Lysozyme PYMOL
Lysozyme PYMOL
Nim : 170332614576
OFF : G
Struktur primer adalah struktur alpha helix yang di gambarkan menggunakan stick sehingga
terlihat urutan asam amino.
LYS (60) ASP (61) GLU (62) ALA (63) GLU (64) LYS (65) LEU (66) PHE (67) ASN (68)
GLN (69) ASP (70) VAL (71) ASP (72) ALA (73) ALA (74) VAL (75) ARG (76) GLY (77)
ILE (78) LEU (79) ARG (80).
Interaksi yang menstabilkan dalam struktur primer yaitu ikatan peptida. Beberapa contoh dari
struktur primer diatas yaitu ikatan peptida antara ALA (73) dan ASP (72) ; ikatan peptida
ASN (68) dan GLN (69).
2. Struktur Sekunder dari lysozyme
Struktur sekunder merupakan struktur dari rantai alfa helix yang ditunjukkan dalam bentuk
stick dan cartoon.
Interaksi yang menstabilkan pada struktur sekunder yaitu interaksi hidrogen yang terjadi pada antara
ikatan peptida (gugus O rangkap dalam karbonil pada ikatan peptida dengan gugus H pada gugus
amino dalam ikatan peptida lainya).
3. Struktur tersier dari lysozyme
Struktur tersier merupakan struktur yang tersusun dari 2 rantai helix yang dihubungkan oleh
rantai beta sheet.
Interaksi yang menstabilkan dalam struktur tersier yaitu interaksi antar helix yang dapat
dilihat pada gambar diatas, dimana terjadi interaksi dipol-dipol antar atom O rangkap pada
gugus karbonil yang terdapat pada helix yang satu dengan atom O pada helix lainnya.