3/11/2013

OVERVIEW
BIOKIMIA

DOSEN :
Prof. Dr. ERNAWATI SINAGA, M.Biomed, Apt
Prof. Dr. SHIRLY KUMALA, M.Biomed., Apt
Dr. DIAN RATIH L, M.Biomed, Apt
RININTA FIRDAUS, Ssi., MSc., Apt

BIOKIMIA

 Ilmu yang mempelajari tentang senyawa-

senyawa yang terdapat dalam tubuh makhluk
hidup, dan reaksi-reaksi kimia yang terjadi
pada senyawa-senyawa tersebut

 Aplikasi dari ilmu kimia untuk mempelajari

proses biologi

 Dapat memberi penjelasan tentang penyebab

penyakit manusia, hewan, tumbuhan

1
 3/11/2013

PERAN BIOKIMIA PADA

TINGKAT KLINIK
 Mengungkap penyebab fundamental dan mekanisme
terjadinya penyakit.
Misalnya: Penyakit-penyakit metabolik.
 Merekomendasikan terapi yang rasionil dan efektif
(berdasarkan no.1)
Misalnya: Pengaturan diet pada peny. Metabolik.
 Menegakkan Diagnosis.
Misalnya: Pemeriksaan lab. Peny. jantung, liver, dll.
 Memantau Perjalanan Penyakit.
 Menilai respon peny. Terhadap Terapi.

BIOKIMIA MENJADI DASAR:

1. ILMU FAAL 4. PATOLOGI.

2. IMUNOLOGI 5. FARMASI.
3. GENETIKA 6.MIKROBIOLOGI.

2
 3/11/2013

Apa yang dipelajari

 Struktur kimia dan bentuk tiga dimensi molekul

biologi (Biomolekul)
 Interaksi antar biomolekul
 Sintesis dan degradasi biomolekul dalam sel
 Perolehan dan pemanfaatan energi oleh sel
 Mekanisme pengorganisasian biomolekul dan
pengkoordinasian aktifitasnya
 Penyimpanan, pemindahan dan ekspresi informasi
genetika

Organisasi Kehidupan

Organisme Morfologi

Organ Anatomi

Jaringan Histologi

Sel Sitologi

Molekul Biokimia - Biomol

3
 3/11/2013

5 Kingdom Makhluk
hidup

1. Monera
2. Protista
3. Fungi
4. Planta
5. Animalia

 Semua makhluk hidup tersusun oleh sel

 Sel adalah unit terkecil organisasi kehidupan

Uniseluler Multiseluler

Unit terkecil sistem kehidupan

4
 3/11/2013

Ukuran Sel

150-250 nm small bacteria such as Mycoplasma

(1 - 10 µm) the general sizes for Prokaryotes
1 µm human nerve cell
2 µm E.coli - a bacterium
9 µm Human red blood cell
(10 - 30 µm) Most Eukaryotic animal cells
(10 - 100 µm) Most Eukaryotic plant cells
90 – 800 µm Amoeba
100 µm Human Egg
2 mm frog egg

Nucleoid region contains the DNA Contain 3 basic cell structures:

•Cell membrane & cell wall • Nucleus
• Contain ribosomes (no membrane) • Cell Membrane
to make proteins in • Cytoplasm with organelles
their cytoplasm

10

5
 3/11/2013

Sel Prokariota

Sel Eukariota : Hewan

6
 3/11/2013

Sel Eukariota : Tumbuhan

Perbandingan Sel
Prokariota dan Eukariota
Organel Prokariota Eukariota
Nukleus Nukleoid Ada
Mitokondria Tidak ada Ada
(enzim utk reaksi oksidasi
terletak di membran plasma)
RE Tidak ada Ada
Kloroplas Tidak ada Ada pada sel
(reaksi fotosintesis berlangsung tumbuhan
di kromatofor)
Membran/ Membran dan dinding sel Membran (hewan)
Dinding sel Dinding (tumbuhan

