Sintesis

Protein
BIOKIMIA IBD

I D A B E TA N U R S A N T I

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 1

An Nisa 23
“Diharamkan atas kamu (mengawini) ibu-ibumu; anak-anakmu yang wanita;
saudara-saudaramu yang wanita, saudara-saudara bapakmu yang wanita; saudara-
saudara ibumu yang wanita; anak-anak wanita dari saudara-saudaramu yang laki-
laki; anak-anak wanita dari saudara-saudaramu yang wanita; ibu-ibumu yang
menyusui kamu; saudara wanita sepersusuan; ibu-ibu istrimu (mertua); anak-anak
istrimu yang dalam pemeliharaanmu dari istri yang telah kamu campuri, tetapi jika
kamu belum campur dengan istrimu itu (dan sudah kamu ceraikan), maka tidak
berdosa kamu mengawininya; (dan diharamkan bagimu) istri-istri anak kandungmu
(menantu); dan menghimpunkan (dalam perkawinan) dua wanita yang bersaudara,
kecuali yang telah terjadi pada masa lampau; sesungguhnya Allah Maha
Pengampun lagi Maha Penyayang” (an-Nisaa’ :23)

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 2

Sintesis protein

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 3

 APAKAH ITU SINTESIS PROTEIN?
Pada kromosom sel terdiri dari protein histon & nukleo protein
Dari nukleo protein akan disusun DNA & RNA
Proses penyusunan DNA & RNA ini yang disebut sintesis
protein

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 4

 MATERI SINTESIS
Bahan : 20 macam asam amino dalam sitoplasma
Pendesain : DNA
Pelaksana : RNA ( mRNA, rRNA, tRNA)
Sumber energi : ATP
Katalisator : RNA polimerase

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 5

 KODE GENETIK
Terdapat di m-RNA
Mengkode spesifisitas asam amino penyusun protein
Terdiri dari 3 nukleotida (triplet)  kodon
Total ada 64 kodon
3 kodon (UAA, UAG, UGA) : kodon terminasi
Hampir universal
Akan dikenal oleh antikodon pada t-RNA

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 6

 JENIS RNA
m-RNA  messenger RNA : berisi kodon-kodon asam amino yang
akan dirangkai
t-RNA  transfer RNA : memiliki bagian anti kodon yang
berpasangan dengan kodon asam amino yang dibawa.
Bertugas membawa asam amino yang akan dirangkai
r-RNA  ribosomal RNA : komponen ribosom

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 7

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 8
 Pembentukan asam nukleat
RNA
ATP, UTP, GTP, CTP
RNA polimerase

RNA

DNA
dATP, dTTP, dGTP, dCTP
DNA polimerase

DNA
SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 9
DNA RNA

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 10

 DNA RNA
Terdiri dari 2 utas rantai Terdiri dari 1 utas rantai
polinukleotida yang polinukleotida
membentuk struktur double-
helix

5’ 3’

A T G C

T A C G
3’ 5’

antiparalel
SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 11
 DNA RNA
2 utas  double helix Terdiri dari 1 utas rantai
A T G C polinukleotida
A U G C
pur pir pur pir
pur pir pur pir

Rantai lebih panjang Rantai lebih pendek

Deoksiribosa Ribosa.

Ikatan Hidrogen
A T

G C
Hukum berpasangan
SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 12
SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 13
TAHAPAN SINTESIS PROTEIN

REPLIKASI
TRANSKRIPSI
TRANSLASI

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 14

 TAHAPAN SINTESIS PROTEIN
REPLIKASI : penggandaan dan pembuatan duplikat rantai DNA
TRANSKRIPSI : pencetakan oleh m-RNA pada template DNA/rantai DNA
terjadi dalam nukleus
TRANSLASI : penerjemahan kode genetik yang dibawa oleh m-RNA di dalam
ribosom oleh t-RNA dengan jenis asam aminositoplasma yang sesuai dengan
kode triplet pada m-RNA sehingga membentuk rantai polipeptida/protein

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 15

Replikasi
TAHAP AWAL SINTESIS PROTEIN

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 16

 Replikasi
Materi genetis : perlu diketahui untuk melihat pewarisan sifat
Replikasi materi genetis : perlu diketahui untuk mengetahui cara
materi tersebut diperbanyak dan diwariskan dari satu sel ke sel
berikutnya dan dari satu generasi ke generasi baru makhluk hidup
Bagaimana materi genetis diperbanyak secara tepat dan cepat ?

