduksi secara
alami oleh bakteri dan jamur untuk melawan mikroorganisme lain disebut
antibiotik. Agen kemoterapi yang dibuat dari bahan kimia di laboratorium
disebut obat sintetis.
Kecelakaan yang Beruntung — Antibiotik

Antibiotik pertama ditemukan secara tidak sengaja.

Alexander Fleming, seorang dokter Skotlandia dan ahli
bakteriologi, hampir membuang beberapa piring budaya
yang telah terkontaminasi oleh jamur. Untungnya, dia
memperhatikan pola pertumbuhan yang aneh di piring —
area yang jelas di mana pertumbuhan bakteri telah
terhambat mengelilingi jamur. Fleming melihat jamur yang
menghambat pertumbuhan bakteri. Jamur kemudian
dikenal sebagai Penicillium chrysogenum (pen9i-SIL-lē-um
krĪ-SO-jen-um), dan penghambat aktif jamur tersebut
disebut penisilin. Jadi, penisilin adalah antibiotik yang
diproduksi oleh jamur. Kegunaan yang sangat besar dari
penisilin tidak terlihat sampai tahun 1940-an, ketika
akhirnya diuji secara klinis dan diproduksi secara massal.
Perkembangan Modern dalam Mikrobiologi

- Ahli mikrobiologi menggunakan genomik, studi

tentang semua gen organisme, untuk
mengklasifikasikan bakteri, jamur, dan protozoa.

- Studi tentang AIDS, analisis tindakan

interferon, dan pengembangan vaksin
baru adalah beberapa di antara minat
penelitian saat ini di bidang imunologi.

- Teknik baru dalam biologi molekuler dan

mikroskop elektron telah menyediakan alat untuk
memajukan pengetahuan kita tentang virologi.

- Perkembangan teknologi DNA rekombinan

telah membantu memajukan semua bidang
mikrobiologi
Mikroba dan Kesejahteraan Manusia

- Mikroorganisme mendegradasi tumbuhan dan hewan yang mati dan mendaur ulang unsur kimia untuk digunakan
oleh tumbuhan dan hewan hidup.

- Bakteri digunakan untuk menguraikan bahan organik di limbah.

- Proses bioremediasi menggunakan bakteri untuk membersihkan limbah beracun.

- Bakteri penyebab penyakit pada serangga digunakan sebagai pengendali biologis hama
serangga. Pengendalian biologis bersifat spesifik untuk hama dan tidak merusak lingkungan.

- Menggunakan mikroba untuk membuat produk seperti makanan dan bahan kimia disebut bioteknologi.
- Dengan menggunakan DNA rekombinan, bakteri dapat menghasilkan zat penting seperti
protein, vaksin, dan enzim.

- Dalam terapi gen, virus digunakan untuk membawa pengganti gen yang rusak atau hilang ke dalam sel
manusia.

- Bakteri hasil rekayasa genetika digunakan dalam pertanian untuk melindungi tanaman dari embun beku dan
serangga dan untuk meningkatkan umur simpan produk
Mikroba dan Penyakit Manusia

- Setiap orang memiliki mikroorganisme di dalam dan di dalam tubuhnya; ini membentuk
mikrobiota normal, atau flora.

- Sifat penyebab penyakit dari suatu spesies mikroba dan daya tahan tubuh inang
merupakan faktor penting dalam menentukan apakah seseorang akan tertular suatu
penyakit.

- Komunitas bakteri yang membentuk lapisan berlendir di permukaan disebut biofilm.

- Penyakit menular adalah penyakit di mana patogen menyerang inang yang rentan.
-
Penyakit infeksi yang sedang berkembang (PIE) adalah penyakit baru atau penyakit yang terus
berubah yang menunjukkan peningkatan insidensi di masa lalu atau berpotensi meningkat dalam
waktu dekat.
Klasifikasi Mikroorganisme
Taksonomi adalah ilmu klasifikasi organisme. Tujuannya adalah untuk
menunjukkan hubungan antar organisme.
Taksonomi juga menyediakan sarana untuk mengidentifikasi organisme.
Studi tentang Hubungan Filogenetik
1. Filogeni adalah sejarah evolusi sekelompok organisme.
2. Hirarki taksonomi menunjukkan hubungan evolusioner, atau
filogenetik, di antara organisme.
3. Bakteri itu dipisahkan menjadi Kingdom Prokaryotae pada tahun 1968.
4. Organisme hidup dibagi menjadi lima kerajaan pada tahun 1969.
Klasifikasi Prokariota
• Skema klasifikasi taksonomi untuk prokariota ditemukan di Bergey's
Manual of Systematic Bacteriology, edisi ke-2. Dalam Bergey's
Manual, prokariota dibagi menjadi dua domain: Bakteri dan Archaea

• klasifikasi didasarkan pada kesamaan dalam urutan nukleotida rRNA.

Kelas dibagi menjadi pesanan; pesanan, ke dalam keluarga; keluarga, ke
dalam genera; dan genera, menjadi spesies.
• Manual Bergey memberikan referensi untuk mengidentifikasi bakteri di
laboratorium, serta skema klasifikasi untuk bakteri
Klasifikasi Eukariota
• Pada tahun 1969, organisme eukariotik
sederhana, kebanyakan uniseluler,
dikelompokkan sebagai Kingdom
Protista, kerajaan penampung semua
untuk berbagai organisme.
Secara historis, eukariotik
organisme yang tidak cocok
dengan kerajaan lain ditempatkan
di Protista.
Metode Klasifikasi dan Identifikasi
Mikroorganisme
Kebanyakan organisme prokariotik tidak memiliki ciri morfologi yang membedakan
atau bahkan banyak variasi dalam ukuran dan bentuk. Akibatnya, ahli mikrobiologi
telah mengembangkan berbagai metode untuk menguji reaksi metabolik dan
karakteristik lain untuk mengidentifikasi prokariota.