7
 3/11/2013

Perbandingan Sel
Hewan & Tumbuhan

 Sel tumbuhan memiliki dinding sel yang

tersusun atas selulosa
 Sel tumbuhan memiliki kloroplas dan
plastida
 Sel tumbuhan memiliki vakuola yang
banyak dan besar-besar

Komponen Sel
 Membran Sel
 Mitokondria
 Sitoplasma:
 Kloroplas
 Organel sel
 Ribosom
 Cairan sel
(Sitosol)  Retikulum
Endoplasmik
 Badan Golgi
 Nukleus
 Lisosom, Peroksisom,
Granula sekretori

8
 3/11/2013

Membran Plasma

Nukleus

9
3/11/2013

10
 3/11/2013

Biolog. Nanostructures

Biochemistry
22

11
 3/11/2013

Many Important Biomolecules

are Polymers

• Biopolymers - macromolecules created by

joining many smaller organic molecules
(monomers)

24

12
 3/11/2013

Molecular Organisation of a cell

25

Biomolecules
26
– Structure
Anabolic

 Building block  Macromolecule

 Simple sugar  Polysaccharide
 Amino acid  Protein (peptide)
 Nucleotide  RNA or DNA
 Fatty acid  Lipid

Catabolic

13
 3/11/2013

Komposisi Kimia Sel

 90% air
 5% protein
 1,5% karbohidrat
 1,5% asam nukleat
 1,0% lipid
 1,0% lain-lain

Komposisi Tubuh Makhluk Hidup

14
 3/11/2013

Karbohidrat

 Basic unit : Monosakarida

 Jumlahnya paling banyak diantara
biomolekul lain
Fungsi Karbohidrat

Sumber kalori
Komponen Struktural
Senyawa Fungsional : sebagai
antigen, marker, signal (komunikasi
antar sel)

Ikatan Glikosidik

15
 3/11/2013

LIPID
 Senyawa-senyawa yang sukar
larut di dalam air, tetapi mudah
larut dalam pelarut organik
 triacylglycerol, steriods
(cholestrol, sex hormones), fat
soluble vitamins.
 Two types: saturated (C-C sb)
and unsaturated (C-C db)

Fungsi Lipid

 Sebagai sumber energi (cadangan),

terutama dalam bentuk triasilgliserol
 Sebagai komponen struktural
(membran)
 Sintesis hormon dari kolesterol
 Penyusun asam empedu (untuk
solubilisasi lemak)
 Insulator

16
 3/11/2013

Triglyceride
33

Glycerol Fatty Acid Chains

Structure of a biological membrane

34

• A lipid bilayer with associated proteins

17
 3/11/2013

Steroids

The carbon skeleton of

steroids is bent to form
4 fused rings
Cholesterol
Cholesterol is the
“base steroid” from
which your body
produces other Estrogen
steroids Testosterone

Estrogen &
testosterone are also
steroids

Synthetic Anabolic Steroids are variants of testosterone

35

Protein
 Polimer asam amino,
dihubungkan oleh ikatan peptida
 20 macam asam amino
pembentuk protein

ASAM AMINO
• Building blocks (penyusun makromolekul
proteins)

• Rantai sampingnya menentukan sifat

kimia masing2 asam amino) dan
menentukan struktur pelipatan protein
dan fungsi biologinya.

18
 3/11/2013

Fungsi Protein
 Pembangun struktur tubuh (protein struktural) :
keratin, kolagen, elastin
 Enzim : amilase, protease, lipase, fosforilase
 Hormon : insulin, glukagon
 Pertahanan tubuh : immunoglobulin (antibodi), bisa
ular
 Transportasi (protein transport) : hemoglobin,
mioglobin, transferin, albumin, lipoprotein
 Cadangan : ovalbumin, gluten

Proteins as Enzymes
38

 Enzim mengatur kecepatan reaksi kimia dengan

menurunkan energi aktivasi yang dibutuhkan oleh suatu
reaksi kimia.
 Enzim tidak mempengaruhi kesetimbangan reaksi
 Enzim tidak ikut bereaksi
 Enzim dapat digunakan kembali

19
 3/11/2013

Nucleic Acids

Menyimpan informasi genetik untuk

membuat semua protein tubuh.