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 17

 3 model replikasi
1. Conservative model
2. Semiconservative model
3. Dispersive model

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 18

Model replikasi DNA

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 19

Mekanisme Sintesis DNA
Replikasi DNA berlangsung dalam beberapa tahap:
Denaturasi untaian DNA induk
Inisiasi sintesis DNA
Pemanjangan untaian DNA
Ligasi fragmen-fragmen DNA
Terminasi sintesis DNA

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 20

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 21
 PROTEIN DAN ENZIM YANG TERLIBAT DALAM
PROSES REPLIKASI DNA
1. Pemecahan/pengudaran Heliks Ganda
•Helikase : Berfungsi mengudar heliks ganda
•Girase : Menghilangkan tegangan pada pangkal percabangan replikasi
•Protein SSB : Mencegah utas tunggal bergabung membentuk kembali heliks ganda
2. Sintesis Utas Baru
•RNA Polimerase: Sintesis RNA primer
•DNA Polimerase III: Sintesis perpanjangan utas DNA baru
•DNA Polimerase I: Pengisian celah antara dua fragmen Okazaki dan membuang RNA primer
•Ligase: menyambung dua fragmen Okazaki
SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 22
Enzim dalam replikasi

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 23

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 24
DNA polymerase
Pada ujung untai DNA yang sedang terbentuk, DNA polimerase
menjadi katalis untuk pembentukan ikatan fosfodiester antara 3’-
OH dari deoksi dengan 5’-fosfat nukleotida berikutnya
Mencari prekursor d-NTP yang tepat , yang komplementer
dengan DNA template. Penambahan sekitar 850 nukleotida tiap
detik pada E.coli dan 60-90 per detik pada manusia
Arah sintesis untai DNA yang baru adalah dari 5’-3’

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 25

 Inisiasi replikasi dimulai dengan adanya
sekuen DNA yang disebut replicator

Pada replicator terdapat origin of replication

Bagian pada untai DNA yang ‘membuka’ untuk direplikasi,
disebut replication bubble
Untai DNA yang digunakan sebagai template/cetakan,
disebut template strands

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 26

 Replikasi
Saat DNA membuka, terbentuk struktur seperti garpu, yang
disebut replication fork
Pada satu replication bubbles, terdapat 2 replication fork
Secara umum, replikasi DNA berjalan dua arah =
bidirectional

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 27

Semidiscontinuous DNA
replication
Setelah DNA helicase berhasil membuka untai ganda DNA (disebut
DNA denaturation = DNA melting), protein SSB (single-strand DNA-
binding protein) menempel pada tiap untai DNA yang sudah membuka,
menjaga supaya tidak menutup lagi
RNA primer berada pada ujung 5’ untai baru DNA untuk satu untai
template DNA
RNA primer juga terdapat pada template DNA yang lain

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 28

DNA helicase terus bergerak maju, membuka 2 untai DNA asal/parent
Terdapat DNA gyrase (enzim topoisomerase) yang berada di depan
replication fork untuk mengurangi tegangan pada untai DNA
DNA polymerase III menambah nukleotida pada RNA primase
membentuk untai DNA yang baru
DNA polymerase hanya dapat menambahkan nukleotida pada ujung 3’
untai nukleotida sehingga replikasi DNA berjalan dari arah 5’ 3’

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 29

Leading strand & lagging strand
 Leading strand : Pada salah satu template DNA (1 untai
DNA yang direplikasi), dengan RNA primase yang selalu
menjauh dari arah replikasi, akan terbentuk untai baru
yang kontinu
 Lagging strand: Pada template yang lain, akan
terbentuk untai baru secara bertahap, terdiri dari potongan-
potongan DNA yang baru
SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 30
 Rolling circle replication
 Biasanya terjadi pada virus e.g. Bacteriophage λ
 DNA double strand berbentuk cincin / lingkaran mereplikasi membentuk DNA linear
 Dibuat suatu celah (nick) pada salah satu strand DNA
 Ujung 5’ ditarik keluar dari model cincin untuk membuat replication fork (seperti pada contoh
sebelumnya)
 Ujung 3’ bertindak sebagai primer supaya DNA polymerase dapat memulai sintesis
 Dari ujung 5’ yang keluar dari bentuk cincin, akan terbentuk untai DNA baru
 Metode ini merupakan metode discontinuous karena pembentukan untai DNA baru dari
lagging strand

