PENGANTAR BIOKIMIA

1. Jelaskan perbedaan utama sel prokariot dan eukariot!

2. Sebutkan ion logam yang terdapat dalam organisme hidup!
3. Diantara spesi berikut, manakah yang dimaksud biopolimer?
a. Glukosa f. Hemoglobin
b. Selulosa g. Nukleotida
c. DNA h. Protein
d. Urea i. Air
e. Asam amino j. Oksigen
4. Di antara organel sel berikut, manakah yang terdapat pada sel tumbuhan, sel hewan atau
pada keduanya?
a. Nukleus
b. Ribosom
c. Lisosom
d. Peroksisom
e. Kloroplas
f. Mitokondria
g. Glioksisom
5. Sitokrom c diperlukan untuk mengubah energi dari reducing power menjadi anhidrida fosfat.
Di organel mana kira-kira sitokrom c ini banyak ditemukan?

PROTEIN

1. Mengapa asam amino tidak pernah memiliki gugus –COOH dan –NH2 secara bersamaan
pada semua kondisi pH?
2. Titik isoelektrik asam aspartat terjadi pada pH 2,8. Gambarkan struktur asam aspartat yang
dominan pada pH 1,5, dan 11!
3. Pada pasangan asam amino berikut, manakaha asam amino yang memiliki gugus R yang
lebih nonpolar.
a. Gly: Val
b. Ala: Ser
c. Phe: Tyr
d. Lys: Pro
4. Prediksi kemungkinan lokasi asam amino berikut: Glu, Leu, Ser, dan Ile, apakah di dalam
atau permukaan sebelah luar pada protein globular!
5. Suatu polipeptida diisolasi dari otak mempunyai sekuens: Glu-His-Trp-Ser-Tyr-Gly-Leu-Arg-
Pro. Tentukan muatan total polipeptida tersebut pada pH 3 dan 11, jika diketahui pKR Glu,
His, Trp, Ser, Tyr, Gly, Leu, Arg, dan Pro masing-masing 4,3; 6,0;13,6;10,0; dan 12,48.
6. Gambarkan interaksi non kovalen yang terjadi antar asam amino berikut:
a. Ile dan Val
b. Glu dan His
c. Tyr dan Thr
d. Ala dan Ala
7. Masing-masing perlakuan berikut dapat merusak ikatan kovalen dan atau non kovalen pada
protein. tentukan jenis ikatan yang dirusak oleh perlakuan berikut dan tentukan apakah
protein menjadi terdenaturasi atau terhidrolisis sebagai akibatnya!
a. Pemanasan suhu 60 oC
b. Penambahan HCl dan H2O dilanjutkan pemanasan pada 100 oC
 c. Penambahan urea
d. Penambahan SDS (sodium dodesil sulfat)
e. Penambahan merkaptoetanol

ENZIM

1. Enzim β-galaktosidase mengubah laktosa menjadi glukosa dan galaktosa.

a. Sebutkan reaktan dan produk pada reaksi tersebut
b. Gambarkan diagram energi dengan dan tanpa enzim. Tandai substrat, produk, dan
energi yang dibutuhkan dengan dan tanpa enzim.
c. Mengapa enzim dapat mempercepat jalannya reaksi?
2. Termasuk kelompok enzim apakah yang mengkatalisis reaksi berikut?
a. Hidrolisis sukrosa
b. Penambahan oksigen
c. Isomerasi glukosa menjadi fruktosa
d. Transfer gugus amino ke asam α-keto
e. Mengubah asam piruvat menjadi asam asetat
3. Tripsin, suatu peptidase yang menghidrolisis polipeptida dan bekerja di dalam usus halus
pada pH optimum = 8.0. bagaimana kecepatan reaksi tripsin jika:
a. Konsentrasi polipeptida diturunkan
b. pH diturunkan menjadi 5
c. reaksi dilakukan pada suhu 50 oC
4. asam oksaloasetat merupakan inhibitor suksinat dehidrogenase. Gambarkan struktur asam
suksinat dan asam oksaloasetat kemudian tentukan jenis inhibitor apa asam oksaloasetat!

Asam nukleat

1. Jika suatu monomer asam nukleat diketahui tersusun atas satu gugus fosfat, basa timin, dan
gula ribosa. Gambarkan struktur monomer tersebut dan tentukan jenis asam nukleat yang
disusun oleh monomer tersebut!
2. Tentukan perbedaan antara:
a. Nukleotida dan nukleosida
b. dNTP dan ddNTP
c. AMP dan ATP
d. Deoksiribosa dan ribosa
e. Lagging strand dan leading strand
3. Jelaskan istilah berikut:
a. Fragmen okazaki
b. Primer
c. Kodon
d. Operon
4. Sebutkan enzim apa saja yang terlibat pada proses replikasi dan perannya!
5. Bagaimana mekanisme pengendalian ekspresi gen di dalam organisme hidup? Beri contoh
dan mekanisme pengendaliannya!