Two types exist --- DNA & RNA

39

Macromolecules
40

20
 3/11/2013

Macromolecules
41

• Proses kehidupan
membutuhkan energy
• Energy diperoleh dari
reaksi kimia
• Reaksi kimia dalam sel
hidup banyak melibatkan
enzim
• Reaksi kimia yang
terjadi dalam sel hidup
disebut dengan
metabolisme

21
 3/11/2013

Metabolisme

• KATABOLISME • ANABOLISME
Rangkaian reaksi Rangkaian reaksi
kimia untuk memecah kimia untuk
makromolekul menjadi mensintsis molekul
bentuk yang lebih yang lebih kompleks
sederhana dari molekul yang
lebih sederhana
reaksi bersifat
eksergonik Reaksinya
endergonik
Cellular respiration
C6H1206 + 6O26CO2 +6H20 + Polymerization
ENERGY Photosynthesis
6CO2 +6H20 + light  C6H1206 +
6O2

ANABOLISME KATABOLISME

• Glukoneogenesis • Rantai Pernafasan

• Glikogenesis (Fosforilasi
• Pentosa Phosphat Oksidatif)
pathway • Glikolisis
• Biosintesis asam • Oksidasi beta
lemak • Glikogenolisis
• Biosintesis kolesterol
• Ketogenesis

INTERMEDIATE
• Siklus Krebs (Citric Acid Cycle)

22
 3/11/2013

Biosintesis Protein

• Sintesis Protein tergantung dari susunan basa dalam

gen
• Terdiri dari 2 proses dasar :
- Transkripsi
-Translasi
Dilanjutkan dengan proses modifikasi post translasi
sehingga struktur protein menjadi kompleks dan
menentukan fungsi biologisnya.

Metabolisme Purin Pirimidin

• Basa nitrogen Purin dan Pirimidin dapat

membentuk kompleks dengan gula ribosa dan
fosfat membentuk nukleotida

• Metabolisme Purin pada manusia menghasilkan

asam urat .
•Abnormalitas metabolisme purin dapat
menjelaskan penyakit gout

• Dengan mengetahui metabolisme Pirimidin dapat

dimengerti prinsip pengobatan tumor seperti pada
obat2 metotreksat, dll/.

23
 3/11/2013

47

Cakupan Bahasan
Biokimia

}
 Asam nukleat
Molekul
 Protein
 Karbohidrat
Metabolisme
 Lipid

24
 3/11/2013

Pertemuan Ke Materi
1. Overview Biokimia
2. Biomolekul (Karbohidrat dan Lipid)
3. Biomolekul (Asam Amino dan Protein)
4. Asam Nukleat dan Biosintesis Protein
5. Enzim
6. Kinetika Enzim
7. Diskusi/Presentasi/Latihan Soal
8. UTS
9. Bioenergetika
10. Oksidasi Biologi
11. Metabolisme Karbohidrat
12. Metabolisme Lipid
13. Metabolisme Asam Amino
14. Metabolisme Purin Pirimidin
15. Diskusi/Presentasi/Latihan Soal
16. UAS

PENILAIAN

Komposisi Nilai Akhir =

KEHADIRAN (memenuhi persyaratan)
20% TUGAS
40% UTS
40% UAS

25
 3/11/2013

DAFTAR PUSTAKA

 Berg, J.M., Tymoczko, J.L., and Stryer, L.

Biochemistry. 5th edition. Freeman and Co. 453-
487
 Koolman J, Roehm KH, 2005, Color Atlas of
Biochemistry, 2nd Ed, New York.
 Murray RK., Biokimia Harper, 27th , EGC, Jakarta
 Pantjita H., Ikhtisar Biokimia Dasar, Balai
Penerbit FKUI, 2002

Thank You Revisi_ Genap 2012/2013_DRL

26