Manual Bergey tentang Bakteriologi Penentu telah menjadi referensi yang

banyak digunakan sejak edisi pertama diterbitkan pada tahun 1923. Manual
Bergey tidak mengklasifikasikan bakteri menurut keterkaitan evolusioner
tetapi memberikan skema identifikasi (determinatif) berdasarkan kriteria
seperti komposisi dinding sel, morfologi, diferensial pewarnaan, kebutuhan
oksigen, dan pengujian biokimia
Karakteristik Morfologi
• Karakteristik morfologi (struktural) telah membantu ahli taksonomi
mengklasifikasikan organisme selama 200 tahun. Organisme yang lebih tinggi
sering diklasifikasikan menurut detail anatomi yang diamati. Tetapi banyak
mikroorganisme terlihat terlalu mirip untuk diklasifikasikan berdasarkan
strukturnya saja. Organisme yang mungkin berbeda dalam sifat metabolik
atau fisiologis dapat terlihat serupa di bawah mikroskop. Ratusan spesies
bakteri adalah batang kecil atau cocci kecil.
• Morfologi sel memberi tahu kita
sedikit tentang filogenetik
hubungan. Namun,
karakteristik morfologi
masih berguna dalam mengidentifikasi
bakteri. Sebagai contoh,
perbedaan struktur seperti
endospora atau flagela dapat
membantu.
Pewarnaan Diferensial
Tes Biokimia
• Aktivitas enzimatik banyak digunakan untuk
membedakan bakteri. Bahkan bakteri yang
berkerabat dekat biasanya bisa
dipisahkan menjadi spesies yang
berbeda dengan melakukan uji biokimia.
• Semua anggota keluarga
Enterobacteriaceae adalah oksidase-
negatif. Di antara bakteri enterik
adalah anggota genera Escherichia,
Enterobacter, Shigella, Citrobacter, dan
Salmonella. Escherichia, Enterobacter,
dan Citrobacter, yang memfermentasi
laktosa untuk menghasilkan asam dan gas,
dapat dibedakan dari Salmonella dan
Shigella, yang tidak.
Serologi

• Serologi adalah ilmu yang mempelajari respons serum dan imun yang terbukti
dalam serum (lihat Bab 18). Mikroorganisme bersifat antigenik; yaitu,
mikroorganisme yang masuk ke dalam tubuh hewan merangsangnya untuk
membentuk antibodi. Antibodi adalah protein yang bersirkulasi di dalam darah
dan bergabung dengan cara yang sangat spesifik dengan bakteri yang
menyebabkan produksinya. Misalnya, sistem kekebalan kelinci yang disuntik
dengan bakteri tifoid yang mati (antigen) merespons dengan memproduksi
antibodi terhadap bakteri tifoid. Larutan antibodi semacam itu yang digunakan
dalam identifikasi banyak mikroorganisme penting secara medis tersedia
secara komersial; larutan semacam itu disebut antiserum
Tes Aglutinasi Geser

• Dalam prosedur yang disebut uji aglutinasi

slide, sampel bakteri yang tidak diketahui
ditempatkan dalam setetes garam pada
setiap slide. Kemudian antiserum berbeda
yang diketahui ditambahkan ke setiap
sampel. Bakteri menggumpal
(menggumpal) bila dicampur dengan
antibodi yang diproduksi sebagai respons
terhadap spesies atau strain bakteri
tersebut; tes positif ditunjukkan dengan
adanya aglutinasi.
ELISA

• uji
SEBUAH dipanggil itu terkait enzim
immunosorbent assay (ELISA) banyak digunakan
karena cepat dan dapat dibaca oleh pemindai
komputer. Dalam ELISA langsung, antibodi yang
diketahui ditempatkan di (dan melekat pada)
lubang lempeng mikro, dan jenis bakteri yang
tidak diketahui ditambahkan ke setiap lubang.
Reaksi antara antibodi yang diketahui dan bakteri
memberikan identifikasi bakteri. ELISA digunakan
dalam pengujian AIDS untuk mendeteksi adanya
antibodi terhadap human immunodeficiency virus
(HIV), virus penyebab AIDS.
Western blot

• Tes serologis lainnya,

Western blotting, juga digunakan
untuk mengidentifikasi antibodi
dalam serum pasien. Infeksi HIV
dikonfirmasi dengan Western
blotting, dan
Penyakit Lyme, yang disebabkan
oleh Borrelia burgdorferi, adalah
sering didiagnosis dengan
Western blot.
Pengetikan Phage

• Seperti serologis
pengujian, pengetikan fag
mencari kesamaan
di antara bakteri.
Komposisi Basis DNA
Ahli taksonomi dapat menggunakan
komposisi dasar DNA organisme
untuk menarik kesimpulan
keterkaitan. Komposisi dasar ini
biasanya dinyatakan sebagai
persentase guanin plus
sitosin (G 1 C). Dasar
komposisi satu spesies secara teoritis
merupakan properti tetap; Dengan
demikian, perbandingan kandungan G 1 C
pada spesies yang berbeda dapat
mengungkapkan derajat keterkaitan
spesies
Sidik Jari DNA
Menentukan seluruh urutan basa dalam DNA
organisme tidak praktis untuk identifikasi
laboratorium karena membutuhkan banyak
waktu. Namun, penggunaan enzim restriksi
memungkinkan para peneliti untuk
membandingkan urutan basa organisme yang
berbeda. Enzim restriksi memotong molekul
DNA dimanapun urutan basa tertentu terjadi,
menghasilkan fragmen restriksi
• Dalam teknik ini, DNA dari dua mikroorganisme diperlakukan dengan
enzim restriksi yang sama, dan fragmen restriksi (RFLP) yang dihasilkan
dipisahkan dengan elektroforesis, menghasilkan sidik jari DNA.

