RESUM 3-4

♥ Kode Genetik
Gen dikendalikan oleh struktur polipeptida. Urutan 4 pasang basa DNA dapat
mengotrol 20 asam amino pada protein. Molekul mRNA berperan untuk menentukan
urutan asam amino dari polipeptida. Dalam proses penentuan diperlukan kodon yang
terdiri dari triplet yang ikut menentukan asam amino yang akan terbentuk.
♥ Tiga Nukleotida Per Kodon
Saat translasi, 20 asam amino berbeda yang digabungkan. Hal ini berarti bahwa ada
20 kodon tersebut harus dibentuk dengan 4 simbol (basa) melalui mRNA. Fakta utama
mengenai kode genetika adalah fakta tentang kode triplet ( tiga nukleotida per kodon).
Penelitian Crick (1961) dan temannya membuktikan bahwa kode genetik terdiri atas kode
triplet yang diperolehnya dari penelitiannya tentang suatu penyebab mutasi pada suatu
mutasi yang terjadi pada suatu alel rII dari fage T4. Jika kita menengok kembali ulasan
mengenai hasil yang kejadian atas suppressor mutaions lebih cukup daripada back-
mutations yang berasal dari tempat aslinya. Penelitian Crick dan temannya beralasan jika
original mutation yang tunggal berdasarkan pasangan penjumlahan atau pengurangan maka
suppressor mutations harus menjadi pasangan tunggal baik dari pengurangan atau
penjumlahan berturut- turut dari kejadian tempat satu ke tempat yang lebih dekat dengan
mutasi. Pasangan yang tunggal dari penjumlahan atau pengurangan akan mengubah
reading frame pada gen dan mRNA untuk bagian dari gen distal pada mutasi.
Hal ini menandai bahwa penjumlahan dari tiga pasangan atau pengurangan dari tiga
pasangan bagian kiri distal yang ada di gen dengan memperbaiki reading frame. Hasil ini
dapatdijadikan harapan jika hanya masing-masing kodon yang mengandung tiga
nukleotida.
♥ Penerjemahan kode
Penerjemahan kode ditentukan oleh :
1. Kodon yang spesifik dengan asam amino
2. Jumlah dari kemungkinan 64 kodon yang digunakan
3. Bagaimana kode dijelaskan
4. Apakah spesies yang berbeda menggunakan kodon yang sama atau tidak
Penemuan MW Nirenberg (penerima hadiah nobel 1968) dan JH Matthei dan
kemudian S. Ochoa (penerima hadiah nobel 1959) dan rekan kerjanya menunjukkan bahwa
sintesis molekul RNA dapat digunakan sebagai mRNA buatan untuk sintesis protein in
vitro. Ketika ribosom, tRNA aminoasil, dan faktor-faktor protein terlarut yang dibutuhkan
untuk penerjemahan yang dimurnikan dari mRNA alami, komponen ini dapat
 RESUM 3-4

dikombinasikan in vitro dan dirangsang untuk mensintesis polipeptida dengan penambahan

molekul RNA disintesis secara kimia. Jika komposisi sintesis molekul-molekul mRNA
diketahui, komposisi sintesis polipeptid dapat digunakan untuk menentukan kodon asam
amino. Penetapan kodon pertama (UUU untuk fenilalanin) dibuat ketika Nirenberg dan
Mathaei mendemonstrasikan bahwa Polyuridylic acid [poly U= (U)n] didahului oleh
sintesis fenilalanin [(fenilalanin) n]. Ochoa melanjutkan dengan menggunakan RNAs
sintesis dengan urutan acak dari komposisi nukleotda yang telah diketahui. Frekuensidari
triplet yang berbeda ini dapat dengan mudah di kalkulasi.
♥ Degenerasi dan Ketidakstabilan
Semua asam amino kecuali metionin dan triptofan ditentukan oleh lebih dari satu
kodon. Khususnya tiga asam amino, leusin, serin, dan arginin, yang masing-masing
ditentukan oleh enam kodon yang berbeda. Isoleusin memiliki tiga kodon. Asam amino
lainnya masing-masing memiliki dua atau empat kodon. Terjadinya lebih dari satu kodon
per asam amino yang disebut degenerasi. Degenerasi dalam kode genetik tidak secara acak,
sebaliknya, hal ini terjadi dengan teratur. Beberapa kodon menentukan suatu asam amino
hanya dengan pola tertentu yaitu base ketiga atau 3 'dari kodon. Terdapat 2 jenis
degenerasi yaitu:
1. Degenerasi parsial terjadi ketika base ketiga dapat berupa salah satu dari dua
pyrymidines (U dan C) atau sebaliknya, salah satu dari dua purin (A dan G).
Dengan degenerasi parsial, mengubah base ketiga dari purin ke pirimidin, atau
sebaliknya, akan mengubah asam amino yang ditentukan oleh kodon.
2. Degenerasi lengkap terjadi ketika salah satu dari empat basa dapat hadir pada
posisi ketiga dalam kodon, dan kodon masih akan menentukan asam amino yang
sama. Misalnya, valin ditentukan oleh GUU, GUC, GUA, dan GUG.
Kode genetik telah dipastikan memiliki peran dalam meminimalisir mutasi yang
bersifat letal. Adanya penambahan basa pada posisi kodon ketiga tidak mengubah asam
amino yang ditetapkan oleh kodon.
Oleh karena degenerasi kode gen, harus ada beberapa tRNA berbeda yang
mengenali kodon yang baru agar dapat menentukan asam aminonya atau antikodon dari
tRNA yang diberikan harus sesuai dengan beberapa kodon yang baru. Terdapat beberapa
tRNA untuk asam amino tertentu, dan beberapa tRNA mengenali lebih dari satu kodon.
Ikatan hidrogen antar basa dalam antikodon tRNA dan kodon mRNA muncul untuk
mengikuti aturan pemasangan basa yang terikat kuat, hanya untuk dua basa kodon pertama.
 RESUM 3-4

