translasi

Alur Genetika
 tRNA
Mengkopi Bagian Spesifik dari DNA
Site Amino acid spesifik
Anticodon
Terlibat dalam translasi (sintesis Protein)
 rRNA
Ribosom tersusun atas dua subunit
prokariot : 70S = sub unit 50S + 30S
eukariot : 80S = sub unit 60S + 40S
Tiap subunit terdiri dari rRNA dan protein
Terlibat dalam translasi
Karakteristik Struktural tRNA dan mRNA.
 KODON

Kode Triplet yang spesifik untuk

membentuk asam amino
Terdapat pd mRNA
20 asam amino
Start kodon dan Stop kodon
 Copyright The McGraw-Hill Companies, Inc. Permission required for reproduction or display.

Second Base Position

U C A G
UUU
UUC } Phenylalanine
UCU
UCC
Serine
UAU
UAC
} Tyrosine
UGU
UGC } Cysteine
U
C
U
UUA
UUG } Leucine
UCA
UCG
UAA
UAG
} STOP**
UGA
UGG
STOP**
Tryptophan
A
G
CUU CCU CAU
} Histidine
CGU U
First Base Position

CUC CCC CAC CGC C

Third Base Position

C Leucine Proline Arginine
CUA
CUG
CCA
CCG
CAA
CAG } Glutamine
CGA
CGG
A
G
AUU
AUC
Isoleucine
ACU
ACC
AAU
AAC } Asparagine
AGU
AGC } Serine
U
C
A Threonine
AUA
AUG STARTfMethionine*
ACA
ACG
AAA
AAG } Lysine
AGA
AGG } Arginine
A
G

G
GUU
GUC
Valine
GCU
GCC
Alanine
GAU
GAC } Aspartic acid
GGU
GGC
Glycine
U
C
GUA
GUG
GCA
GCG
GAA
GAG } Glutamic acid
GGA
GGG
A
G

* This codon initiates translation.

**For these codons, which give the orders to stop translation, there are no corresponding tRNAs and no amino acids.
Gambaran Kodon dan pasangannya yang membawa asam amino
 Sintesis PROTEIN
(translasi)

Beberapa faktor yang terlibat dalam sintesis

protein
mRNA : kodon
tRNA : site asam amino dan site anti kodon
Ribosom : site P & site A, large & small unit
Interaksi ribosom, tRNA dan mRNA
 Copyright The McGraw-Hill Companies, Inc. Permission required for reproduction or display.

Interaksi kodon - anti kodon

Leucine

fMet 2

1
A
P
E 2
1

G AC G
Anticodon U AC CUG C CG
A UG
mRNA

Codon
UAG

(a) Entrance of tRNAs 1 and 2

INTERAKSI ANTARA KODON DENGAN ANTI KODON
Ketepatan sintesis protein ditentukan oleh dua system :
1. system ketepatan muatan asam amino pada tRNA
2. pasangan kodon-antikodon

Pasangan kodon-antikodon.
- 61 dari 64 kodon mengkode 20 asam amino, sehingga diharapkan ada 61
tRNA yang berbeda.
- Faktanya tRNAAla dari Yeast (ragi) dapat berpasangan dengan 3 dari 4
kodon alanin (GCX) yaitu :
-GCU
O
-GCC
-GCA C N
Antikodon tRNAAla tersebut adalah : 5-IGC- 3 H- N C
C-H
I = inosin adalah nukleosida ribosil hipoksantin
H- C C
N N
I dapat berpasangan U,C,A dengan ikatan hydrogen
tetapi tidak sekuat tipe Watson-Crick. Ribosa
Tidak ada antikodon yg dimulai dg 5A.
Setiap A muncul pd posisi pertama dr tRNA baru hasil transkripsi, A akan di-
deaminasi mjd hipoksantin (basa dr inosin).
HIPOTESIS WOBBLE (bergoyang)
Hampir semua kodon menunjukkan bhw basa ke-3 tidak penting
Francis Crick (1965) mengusulkan hipotesis wobble meliputi :
- respon bbrp tRNA thd bbrp kodon
- pola redundancy (kelebihan) sbg respon dari satu antikodon untuk bbrp
kodon
Dalam interaksi kodon-antikodon, standar pasangan tdk spt pd double helix.
Posisi basa ke-3 dari kodon bermain dlm struktur (permainan ini disebut
wobble = goyangan), memberi peluang tjd pasangan basa yg tdk standar.

