ASALAMULAIKUM

STUDI IN SILICO SENYAWA TURUNAN PIGMEN Monascus sp.

SEBAGAI KANDIDAT ANTIKARDIOVASKULAR
 

RIKY RAHMATULLOH
31115159

Dr Hj Anna yuliana, M.si Nur Laili Dwi Hidayati, M. si

 Latar belakang

Kardiovaskular Monscus sp.

Sistem kardiovaskular adalah salah satu sistem yang penting dalam Monascus sp. merupakan kapang yang digunakan
tubuh karena tidak ada sel dan jaringan yang dapat berfungsi dengan untuk fermentasi beras sehingga dihasilkan beras
baik tanpa adanya oksigen dan pasokan darah yang cukup merah (Red Mold Rice) atau angkak

Studi in silico
Metode toksikologi in silico mampu memberikan gambaran informasi
terkait toksisitas suatu senyawa serta membantu mengindentifikasi
toksisitas senyawa agar dapat dilakukan pemilihan calon senyawa
untuk dikembangkan menjadi kandidat obat baru
 Rumusan masalah
01 Berdasarkan latar belakang diatas, dalam penelitian ini akan dirumuskan masalah
sebagai berikut : apakah dengan hasil studi in silico senyawa turunan pigmen dari
Monascus sp dapat dihasilkan senyawa yang potensial sebagai kandidat
Antikardiovaskular?

Tujuan penelitian
02 Tujuan
. dari penilitian ini adalah untuk memprediksi senyawa turunan pigmen
dari Monascus sp. yang paling berpotensi sebagai kandidat antikardiovaskular
berdasarkan pengujian secara in silico

Hipotesis penelitian
03 Terdapat senyawa turunan pigmen yang berpotensi sebagai antikardiovaskular
dari Monascus sp. berdasarkan pengujian secara in sillico
 TINJAUAN PUSTAKA

Monascus sp.
Klasifikasi
Definisi
Pigmen Kardiovaslular
- Definisi
- Etiologi
Interakasi obat dengan reseptor - Faktor resiko penyakit jantung
- Diagnosis
Obat akan menghasilkan efek apabila berikatan dengan reseptor,untuk
.
melihat interaksi obat dengan reseptor dapat dilakukan studi in silico
dengan metode molecular docking
Studi in silico

Software dan web server untuk studi

in silico
- Marvin sketch
- PharmMapper
- Pdbsum
- Autodock
- PreADMET
 METODE PENELITIAN
Alat dan Bahan
- Alat
Adapun peralatan yang digunakan berupa perangkat keras
dan lunak komputer. Perangkat tersebut berupa personal computer
dengan spesifikasi 4,96 GB RAM Operating System dan
perangkat lunak yang digunakan adalah, MarvinSketch,Autodoc,
Molegro Molecul Viewer, dan program yang berbasis web seperti,
PdbSum, PreADMET
- Bahan
Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah PDB file
hasil identifikasi reseptor yang di unduh dari http://www.org dan
senyawa 6 senyawa zat warna induk beserta 57 senyawa zat
warna hasil isolasi turunan azhapilone dari kapang Monascus sp
 Prosedur Penelitian
Preparasi reseptor
Reseptor yang digunakan diunduh secara
Preparasi ligan online dari www.rscb.org kemudian
Ligan digambar dengan
menggunakan software chemdrow
4 dilakukan preparasi yaitu pemisahasan dari
ligan alami nya dan dilakukan penghilangan
di copy ke MarvinSketch, molekul air dan penambahan hidrogen
kemudian dilakukan optimasi
geometri dan protonasi pada ph 7,4 1 5 Validasi metode docking
Metode docking dikatakan valid
Drug scan jika nilai RMSD ≤2
Analiasis pengamatan obat dilakukan
dengan mempertimbangkan aturan obat
yang baik (lipinski’s rule of five) dan
bioavailabilitas oral dari ligan.
2 6
Docking ligan uji dan visualisasi interaksi