Pasangan basa yang melibatkan ketiga kodon terbaik yang tampak kurang kuat , sering
disebut dengan “goyah atau tidak stabil”.
Berdasarkan jarak molekuler dan sterik ( tiga - struktur dimensi ) dipertimbangkan ,
ketidakstabilan tersebut akan menghasilkan beberapa jenis tertentu.,yaitu pasangan pada
dasar kodon ketiga dalam interaksi kodon-antikodon. Hal ini mengharuskan bahwa
setidaknya ada dua tRNA untuk setiap asam amino yang menunjukkan degenerasi kodon
lengkap di posisi ketiga. Hipotesis wobble memprediksi terjadinya tiga tRNA untuk kodon
enam serin. tRNA serin telah ditandai sebagai berikut.
1. tRNAser 1 (antikodon AGG) mengikat kodon UCU dan UCC
2. tRNAser 2 ( antikodon AGU ) mengikat kodon UCA dan UCG ,
3. tRNAser 3 ( antikodon UCG ) mengikat untuk kodon AGU dan AGC
♥ Inisiasi dan terminasi kodon
Kode genetik juga memberikan tanda-tanda informasi genetik pada level translasi.
Tiga kodon UAA, UAG, dan UGA merupakan rantai polipeptida terminasi. Kodon-kodon
tersebut dikenali oleh protein Release factor (RF) dari pada tRNAs. Protein tersebut adalah
RF-1 yang mengenal UAA dan UAG dan RF-2 yang mengakibatkan terminasi pada kodon
UGA dan UAA. Kodon AUG dan GUG dikenali oleh initiator t RNA, t RNAi met, tapi hal
itu hanya ada saat mengikuti urutan nukleotida yang tepat saja pada leader segments
molekul m RNA. Pada posisi internal, AUG dikenali t RNA met dan GUG dikenali valine t
RNA.
♥ Universalitas Kode
Penggantian asam amino terjadi karena mutasi, asam nukleat dan urutan
polipeptida menunjukkan hubungan bahwa kode genetik itu hampir sama atau bahkan
sama pada semua organisme (universal). Pengecualian pada mitokondria manusia, ragi dan
beberapa spesies lain dimana UGA merupakan kodon triptofan. Sedangkan UGA
merupakan kodon terminasi dalam sistem non mitokondria. Dalam mitokondria ragi, CUA
menentukan treonin bukan leusin. Dalam mitokondria mamalia, AUA menentukan
metionin bukan isoleusin.
♥ Suppressor mutasi yang memproduksi tRNAs dengan mengubah kodon pengenal
Kode genetic nonmitokondria tidak bersifat universal, hanya sebagian kecil dari
batas sense, karena adanya variasi minor pada kodon pengenal dan translasi. Pada bakteri
E.coli dan ragi, sebagai contoh terjadinya mutasi pada gen tRNA, yang mana mereka
menghasilkan pengubah codon pengenal dengan antikodon dari tRNAs. Mutasi tersebut
pada awalnya terdeteksi sebagai suppressor mutasi, yaitu mutasi yang muncul dari effek
 RESUM 3-4