• Membandingkan jumlah dan ukuran fragmen restriksi yang

dihasilkan dari organisme berbeda memberikan informasi tentang
persamaan dan perbedaan genetik mereka; semakin mirip polanya,
atau sidik jari DNA, organisme diharapkan semakin dekat
hubungannya
Tes Amplifikasi Asam Nukleat (NAATs)
• Ketika mikroorganisme tidak dapat dibiakkan dengan metode konvensional,
agen penyebab penyakit menular mungkin tidak dapat dikenali. Namun, tes
amplifikasi asam nukleat (NAATs) dapat digunakan untuk meningkatkan jumlah
DNA mikroba ke tingkat yang dapat diuji dengan elektroforesis gel. NAAT
menggunakan PCR, PCR transkripsi balik, dan PCR waktu nyata. Jika primer
untuk mikroorganisme tertentu digunakan, keberadaan DNA yang diperkuat
menunjukkan bahwa mikroorganisme tersebut ada.
Hibridisasi Asam Nukleat
Probe DNA digunakan untuk mengidentifikasi bakteri.
Chip DNA

• Teknologi baru yang menarik adalah chip

DNA, atau microarray, yang dapat dengan
cepat mendeteksi patogen dalam inang atau
lingkungan dengan mengidentifikasi gen
yang unik untuk patogen tersebut. Chip DNA
terdiri dari probe DNA. Sampel yang
mengandung DNA dari organisme yang tidak
diketahui diberi label dengan pewarna
fluoresen dan ditambahkan ke chip.
Hibridisasi antara DNA probe dan DNA dalam
sampel dideteksi dengan fluoresensi.
Fluorescent In Situ Hybridization (IKAN)
• RNA berlabel pewarna fluoresen atau probe DNA digunakan untuk menodai
mikroorganisme di tempat, atau di tempat. Teknik ini disebut hibridisasi in situ
fluoresen, atau IKAN. Sel diperlakukan sehingga probe memasuki sel dan
bereaksi dengan DNA target di dalam sel (in situ). IKAN digunakan untuk
mengetahui identitas, kelimpahan, dan aktivitas relatif mikroorganisme di
lingkungan dan dapat digunakan untuk mendeteksi bakteri yang belum
dibudidayakan.
Kunci Dikotomis
• Kunci dikotomis banyak digunakan untuk
identifikasi. Dalam kunci dikotomis, identifikasi
didasarkan pada pertanyaan-pertanyaan yang
berurutan, dan setiap pertanyaan memiliki dua
kemungkinan jawaban (cara dikotomis dipotong
menjadi dua). Setelah menjawab satu
pertanyaan, penyidik diarahkan ke pertanyaan
lain sampai organisme diidentifikasi. Meskipun
kunci-kunci ini seringkali tidak ada hubungannya
dengan hubungan filogenetik, mereka sangat
berharga untuk identifikasi
Cladogram

• Cladogram adalah
peta yang menunjukkan
evolusioner
hubungan
di antara organisme
(clado- artinya
cabang).
Ukuran Hubungan Antar Mikroorganisme
Bab 13
 Apa itu Virus? Bab 13

• Partikel infeksius submikroskopis

• Kurangnya struktur seluler
- Tidak organel
- Tidak sitoplasma
- Tidak inti atau nukleoid
- Tidak mesin biokimia
- Tidak bisa menghasilkan energi

- Dapat mensintesis senyawa biologis

• Parasit intraseluler wajib
- Harus menginfeksi & mengambil alih sel inang untuk menyebarkan dirinya sendiri

- Sangat bergantung pada sel inang

 Bab 13

Struktur Virus
Terminologi Struktur Virus Bab 13

• Virion - virus lengkap

- Genom - asam nukleat
- Kapsid - protein
- Nukleokapsid = genom & kapsid
• Amplop
- Beberapa virus memiliki amplop
- Lipid
- terkadang lonjakan protein atau karbohidrat
 Virus dikelompokkan berdasarkan Bentuk Bab 13

Katedral Icosahedral

Spiral

Kompleks
Bab 13
er 13
Telanjang melawan Amplop Bab 13

• Tidak ada amplop = virus telanjang

• Bentuk mana pun bisa diselimuti
 Struktur Virus menentukan: Bab 13

• Kisaran & Spesifisitas Host

- Organisme apa yang bisa terinfeksi
- Sangat sempit sampai lebih luas
- Cacar: manusia
- Virus Polio: Manusia & Primata
- Rabies: banyak hewan berdarah panas

• Tropisme jaringan
- Jaringan tertentu diserang
- HIV: hanya WBC tertentu (sel T-helper)
- Rabies: jaringan saraf pada umumnya
 Klasifikasi Virus Bab 13

• Dikelompokkan menurut Jenis Asam nukleat

- Virus DNA
- Tunggal DNA-untai
- Dua kali lipat DNA-untai

- Virus RNA
- Tunggal RNA beruntai
- Dua kali lipat RNA beruntai
- Positif -strand (+ strand)
- Setara untuk messenger RNA (mRNA)
- Negatif -strand (- untai)
- Gratis untuk mengirim pesan RNA
 Bab 13

Taksonomi Viral

• Keluarga nama diakhiri dengan: -viridae

• Genus nama diakhiri dengan: -virus

• Spesies virus
- sekelompok virus yang berbagi informasi genetik yang sama
- ceruk ekologis yang sama (inang).
- Nama umum digunakan untuk spesies:
- kota, orang, penyakit
Bab 13
Bab 13
 Bab 13
Taksonomi Viral - Contoh

• Keluarga Pircornaviridiae
• RNA untai tunggal
• tidak terselubung
- Virus polio
- Virus hepatitis A.
Klasifikasi virus berdasarkan jaringan yang terkena Bab 13

• Pneumotrofik
Jaringan pernapasan
• Dermotrofik
- Kulit & jaringan terkait
• Viscerotrophic
- Organ dalam
• Neurotrofik
- Jaringan saraf
 Bab 13

Replikasi Virus
Struktur Bakteriofag Bab 13
Replikasi Bakteriofag Bab 13

• Lima Langkah
- Lampiran
- Penetrasi
- Biosintesis
- Pematangan
- Melepaskan
Replikasi Bakteriofag Bab 13
Replikasi Bakteriofag Bab 13
 Replikasi Virus Hewan Bab 13

• Beberapa kesamaan dengan Replikasi Bakteriofag

- Lampiran
- untuk membran plasma bukan dinding sel
- Paku atau protein pada permukaan virus - Tidak ada serat ekor
- Penetrasi
- seluruh virus masuk bukan hanya asam nukleat
- Uncoating
- Kapsid harus dilepas untuk melepaskan asam nukleat virus
- Replikasi
- Melepaskan
- Pecahnya sel > kematian sel inang
- Budding > Akuisisi amplop
Berbagai Cara Virus Hewan memasuki Sel InangBab 13

• Fusi
- Selubung virus & sekering membran inang

• Nukleokapsid digunakan sel inang

- Seperti fagositosis

• Tidak dilapisi
- Lapisan protein dihilangkan
- Asam nukleat virus dilepaskan ke dalam sitoplasma inang
Berbagai Cara Virus Hewan memasuki Sel InangBab 13

