MODUL INSTALASI DAN RUNNING WRFDA PADA HPC

A. INSTALASI WRFDA DAN RUNNING OBSPROC 3DVAR

Dalam instalasi WRFDA pada High Processing Computer, dilakukan dengan menjalankan
langkah-langkah sebagai berikut :
1. Login pada HPC dengan username yang telah diberikan. Pastikan komputer yang digunakan
telah terhubung atau memiliki koneksi internet. Untuk login pada HPC dilakukan dengan
command berikut
• ssh -p 1234 stmkg-7b@182.16.251.51
kemudian masukan password. Jika berhasil login, maka akan muncul tampilan sebagai
berikut.

Gambar 1. Login pada High Processing Computer (HPC)

2. Kemudian membuat folder sesuai user masing masing dengan command :

mkdir (nama user)
pada sesi kali ini, penulis membuat dengan nama dzq. Sehingga command yang digunakan
adalah
• mkdir dzq
kemudian membuat folder WRFDA pada folder masing-masing user
• mkdir WRFDA_Dzaki
untuk langkah selanjutnya membuat folder obsproc_3dvar
• mkdir obsproc_3dvar
sehingga pada folder WRFDA masing-masing user akan terdapat folder obsproc_3dvar

Gambar 2. Membuat folder pada masing-masing user

3. Langkah selanjutnya adalah mencopy beberapa file dari folder admin HPC yang digunakan
untuk proses instalasi. Langkah ini dilakukan dengan command :

• cp /opt/ohpc/pub/SHARED/wido
wrf2_data/ob/2008020512/2008020512.obs .
• ln –sf /opt/ohpc/pub/model/WRFDA/var/obsproc/obserr.txt .
• cp
/opt/ohpc/pub/model/WRFDA/var/obsproc/namelist.obsproc.3dva
r.wrfvar-tut \ ./namelist.obsproc

Sehingga isi folder obsproc_3dvar sebagai berikut :

Gambar 3. Tampilan isi folder obsproc_3dvar

4. Langkah selanjutnya adalah mengedit file namelist.obsproc dengan command :
• nano namelist.obsproc

edit sesuai screenshot berikut

Gambar 4. Tampilan isi namelist.obsproc

Gambar
5. Kemudian link file obsproc.exe pada folder admin HPC dengan command :
• ln -sf /opt/ohpc/pub/model/WRFDA/var/obsproc/obsproc.exe .

6. Langkah selanjutnya adalah menjalankan file ./obsproc.exe dengan command :

• ./obsproc.exe
• cp
/opt/ohpc/pub/SHARED/TOOLS/var/graphics/ncl/plot_ob_ascii_l
oc.ncl .
• ml load ncl-6.6.2-gcc-8.5.0-ec4q3dc
• ncl plot_ob_ascii_loc.ncl

7. Untuk menampilkan output berupa diagram Hovmoler, dapat dilakukan dengan command
• ml load nco-5.0.1-gcc-8.5.0-2rfcrw3
• ncdiff wrfvar_output fg increment.nc
• cp /opt/ohpc/pub/SHARED/TOOLS/var/graphics/ncl/WRF-
Var_plot.ncl .
• cp
/opt/ohpc/pub/SHARED/TOOLS/var/graphics/ncl/WRF_contributed
.ncl.test .
• WRF-Var_plot.ncl

B. RUNNING OBSPROC 4D_VAR

Dalam running obsproc_4dvar pada High Processing Computer, dilakukan dengan
menjalankan langkah-langkah sebagai berikut :
1. Membuat folder obsproc_4dvar pada folder WRFDA masing-masing user dengan command
• mkdir obsproc_4dvar
2. Mengcopy dan men-link beberapa file pada direktori admin HPC untuk proses running
obsproc_4dvar
• cp /opt/ohpc/pub/SHARED/wido-
wrf2_data/ob/2008020512/2008020512.obs .
• ln –sf /opt/ohpc/pub/model/WRFDA/var/obsproc/obserr.txt .
Sehingga folder obsproc_4dvar akan memiliki isi sebagai berikut :
 Gambar 7. Isi folder obsproc_4dvar
3. Kemudian mengcopy dan mengedit file namelist.obsroc.4dvar dengan command
• cp
/opt/ohpc/pub/model/WRFDA/var/obsproc/namelist.obsproc.4dva
r.wrfvar-tut \ ./namelist.obsproc
• nano namelist.obsproc

Edit sesuai screenshot berikut :

Gambar 5. Isi namelist.obsproc_4dvar

 4. Kemudian link file obsproc,exe dan copy file plot_ob_ascii_loc.ncl pada direktori admin
HPC dengan command
• ln -sf /opt/ohpc/pub/model/WRFDA/var/obsproc/obsproc.exe
.
• cp
/opt/ohpc/pub/SHARED/TOOLS/var/graphics/ncl/plot_ob_ascii
_loc.ncl .
5. Kemudian jalankan file tersebut dengan command
• ml load ncl-6.6.2-gcc-8.5.0-ec4q3dc
• ncl plot_ob_ascii_loc.ncl

Jika berhasil maka akan menampikan

Gambar 6. Obsproc_4dvar
C. RUNNING WRF-DA 3DVAR
Untuk menjalankan WRF-DA 3DVAR, dilakukan dengan langkah-langkah berikut :
1. Membuat direktori folder 3dvar pada direktori masing-masing user
• mkdir 3dvar

2. Kemudian men-copy dan men-link beberapa file untuk proses running di HPC pada direktori
admin HPC dengan command
• cp /opt/ohpc/pub/SHARED/wido-wrf2_data/namelist.input.3dvar
\ ./namelist.input
• ln -sf /opt/ohpc/pub/model/WRFDA/run/LANDUSE.TBL .
 • ln -sf /home/{direktori
user}/WRFDA/obsproc_3dvar/obs_gts_2008-02-05_12:00:00.3DVAR
\ ./ob.ascii
• ln -sf /opt/ohpc/pub/SHARED/wido-wrf2_data/be/be.dat .
• cp /opt/ohpc/pub/SHARED/wido-
wrf2_data/rc/2008020512/wrfinput_d01 ./fg

3. Kemudian edit job_example.sh untuk mengatur nodes dan job name pada HPC

Gambar 7. Mengedit job_example.sh

4. Langkah selanjutnya adalah merunning job yang telah diatur pada HPC dengan command
• sbatch job_example.sh

5. Kemudian untuk menvisualisasi output yang telah di running pada job_example.sh

dilakukan dengan command
• ml load nco-5.0.1-gcc-8.5.0-2rfcrw3
• ncdiff wrfvar_output fg increment.nc
• cp /opt/ohpc/pub/SHARED/TOOLS/var/graphics/ncl/WRF-
Var_plot.ncl .
• cp
/opt/ohpc/pub/SHARED/TOOLS/var/graphics/ncl/WRF_contributed
.ncl.test .
• ncl WRF-Var_plot.ncl
• gs WRF-VAR_U_level_18.pdf
 Sehingga ouput dari proses running adalah sebagai berikut

Gambar 8. Output Running WRFDA_3dVar

Sehingga output dari proses running WRFDA metode 3DVAR ini adalah sebagai berikut. Dan
jika output yang keluar seperti gambar dibawah maka proses running WRFDA dengan metode
3DVAR dinyatakan berhasil.

============================== SELESAI =============================