mutasi lain. Mereka terlihat sebagai site pada gen tRNA yang dapat mengubah kekhususan
sifat pengenal kodon oleh tRNAs. Setelah itu mereka menunjukkan pada merekalah gen
tRNA mengubah kekhususan sifat pengenal kodon oleh tRNAs.
Suppressor mutasi yang mengubah kekhususan tRNA adalah suppressor dari
mutasi yang memproduksi akhiran-rantai triplet UAG dalam mengkode rangkaian
structural gen. Mutasi tersebut disebut mutasi amber, yang terjadi akibat dari sintesis dari
akhiran fragmen asam amino yang menetapkan polipeptida sebagai gen.
Mutasi yang menghasilkan triplet rantai terminasi dengan gen disebut nonsense
mutasi, berkebalikan dengan mutasi missense yang mengubah sebuah triplet menjadi triplet
lain yang menghasilkan asam amino berbeda.
Tidak terlihatnya suatu mutasi pada nonsense menunjukkan efek mutasi pada
gen tRNA yang disebabkan adanya mutasi dari tRNAs untuk mengenali kodon nonsense
(antisense) (UAG, UAA, or UGA). Ketika salah satu dari supressor tRNA berupa UAG
dari mutasi su3 berada pada satu baris yang sama maka hal tersebut akan mengubah
antikodon. Pada ‘amber’ penekan mutasi yang terjadi pada tRNAtyr2. Pada antikodon
nonsuspensor tRNAtyr2 menunjukkan 5’-G’UA-3’ (dimana G’ merupakan derivat dari
guanin). Sedangkan pada antikodon dari mutasi (suppressor) tRNAtyr2 merupakan 5’-CUA-
3’. Mutasi antikodon ini dapat berpasangan dengan 5’-UAG-3’ kodon ‘amber’
(Berpasangan dengan ujung yang berlawanan) seperti:
3’-AUC-5’ (antikodon)
5’- UAG-3’ (kodon)
Suspensor tRNAs mengizinkan polipeptida yang telah lengkap untuk disintesis dari
mRNAs yang mengandung kodon antisense. Polipeptida akan berfungsi selama asam
amino disisipkan oleh suppressor tRNAs pada posisi yang tepat dan nantinya akan
menghasilkan gen-gen yang fungsional. Strain Escherichia colli yang mengandung gen
supresor menunjukkan tingkat pertumbuhan yang sebanding dengan strain tanpa gen
supresor. Penyebab mengapa strain penekan tidak menunjukkan efek merugikan seperti
"read-through" belum terungkap jalan keluarnya. Mungkin sebagian gen seperti fag MS2
mantel gen yang berakhir dengan dua atau lebih kodon stop yang berbeda.
 RESUM 3-4

RQA
Nama : Ika Nanda Febriana
NIM: 180342618007
1. Apakah yang dimaksud kode genetik, dan apakah perannya?
Jawab : Kode genetik adalah urutan basa nukleotida dalam asam nukleat (DNA dan
RNA) yang mengkode rantai asam amino dalam protein. DNA terdiri dari empat basa
nukleotida: adenin (A), guanin (G), sitosin (C) dan timin (T). RNA mengandung
nukleotida adenin, guanin, sitosin dan urasil (U). Ketika tiga kontinyu basa nukleotida
kode untuk asam amino atau menandakan awal atau akhir sintesis protein, set ini
dikenal sebagai kodon. Ini set triplet memberikan instruksi untuk produksi asam amino.
Asam amino yang dihubungkan bersama untuk membentuk protein.

2. Bagaimana perbedaan mutasi amber, mutasi suppressor, mutasi missense dan mutasi
nonsense?
Jawab: Suppressor mutation itu terjadi mutasi pada gen lain. Dalam hal ini, mutasi
ini menekan efek mutasi mula-mula sekalipun kejadiannya berlangsung pada gen lain.
Yang terjadi berupa penekanan/supresi suatu cacat akibat mutasi oleh satu mutasi pada
gen lain. Gen yang menyebabkan supresi mutasi pada gen lain disebut gen supressor.
Sedangkan mutasi amber adalah mutasi yang terjadi akibat dari sintesis dari akhiran
fragmen asam amino yang menetapkan polipeptida sebagai gen. Mutasi missens
adalah mutasi yang terjadi karena perubahan suatu pasangan basa (dalam gen) yang
mengakibatkan terjadi perubahan satu kode genetika, sehingga asam amino yang
terkait (pada polipeptida) berubah. Mutasi nonsense adalah suatu pergantian pasangan
basa yang berakibat terjadinya perubahan suatu kode genetika pengkode asam amino
menjadi kode genetika pengkode terminasi

3. Bagaimana terjadinya mutasi amber? Jelaskan!

Jawab: Suppressor mutasi yang mengubah kekhususan tRNA adalah suppressor dari
mutasi yang memproduksi akhiran-rantai triplet UAG dalam mengkode rangkaian
structural gen. Mutasi tersebut disebut mutasi amber, yang terjadi akibat dari sintesis
dari akhiran fragmen asam amino yang menetapkan polipeptida sebagai gen.