• Vesikel
- Bentuk di sekitar virus & terjepit
• Fusi
- Amplop virus & membran vesikula
- Virus di dalam vesikel

• Tidak dilapisi
- Lapisan protein dihilangkan

- Asam nukleat virus dilepaskan ke dalam sitoplasma inang

 Replikasi berbeda di antara keduanya Bab 13
Virus DNA dan RNA

• Virus DNA
- DNA virus mengarahkan sintesis protein & DNA virus

• Virus RNA
- Terdampar positif
- RNA virus bertindak sebagai mRNA
- Kode untuk protein & genom RNA virus baru

- Untai negatif
- Viral RNA bertindak sebagai template untuk sintesis mRNA
- Kode mRNA baru untuk protein
Replikasi virus DNA Bab 13
Replikasi Virus DNAAnimal Bab 13
Replikasi Virus RNA Bab 13
Replikasi Virus RNA Bab 13

A.Virus memasuki sitoplasma sel inang *

B. Melepas
C. + (positif) virus RNA
- Mensintesis protein virus secara langsung
- Mensintesis RNA negatif
- RNA negatif menghasilkan salinan + RNA
- + RNA bergabung dengan protein virus
- Bentuk virus baru
D. - Virus RNA (negatif)
- Mensintesis RNA positif
- mensintesis bentuk protein + RNA
- RNA positif membuat salinan - RNA
- menggabungkan - RNA dengan protein virus

E. Lepaskan virus baru

* Semua tahapan terjadi dalam sitoplasma sel inang

 Provirus Bab 13

• Beberapa virus hewan dapat menjadi a provirus

• RNA untai ganda virus

• Gunakan Reverse Transcriptase enzim
- Mempersatukan DNA virus beruntai ganda

• Mengintegrasikan dsDNA virus ke dalam DNA pejamu

• DNA botol bereplikasi bersama dengan sel inang

R

• Provirus mungkin menjadi aktif

- Bentuk virus generasi baru
- Pelepasan dari sel inang menghancurkan sel inang
Obat dapat menghambat replikasi virus Bab 13

• Aktivitas antibodi
- Mencegah virus mengikat ke sel inang

• Obat antivirus
- Cegah lampiran
- Menyebabkan kesalahan dalam sintesis NA virus

• Membalikkan penghambat transkriptase

- Ikat untuk membalikkan transkriptase

• Penghambat neuraminidase
- Memblokir aksi enzim yang menyerang membran inang
- Tidak bisa masuk ke sel inang
Interferon menempatkan sel dalam keadaan antivirus Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
3
 Bab 13

Virus corona
 Bab 13

Virus corona
Bab 13
3
Bab 13
 Bab 13

Virus Influenza
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
apter 13
Bab 13
 Bab 13

PRION
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
 Bab 13

Virus Tanaman dan Viroid

Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
Bab 13
BAKTERIOLOGI 1
Dinding Sel Bakteri
Bakteri Gram Positif
Segmen
peptidoglikan dari
Staphylococcus aureus
Dinding Sel
Bakteri Negatif
Mikrobiota Manusia Normal