Tabel pasangan wobble

Basa ke-3 Basa ke-1 Basa ke-1
kodon antikodon antikodon
A U I
G C U
U G I
C G I
Tahapan Sebelum Translasi (Preinisiasi):

: reaksi esterifikasi antara asam amino dg tRNA

Asam amino
tRNA

Aminoasil tRNA
 Tahapan TRANSLASI
Inisiasi :
Ribosom sub unit kecil akan menempel pada
mRNA dekat dengan start codon (cth. AUG)
Antikodon tRNA yang mengikat asam amino
pertama (inisiator) akan menempel pada start
codon
Ribosom sub unit besar bergabung mbtk
kompleks inisiasi
 Tahapan TRANSLASI
Elongasi :
Ribosom akan bergerak ke kodon berikutnya
(Translokasi), diikuti dengan tRNA (antikodon)
baru yang melekat pada kodon tersebut dan
menambahkan asam amino tersebut dengan
asam amino sebelumnya
Ikatan asam amino yang terbentuk merupakan
ikatan peptida atau protein oleh enzim peptidil
transferase
Peptidil
transferase
 Tahapan TRANSLASI
Terminasi :
Stop codon menghentikan proses translasi
Protein lepas dr mesin sintesis
Ribosom lepas dr mRNA & terdisosiasi kembali
Proses Translasi.
Animasi protein synthesis
Beberapa cara modifikasi :
1.a. Prokariot
modifikasi f-met pada NH2 terminal asam amino yaitu
gugus formil dibuang dg enzim deformilase :
f-met metionin
b. Prokariot atau eukariot
f-met, met dan bbrp as. amino dibuang
enz amino peptidase
deformilasi
Proses f-met met,
terjadi bila as amino kedua : Arginin, Asparagin, as.Aspartat,
as.Glutamat, Isoleusin dan Lisin
Proses f-met hilang (dibuang),
terjadi bila AA kedua : Alanin, Glisin, Prolin, Threonin, Valin
2. NH2-terminal as.amino yg baru terbentuk
kadang mengalami asetilasi
3. Beberapa as. amino dimodifikasi
kolagen: prolin dan lisin hidroksilasi
bbrp organisme : serin,tirosin, treonin
fosforilasi pd gugus OH
sering OH-bebas dari serin dan treonin
berikatan dg gula membentuk glikoprotein
4. Dua gugus sulfhidril (-SH) yg jauh pada 2 sistein
mengalami oksidasi membentuk ikatan
disulfida
 TRANSKRIPSI DAN TRANSLASI
PADA EUKARYOTA
Mirip dengan Prokariot, kecuali :
AUG mengkode methionin dengan bentuk yang
berbeda
mRNA hanya mengkode satu protein (monosistronik)
Transkripsi dan translasi tidak terjadi secara simultan
Sebelum mRNA terbentuk terlebih dahulu berupa Pre-
mRNA yg terdiri dari :
Introns (urutan RNA yang bukan merupakan penyandi genetik)
Exons
Untuk membentuk mRNA dari Pre-mRNA terjadi
Splicing (penghilangan intron).
Eukaryota vs Prokariot
 Animasi

processing of gene information

procaryotes and eucaryotes
 PENGHAMBAT SINTESIS
PROTEIN OLEH ANTIBIOTIK
Rifampisin : mengikat pada enzim
polimerase RNA bakteri dan
menghambat mRNA
Eritromisin dan Azitromisin : mengikat
pada ribosome bakteri, dan
menghambat pelekatan pada mRNA.
Tetrasiklin : mengikat pada ribosome
bakteri, dan menghambat translasi
mRNA