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 31

 POLISOM

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 32

 PEMATANGAN PROTEIN
Dapat terjadi :
Pelepasan gugus N-formil pada ujung amino
Pelepasan metionin
Pemutusan rantai polipeptida
Reaksi oksidasi
Reaksi hidroksilasi
Pembentukan ikatan disulfida
Dan lain-lain
SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 33
Transkripsi
TAHAP KEDUA SINTESIS PROTEIN

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 34

Transkripsi
Terdiri dari 3 tahap :
Tahap inisiasi
Tahap elongasi
Tahap terminasi

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 35

 TRANSKRIPSI : 1. INISIASI
• Daerah DNA di mana RNA
polimerase melekat dan
mengawali transkripsi
disebut sebagai promoter.
• Suatu promoter menentukan
di mana transkripsi
dimulai, juga menentukan
yang mana dari kedua untai
heliks DNA yang digunakan
sebagai cetakan. 
 TRANSKRIPSI : 2. ELONGASI
Saat RNA bergerak di sepanjang DNA, RNA membuka pilinan heliks
ganda DNA, sehingga terbentuklah molekul RNA yang akan lepas dari
cetakan DNA-nya. 
 TRANSKRIPSI : 3. TERMINASI
 Transkripsi berlangsung sampai RNA polimerase
mentranskripsi urutan DNA yang disebut terminator.
 Terminator yang ditranskripsi merupakan suatu urutan
 RNA yang berfungsi sebagai sinyal terminasi yang
sesungguhnya.
 Pada sel prokariotik, transkripsi biasanya berhenti tepat pada
akhir sinyal terminasi; yaitu, polimerase mencapai titik
terminasi sambil melepas RNA dan DNA.
Translasi
TAHAP KETIGA SINTESIS PROTEIN

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 40

 TRANSLASI

Terdiri dari 3 tahap :

Tahap inisiasi
Tahap elongasi
Tahap terminasi
SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 41
TRANSLASI

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 42

 Tahap Inisiasi Translasi

Pengikatan faktor inisiasi (IF1,IF2,IF3) ke ribosom

sub unit kecil
Pengikatan mol.charge tRNA dan mRNA ke ribosom
sub unit kecil
Pembentukan kompleks inisiasi 70S

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 43

 Tahap Elongasi Translasi

Pengikatan aminoasil tRNA

Pembentukan ikatan peptida
Translokasi

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 44

 PEMBENTUKAN IKATAN PEPTIDA
.

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 45

 TAHAP ELONGASI TRANSLASI
.

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 46

 TAHAP TERMINASI TRANSLASI

Situs A ditempati stop kodon

Tak ada tRNA yang mengenali stop kodon
Situs A ditempati release factor
Memicu pelepasan polipeptida dari peptidil tRNA, pemecahan
secara hidrolitik
Kompleks ribosom pecah menjadi komponen semula

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 47

 TAHAP TERMINASI TRANSLASI

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 48

Inhibitor
PADA SINTESIS PROTEIN

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 49

 INHIBITOR SINTESIS PROTEIN
ANTIBIOTIKA CARA KERJA (prokariot)
Streptomisin Berikatan dengan subunit ribosom 30S shg
menghambat inisiasi dan menyebabkan
salah baca mRNA
Tetrasiklin Berikatan dengan subunit ribosom 30S dan
menghambat pengikatan aminoasil tRNA
Kloramfenikol Berikatan dengan subunit ribosom 50S dan
menghambat aktivitas peptidiltransferase
Eritromisin Berikatan dengan subunit ribosom 50S dan
menghambat translokasi

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 50

 INHIBITOR SINTESIS PROTEIN
INHIBITOR CARA KERJA (prokariot & eukariot)
Puromisin Analog aminoasil-tRNA, shg terjadi
terminasi dini
Actinomisin D Mengikat DNA dan menghambat gerakan
RNA polimerase, shg mencegah transkripsi
Mitomisin Terjadi iktan kovalen antara 2 rantai DNA,
sehingga replikasi menurun

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 51

 INHIBITOR SINTESIS PROTEIN
PADA EUKARIOT
Sikloheksimid

menghambat aktivitas
peptidil transferase
ribosom sub unit 60 S

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 52

Terima kasih 

SINTESIS PROTEIN IDA BETANURSANTI 2022 53