Istilah “flora mikroba normal” menunjukkan populasi mikroorganisme

yang menghuni kulit dan selaput lendir orang normal yang sehat.
Mikroorganisme yang hidup di dalam dan pada manusia (sekarang
disebut sebagai mikrobiota normal) diperkirakan melebihi jumlah sel
somatik dan kuman manusia dengan faktor 10. Genom simbion
mikroba ini secara kolektif didefinisikan sebagai mikrobioma. Penelitian
telah menunjukkan bahwa “mikrobiota normal” memberikan garis
pertahanan pertama melawan mikroba patogen, membantu
pencernaan, berperan dalam degradasi toksin, dan berkontribusi pada
pematangan sistem kekebalan. Pergeseran mikrobiota normal atau
stimulasi inflamasi oleh komensal ini dapat menyebabkan penyakit
seperti penyakit radang usus.
PROYEK MIKROBIOM MANUSIA Dalam upaya yang luas untuk memahami peran
yang dimainkan oleh ekosistem mikroba penduduk dalam kesehatan dan
penyakit manusia, pada tahun 2007, National Institutes of Health meluncurkan
Proyek Mikrobioma Manusia. Salah satu tujuan utama dari proyek ini adalah
untuk memahami kisaran keanekaragaman genetik dan fisiologis manusia,
mikrobioma, dan faktor-faktor yang mempengaruhi distribusi dan evolusi
mikroorganisme penyusun.
PERAN MICROBIOTA RESIDEN
Kulit dan selaput lendir selalu menampung berbagai mikroorganisme yang
dapat diatur menjadi dua kelompok: (1) mikrobiota penghuni terdiri dari jenis
mikroorganisme yang relatif tetap yang secara teratur ditemukan di daerah
tertentu pada usia tertentu; jika diganggu, ia segera membangun kembali
dirinya sendiri; dan (2) mikrobiota transien terdiri dari mikroorganisme
nonpatogen atau berpotensi patogen yang menghuni kulit atau selaput lendir
selama berjam-jam, berhari-hari, atau berminggu-minggu.
Mikrobiota sementara berasal dari lingkungan, tidak menghasilkan
penyakit, dan tidak tumbuh secara permanen di permukaan.
Anggota mikrobiota transien umumnya tidak begitu penting selama
flora penghuni normal tetap utuh. Namun, jika mikrobiota penghuni
terganggu, mikroorganisme transien dapat berkoloni, berkembang
biak, dan menghasilkan penyakit.
Bacillus Gram-Positif Pembentuk Spora: Spesies
Bacillus dan Clostridium
Basil pembentuk spora gram positif adalah spesies Bacillus dan Clostridium.
Basilus ini ada di mana-mana, dan karena membentuk spora, mereka dapat
bertahan di lingkungan selama bertahun-tahun. Sedangkan spesies Bacillus
adalah aerob, spesies Clostridium adalah anaerob.
Dari sekian banyak spesies Bacillus dan genera terkait, sebagian besar tidak
menyebabkan penyakit dan tidak dikarakterisasi dengan baik dalam mikrobiologi
medis. Namun, ada beberapa spesies yang menyebabkan penyakit penting pada
manusia. Antraks, penyakit klasik dalam sejarah mikrobiologi, disebabkan oleh Bacillus
anthracis. Antraks tetap merupakan penyakit penting pada hewan dan kadang-kadang
pada manusia. Karena toksinnya yang kuat, B anthracis adalah agen potensial utama
bioterorisme dan perang biologis. Bacillus cereus dan Bacillus thuringiensis
menyebabkan keracunan makanan dan terkadang infeksi mata atau infeksi lokal
lainnya.
Genus Clostridium sangat heterogen, dan lebih dari 190 spesies telah
dideskripsikan. Daftar organisme patogen, serta spesies baru yang
diisolasi dari kotoran manusia yang potensi patogennya masih belum
ditentukan, terus bertambah.
Clostridia menyebabkan beberapa penyakit perantara toksin penting,
termasuk Clostridium tetani, tetanus; Clostridium botulinum, botulisme;
Clostridium perfringens, gangren gas; dan Clostridium difficile, kolitis
pseudomembran. Clostridia lain juga ditemukan pada infeksi anaerobik
campuran pada manusia
Spora
JENIS BACILLUS
Genus Bacillus termasuk batang aerobik besar, gram positif yang terbentuk dalam rantai.
Sebagian besar anggota genus ini merupakan organisme saprofit yang banyak terdapat di
tanah, air, dan udara serta pada tumbuhan, seperti Bacillus cereus dan Bacillus subtilis.
Beberapa merupakan serangga patogen, seperti B thuringiensis. Organisme ini juga
mampu menyebabkan penyakit pada manusia. B cereus dapat tumbuh dalam makanan
dan menyebabkan keracunan makanan dengan menghasilkan enterotoksin (diare) atau
racun emetik (muntah). Baik B cereus dan B thuringiensis kadang-kadang dapat
menyebabkan penyakit pada manusia yang mengalami penurunan sistem imun (misalnya,
meningitis, endokarditis, endophthalmitis, konjungtivitis, atau gastroenteritis akut). B
anthracis, yang menyebabkan antraks, adalah patogen utama dari genus.
• Antraks pada dasarnya adalah penyakit herbivora — kambing, domba, sapi,
kuda, dan sebagainya; hewan lain (misalnya tikus) relatif resisten terhadap
infeksi. Antraks merupakan penyakit endemik masyarakat agraris di negara
berkembang di Afrika, Timur Tengah, dan Amerika Tengah.
• Pada manusia, infeksi biasanya didapat dengan masuknya spora
melalui kulit yang terluka (antraks kulit) atau selaput lendir yang jarang
(antraks gastrointestinal) atau dengan menghirup spora ke paru-paru
(antraks inhalasi).
• Racun antraks terdiri dari tiga protein, antigen pelindung (PA), faktor edema (EF),
dan faktor mematikan (LF). PA mengikat reseptor sel tertentu, dan setelah aktivasi
proteolitik, ia membentuk saluran membran yang memediasi masuknya EF dan LF
ke dalam sel. EF adalah siklase adenilat; dengan PA, itu membentuk toksin yang
dikenal sebagai toksin edema. LF plus PA membentuk toksin yang mematikan, yang
merupakan faktor virulensi utama dan penyebab kematian pada hewan dan
manusia yang terinfeksi. Ketika disuntikkan ke hewan laboratorium (misalnya tikus),
toksin yang mematikan dapat dengan cepat membunuh hewan tersebut. Gen racun
antraks dikodekan pada plasmid lain, pXO1. Mekanisme kerja yang tepat dari kedua
racun tersebut tidak sepenuhnya jelas, tetapi keduanya memiliki efek
imunomodulasi yang kuat.
Bacillus cerius
Keracunan makanan yang disebabkan oleh B
cereus memiliki dua bentuk yang berbeda, tipe
muntah yang diasosiasikan dengan nasi
goreng, dan tipe diare, yang diasosiasikan
dengan hidangan daging dan saus. B cereus
menghasilkan racun yang menyebabkan
penyakit yang lebih merupakan keracunan
daripada infeksi bawaan makanan. Bentuk
muntah dimanifestasikan oleh mual, muntah,
kram perut, dan kadang diare
sembuh sendiri, dengan pemulihan yang terjadi
dalam waktu 24 jam.
JENIS CLOSTRIDIUM
• Gangren gas ( juga dikenal sebagai clostridial.dll

myonecrosis dan myonecrosis)

adalah infeksi bakteri yang menghasilkan gas
jaringan di ganggren .
Bentuk gangren yang mematikan ini
biasanya disebabkan oleh Clostridium
perfringens bakteri. Sekitar 1.000 kasus
gangren gas sedang
dilaporkan tahunan di United
Serikat
• Pada botulisme bayi, madu adalah penyebab paling sering terjadinya infeksi.
Patogenesis berbeda dari cara orang dewasa memperoleh infeksi. Bayi menelan spora C
botulinum (atau C butyricum atau C baratii), dan spora berkecambah di dalam saluran
usus. Sel vegetatif menghasilkan racun saat mereka berkembang biak; racun saraf
kemudian diserap ke dalam aliran darah. Toksin bekerja dengan memblokir pelepasan
asetilkolin di sinapsis dan sambungan neuromuskuler (lihat pembahasan sebelumnya).
Hasilnya adalah kelumpuhan lembek. Hasil uji kekuatan elektromiogram dan
edrofonium adalah tipikal.
Botulinum Toxin dalam penggunaan dermatologi