3
terhadap protein target
Studi ADEM
Docking dilakukan dengan software
Dilakukan secara online melalui situs
autodock lalu dilakukan pengaturan grid
http//preadmet.bmdrc.org. parameter ADME
box yang sama pada proses validasi.
caco-2sel,%HIA,Plasma Protein Binding.
Hasil docking kemudian dipilih hasil
yang memiliki nilai binding afinity yang
paling rendah. Discover studio
 Jadwal penelitian
Tempat penelitian dilakukan di lab Mikrobiologi STIKes Bakti Tunas Husada
 DAFTAR PUSTAKA
• Aisyah, I. 2015. Hubungan Penggunaan Obat Kardiovaskular Terhadap Terjadinya Xerostomia Pada
Pasien Penyakit Jantung Koroner Di RSUD Dr. Pirngadi Medan.[Skripsi] Fakultas Kedokteran Gigi
Universitas Sumatera Utara, Medan
• Bhattacharjee, Biplab., Sandhya Vijayasarathy, Prashanta Karunakar, jhinukchatterjee. 2012. Comparative
Reverse Screening Approach to Identify Potential Antineoplastic Target of Safron Functional Components
and Binding Mode. Reseach Article. Asian Pasific J Cancer Prev, 13 (11), 5605-5611.
• Biomed, Syamsudin M. 2014 Farmakologi Molekulr. Jakarta: EGC
• Block JH., Beale JM. 2012. Wilson Dan Gisvold: Buku Ajar Kimia Medisinal Organik Dan Kimia Farmasi.
Edisi 11. Jakarta: EGC.
• DBM, Virupakshaiah, et al. 2014 In silico designing of methicillin antibiotic analog for the treatment of
staphylococcus aureus. Journal Of Advanced Bioinformatic Aplication And Research Issn 0976-2604.
Online ISSN 2278-6007 Vol 5, Issue, 2014, pp33-36
• Irianto Koes.2015. Ilmu Kesehatan Masyarakat. Jakarta.Hal : 216-220.
• Katrasasmitha R.E., Anugrah R., dan Tjahjono H.D. 2015. Kajian docking dan prediksi beberapa aspek
farmakokinetika desain molekul turunan kuinin sebagai upaya menemukan kandidat senyawa antimalaria
yang baru. Kartka Jurnal Ilmiah Farmasi, Jun 2015, 3 (1), 13-20 ISSN 2354-6565.
• Knox C, Law, Jewison T., Liu, Son Ly, Frolkis A., Alison P., banco K., Mak C., Neveu V., Djounbou Y.,
Eisner R., Guo, David S. 2011. Drugbank 3.0: A comprehensive resource for ‘omics’ research on drug.
Nucleic Acid Research 39 (Database Issue): D1035-41.
• Levita J., dan Mustarichie R. 2012. Pemodelan Molekul Dalam Kimia Medisinal. Edisi 1. Yogyakarta: graha
ilmu. Hal 65.
• Lipinski, C.A, Franco Lombardo, Beryl W.D, Paul J.F. 2001. Experimental and computational approaches
to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings. Central Research
Division, Pfizer Inc., Groton, CT 06340, USA.
• M, Eman Mostafa., and M. Salad Abbady. 2014. Secondary Metabolites and Bioactivity of the Monascus
Pigments Review Article. Assiut University, Mesir
• Muhamad Jyuldi Prayoga Dan Agustias Tjiptraningrum.2016. Pengaruh pemberian angkak (Beras
fermentasi Monascus purpureus) dalam meningkatkan kadar trombosit pada penderita ]Demam Berdarah
Dengue Majority. Fakultas Kedokteran Universitas Lampung
TERIMAKASIH
Preparasi ligan
Drug scan
Studi ADMET
Preparasi Reseptor
 Validasi metode Docking

Validasi metode docking

Docking ligan uji dan visualisasi interaksi terhadap protein target
Kenapa tidak langsung dilakukan
farmakologi? Kenpa harus studi in silico?
Untuk menghemat waktu dan meminimalisir
biaya
Apasih yang akan kamu peroleh dari studi
in silico? Binding ifinity itu apa?
Ikatan energi bebas,semakin rendah ikatan
energi bebas maka akan semakin mudah
senyawa berikatan dengan resptor.
Perbedaan parameter lipinski

Optimasi geometri= dicari energi yang

paling rendah
Sitotosik dan toksisitas?

Ciri turunan azapilon?

Kelompok jamur poliketida
seberapa berfokus kepada pigmen
monascus sp?

Klasifikasi?