Daftar Fakultas dan Program Studi UNIJOYO.

Fakultas Hukum

 Prodi Ilmu Hukum (S1)

Fakultas Ekonomi dan Bisnis

 Prodi Manajemen (S2)

 Prodi Akuntansi Forensik (S2)
 Prodi Manajemen (S1)
 Prodi Akuntansi (S1)
 Prodi Ekonomi Pembangunan (S1)
 Prodi Akuntansi Sektor Publik (D3)
 Prodi Enterpreneurship (D3)

Fakultas Pertanian

 Prodi Teknologi Industri Pertanian (S1)

 Prodi Agribisnis (S1)
 Prodi Agroekoteknologi (S1)
 Prodi Ilmu Kelautan (S1)

Fakultas Teknik

 Prodi Teknik Industri (S1)

 Prodi Teknik Informatika (S1)
 Prodi Teknik Elektro (S1)
 Prodi Manajemen Informatika (D3)
 Prodi Mekatronika (D3)
 Prodi Teknik Multimedia dan Jaringan (D3)

Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Budaya (FISIB)

 Prodi Sosiologi (S1)

 Prodi Sastra Inggris (S1)
 Prodi Ilmu Komunikasi (S1)
 Prodi Psikologi
(S1)
Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP)

 Prodi PGSD (S1)

 Prodi Pendidikan Informatika (S1)
 Prodi Pendidikan IPA
 Prodi Pendidikan Anak Usia Dini
 Prodi Pendidikan bahasa dan sastra indonesia

Fakultas Ilmu-Ilmu Keislaman (FIK)

 Prodi Hukum Bisnis Syariah (S1)

 Prodi Ekonomi Syariah (S1)