• Suntikan botoks dikenal terutama karena kemampuannya mengurangi

munculnya kerutan di wajah
Aerobik Non-Pembentuk Spora Gram-Positif
Bacilli: Co
Stafilokokus
The Streptococci, Enterococci
Batang Gram-Negatif Enterik
(Enterobacteriaceae)
• Enterobacteriaceae adalah kelompok batang gram negatif yang besar dan
heterogen yang habitat aslinya adalah saluran usus manusia dan hewan.
Keluarga mencakup banyak genera (Escherichia, Shigella, Salmonella,
Enterobacter, Klebsiella, Serratia, Proteus, dan lain-lain). Beberapa organisme
enterik, seperti Escherichia coli, adalah bagian dari mikrobiota normal dan
secara kebetulan menyebabkan penyakit, tetapi yang lain, salmonella dan
shigellae, secara teratur merupakan patogen bagi manusia. Enterobacteriaceae
adalah anaerob fakultatif atau aerob, memfermentasi berbagai macam
karbohidrat, memiliki struktur antigenik yang kompleks, dan menghasilkan
berbagai racun dan faktor virulensi lainnya.
• Escherichia-E coli biasanya menghasilkan hasil tes positif untuk indol, lisin
dekarboksilase, dan fermentasi manitol dan menghasilkan gas dari
glukosa. Isolat dari urin dapat dengan cepat diidentifikasi sebagai E coli
melalui hemolisisnya pada agar darah, morfologi kolonial khas dengan
“kilau” warna-warni pada media diferensial seperti agar EMB, dan hasil uji
spot indole positif. Lebih dari 90% isolat E coli positif β- glukuronidase
menggunakan substrat 4-methylumbelliferyl-
β- glukuronida (MUG). Isolasi dari situs anatomi selain urin, dengan sifat
karakteristik (di atas ditambah hasil tes oksidase negatif) seringkali
dapat dipastikan sebagai E coli dengan hasil tes MUG positif.
Shigella

Shigellae nonmotile dan biasanya tidak

memfermentasi laktosa tetapi
memfermentasi karbohidrat lain,
memproduksi asam tapi bukan gas.
Mereka tidak menghasilkan H2 S.
Keempat spesies Shigella berkerabat
dekat dengan E. coli. Banyak antigen
yang sama satu sama lain dan dengan
bakteri enterik lain (misalnya, Hafnia
alvei dan Plesiomonas shigelloides).
Bakteriologi 2
Pseudomonads
dan Acinetobacter
Vibrio dan Helicobacter

VIBRIO CHOLERAE Epidemiologi kolera erat kaitannya dengan

pengenalan penularan V cholerae dalam air dan perkembangan
sistem air sanitasi.
Haemophilus
dan Bordetella
Yersinia dan
Pasteurella
 Yersinia pestis
• Gram-negatif, non-motil
• Coccobacillus yang tidak membentuk spora
• Anaerob fakultatif,
tidak terbungkus
• Ukuran genom dsDNA ~ 4,380 ±
http://www.turbosquid.com/3d-models/3d-yersinia-pestisbacteria-bubonic-model/682722
135 kb
• Pewarnaan bipolar (terlihat seperti
peniti)
• Agen penyebab Wabah Hitam
• LD 50 berkisar dari 1 hingga 10 8
tergantung ketegangan
• Patogenisitas terkait dengan
plasmid pCD1, pPCP1, dan
http://en.wikipedia.org/wiki/Wayson_stain pMT1
Kredit: I. Miralda - F2013
 Y. pestis siklus hidup & patogenisitas
• Menggunakan siklus enzootic menggunakan
kutu tikus oriental (X enopsylla cheopis) sebagai
vektor
- Y. pestis mencegah darah masuk ke
perut kutu
- Kolam darah di kerongkongan dan setelah
bercampur dengan bakteri dimuntahkan
ke inang mamalia selama makan
• Bakteri hanya dapat bertahan hidup
jika difagositosis oleh makrofag
- Adhesins dan integrin unik yang digunakan
untuk memblokir produksi
sitokin proinflamasi
- Berkembang biak di dalam & berjalan ke
kelenjar getah bening regional dan menjajah
bagian tubuh lainnya

• 3 Jenis wabah, masing-masing menyerang

sistem yang berbeda dengan penurunan
waktu inkubasi & angka kematian
- Bubonik (limfatik) 2-6 hari
- Pneumonic (pernapasan) 1-7 hari
http://www.ppdictionary.com/bacteria/gnbac/pestis.htm
- Septicaemic (darah) 8 jam-2 hari
http://www18.homepage.villanova.edu/phoebe.lett/Plaguebuboes.jpg
Neisseriae
Infeksi yang Disebabkan oleh Bakteri Anaerob
• Treponema pallidum
• Mikoplasma
• Rickettsia
Mikrobiologi dan Imunologi
apt. Yuni Elsa Hadisaputri, M.B.S., Ph.D

17-19 Maret 2021

Time line
•Perkenalan
•Kesepakatan perkuliahan
•RPS
•Bahan
•Penilaian
RPS
Referensi

Buku Bacaan Wajib (BW)

 Pelczar MJ, Chan ECS, Elements of Microbiology
 Pelczar MJ, Chan ECS, Krieg NR. Microbiology
Concepts and Applications
 Jawetz E, Melnick JL, Adelberg EA, Review of Medical
Microbiology
 Salyers AA, Whitt DD, Bacterial Pathogenesis : A
Molecular Approach
 FUNGI
Peranan, morfologi, reproduksi, fisiologi, klasifikasi serta penyakit
yang disebabkan fungi
Peranan Fungi dalam Kehidupan Manusia
Jamur sangat berperan dalam kehidupan manusia. Di dalam ekosistem jamur dan bakteri berperan sebagai
pengurai (decomposer). Beberapa jenis jamur dapat dimanfaatkan dalam industri makanan dan minuman,
disamping itu jamur ada juga yang dapat menyebabkan penyakit pada tumbuhan, hewan, dan manusia.
Berikut ini beberapa jamur yang menguntungkan dan merugikan dalam kehidupan manusia.

Jamur yang menguntungkan adalah sebagai berikut:

Rhizopus Oryzae, untuk pembuatan tempe
Mucor Javanicus, untuk pembuatan tape.
Saccharomyces cereviceae, untuk pembuatan roti dan minuman alkohol.
Aspergillus oryzae, untuk pembuatan roti
Aspergillus wentii, untuk pembuatan kecap
Penicillum notatum dan penicillum chrysogenum, menghasilkan antibiotik.

Jamur yang merugikan antara lain sebagai berikut:

Aspergillus flavus, menghasilkan racun aflatoksin
Aspergillus fumigates, penyebab penyakit paru-paru pada burung
Exobasidium vexans, parasit pada tanaman teh.
Amanita phalloides, menghasilkan racun balin.
Epidermophyton flocosum, penyebab penyakit kaki atlet.
Kingdom fungi terdiri atas 4 divisi yaitu:

1.Zygomycotina, hipa tidak bersekat, bersifat saprofit

Contoh; Rhizopus oryzae untuk membuat tempe.
2.Ascomycotina, hifa bersekat, berinti banyak
Contoh: Trichoderma resel menghasilkan enzim selulosa untuk
memproduksi protein sel tunggal (PST).
3.Basidiomycotina, hifa bersekat membentuk tubuh buah
(basidiokarp), umumnya makroskopis.
Contoh: Volvariela vilvaceae (jamur merang) dan Amanita
phalloides menghasilkan racun yang mematikan.
4.Deuteromycotina (kelompok jamur yang belum diketahui
cara reproduksi generatifnya) ciri-ciri hifa bersekat, berukuran
mikroskopis. Contohnya: Helmintosporium oryzae, merusak
kecambah dan buah. Ephidermatophyyon flocosum,
menyebabkan penyakit kaki atlet.
Pengertian Fungi atau Jamur

Jamur/fungi adalah organisme eukariotik yang memiliki

dinding sel dan pada umumnya tidak motil. Karakteristik
ini menyerupai tumbuhan namun fungi tidak memiliki
klorofil. Dengan demikian fungi tidak dapat melakukan
fotosintesis menghasilkan bahan organik dari
karbondioksida dan air. Sehingga fungi disebut sebagai
organisme heterotof dan sifat heteretof menyerupai sel
hewan.

Fungi merupakan kingdom yang cukup besar terdiri dari

kurang lebih 50.000 species, dan bisa mempunyai
karakteristik yang berbeda-beda baik secara struktur,
fisiologi, maupun reproduksinya. Fungi dapat ditemukan
dalam bentuk kapang pada permukaan sayuran busuk,
sebagai ragi pada roti, mauun sebagai cendawan (jamur
berukuran besar yang tumbuh ditanah atau pada kayu-
kayu lapuk). Jadi fungi mempunyai berbagai penampilan
tergantung dari spesiesnya.
 Fisiologi Jamur

Fungi memiliki ciri-ciri sebagai berikut:

•Berupa benang tunggal/bercabang

(hifa). Kumpulan hifa disebut sebagai
miselium.
•Mempunyai spora
•Memproduksi spora
•Tidak memiliki klorofil, sehingga tidak
berfotosintesis
•Berkembang biak secara seksual dan
aseksual
•Tubuh berfilamen dan dinding sel
mengandung khitin, glukan, selulosa, dan
mannan
Reproduksi secara aseksual dan seksual

•Reproduksi secara aseksual dengan

pembentukan kuncup (pada khamir),
fragmentasi, dan pembentukan spora
aseksual (berupa sporangiospora atau
konidia).

•Reproduksi secara seksual dengan

konjugasi dan pembentukan spora seksual (
berupa zigospora, askospora, dan
basidiospora).
Spora aseksual, yang berfungsi untuk menyebarkan
spesies dibentuk dalam jumlah besar. Ada banyak macam
spora aseksual, yaitu:
1.Konidiospora atau konidium.
Konidium yang kecil dan bersel satu disebut
mikrokonidium. Konidium dibentuk di ujung atau di sisi
sutu hifa.
2.Sporangiospora. Spora bersel satu ini terbentuk di
dalam kantung yang disebut sporangium di ujung hifa
khusus.
3.Oidium tau artrospora. Spora bersel satu ini terbentuk
karena terputusnya sel-sel hifa.
4.Klamidospora. Spora bersel satu yang berdinding tebal
ini sangat resisten terhadap keadaan yang buruk,
terbentuk dari sel-sel hifa somatik.
5.Blastospora. Tunas atau kuncup pada sel-sel khamir
disebut blastospora.
Ada beberapa tipe spora seksual, yaitu:
1.Askospora
Spora bersel satu ini terbentuk didalam pundi atau
kantung yang dinamakan askus. Biasanya terdapat
delapan askospora di dalam setiap askus.
2.Basidiospora
Spora bersel satu ini terbentuk di atas struktur berbentuk
gada yang dinamakan basidium.
3.Zigospora.
Zigospora adalah spora besar berdindiing tebal yang
terbentuk apabila ujung-ujung dua hifa yang secara
seksual serasi, disebut juga gametangia.
4.Oospora
Oospora terbentuk didalam struktur betina khusus yang
disebut ooginium. Pembuahan telur, oosfer, oleh gamet
jantan yang terbentuk di dalam anteredium menghasilkan
oospora.
Spora aseksual dan seksual dapat dikitari oleh struktur
pelindung yang sangat terorganisasi yang disebut tubuh
buah. Tubuh buah aseksual diantaranya ialah aservulus
dan piknidium. Tubuh buah seksual yang umum disebut
peritesium dan apotesium.
Cara Hidup Jamur

Parasit obligat
Merupakan sifat jamur yang hanya dapat hidup pada
inangnya, sedangkan di luar inangnya tidak dapat hidup.
Misalnya, Pneumonia carinii (khamir yang menginfeksi
paru-paru penderita AIDS).
Parasit fakultatif
Adalah jamur yang bersifat parasit jika mendapatkan
inang yang sesuai, tetapi bersifat saprofit jika tidak
mendapatkan inang yang cocok.

Saprofit
Merupakan jamur pelapuk dan pengubah susunan zat
organik yang mati. Jamur saprofit menyerap makanannya
dari organisme yang telah mati seperti kayu tumbang dan
buah jatuh. Sebagian besar jamur saprofit mengeluarkan
enzim hidrolase pada substrat makanan untuk
mendekomposisi molekul kompleks menjadi molekul
sederhana sehingga mudah diserap oleh hifa.
Penyebab Infeksi Jamur
Penyebab infeksi jamur atau mikosis tergantung kepada jenis infeksi itu sendiri. Di bawah ini akan dijelaskan
beberapa jenis infeksi jamur, penyebabnya, serta faktor risiko yang menyertainya.
Candidiasis
Candidiasis disebabkan oleh infeksi jamur Candida. Pada kondisi normal, jamur tersebut hidup secara alami di
permukaan kulit. Namun bila perkembangannya tidak terkendali, jamur tersebut akan menyebabkan infeksi. Salah
satu penyebab tumbuh suburnya jamur ini adalah efek samping antibiotik.
Perkembangan jamur Candida yang tidak terkendali dapat dipicu oleh sejumlah hal, antara lain kurangnya
kebersihan diri, mengenakan pakaian ketat, iklim yang hangat, serta kondisi kulit yang lembap atau tidak
dikeringkan dengan benar.
Infeksi Candida auris
Seperti namanya, infeksi ini disebabkan oleh jamur Candida auris. Berbeda dari jamur Candida lain, Candida
auris kebal terhadap obat anti jamur yang biasa digunakan untuk mengobati candidiasis. Di samping itu, jenis
jamur ini juga dapat menyebabkan kematian pada sebagian besar penderitanya.
Candida auris menyebar dari orang ke orang, melalui pemakaian bersama pada peralatan yang terkontaminasi.
Kurap
Kurap disebabkan oleh jenis jamur yang hidup di tanah, yaitu epidermophyton, microsporum, dan trichophyton.
Seseorang bisa terinfeksi bila menyentuh tanah yang terkontaminasi jamur tersebut. Penyebaran dapat terjadi
antara hewan ke manusia, atau dari manusia ke manusia.
Pneumocystis pneumonia (PCP)
PCP disebabkan oleh jamur Pneumocystis jirovecii, yang menyebar melalui udara. PCP menyerang individu
dengan sistem kekebalan tubuh lemah, seperti penderita HIV/AIDS, atau pada pasien pasca menjalani
transplantasi organ dan obat imunosupresif.
Penyebab Infeksi Jamur (lanjutan 1)

Infeksi jamur kuku

Infeksi jamur kuku terjadi ketika terdapat jamur di kuku yang tumbuh tidak terkendali. Jenis jamur penyebab infeksi
jamur kuku sama dengan jamur penyebab kurap. Infeksi jamur ini juga bisa terjadi pada tangan (tinea manum).
Meskipun dapat terjadi pada siapa saja, risiko infeksi jamur kuku lebih tinggi pada penderita diabetes, lansia di atas
65 tahun, pengguna kuku palsu, orang yang mengalami cedera kuku, dan individu dengan kekebalan tubuh lemah.
Aspergillosis
Aspergillosis disebabkan oleh perpaduan antara sistem kekebalan tubuh yang lemah dan paparan
jamur Aspergillus. Jamur ini dapat ditemukan di tumpukan kompos, tumpukan gandum, dan sayuran yang
membusuk.
Selain pada individu dengan sistem kekebalan tubuh lemah (misalnya kondisi sel darah putih rendah atau sedang
mengonsumsi obat kortikosteroid), risiko aspergillosis lebih tinggi pada penderita asma atau cystic fibrosis.
Infeksi jamur mata
Infeksi jamur mata adalah kondisi yang jarang, namun tergolong serius. Infeksi jamur mata paling sering
disebabkan oleh jamur Fusarium yang hidup di pohon atau tanaman. Jamur Fusarium bisa masuk ke mata bila
mata tidak sengaja tergores bagian tanaman tersebut.
Selain akibat cedera mata, infeksi jamur mata dapat terjadi pada pasien yang menjalani operasi katarak atau
transplantasi kornea. Pada kasus yang jarang, infeksi jamur mata juga terjadi akibat penggunaan obat tetes mata
atau cairan pembersih lensa kontak yang sudah terkontaminasi, serta pengobatan dengan suntikan kortikosteroid
pada mata.
Penyebab Infeksi Jamur (lanjutan 2)

Histoplasmosis
Histoplasmosis disebabkan oleh jamur Histoplasma. Jamur ini dapat ditemukan di tanah yang terpapar kotoran
burung atau kelelawar. Infeksi terjadi ketika spora jamur di tanah terhirup dan masuk ke saluran pernapasan.
Setiap orang dapat terjangkit histoplasmosis. Akan tetapi, infeksi ini lebih rentan terjadi pada petani, peternak,
penjelajah gua, pekerja konstruksi, dan petugas pengendali hama.
Mucormycosis
Mucormycosis terjadi akibat menghirup spora jamur golongan Mucorales secara tidak sengaja. Infeksi juga
dapat terjadi bila luka terbuka di kulit terpapar jamur ini.
Jamur Mucorales bisa ditemukan di daun, kayu, tanah, atau di tumpukan kompos. Namun walaupun jamur ini
terdapat di alam, bukan berarti infeksi pasti terjadi pada setiap orang yang terpapar spora jamur. Infeksi lebih
berisiko terjadi pada orang dengan sistem kekebalan tubuh lemah, seperti penderita kanker dan diabetes.
Sporotrichosis
Sporotrichosis disebabkan oleh jamur Sporothrix yang banyak ditemukan di tanah atau tanaman. Infeksi terjadi
ketika spora jamur masuk ke tubuh melalui sentuhan, terutama melalui luka terbuka di kulit. Meskipun sangat
jarang, infeksi juga dapat terjadi bila menghirup spora jamur secara tidak sengaja.
Beberapa orang dengan jenis pekerjaan tertentu lebih berisiko terserang infeksi sporotrichosis, misalnya tukang
kebun, petani, dan pasien yang sedang menjalani terapi imunosupresif.
Talaromycosis
Talaromycosis disebabkan oleh jamur Talaromyces marneffei. Sama seperti beberapa jenis infeksi jamur
lain, talaromycosis umumnya menyerang orang dengan sistem kekebalan tubuh lemah.
Pengobatan Infeksi Jamur
Metode pengobatan infeksi jamur tergantung kepada jenis
infeksi, tingkat keparahan, dan bagian tubuh yang
terinfeksi. Pada umumnya, pasien akan diberikan obat
antijamur.
Obat antijamur yang digunakan untuk infeksi jamur sangat
beragam. Bentuk dan dosis obat, serta durasi pengobatan
berbeda-beda, terutama pada ibu hamil dan anak-anak.
Pada beberapa kasus, obat antijamur harus diberikan di
rumah sakit. Sebaiknya konsultasi terlebih dahulu ke
dokter sebelum menggunakan obat ini.
Obat antijamur yang dapat digunakan, antara lain:
•Amphotericin
•Clotrimazole
•Griseofulvin
•Itraconazole
•Ketoconazole
•Miconazole
•Natamycin
•Nystatin
•Terbinafine
•Tioconazole
•Voriconazole
The End

Question?